cluster # 8948

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8948 cluster # 8948 Sequences # 8 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8948#0 length = 1549 sequences # 8
consensusID : consensus_8948#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1549
fasta sequence
                              [AGTATTATTATTATCATTATTATTGTT-ACAATAATTGCCTAAATGCTTGAATGCATCACTAAGACGTGTTTGTATAATAGGATCTTCACAATTATTAATCCATTGATAAACAAGATTTGAATAAGCTTCCGGACTTAAATGAATTAAATTGAGTAGTGCAGATGAAAATGATGCTTCTAAATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATTCAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACGAGAACGTGATCTAATCTCCAAAAAATGATCAGTCAATGAAATGATAATATCCAAACACTGCTGAATCACTGAATTGTCAACACATCCTGCTGAACATGATGAAGATCGTGAAGTTGATG-AAGATTTAATGTGATTTGATTGAT-TAAATTCAACACCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACGACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGGGGACGTAATTCACATGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTCCGTTATTAACGGTAATAAATGTCCTAAGCCAATAACGGCTGCATCAACTGTCGGTATAGCACTAAATGTTGAATCTTGAGAATTGATAGAGTCTGGTTGAATAACTAGTTCATTGTCAACCTGAGACAGAAATACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATTTAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATTTGATCATCTTCAGCTGTCGCTTCAAAATTTAATTTACCTTGTGTATTTTTAGTATAGTGTTTGCATAAAACAACTGTCCAATTTAAAAATGGACCAGAAGCACATGGAGTAACACAATCATTTCTATTTGCTTTATTTATTTCTAATGATGATTGTACAACTGTAGAATCATTATTTAATAATGATACTGAAGACAATTCTGACAATGATGATGGTAGACTGACCAAATAAATTAGACAAGATTCAGCGACATCAGAGAATAAAGAGAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACACTAAATAATTTGCACTATGTGACAAGAATGGACCTAAAAGACCATTCCAAACTAATGAAACTAAATCGGTACTTGAGTTACTGTTTGATGCTATTGATCCTATAGCACGTGCAACACCTCTT-AAACAGCTGTACAATTAACCAACATACTAATGGTTGTAGAATCTTGAAGTGAACTGAAAGATGCATCATTTGTAAGAACATTGAGTATACGAAGAACTTGTTCTCGAATCTCGCGAATAAGCTGTAGTAGTAAAGAATCGGAGACTTCTTCATTACTATGATGCTGCTGCTGTACTAATGCCGATGATGATAGATTTTTTTTATCAATTGACCAACTGCCGCACAAACAAGCCTCAACTAATGGAATTAAACTATCTGTCGATAAATTAGACCATGTGTGTTCTGAAGCTTGAGGACCAGCGA]

[+] EMBL CD179450             [AGTATTATTATTATCATTATTATTGTT ACAATAATTGCCTAAATGCTTGAATGCATCACTAAGACGTGTTTGTATAATAGGATCTTCACAATTATTAATCCATTGATAAACAAGATTTGAATAAGCTTCCGGACTTAAATGAATTAAATTGAGTAGTGCAGATGAAAATGATGCTTCTAAATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATTCAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACGAGAACGTGATCTAATCTCCAAAAAATGATCAGTCAATGAAATGATAATATCCAAACACTGCTGAATCACTGAATTGTCAACACATCCTGCTGAACATGATGAAGGTCGTGAAGTTGATG AAGATTTAATGTGATTTGATTGAT TAAATTCAACACCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACGACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGNGGACGTAATTCACATGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTCCGTTATTAACGGT ATAAATGTCCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AW053273             [           TATCCCTATTTTTTTTCACAA AATGCCCAAAATG  TGGAGCCACCACTAAGACG GTTTGTATAATAGGATCTTCACAATTATTAATCCATTGATAAACAAGATTTGAATAAGCTTCCGGACTTAAATGAATTAAATTGAGTAGTGCAGATGAAAATGATGCTTCTAAATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATTCAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACGAGAACGTGATCTAATCTCCACAAAATGATCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD183262             [                                                                                                                                                                 GATGAAAATGATGCTTCTAAATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATTCAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACGAGAACGTGATCTAATCTCCAAAAAATGATCAGTCAATGAAATGATAATATCCAAACACTGCTGAATCACTGAATTGTCAACACATCCTGCTGAACATGATGAAGATCGTGAAGTTGATG AAGATTTAATGTGATTTGATTGAT TAAATTCAACACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD181220             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGATGAAGATCGTGAAGTTGATG AAGATTTAATGTGATTTGATTGAT TAAATTCAACACCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACGACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGGGGACGTAATTCACATGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTCCGTTATTAACGGTAATAAATGTCCTAAGCCAATAACGGCTGCATCAACTGTCGGTATAGCACTAAATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD181746             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGATGAAGATCGTGAAG TGATGAAAGATTTAATGTGANTTGA TGATAAAAATTCANCANCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACGACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGGGGACGTAATTCACATGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTCCGTTATTAACGGTAATAAATGTCCTAAGCCAATAACGGCTGCATCAACTGTCGGTATAGCACTAAATGTTGAATCTTGAGAATTGATAGAGTCTGGTTGAATAACTAGTTCATTGTCAACCTGAGACAGAAATACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATTTAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD147307             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTTGAATCTTGAGAATTGATAGAGTCTGGTTGAATAACTAGTTCATTGTCAACCTGAGACAGAAATACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATTTAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATTTGATCATCTTCAGCTGTCGCTTCAAAATTTAATTTACCTTGTGTATTTTTAGTATAGTGTTTGCATAAAACAACTGTCCAATTTAAAAATGGACCAGAAGCACATGGAGTAACACAATCATTTCTATTTGCTTTATTTATTTCTAATGATGATTGTACAACTGTAGAATCATTATTTAATAATGATACTGAAGACAATTCTGACAATGATGATGGTAGACTGACCAAATAAATTAGACAAGATTCAGCGACATCAGAGAATAAAGAGAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD201446             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATTTAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATTTGATCATCTTCAGCTGTCGCTTCAAAATTTAATTTACCTTGTGTATTTTTAGTATAGTGTTTGCATAAAACAACTGTCCAATTTAAAAATGGACCAGAAGCACATGGAGTAACACAATCATTTCTATTTGCTTTATTTATTTCTAATGATGATTGTACAACTGTAGAATCATTATTTAATAATGATACTGGAGACAATTCTGACAATGATGATGGTAGACTGACCAAATAAATTAGACAAGATTCAGCGACATCAGAGAATAAAGAGAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACACTAAATAATTTGCACTATGTGACAAGAATGGACCTAAAAGACCATTCCAAACTAATGAAACTAAATCGGTACTTGAGTTACTGTTTGATGCTATTGATCCTATAGCACGTGCAACACCTCTT AAACAGCTGTACAATTAACCAACATACTAATGGTTGTAGAATCTTGAAGTGAACTGAAAGATGCATCATTTGTAAGAACATTGA                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD119171             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGAGAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACACTAAATAATTTGCACTATGTGACAAGAATGGACCTAAAGGACCATTCCAAACTAATGAAACTAAATCGGTACTTGAGTTACTGTTTGATGCTATTGATCCTATAGCACGTGCAACACCTCTTAAAACAGCTGTACAATTAACCAACATACTAATGGTTGTAGAATCTTGAAGTGAACTGAAAGATGCATCATTTGTAAGAACATTGAGTATACGAAGAACTTGTTCTCGAATCTCGCGAATAAGCTGTAGTAGTAAAGAATCGGAGACTTCTTCATTACTATGATGCTGCTGCTGTACTAATGCCGATGATGATAGATTTTTTTTATCAATTGACCAACTGCCGCACAAACAAGCCTCAACTAATGGAATTAAACTATCTGTCGATAAATTAGACCATGTGTGTTCTGAAGCTTGAGGACCAGCGA]




