cluster # 8895

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Schistosoma mansoni
cluster # 8895 cluster # 8895 Sequences # 7 consensus # 2

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consensus_8895#0 length = 1080 sequences # 6

consensus_8895#1 length = 315 sequences # 1

consensusID : consensus_8895#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1080
fasta sequence

                              [CTATCATCTCAGTCGTACAGTAGTTTGAATTTTAATAGTTCAGTATGTGACAACTTTACTAATATCAACCCACATTCAATATTCATGACATCTAATGAACCTAGTTGTTTTCAATTCGGGATGAGAAGTCCCACTGATGATAAGCCCAACTCTTTTGATTTCACTACATTTGGTCCCGTTGGGTCTTCATCACCAGCCGGTGCTTTCATCCACTCAAATTTAATTAGTTCTAACTGCAATAGTTCTATCTTGTCAAATTTATCTTCAACAGGTTTACAGAGTAGACAAGTGTGTTTAGATTCACAAAATACTGATACCTTAATTTTTCCTATGATGTCTCCATCAGTTTCGCATTCAGATGCCACCTCGAATTCATCTACGATGTAGTAGCGATCAGACACTATAAGAATTGAGTTGTTTTTGTCTTATCATACGTTTACATCAAAAATTCTTA-TTTTTGCTGTATTTCCGTTATTAATTTTTATCTGGACAGCAGTATGGAAAGAAAACTAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTTCGAAACTCGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTTTGCATTTTGATAACTTTCAGAGAGTTTGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTATTGTTACTATTATTACTCTTGATATATTTTTT-TGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATGGTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAGATTTGTCTTCTAGACCCTTCCAATCACTTTCTTTAATATCTTCATACGAATTTTGCTATTTCTTTTGTTTCCGAACTAAATATTATGGTCTAGTCGTTGCGTTTTCGTGTTAATTTCTTGTGTTATCCTTTATGATTTTGTTCTTACCTTTCCCTTTTTCAATGTGTTGCTTAACGCTTTGTAGTCGATACTAAAATTGTGGTCTTTGTTTTGTATTCACAACTTATGCACACTTTTCCAACTCATATTTAATATTCATACGTTTAAGAGTGTCTCAATGGTTGGCTAGTCATCTTTTTTCCTGTTTCTTATCTTTCATGTTCAGTT]

