cluster # 8954

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Schistosoma mansoni
cluster # 8954 cluster # 8954 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_8954#0 length = 1150 sequences # 3

consensus_8954#1 length = 835 sequences # 5

consensusID : consensus_8954#0
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1150
fasta sequence

                              [GGAGCCATAATTCGGCACGAGGCTTTCGTCTCTTTTATATACAGTTTAAGGGAGAATATATTGAGAGATCCGAAGGATTGTCTTTTGGTGTCCGTCCCTGGAATGATCTACACAATTCAAAACAACTTGCTATTTGTTGGTTATTCAAATTTAGATGCTGTTTCCTTTCAGATATCATATCAATTGAAGATTTTCACAACAGCAATCTTCTTTAGAATAATCTTATCGAAACATTTAAGTCGGATACAGTGGTGCTCCCTAGGTGTTCTGTTCACCGGTGTTGTATTAACACAACTGAGTGATGTAGTCGATTCTAGTACTGAAAAAACGAAAAATGTTGCAGAAAATAGTAATCTACTTGTCGGTCTTTCTTCTGTTGTATTGGCTTGTAGTTGTTCGGGTTTTGCTGGTGTTTTCTTTGAGAAATTATTAAAGGGTAGTCATAAAAGTGTAGCTATACGTAATATACAGTTGGCATTCTACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGAAAGATGGTAAAGAGGTTGCTAGGAAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACTCTGTTGTATGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTAGGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCCACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTNTAATCCGACAATTTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCTTATCCCCCTTCAATAATCATAGTACTACTACTAANCATAAGATANATGGTGTGAATTCATTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAANTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTNTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATATCAAATACATCGCTATCGTTGAAAATACTCTGATACTTGATTTTTANGATGTTACTCCCCGGCTCTGTCATTGTTCTCTGATTTCCACGATCTGGATGCTAGAATAATCTACTACTCGTTGTCTTGATGATCTTAGACTCGATCCTCTCACTTGAATAAAGTCGGTTGCATACTCTTATAGGTGAAA]

[+] EMBL CD081672             [GGAGCCATAATTCGGCACGAGGCTTTCGTCTCTTTTATATACAGTTTAAGGGAGAATATATTGAGAGATCCGAAGGATTGTCTTTTGGTGTCCGTCCCTGGAATGATCTACACAATTCAAAACAACTTGCTATTTGTTGGTTATTCAAATTTAGATGCTGTTTCCTTTCAGATATCATATCAATTGAAGATTTTCACAACAGCAATCTTCTTTAGAATAATCTTATCGAAACATTTAAGTCGGATACAGTGGTGCTCCCTAGGTGTTCTGTTCACCGGTGTTGTATTAACACAACTGAGTGATGTAGTCGATTCTAGTACTGAAAAAACGAAAAATGTTGCAGAAAATAGTAATCTACTTGTCGGTCTTTCTTCTGTTGTATTGGCTTGTAGTTGTTCGGGTTTTGCTGGTGTTTTCTTTGAGAAATTATTAAAGGGTAGTCATAAAAGTGTAGCTATACGTAATATACAGTTGGCATTCTACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGAAAGATGGTAAAGAGGTTGCTAGGAAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACTCTGTTGTATGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTAGGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCCACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTNTAATCCGACAATTTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCTTATCCCCCTTCAATAATCATAGTACTACTACTAANCATAAGATANATGGTGTGAATTCATTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAANTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTNTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATATCAAATACATCGCTATCGTTGAAAATACTCTGATACTTGATTTTTANGATGTTACTCCCCGGCTCTGTCATTGTTCTCTGATTTCCACGATCTGGATGCTAGAATAATCTACTACTCGTTGTCTTGATGATCTTAGACTCGATCCTCTCACTTGAATAAAGTCGGTTGCATACTCTTATAGGTGAAA]
[+] EMBL CD188856             [                                                                                                                                                                                               tggCACAACAGCAATCTTCTTTAGAATAATCTTATCGAAACATTTAAGTCGGATACAGTGGTGCTCCCTAGGTGTTCTGTTCACCGGTGTTGTATTAACACAACTGAGTGATGTAGTCGATTCTAGTACTGAAAAAACGAAAAATGTTGCAGAAAATAGTAATCTACTTGTCGGTCTTTCTTCTGTTGTATTGGCTTGTAGTTGTTCGGGTTTTGCTGGTGTTTTCTTTGAGAAATTATTAAAGGGTAGTCATAAAAGTGTAGCTATACGTAATATACAGTTGGCGTTCTACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGAAAGATGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD068336             [                                                                                                                                                                                                                                                      gtGTGTTGCTCCCTAGGTGTTCTG TCAGCGGTGTTGTATTAACACAACTGAGTGATGTAGTCGATTCTAGTACTGAAAAAACGAAAAATGTTGCAGAAAATAGTAATCTACTTGTCGGTCTTTCTTCTGTTGTATTGGCTTGTAGTTGTTCGGGTTTTGCTGGTGTTTTCTTTGAGAAATTGTTAAAGGGTAGTCATAAAGGTGTAGCTATACGTAATATACAGTTGGCATTCTACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGACCGATGGTCCAGGGGTTGCTAGGAAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_8954#0
GGAGCCATAATTCGGCACGAGGCTTTCGTCTCTTTTATATACAGTTTAAGGGAGAATATA
TTGAGAGATCCGAAGGATTGTCTTTTGGTGTCCGTCCCTGGAATGATCTACACAATTCAA
AACAACTTGCTATTTGTTGGTTATTCAAATTTAGATGCTGTTTCCTTTCAGATATCATAT
CAATTGAAGATTTTCACAACAGCAATCTTCTTTAGAATAATCTTATCGAAACATTTAAGT
CGGATACAGTGGTGCTCCCTAGGTGTTCTGTTCACCGGTGTTGTATTAACACAACTGAGT
GATGTAGTCGATTCTAGTACTGAAAAAACGAAAAATGTTGCAGAAAATAGTAATCTACTT
GTCGGTCTTTCTTCTGTTGTATTGGCTTGTAGTTGTTCGGGTTTTGCTGGTGTTTTCTTT
GAGAAATTATTAAAGGGTAGTCATAAAAGTGTAGCTATACGTAATATACAGTTGGCATTC
TACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGAAAGATGGTAAAGAGGTTGCTAGG
AAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACTCTGTTGTATGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTA
GGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCC
ACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTNTAATCCG
ACAATTTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCT
TATCCCCCTTCAATAATCATAGTACTACTACTAANCATAAGATANATGGTGTGAATTCAT
TCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAANTTATCTGTCTAGCTGTTTCGAT
TNTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAA
ATATCAAATACATCGCTATCGTTGAAAATACTCTGATACTTGATTTTTANGATGTTACTC
CCCGGCTCTGTCATTGTTCTCTGATTTCCACGATCTGGATGCTAGAATAATCTACTACTC
GTTGTCTTGATGATCTTAGACTCGATCCTCTCACTTGAATAAAGTCGGTTGCATACTCTT
ATAGGTGAAA

