These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8941#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 639 fasta sequence [CATACCAGATCCAGTGACAACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACACCAACCACAACATCCAGGTTTACATCTCCAACATGCCCATATTAAAGCAGAAATTAATAATAACAAAGCTAATAATAATCCAGCTAATAGACCATCAATCATAGCACCGCCTAAACCGAATAGTCCACCAGCTTGAGAAAGAATCAATCCAGTACCAGCATTAATTCCAGTTGCACCGGCACCATAAATATTACCATCGGATATATGAAG] [+] EMBL CD170767 [CATACCAGATCCAGTGACAACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGC ] [+] EMBL CD124855 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ] [+] EMBL CD124862 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCGTACCTTCCATATCGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ] [+] EMBL CD124974 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTGTGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ] [+] EMBL CD124976 [ ACATATTTACTATTCTTAGCAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ] [+] EMBL CD124982 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTCACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ] [+] EMBL CD124868 [ ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC ] [-] EMBL CD197475 [ TGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTAAACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACACCAACCACAACATCCAGGTTTACATCTCCAACATGCCCATATTAAAGCAGAAATTAATAATAACAAAGCTAATAATAATCCAGCTAATAGACCATCAATCATAGCACCGCCTAAACCGAATAGTCCACCAGCTTGAGAAAGAATCAATCCAGTACCAGCATTAATTCCAGTTGCACCGGCACCATAAATATTACCATCGGATATATGAAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||