cluster # 8907

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Schistosoma mansoni
cluster # 8907 cluster # 8907 Sequences # 7 consensus # 2

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consensus_8907#0 length = 833 sequences # 4

consensus_8907#1 length = 805 sequences # 3

consensusID : consensus_8907#0
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Sequences nbr = 4
consensus length = 833
fasta sequence

                              [AGCTTAAACTGTGCTCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCTACAAAGATGCCACATATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCCTACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGGAGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCCATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAATGGCAAAGCGTCTAAACTCTACTCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATGCCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTTCACCAGATTTATGTGTAGCTTTAGTTGGTGGAATGGATTCGGGCAAATCAACATTAATTAGTGTATTAACTGATGGTGAATTGGATAATGCACGTGGTAAAGCACGATTAAATTTATTTCGTCATTTACATGAAGTACAATCAGGCCGTACAAGTAGTTTAAGTCGTGAATTATTAGGTTTTGATATAAATGGTCATGTTACTAATTATAAATATGCTGATGGTAGAGTATATCGACGTTCAACCGAAGAAATTGTTCGAATGTCATCCAACTTGTTAACATTACTTGATTTAGCTGGACATTCAAAATATCAACGTACAACATTAGCTGGTATTGCTTGTAATCAACCAATTATAGGGATTTTAGTCATCTCTGCAACTATTGGTTTAAGTAGTATAGGATCAAC]

[+] EMBL CD112619             [AGCTTAAACTGTGCTCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCTACAAAGATGCCACATATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCCTACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGGAGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCCATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAATGGCAAAGCGTCTAAACTCTACTCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATGCCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTTCACCAGATTTACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD167026             [                                                                                                                                                                                                      AAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATAATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCCATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAATGGCAAAGCGTCTAAACTCTACTCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATGCCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTTCACCAGATTTATGTGTAGCTTTAGTTGGTGGAATGGATTCGGGCAAATCAACATTAATTAGTGTATTAACTGATGGTGAATTGGATAATGCACGTGGTAAAGCACGATTAAATTTATTTCGTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD096142             [                                                                                                                                                                                                                                                                         TCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAATGGCAAAGCGTCTAAACTCTACTCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATGCCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTTCACCAGATTTATGTGTAGCTTTAGTTGGTGGAATGGATTCGGGCAAATCAACATTAATTAGTGTATTAACTGATGGTGAATTGGATAATGCACGTGGTAAAGCACGATTAAATTTATTTCGTCATTTACATGAAGTACAATCAGGCCGTACAAGTAGTTTAAGTCGTGAATTATTAGGTTTTGATATAAATGGTCATGTTACTAATTATAAATATGCTGATGGTAGAGTATATCGACGTTCAACCGAAGAAATTGTTCGAATGTCATCCAACTTGTTAACATTACTTGATTTAGCTGGACATTCAAAATATCAACG                                                                                          ]
[-] EMBL CD097008             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTTCACCAGATTTATGTGTAGCTTTAGTTGGTGGAATGGATTCGGGCAAATCAACATTAATTAGTGTATTAACTGATGGTGAATTGGATAATGCACGTGGTAAAGCACGATTAAATTTATTTCGTCATTCACATGAAGTACAATCAGGCCGTACAAGTAGTTTAAGTCGTGAATTATTAGGTTTTGATATAAATGGTCATGTTACTAATTATAAATATGCTGATGGTAGAGTATATCGACGTTCAACCGAAGAAATTGTTCGAATGTCATCCAACTTGTTAACATTACTTGATTTAGCTGGACATTCAAAATATCAACGTACAACATTAGCTGGTATTGCTTGTAATCAACCAATTATAGGGATTTTAGTCATCTCTGCAACTATTGGTTTAAGTAGTATAGGATCAAC]




