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Schistosoma mansoni
cluster # 8916 cluster # 8916       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8916#0 length = 1229 sequences # 8  
consensusID : consensus_8916#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1229
fasta sequence 
                              [CGATTTATCAGGAGCCTTAGGGACCTATAAGTCCCTTCGGAGACTGACCAATCTCGATAAAAGCACTACACTGCATGCTTGTTTCCTGGCCCAGGAGTCACGAGATATTTCGGAAGTTGAGTTCTGGTCCGGTGTAGCACAAGACATGTTTCCTTCCGAGAAAATAACATTTCTGTTAAAAGAAAAGGTCTTGACTCGTGGCGACAAGGTCCCAGAATTGTTAAAACTGTTGGAATCTCAGTTGCAAAAAGATGAGAGTGATTCCGAAGTCTGTATTCGACTTGTAAACTTGCTTTACAAGTCAGGATCCGTCGTAGATGGATTTTCACGCTGTTTGAATTGCATCAACGCTGGACGGCATTTCGGTATTGCTAGCTGGTTTCATAACTGCCTGAGTCTTCTAGAACCTGCAAAACTTCCTATCCCTAAAGCAGATCTACCTTTGGAGTCGTTGTATTTGGTTCGTACAGTTTGTTTGATGGAGTTGATTCGTGTGACATCACAAACCTCCTGTTTGTCTGATATGCATCAGTTACTCATACAGCTGGAAGCAGTTTCTAGTGAACTTAGTAAGTTACAGTCTAAAGGTTCAAACACCCTTAATGAGTTCGCTGTCATTTGGCTTAATTTCTAT-GGTGGTGTTTATGCTCAACGGCGTTTCATGAATG-AATGTACTGAGTCCACAGATTTTCCACACTTCCTCGCATTCCACTTTTATCAACGTGTAAGTAATGCTCGACATCCCGATGTTACCCCTGGATCTTCCAATATCTCTGCTTCACTTCGACATCATCTTCGCCGAGAGTGTTCCTCAATTTGTGCTCAGGCTACTTACCTGGTTCACTTATTTTCAGCCTCACTTGATAAAACGAAACCCACTAAGGAGAACGCGATCAGCTTGAATTCTTTAACGTGGAAGGAGCTAATTAGTTTAACTGATGGGGTTATGTCTGAAAACTTTCCATTGGATACATATCGTTTTGATACAGTTGGCCAGAAAACATCTAAAACCTTTGAAATGCATGGTTCCCTTGACGAATACTTAACATCTCCCGATTGTTTAAATCTTATAATGTGGATTTGTGCTCAACAGTTATCATTCTTGAATGTAAGTGACGAGGATTTTACTCTCAGCTTGCCTAGACTGGAATTTCTGCTTAAATCGGTCAAAAGACTATTTCCTAAGTTGGAATTTTCTTATCCATCACCTGTTTTTGGATTACCTACTG]

[+] EMBL CD168143             [CGATTTATCAGGAGCCTTAGGGACCTATAAGTCCCTTCGGAGACTGACCAATCTCGATAAAAGCACTACACTGCATGCTTGTTTCCTGGCCCAGGAGTCACGAGATATTTCGGAAGTTGAGTTCTGGTCCGGTGTAGCACAAGACATGTTTCCTTCCGAGAAAATAACATTTCTGTTAAAAGAAAAGGTCTTGACTCGTGGCGACAAGGTCCCAGAATTGTTAAAACTGTTGGAATCTCAGTTGCAAAAAGATGAGAGTGATTCCGAAGTCTGTATTCGACTTGTAAACTTGCTTTACAAGTCAGGATCCGTCGTAGATGGATTTTCACGCTGTTTGAATTGCATCAACGCTGGACGGCATTTCGGTATTGCTAGCTGGTTTCATAACTGCCTGAGTCTTCTAGAACCTGCAAAACTTCCTATCCCTAAAGCAGATCTACCTTTGGAGTCGTTGTATTTGGTTCGTACAGTTTGTTTGATGGAGTTGATTCGTGTGACATCACAAACCTCCTGTTTGTCTGATATGCATCAGTTACTCATACAGCTGGAAGCAGTTTCTAGTGAACTTAGTAAGTTACAGTCTAAAGGTTCAAACACCCTTAATGAGTTCGCTGTCATTTGGCTTAATTTCTATGGGTGGTGTTTATACTCAACGGCGTTTCATGAATG AATGTACTGAGTCCACAGATTNTCCACACTTNCTCGCATT CACTNTTATCAACGTGTAAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD198826             [   