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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8922#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 999 fasta sequence
[TGTGATTTGTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTCAGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAACATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAACTCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACTCATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGAGACAATAA-CCTGCGTGATGATGTCTATG-AAAT-AAATCAT-ACATGT-CCAATT-AAAGATATAT]
[+] EMBL AI977230 [TGTGATTTGTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTCAGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAACATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAACTCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGNGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGT ]
[+] EMBL AI976931 [ GATTTGTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTCAGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAACATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAACTCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGG ]
[+] EMBL CD082604 [ GTTGCATGAATGTGGATAAAACCTTGCTTAACAGGACTTTTGTTCGTAGTTCAGTGTTGGAAACACTAAGATGTCCTGAAACTAGAACAAATGCGTCTCCAAAAGTTGAAAACATTAATCTCTCTGGCCAAGAGATAAAAAATTTCTATGAATCTCTTACACAGTGCGTAACTCAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTNTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTNTGGA ]
[+] EMBL CD080081 [ CAAAAAATTGAATACTCATCACTTGATTCAAATTTAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACTCATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCC ATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGNTTTGTCG AATCGAGAT AAGTGAGAC ATAA CCTGCGTGATGATGTCTATG AAAT AAATCAT ACATGT CCAATT AAAGATA ]
[-] EMBL BF936092 [ TAATTAAATGTTCCGTATGTGGTGGCTCTTTTAATGATTTTAAGAAACACGTTTCATCTATTGGTCATCAAGTAGCTGAGATGTCAAACAAAAGTTCAAAACCATCGCCGCTGTTAATTCCTCCTTCAAATAAAGGTTATCAACTTTTAAGTAGAATAGGTTGGCGTGATGCTGCCCTCGATCCAGAATGTGAAGAACTGAAAACTTTGAAAGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTTTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTTTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAAATGTGAGACGACTTCGTCACTCATCCATTAAAATGGACTCGAAATA ]
[-] EMBL CD076198 [ AGTACTATCTGACAATTCAACTAACGAGTCTAAATCACATTTCTGCATTAAAAACGGCGGTTTGGGTGCTCTCAGACAAGGTCGACGCTTTCCTGTAGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGGTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACTCATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGAGACAATAACCCTGCGTGATGATGTCTATGAAAATAAAATCATAACATGTCCCAATTAAAAGA ATAT]
[-] EMBL CD147836 [ AGCAACTGTCTTAAAACGCGATCGTCTTGTTTTTGGATGGCCAAATACAACAAATACTGCAAGAATTACACATTTCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACACATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGAGACAATAA CCctagttgc ]
[-] EMBL CD111306 [ TCAACCCAGGTGATTTAAAAGCAGTTGAACATCCTAAAGATGTGAGACGACTTCGTCACACATCCATTAAAATGGACTCGAAATATTTGATAAGAAAAATGAATTTAGAGAAGAAAAAAGAACGTATTATAAGACAAGGGTTTAATTTGACTGATGAACAGTTAGCTTTGCTTTATGACAAATAAACGTTTGAATCATTTCATATTAAGTATAGCTATTTTCTTCAGTATATACTGTACATAACTATCGAATTTATTTAAATCTATGTCCCAATTCCTGTCAATTCTGTGTTAAATCTGTTACATTATTTGCTGCTGTTTTGTCGAAATCGAGATAAAGTGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||