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Schistosoma mansoni
cluster # 8941 cluster # 8941       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8941#0 length = 639 sequences # 8  

consensusID : consensus_8941#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 639
fasta sequence
                              [CATACCAGATCCAGTGACAACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACACCAACCACAACATCCAGGTTTACATCTCCAACATGCCCATATTAAAGCAGAAATTAATAATAACAAAGCTAATAATAATCCAGCTAATAGACCATCAATCATAGCACCGCCTAAACCGAATAGTCCACCAGCTTGAGAAAGAATCAATCCAGTACCAGCATTAATTCCAGTTGCACCGGCACCATAAATATTACCATCGGATATATGAAG]

[+] EMBL CD170767             [CATACCAGATCCAGTGACAACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD124855             [                   ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD124862             [                   ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCGTACCTTCCATATCGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD124974             [                   ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTGTGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD124976             [                   ACATATTTACTATTCTTAGCAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD124982             [                   ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTCACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD124868             [                   ACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTTCATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATCAATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATTATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTGTAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACAC                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD197475             [                                                                                                                                                                                                                                                               TGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTAAACCTACGTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGCAGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTTACCAGCACACCAACCACAACATCCAGGTTTACATCTCCAACATGCCCATATTAAAGCAGAAATTAATAATAACAAAGCTAATAATAATCCAGCTAATAGACCATCAATCATAGCACCGCCTAAACCGAATAGTCCACCAGCTTGAGAAAGAATCAATCCAGTACCAGCATTAATTCCAGTTGCACCGGCACCATAAATATTACCATCGGATATATGAAG]


>consensus_8941#0 CATACCAGATCCAGTGACAACATATTTACTATTCTTAGTAATGACAACACAATCAACTTT CATACCTTCCATATTGTAAACATTTTGACGAGCGCTTAAATCATCCATTACTGGTTGATC AATACGTATAGTGGAAATACCTGATGCTCCAATTTGATCTGTGAGATCCAATCTATGATT ATGTCCTATAGGATAACTGGTTACCGATAGAGGTGCTTTAACTATACGTGATTGTGTTTG TAATGATTGTAGACTTGTTGCAGTCATACCACCAGTCGCTGCTCCATCTACTATACCTAC GTTACCGTTGTCACTCAGTAAATGTTTCTTTTCTTTGACAATAATAGCACTTTCAGGAGC AGCACAACATATAGCAGCTAATCGACTCCATGCACTACGTCCAGCTAATCCATTTGATTT ACCAGCACACCAACCACAACATCCAGGTTTACATCTCCAACATGCCCATATTAAAGCAGA AATTAATAATAACAAAGCTAATAATAATCCAGCTAATAGACCATCAATCATAGCACCGCC TAAACCGAATAGTCCACCAGCTTGAGAAAGAATCAATCCAGTACCAGCATTAATTCCAGT TGCACCGGCACCATAAATATTACCATCGGATATATGAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)