>consensus_8948#0
AGTATTATTATTATCATTATTATTGTTACAATAATTGCCTAAATGCTTGAATGCATCACT
AAGACGTGTTTGTATAATAGGATCTTCACAATTATTAATCCATTGATAAACAAGATTTGA
ATAAGCTTCCGGACTTAAATGAATTAAATTGAGTAGTGCAGATGAAAATGATGCTTCTAA
ATTGACCGAATAACTTTCTTTGGTTAGTAATGTGAATAAATCAGATAGGAATTGTGTATT
CAAACCGATAACATTGATTAAACGAATAGCATTTTGTAGCTCTTCTACATGACGAGAACG
AGAACGTGATCTAATCTCCAAAAAATGATCAGTCAATGAAATGATAATATCCAAACACTG
CTGAATCACTGAATTGTCAACACATCCTGCTGAACATGATGAAGATCGTGAAGTTGATGA
AGATTTAATGTGATTTGATTGATTAAATTCAACACCAAATATTCCAAATCGAAGAAGACG
ACCAAAAGATGAGAGTTGATTGTCTGTAAGTCGGATCAATCCCTGGGGACGTAATTCACA
TGCATAAGAGGCTAACGAATAAAATGCTTGGCATAATTCTGGGATTGTTAAATTAGATTC
CGTTATTAACGGTAATAAATGTCCTAAGCCAATAACGGCTGCATCAACTGTCGGTATAGC
ACTAAATGTTGAATCTTGAGAATTGATAGAGTCTGGTTGAATAACTAGTTCATTGTCAAC
CTGAGACAGAAATACAGCACCACTAAGTCTTAATTCAAATTCATGATAGAGAACGCGATT
TAAGAGATTAAGTAAAAGTTGAAGTTCTTGAATTTGATCATCTTCAGCTGTCGCTTCAAA
ATTTAATTTACCTTGTGTATTTTTAGTATAGTGTTTGCATAAAACAACTGTCCAATTTAA
AAATGGACCAGAAGCACATGGAGTAACACAATCATTTCTATTTGCTTTATTTATTTCTAA
TGATGATTGTACAACTGTAGAATCATTATTTAATAATGATACTGAAGACAATTCTGACAA
TGATGATGGTAGACTGACCAAATAAATTAGACAAGATTCAGCGACATCAGAGAATAAAGA
GAACAATGATTGTAAAGCTTCTGAGTAATTATGACATTTCAACACTAAATAATTTGCACT
ATGTGACAAGAATGGACCTAAAAGACCATTCCAAACTAATGAAACTAAATCGGTACTTGA
GTTACTGTTTGATGCTATTGATCCTATAGCACGTGCAACACCTCTTAAACAGCTGTACAA
TTAACCAACATACTAATGGTTGTAGAATCTTGAAGTGAACTGAAAGATGCATCATTTGTA
AGAACATTGAGTATACGAAGAACTTGTTCTCGAATCTCGCGAATAAGCTGTAGTAGTAAA
GAATCGGAGACTTCTTCATTACTATGATGCTGCTGCTGTACTAATGCCGATGATGATAGA
TTTTTTTTATCAATTGACCAACTGCCGCACAAACAAGCCTCAACTAATGGAATTAAACTA
TCTGTCGATAAATTAGACCATGTGTGTTCTGAAGCTTGAGGACCAGCGA
clustalw multiple alignements is not computed in this case