These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8945#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1142 fasta sequence [ATCATTCTTCAGTATCTTGATAATGTATCTTTCTTTCCAGTCTTTGATATTAGTTTTCCTTCACAAATCTTTGTGAAGAGGACGTGACTCATCTTTGCAGTTACCCCCATATCTGATTTCAACGCTTCGGCTGATATGTCGTTTGATTCTGCTGCTTTGACATTTTTGGTTTTTTTGAATGGCTTTGTTGATTTCCGATATTGGCAAGATATAATCCGTTAGGATGTTTGCTTGTGCGGCTTCGATATCCAATGGATTCAGAGGTCCCGTTCTATTCAAGAACTCTTAAAGTGCTTTACTGATCGGTTCTTCTGATATCAAACCCAAATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGGTCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTTCAGTTTCAGTCAGACCACCACCAGTTGGTGATCTGAAGCTATATTAGCTTCTTTGTTTGTTTCTATGACTTCCATGAACCCCATGAATTTTTTATTTATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATACC] [+] EMBL CD068663 [ATCATTCTTCAGTATCTTGATAATGTATCTTTCTTTCCAGTCTTTGATATTAGTTTTCCTTCACAAATCTTTGTGAAGAGGACGTGACTCATCTTTGCAGTTACCCCCATATCTGATTTCAACGCTTCGGCTGATATGTCGTTTGATTCTGCTGCTTTGACATTTTTGGTTTTTTTGAATGGCTTTGTTGATTTCCGATATTGGCAAGATATAATCCGTTAGGATGTTTGCTTGTGCGGCTTCGATATCCAATGGATTCAGAGGTCCCGTTCTATTCAAGAACTCTTAAAGTGCTTTACTGATCGGTTCTTCTGATATCAAACCCAAATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCT ] [+] EMBL CD095076 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTGTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTAT ] [+] EMBL CD094615 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACT ] [+] EMBL CD094752 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTGTTTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATC ] [+] EMBL CD094637 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTTTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTG TTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAGGGTATCAATAAGGTTTCATGTTTTATTCTGGTGCTTATCGAAATCAACCCCTCCTGACATGTTGGCGTTACCACTTCTTTAATCTTTTCCTAGCTGTCTGCCATGGTGGTTTCCATTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGGTCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTT ] [+] EMBL CD095136 [ ATGATTGGTTGCCATCTTTACCCTTCACTGGTATCTCTGGCTTGTCGTATTCTTCTGAGAGCTCCTTGGTTGCATCATGTAGTCCTCTTATATTCTCTTCTTTTGCTGCTTGTTCTGCTGTAGTTGCCAGGCCTTCTATATATTTCTCCTTACCACCTCCAATTCTGTTATTCACTTGCTCGTTTACTTCTATGTATTTGGCTTTTGACCTTGCTTCCTCTGCTCTTGTTCGGCTGTTTTCGACTGCTATCTTCTTG TTTTTTTTTCTTGAATCATGCCTAAGGTATCAATAAGGGTTCATGGTTTATTCT ] [+] EMBL CD169361 [ TTTTTCCGAGCGGATCTTGTAAGGCTTGTAACTTGTTGCTGAGAGCTATCTTAAATTCACTGGGTTTGTCGGTATCTCGAAGGATGACAGTACTAAACTTTTGTATTGTTATTGGTCTGATTGTCCAATGCTTCTTTAGTTTCAGTTTCAGTCAGACCACCACCAGTTGGTGATCTGAAGCTATATTAGCTTCTTTGTTTGTTTCTATGACTTCCATGAACCCCATGAATTTTTTATTTATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATAC ] [-] EMBL CD169740 [ TATTCAGATGTGATTTATCTGGTTTTCTGTATCGTGGTCCCATGTAGTTTCGTGTTTGTTTTTGTGGAGGGAAGTACTATTACGTTACTACAGTGCTATTAAAAATAAACAGATCTACAAGCCTCTGGTCATCCTCAGTCCTTTTTTAAATTCATGCAGTCAAATTAATTCTTCATACC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||