>consensus_8907#0
AGCTTAAACTGTGCTCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCT
ACAAAGATGCCACATATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGG
AAATTGGTTGATCCTACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGT
CTTAATGAAGGTGGAGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTC
AGTGGACTTCGTCCATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAATGGCAAAG
CGTCTAAACTCTACTCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCA
TCAGATAAAGAATGCCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAAT
GATGGTTCACCAGATTTATGTGTAGCTTTAGTTGGTGGAATGGATTCGGGCAAATCAACA
TTAATTAGTGTATTAACTGATGGTGAATTGGATAATGCACGTGGTAAAGCACGATTAAAT
TTATTTCGTCATTTACATGAAGTACAATCAGGCCGTACAAGTAGTTTAAGTCGTGAATTA
TTAGGTTTTGATATAAATGGTCATGTTACTAATTATAAATATGCTGATGGTAGAGTATAT
CGACGTTCAACCGAAGAAATTGTTCGAATGTCATCCAACTTGTTAACATTACTTGATTTA
GCTGGACATTCAAAATATCAACGTACAACATTAGCTGGTATTGCTTGTAATCAACCAATT
ATAGGGATTTTAGTCATCTCTGCAACTATTGGTTTAAGTAGTATAGGATCAAC

consensusID : consensus_8907#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 805
fasta sequence

                              [TAAAACTATGGATAACAGCTCAGATAATGCCCACAACCCGTTCCTTAGCTTAAACTGTGCTCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCTACAAAGATGCCACATATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCCTACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGGAGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCCATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAACGGCAAAGCGTCTAAACTCTACTCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATGCCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTGTAAGTCGAATGTTATATTTAGTACTATTTTATCAAATTTTTTTCTTGTAATGTAACTCACCGAGTACATATCCGTGTACTCGGCTTTAGACTACACTAGGTGTGTGAGCTAATAAAATTCTAACCGGTTGCCTAAACCAAAGTAGGTAGGACAGTATTCAAACCTTTGACTAATAGTCAAAAATAGAGCGTTGTAGCTACCAGGCTATTTGTTCAGGCCAACTAGAAGTTTCGTTTTACAAAGTCTAANTAGTCTATACTAACTTTAATCTGAAAATAATTATCTNCACAAATTGATATTAACTGAAGAAAATCAGGGTATTAGACAGCGCC]

[+] EMBL CD119725             [TAAAACTATGGATAACAGCTCAGATAATGCCCACAACCCGTTCCTTAGCTTAAACTGTGCTCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCTACAAAGATGCCACATATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCCTACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGGAGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCCATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAA GGCAAAGCGTCTAAACTCTACTCTTCATCCCCTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD119707             [TAAAACTATGGATAACAGCTCAGATAATGTCCACAACCCGTTCCTTAGCTTAAACTGTGCTCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCTACAAAGATGCCACATATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCCTACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGGAGGCAAAGCCATTTATAAATTACGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCCATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACG ACGGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD189091             [                                                                                                                                                          GAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCCTACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGGAGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCCATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAATGGCAAAGCGTCTAAACTCTACTCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATGCCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTGTAAGTCGAATGTTATATTTAGTACTATTTTATCAAATTTTTTTCTTGTAATGTAACTCACCGAGTACATATCCGTGTACTCGGCTTTAGACTACACTAGGTGTGTGAGCTAATAAAATTCTAACCGGTTGCCTAAACCAAAGTAGGTAGGACAGTATTCAAACCTTTGACTAATAGTCAAAAATAGAGCGTTGTAGCTACCAGGCTATTTGTTCAGGCCAACTAGAAGTTTCGTTTTACAAAGTCTAANTAGTCTATACTAACTTTAATCTGAAAATAATTATCTNCACAAATTGATATTAACTGAAGAAAATCAGGGTATTAGACAGCGCC]




>consensus_8907#1
TAAAACTATGGATAACAGCTCAGATAATGCCCACAACCCGTTCCTTAGCTTAAACTGTGC
TCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCTACAAAGATGCCACA
TATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCC
TACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGG
AGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCC
ATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAACGGCAAAGCGTCTAAACTCTAC
TCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATG
CCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTGTAAGTCG
AATGTTATATTTAGTACTATTTTATCAAATTTTTTTCTTGTAATGTAACTCACCGAGTAC
ATATCCGTGTACTCGGCTTTAGACTACACTAGGTGTGTGAGCTAATAAAATTCTAACCGG
TTGCCTAAACCAAAGTAGGTAGGACAGTATTCAAACCTTTGACTAATAGTCAAAAATAGA
GCGTTGTAGCTACCAGGCTATTTGTTCAGGCCAACTAGAAGTTTCGTTTTACAAAGTCTA
ANTAGTCTATACTAACTTTAATCTGAAAATAATTATCTNCACAAATTGATATTAACTGAA
GAAAATCAGGGTATTAGACAGCGCC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8907#0      ----------------------------------------------AGCTTAAACTGTGC 14
consensus_8907#1      TAAAACTATGGATAACAGCTCAGATAATGCCCACAACCCGTTCCTTAGCTTAAACTGTGC 60
                                                                    **************