TTTATCAGGAGCCTTAGGGACCTATAAGTCCCTTCGGAGACTGACCAATCTCGATAAAAGCACTACACTGCATGCTTGTTTCCTGGCCCAGGAGTCACGAGATATTTCGGAAGTTGAGTTCTGGTCCGGTGTAGCACAAGACATGTTTCCTTCCGAGAAAATAACATTTCTGTTAAAAGAAAAGGTCTTGACTCGTGGCGACAAGGTCCCAGAATTGTTAAAACTGTTGNGATCTCAGTTGCAAAAAGATGAGAGTGATTCTGAAGTCTGTATTCGACTTGTAAACTTGCTTTACAAGTCAGGATCCGTCGTAGATGGATTTTCACGCTGTTTGAATTGCATnc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD149410             [                                                                                  ttagTGGCACAGGAGCCATGAGATATTTCGGAAGTTGAGTTCTGGTCCGGTGTAGCACAAGACATGTTTCCTTCAGAGAAAATAACATTTTTGTTAAAAGAAAAGGTGTTGACTCGTGGTGACAAGGTCCCACCATTGTTAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD168179             [                                                                                                                                              GACATGTTTCCTTCCGAGAAAATAACATTTCTGTTAAAAGAAAAGGTCTTGACTCGTGGCGACAAGGTCCCAGAATTGTTAAAACTGTTGGAATCTCAGTTGCAAAAAGATGAGAGTGATTCCGAAGTCTGTATTCGACTTGTAAACTTGCTTTACAAGTCAGGATCCGTCGTAGATGGATTTTCACGCTGTTTGAATTGCATCAACGCTGGACGGCATTTCGGTATTGCTAGCTGGTTTCATAACTGCCTGAGTCTTCTAGAACCTGCAAAACTTCCTATCCCTAAAGCAGATCTACCTTTGGAGTCGTTGTATTTGGTTCGTACAGTTTGTTTGATGGAGTTGATTCGTGTGACATCACAAATCTCCTGTTTGTCTGATATGCATCAGTTACTCATACAGCTGGAAGCAGTTTCTAGTGAACTTAGTAAGTTACAGTCTAAAGGTTCAAACACCCTTAATGAGTTCGCTGTCATTTGGCTTAATTTCTAT GGTGGTGTTTATACTCAACGGCGTTTCACGAATG AATGTACTGAGTCTACAGATTTTCCACACTTCCTCGCATTCCACTTTTATCAACGTGTAAGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD070133             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTGCATCAACGCTGGACGGCATTTCGGTATTGCTAGCTGGTTTCATAACTGCCTGAGTCTTCTAGAACCTGCAAAACTTCCTATCCCTAAAGCAGATCTACCTTTGGAGTCGTTGTATTTGGTTCGTACAGTTTGTTTGATGGAGTTGATTCGTGTGACATCACAAACCTCCTGTTTGTCTGATATGCATCAGTTACTCATACAGCTGGAAGCAGTTTCTAGTGAACTTAGTAAGTTACAGTCTAAAGGTTCAAACACCCTTAATGAGTTCGCTGTCATTTGGCTTAATTTCTAT GGTGGTGTTTATGCTCAACGGCGTTTCATGAATG AATGTACTGAGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD198817             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GGACGGCATTTCGGTATGNCTAGCTGGTTTCATAACTGCCCGAGTCTTCTAGAACCTGCAAAACTTCCTATCCCTAAAGCAGATCTACCTTTGGAGTCGTTGTATNTGGTTCGTACAGTTTGTTTGATGGAGTTGATTCGTGTGACATCACAAACCTCCTGTTTGTCTGATATGCATCAGTTACTCATACAGCTGGAAGCAGTTTCTAGTGAACTTAGTAAGTTACAGTCTAAAGGTTCAAACACCCTTAATGAGTTCGCTGTCATTTGGCTTAATTTCTAT GGTGGTGTTTATGCTCAACGGCGTTTCATGAATG AATGTACTGAGTCCACAGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD131140             