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Schistosoma mansoni
cluster # 8926 cluster # 8926       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8926#0 length = 974 sequences # 8  

consensusID : consensus_8926#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 974
fasta sequence
                              [CATCACGTGATGAGAACCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTA-TTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACGGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTACCATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG-TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAA-TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTTTCCTAATCATCAGGAGGGAGAAAGAGGAGAAGAGAGAGCAATATTGAAAGTGAATAAAAATAATAAATATCAATTATGCTATTTATTAAAACAATATCCTTNC]

[-] EMBL CD127110             [CATCACGTGATGAGAACCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTA TTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACGGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTACCATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTGTTTTTTTAACTTTTATCTGCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD166887             [                aCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTATTTGCGAAACACTGTGCAAAGTGTACAAAACTGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTAACATTTGAAGACAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCNTAAATGATATAAGT AGAATGAG AAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCAT AAAATACACAAANAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGGATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD186920             [                                                                                                                                 GGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAAAGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGAACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGATATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD091425             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAAAAATACACAAAAAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAA TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTTTCCTAATCATCAGGAGGGAGAAAGAGGAGAAGAGAGAGCAATATTGAAAGTGAATAAAAATAATAAATATCAATTATGCTATTTATTAAAACAATATCCTTNC]
[-] EMBL SMRAP019             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gbyAGTTGACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATAMASATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL SM3741               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTACTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTTTATTAACGATCCAAATTGTCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD201309             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTAAGTTTTTATTTTCAGTCATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTG TTTTTAAACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCGA TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTCGACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTT                                                                                                       ]
[+] EMBL AI618820             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTATCTGCTTATTTTTAATAACGTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAAGTCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGCTTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTATTGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCT                                                                                                                                             ]


>consensus_8926#0 CATCACGTGATGAGAACCCTTATTGTGCAGATTGCTATACACAATTATTGCGAAACACTG TGCAAAGTGTACAAAACGGATTAGTGGTTTTGGCGGTTGCAAATTTGTACCATTTGAAGA CAAACATTGGCATTCTGATTGTTTCAACTGTAGTAAATGCCAAAATAGTCTGGTAGGCAA AGGATTCCTTGTTTCGGATGATGGGGTTGTTTGTCCTGAATGTGCAAGATAATGAAATGA ACACATATATACACAAATAGACACAAAATCACAAAGACTATAATAAAAAGCCTAAATGAT ATCAGTAAGAATGAGAAAAAAACTTTCAACACTTTCAGTACAATCATAAAAATACACTAA AAGTTAACATACATGATTATGTTTTGTGGTTTTCCTCATTAATATACATTTATGTATTTA CTTATTGTAAGCTGATTTGCTCTCTTTGGTATCTGCTTCCCTTTTATTTATTCACCAGTT TATTAACGATCCAAATTGTCCTTCATCTGAATGTTGCATAATTAAGTTTTTATTTTCAGT CATTTTATTGATGATATTTATAGTACTTATGTCGTTTATAAGTAGCTTCTACTGTTTTTA AACTTTTATCTGCTTATTTTTAATAACCTACATTTCACTCCGAAATTAAATTGTCTCCAA TCGATTCCGAAGTTACTTAAACATTAACCTATACATTTACACTTCATGGTATCTTTTCGC TTGATCACATGTATGAACTTTGCAGATAATTTCTTTATACAATTTGTATCAGATCATTAT TGTGGATCGACATAAAGAAAAGTTGATCTGTTGACATGTAATACTTAACTTCTTAAATTC GACTTTCACTATTGTTTGTTATCAAGATCTTTCCTAATCATCAGGAGGGAGAAAGAGGAG AAGAGAGAGCAATATTGAAAGTGAATAAAAATAATAAATATCAATTATGCTATTTATTAA AACAATATCCTTNC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)