consensus_8907#0      TCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCTACAAAGATGCCACA 74
consensus_8907#1      TCCCAATAGTCGCATATGTGGTAGCTACAGCTGTGGAAGCATCTCTACAAAGATGCCACA 120
                      ************************************************************

consensus_8907#0      TATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCC 134
consensus_8907#1      TATTCTTCCTCCTGAGATAGAAGAAGGGAATATTGAGTATAAACGGAAATTGGTTGATCC 180
                      ************************************************************

consensus_8907#0      TACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGG 194
consensus_8907#1      TACACCAAATCGTTTTGAACAGCTTGTTACTCAAATGAAATGGCGTCTTAATGAAGGTGG 240
                      ************************************************************

consensus_8907#0      AGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCC 254
consensus_8907#1      AGGCAAAGCCATTTATAAATTAGGTGTAGATGATGATGGTCATGTCAGTGGACTTCGTCC 300
                      ************************************************************

consensus_8907#0      ATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAATGGCAAAGCGTCTAAACTCTAC 314
consensus_8907#1      ATCTGAATTAATCAGTTCGTTAACAACACTTGAACGAACGGCAAAGCGTCTAAACTCTAC 360
                      ************************************** *********************

consensus_8907#0      TCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATG 374
consensus_8907#1      TCTTCATCCCCTCAGAGAGTGTGTTATTGAACCAACAACTATTTCATCAGATAAAGAATG 420
                      ************************************************************

consensus_8907#0      CCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTTCA--CCA 432
consensus_8907#1      CCGTAAAGCTATTGAAGTGCTTGTTCGTCTAGCGCCGACAACTAATGATGGTGTAAGTCG 480
                      ****************************************************  *   * 

consensus_8907#0      GAT-TTATGTGTAGCTTTAGTTGGTGGAATGGATTCGGGCAAATCAACATTAATTAGTGT 491
consensus_8907#1      AATGTTATATTTAGTACTATTTTATCAAATTTTTTTCTTGTAATGTAACTCACCGAGTAC 540
                       ** **** * ***   ** **  *  ***   **      ***  *  * *   ***  

consensus_8907#0      ATTAACTGATGGTGAATTGGATAATGCACGTGGTAAA-GCACGATTAAATTTATTTCGTC 550
consensus_8907#1      ATATCCGTGTACTCGGCTTTAGACTACACTAGGTGTGTGAGCTAATAAAATT--CTAACC 598
                      **   *   *  *    *  * * * ***  ***    *  * * **** **   *   *

consensus_8907#0      ATTTACATGAAGTACAATCAGGCCGTACAAGTAGTTTAAGTCGTGAATTATTAGGTTTTG 610
consensus_8907#1      GGTTGCCTAAACCA-AAGTAGGTAGGACA-GTA-TTCAAACCTTTGACTAATAG--TCAA 653
                        ** * * **  * **  ***  * *** *** ** **  * *  * ** ***  *   

consensus_8907#0      ATATAAATGGTCATGTTACTAATTATAAATATGCTGATGGTAGAGTATATCGACGTTCAA 670
consensus_8907#1      AAATAGAGCGT--TGTAGCTACCAGGCTATTTGTTCAGGCCAACTAGAAGTTTCGTTTTA 711
                      * *** *  **  ***  ***       ** ** * * *  *      *    ****  *

consensus_8907#0      CCGAAG--AAATTGTTCGAATGTCATCCAACTTGTTAACATTACTTGATTTAGCTGGACA 728
consensus_8907#1      CAAAGTCTAANTAGTCTATACTAACTTTAATCTGAAAATAATTATCTNCACAAATTGATA 771
                      *  *    ** * **    *     *  **  **  ** * *  *      *  * ** *

consensus_8907#0      TTCAAAATATCAACGTACAACATTAGCTGGTATTGCTTGTAATCAACCAATTATAGGGAT 788
consensus_8907#1      TTAACTGAAGAAAATCAGGGTATTAGACAGCGCC-------------------------- 805
                      ** *    *  **   *    *****   *                              

consensus_8907#0      TTTAGTCATCTCTGCAACTATTGGTTTAAGTAGTATAGGATCAAC 833
consensus_8907#1      ---------------------------------------------