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACCTGCAAAACTTCCTATCCCTAAAGCAGATCTACCTTTGGAGTCGTTGTATTTGGTTCGTACAGTTTGTTTGATGGAGTTGATTCGTGTGACATCACAAACCTCCTGTTTGTCTGATATGCATCAGTTACTCATACAGCTGGAAGCAGTTTCTAGTGAACTTAGTAAGTTACAGTCTAAAGGTTCAAACACCCTTAGTGAGTTCGCTGTCATTTGGCTTAATTTCTAT GGTGGTGTTTATGCTCAACGGCGTTTCATGAATG AATGTACTGAGTCCACAGATTTTCCACACTTCCTCGCATTCCACTTTTATCAACGTGTAAGTAATGCTCGACATCCCGATGTTACCCCTGGATCTTCCAATATCTCTGCTTCACTTCGACATCATCTTCGCCGAGAGTGTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD118579             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCG TTCATGAATGNAATGTACTGAGTCCACAGATTTTCCACACTTCCTCGCATTCCACTTTTATCAACGTGTAAGTAATGCTCGACATCCCGATGTTACCCCTGGATCTTCCAATATCTCTGCTTCACTTCGACATCATCTTCGCCGAGAGTGTTCCTCAATTTGTGCTCAGGCTACTTACCTGGTTCACTTATTTTCAGCCTCACTTGATAAAACGAAACCCACTAAGGAGAACGCGATCAGCTTGAATTCTTTAACGTGGAAGGAGCTAATTAGTTTAACTGATGGGGTTATGTCTGAAAACTTTCCATTGGATACATATCGTTTTGATACAGTTGGCCAGAAAACATCTAAAACCTTTGAAATGCATGGTTCCCTTGACGAATACTTAACATCTCCCGATTGTTTAAATCTTATAATGTGGATTTGTGCTCAACAGTTATCATTCTTGAATGTAAGTGACGAGGATTTTACTCTCAGCTTGCCTAGACTGGAATTTCTGCTTAAATCGGTCAAAAGACTATTTCCTAAGTTGGAATTTTCTTATCCATCACCTGTTTTTGGATTACCTACTG]




>consensus_8916#0
CGATTTATCAGGAGCCTTAGGGACCTATAAGTCCCTTCGGAGACTGACCAATCTCGATAA
AAGCACTACACTGCATGCTTGTTTCCTGGCCCAGGAGTCACGAGATATTTCGGAAGTTGA
GTTCTGGTCCGGTGTAGCACAAGACATGTTTCCTTCCGAGAAAATAACATTTCTGTTAAA
AGAAAAGGTCTTGACTCGTGGCGACAAGGTCCCAGAATTGTTAAAACTGTTGGAATCTCA
GTTGCAAAAAGATGAGAGTGATTCCGAAGTCTGTATTCGACTTGTAAACTTGCTTTACAA
GTCAGGATCCGTCGTAGATGGATTTTCACGCTGTTTGAATTGCATCAACGCTGGACGGCA
TTTCGGTATTGCTAGCTGGTTTCATAACTGCCTGAGTCTTCTAGAACCTGCAAAACTTCC
TATCCCTAAAGCAGATCTACCTTTGGAGTCGTTGTATTTGGTTCGTACAGTTTGTTTGAT
GGAGTTGATTCGTGTGACATCACAAACCTCCTGTTTGTCTGATATGCATCAGTTACTCAT
ACAGCTGGAAGCAGTTTCTAGTGAACTTAGTAAGTTACAGTCTAAAGGTTCAAACACCCT
TAATGAGTTCGCTGTCATTTGGCTTAATTTCTATGGTGGTGTTTATGCTCAACGGCGTTT
CATGAATGAATGTACTGAGTCCACAGATTTTCCACACTTCCTCGCATTCCACTTTTATCA
ACGTGTAAGTAATGCTCGACATCCCGATGTTACCCCTGGATCTTCCAATATCTCTGCTTC
ACTTCGACATCATCTTCGCCGAGAGTGTTCCTCAATTTGTGCTCAGGCTACTTACCTGGT
TCACTTATTTTCAGCCTCACTTGATAAAACGAAACCCACTAAGGAGAACGCGATCAGCTT
GAATTCTTTAACGTGGAAGGAGCTAATTAGTTTAACTGATGGGGTTATGTCTGAAAACTT
TCCATTGGATACATATCGTTTTGATACAGTTGGCCAGAAAACATCTAAAACCTTTGAAAT
GCATGGTTCCCTTGACGAATACTTAACATCTCCCGATTGTTTAAATCTTATAATGTGGAT
TTGTGCTCAACAGTTATCATTCTTGAATGTAAGTGACGAGGATTTTACTCTCAGCTTGCC
TAGACTGGAATTTCTGCTTAAATCGGTCAAAAGACTATTTCCTAAGTTGGAATTTTCTTA
TCCATCACCTGTTTTTGGATTACCTACTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)