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Schistosoma mansoni
cluster # 8945 cluster # 8945       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8945#0 length = 1142 sequences # 8  

consensusID : consensus_8945#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1142
fasta sequence
                              [ATCATTCTTCAGTATCTTGATAATGTATCTTTCTTTCCAGTCTTTGATATTAGTTTTCCTTCACAAATCTTTGTGAAGAGGACGTGACTCATCTTTGCAGTTACCCCCATATCTGATTTCAACGCTTCGGCTGATATGTCGTTTGATTCTGCTGCTTTGACATTTTTGGTTTTTTTGAATGGCTTTGTTGATTTCCGATATTGGCAAGATATAATCCGTTAGGATGTTTGCTTGTGCGGCTTCGATATCCAATGGATTCAGAGGTCCCGTTCTATTCAAGAACTCTTAAAGTGCTTTACTGATCGGTTCTTCTGATATCAAACCCAAATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGGTCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTTCAGTTTCAGTCAGACCACCACCAGTTGGTGATCTGAAGCTATATTAGCTTCTTTGTTTGTTTCTATGACTTCCATGAACCCCATGAATTTTTTATTTATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATACC]

[+] EMBL CD068663             [ATCATTCTTCAGTATCTTGATAATGTATCTTTCTTTCCAGTCTTTGATATTAGTTTTCCTTCACAAATCTTTGTGAAGAGGACGTGACTCATCTTTGCAGTTACCCCCATATCTGATTTCAACGCTTCGGCTGATATGTCGTTTGATTCTGCTGCTTTGACATTTTTGGTTTTTTTGAATGGCTTTGTTGATTTCCGATATTGGCAAGATATAATCCGTTAGGATGTTTGCTTGTGCGGCTTCGATATCCAATGGATTCAGAGGTCCCGTTCTATTCAAGAACTCTTAAAGTGCTTTACTGATCGGTTCTTCTGATATCAAACCCAAATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD095076             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTGTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD094615             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD094752             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD094637             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTG TTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGGTCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD095136             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTCTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTG TTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAAGGTATCAATAAGGGTTCATGGTTTATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD169361             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGGTCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTTCAGTTTCAGTCAGACCACCACCAGTTGGTGATCTGAAGCTATATTAGCTTCTTTGTTTGTTTCTATGACTTCCATGAACCCCATGAATTTTTTATTTATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATAC ]
[-] EMBL CD169740             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATACC]


>consensus_8945#0 ATCATTCTTCAGTATCTTGATAATGTATCTTTCTTTCCAGTCTTTGATATTAGTTTTCCT TCACAAATCTTTGTGAAGAGGACGTGACTCATCTTTGCAGTTACCCCCATATCTGATTTC AACGCTTCGGCTGATATGTCGTTTGATTCTGCTGCTTTGACATTTTTGGTTTTTTTGAAT GGCTTTGTTGATTTCCGATATTGGCAAGATATAATCCGTTAGGATGTTTGCTTGTGCGGC TTCGATATCCAATGGATTCAGAGGTCCCGTTCTATTCAAGAACTCTTAAAGTGCTTTACT GATCGGTTCTTCTGATATCAAACCCAAATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTA TCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATAT TCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTAC CACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTG CTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAA TCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCC CTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGT TTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAA TTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGG TCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTTCAGTTTCAGTCAGACCACCACCAGTTGGTGATC TGAAGCTATATTAGCTTCTTTGTTTGTTTCTATGACTTCCATGAACCCCATGAATTTTTT ATTTATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTT GTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTA CAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATA CC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)