[+] EMBL CD124583             [CTATCATCTCAGTCGTACAGTAGTTTGAATTTTAATAGTTCAGTATGTGACAACTTTACTAATATCAACCCACATTCAATATTCATGACATCTAATGAACCTAGTTGTTTTCAATTCGGGATGAGAAGTCCCACTGATGATAAGCCCAACTCTTTTGATTTCACTACATTTGGTCCCGTTGGGTCTTCATCACCAGCCGGTGCTTTCATCCACTCAAATTTAATTAGTTCTAACTGCAATAGTTCTATCTTGTCAAATTTATCTTCAACAGGTTTACAGAGTAGGCAAGTGTGTTTAGATTCACAAAATACTGATACCTTAATTTTTCCTATGATGTCTCCATCAGTTTCGCATTCAGATGCCACCTCGAATTCATCTACGATGTAGTAGCGATCAGACACTATAAGAATTGAGTTGTTTTTGTCTTATCATACGTTTACATCAAAAATTCTTA TTTTTGCTGTATTTCCGTTATTAATTTTTATCTGGACAGCAGTATGGAAAGAAAACTAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTTCGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD160741             [                                                                                                                                                                                                                                           GCAATAGTTCTATCTTGTCAAATTTATCTTCAACAGGTTTACAGAGTAGACAAGTGTGTTTAGATTCACAAAATACTGATACCTTAATTTTTCCTATGATGTCTCCATCAGTTTCGCATTCAGATGCCACCTCGAATTCATCTACGATGTAGTAGCGATCAGACACTATAAGAATTGAGTGGTTTTTGTCTTATCATACGTTTACATCAAAAATTCTTA TTTTTGCTGTATTTCCGTTATTAATTTTTATCTGGACAGCAGTATGGAAAGAAAACTAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTTCGAAACTCGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTTTGCATTTTGATAACTTTCAGAGAGTTTGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTATTGTTACTATTATTACTCTTGATATATTTTTT TGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATGGTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAGATTTGTCTTCTAGACCCTTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD160714             [                                                                                                                                                                                                                                           GCAATAGTTCTATCTTGTCAAATTTATCTTCAACAGGTTTACAGAGTAGACAAGTGTGTTTAGATTCACAAAATACTGATACCTTAATTTTTCCTATGATGTCTCCATCAGTTTCGCATTCAGATGCCACCTCGAATTCATCTACGATGTAGTAGCGATCAGACACTATAAGAATTGAGTTGTTTTTGTCTTATCATACGTTTACATCAAAAATTCTTATTTTTTGCTGTATTTCCGTTATTAGTTTTTATCTGGACAGCAGTATGGAAAGAAAACTAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTTCGAAACTCGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTTTGCATTTTGATAACTTTCAGAGAGTTTGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTATTGTTACTATTATTACTCTTGATATATTTTTTNTGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATGGTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAGATTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD160721             [                                                                                                                                                                                                                                           GCAATAGTTCTATCTTGTCAAATTTATCTTCAACAGGTTTACAGAGTAGACAAGTGTGTTTAGATTCACAAAATACTGATACCTTAATTTTTCCTATGATGTCTCCATCAGTTTCGCATTCAGATGCCACCTCGAATTCATCTACGATGTAGTAGCGATCAGACACTATAAGAATTGAGTTGTTTTTGTCTTATCATACGTTTACATCAAAAGTTCTTA TTTTTGCTGTATTTCCGTTATTAATTTTTATCTGGACAGCAGTATGGAAAGAAAACTAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTTCGAAACTCGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTTTGCATTTTGATAACTTTCAGAGAGTTTGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTATTGTTACTATTATTACTCTTGATATATTTTTT TGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATGGTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAGATTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD084053             [                                                                                                                                                                                                                                                       acgaggCAAATTTATCTTCAACAGGTTTACAGAGTAGACAAGTGTGTTTAGATTCACAAAATACTGATACCTTAATTTTTCCTATGATGTCTCCATCAGTTTCGCATTCAGATGCCACCTCGAATTCATCTACGATGTAGTAGCGATCAGACACTATAAGAATTTAGTTGTTTTTGTCTTATCATACGTTTACATCAAAAATTCTTA TTTTTGCTGTATTTCCGTTATTAATTTTTATCTGGACAGCAGTATGGAAAGAAAACTAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTTCGAAACTCGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTTTGCATTTTGATAACTTTCAGAGAGTTTGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCNAATTTTATTGTTACTATTATTACTCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD151663             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTCTGGAGTTTATGAACCCAAATTTTATTGTTACTATTATTACTCTTGATATATTTTTN TGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATGGTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAGATTTGTCTTCTAGACCCTTCCAATCACTTTCTTTAATATCTTCATACGAATTTTGCTATTTCTTTTGTTTCCGAACTAAATATTATGGTCTAGTCGTTGCGTTTTCGTGTTAATTTCTTGTGTTATCCTTTATGATTTTGTTCTTACCTTTCCCTTTTTCAATGTGTTGCTTAACGCTTTGTAGTCGATACTAAAATTGTGGTCTTTGTTTTGTATTCACAACTTATGCACACTTTTCCAACTCATATTTAATATTCATACGTTTAAGAGTGTCTCAATGGTTGGCTAGTCATCTTTTTTCCTGTTTCTTATCTTTCATGTTCAGTT]




>consensus_8895#0
CTATCATCTCAGTCGTACAGTAGTTTGAATTTTAATAGTTCAGTATGTGACAACTTTACT
AATATCAACCCACATTCAATATTCATGACATCTAATGAACCTAGTTGTTTTCAATTCGGG
ATGAGAAGTCCCACTGATGATAAGCCCAACTCTTTTGATTTCACTACATTTGGTCCCGTT
GGGTCTTCATCACCAGCCGGTGCTTTCATCCACTCAAATTTAATTAGTTCTAACTGCAAT
AGTTCTATCTTGTCAAATTTATCTTCAACAGGTTTACAGAGTAGACAAGTGTGTTTAGAT
TCACAAAATACTGATACCTTAATTTTTCCTATGATGTCTCCATCAGTTTCGCATTCAGAT
GCCACCTCGAATTCATCTACGATGTAGTAGCGATCAGACACTATAAGAATTGAGTTGTTT
TTGTCTTATCATACGTTTACATCAAAAATTCTTATTTTTGCTGTATTTCCGTTATTAATT
TTTATCTGGACAGCAGTATGGAAAGAAAACTAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTTC
GAAACTCGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTTTGCATTTTGATAACTTTCAGAGAGTT
TGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTATTGTTACTATTATTACTCTTGATA
TATTTTTTTGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATG
GTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAGATTTGTCTTCTAGACCCTTCCAATCAC
TTTCTTTAATATCTTCATACGAATTTTGCTATTTCTTTTGTTTCCGAACTAAATATTATG
GTCTAGTCGTTGCGTTTTCGTGTTAATTTCTTGTGTTATCCTTTATGATTTTGTTCTTAC
CTTTCCCTTTTTCAATGTGTTGCTTAACGCTTTGTAGTCGATACTAAAATTGTGGTCTTT
GTTTTGTATTCACAACTTATGCACACTTTTCCAACTCATATTTAATATTCATACGTTTAA
GAGTGTCTCAATGGTTGGCTAGTCATCTTTTTTCCTGTTTCTTATCTTTCATGTTCAGTT

consensusID : consensus_8895#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 315
fasta sequence

                              [TATGGAAACAAACTAAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTCCGAAACTAGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTGTGCGTTTTGATCCCTTTCAGAGAGTGTGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTACTGTTGCTACTATGACTCTTGATATATTTTTTTGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATGGTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAAAAATGTCTTCTAGACCCGCCGTCTATCTCAATACATTATTTAACTCGGACCCTGCAAC]

[-] EMBL BG930157             [TATGGAAACAAACTAAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTCCGAAACTAGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTGTGCGTTTTGATCCCTTTCAGAGAGTGTGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTACTGTTGCTACTATGACTCTTGATATATTTTTTTGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATGGTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAAAAATGTCTTCTAGACCCGCCGTCTATCTCAATACATTATTTAACTCGGACCCTGCAAC]




>consensus_8895#1
TATGGAAACAAACTAAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTCCGAAACTAGTGATTCGT
CTTACGGGGACCCAACTGTGCGTTTTGATCCCTTTCAGAGAGTGTGACCTTTTTTCTGGA
GTTTATGTACCCAAATTTTACTGTTGCTACTATGACTCTTGATATATTTTTTTGCGTTAT
TATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATGGTTTGTCTCAGCTGCC
TATTTGTCTCTTCTAAAAAATGTCTTCTAGACCCGCCGTCTATCTCAATACATTATTTAA
CTCGGACCCTGCAAC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8895#0      CTATCATCTCAGTCGTACAGTAGTTTGAATTTTAATAGTTCAGTATGTGACAACTTTACT 60
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      AATATCAACCCACATTCAATATTCATGACATCTAATGAACCTAGTTGTTTTCAATTCGGG 120
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      ATGAGAAGTCCCACTGATGATAAGCCCAACTCTTTTGATTTCACTACATTTGGTCCCGTT 180
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      GGGTCTTCATCACCAGCCGGTGCTTTCATCCACTCAAATTTAATTAGTTCTAACTGCAAT 240
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      AGTTCTATCTTGTCAAATTTATCTTCAACAGGTTTACAGAGTAGACAAGTGTGTTTAGAT 300
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      TCACAAAATACTGATACCTTAATTTTTCCTATGATGTCTCCATCAGTTTCGCATTCAGAT 360
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      GCCACCTCGAATTCATCTACGATGTAGTAGCGATCAGACACTATAAGAATTGAGTTGTTT 420
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      TTGTCTTATCATACGTTTACATCAAAAATTCTTATTTTTGCTGTATTTCCGTTATTAATT 480
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      TTTATCTGGACAGCAGTATGGAAAGAAAACTAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTTC 540
consensus_8895#1      ----------------TATGGAAACAAACTAAAGTTTTATCAACTGTTTAAGAGCTTTCC 44
                                      ******** ***   *************************** *

consensus_8895#0      GAAACTCGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTTTGCATTTTGATAACTTTCAGAGAGTT 600
consensus_8895#1      GAAACTAGTGATTCGTCTTACGGGGACCCAACTGTGCGTTTTGATCCCTTTCAGAGAGTG 104
                      ****** ************************** *** *******  ************ 

consensus_8895#0      TGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTATTGTTACTATTATTACTCTTGATA 660
consensus_8895#1      TGACCTTTTTTCTGGAGTTTATGTACCCAAATTTTACTGTTGCTACTATGACTCTTGATA 164
                      ************************************ **** *** *** **********

consensus_8895#0      TATTTTTTTGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATG 720
consensus_8895#1      TATTTTTTTGCGTTATTATATCGTAATCGGTCAACATAACAGCAGAATCTGCTTTAAATG 224
                      ************************************************************

consensus_8895#0      GTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAGATTTGTCTTCTAGACCCTTCCAATCAC 780
consensus_8895#1      GTTTGTCTCAGCTGCCTATTTGTCTCTTCTAAAAAATGTCTTCTAGACCCG-CCGTCTAT 283
                      ******************************** *  **************  **    * 

consensus_8895#0      TTTCTTTAATATCTTCATACGAATTTTGCTATTTCTTTTGTTTCCGAACTAAATATTATG 840
consensus_8895#1      CTCAATACATTATTTAACTCGGACCCTGCAAC---------------------------- 315
                       *   *  **   ** *  ** *   *** *                             

consensus_8895#0      GTCTAGTCGTTGCGTTTTCGTGTTAATTTCTTGTGTTATCCTTTATGATTTTGTTCTTAC 900
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      CTTTCCCTTTTTCAATGTGTTGCTTAACGCTTTGTAGTCGATACTAAAATTGTGGTCTTT 960
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      GTTTTGTATTCACAACTTATGCACACTTTTCCAACTCATATTTAATATTCATACGTTTAA 1020
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8895#0      GAGTGTCTCAATGGTTGGCTAGTCATCTTTTTTCCTGTTTCTTATCTTTCATGTTCAGTT 1080
consensus_8895#1      ------------------------------------------------------------