consensusID : consensus_8954#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 835
fasta sequence

                              [GCTATACGTAATATACAGTTGGCATTCTACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGAAAGATGGTAAAGAGGTTGCTAGGAAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACTCTGTTGTATGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTAGGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCCACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTTTAATCCGACAATCTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCTTATCCCCCTTCAAATAATCATAGTACTACTACTAACAATAAGATAAATGGTGTGAATTCACTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAATTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTTTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATTATCAAAATACATCGCTATCAGTTGAAAATTACTCTGAATACTTGGATTTTTTAGGATGTTAACTTCCCCGTGCTTCTGTTCATTTGGTTCTTCTGTATTTTTCCCACGTATCTGTGATAGCTAGGATATAAAATCTAGCTACTTTCGTTTTGTTCTTTGTATTGTATCTCTCAGAAACTTCTGATTTCTTTTCTCATCTTTTTAATAATAAATGTTTCGGTGTTTTGCCAATTACTAGCTCTAAATAAGGGTTGTCAAAATACATTACTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACGTCTG]

[+] EMBL CD082731             [GCTATACGTAATATACAGTTGGCATTCTACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGAAAGATGGTAAAGAGGTTGCTAGGAAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACTCTGTTGTATGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTAGGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCCACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTTTAATCCGACAATCTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCTTATCCCCCTTCAAATAATCATAGTACTACTACTAACAATAAGATAAATGGTGTGAATTCACTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAATTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTTTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATTATCAAAATACATCGCTATCAGTTGAAAATTACTCTGAATACTTGGATTTTTTAGGATGTTAACTTCCCCGTGCTTCTGTTCATTTGGTTCTTCTGTATTTTTCCCACGTATCTGTGATAGCTAGGATATAAAATCTAGCTACTNTCGNNTTGTTCTTTGNATTGGATCTCTCAGAAACTNCTGATTTCTTTTCTCATCTTTNTAATAATAAATGGTCNCGTGTTTTGCC ATTACTAGCTCTAAATAAGGGGTGTC AAATACATTA                                                         ]
[+] EMBL CD169743             [                                                                                      GAAAGGGTTTTTCCTTGGTTACGACTCTGTTGTATGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTAGGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCCACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTTTAATCCGACAATCTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCTTATCCCCCTTCAAATAATCATAGTACTACTACTAACAATAAGATAAATGGTGTGAATTCACTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAATTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTTTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATTATCAAAATACATCGCTATCAGTTGAAAATTACTCTGAATACTTGGATNTTTTAGGATGTTNACTTCCCCGTGCTTCTGTTCATTTGGTTCTTCTGTATTTTTCCCACGTAT                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD169440             [                                                                                                                                                             TGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCCACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTTTAATCCGACAATCTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATCCATCTTATCCCCCTTCAAATAATCATAGTACTACTACTAACAATAAGATAAATGGTGTGAATTCACTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAATTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTTTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATTATCAAAATACATCGCTATCAGTTGAAAATTACTCTGAATACTTGGATTTTTTAGGATGTTAACTTCCCCGTGCTTCTGTTCATTTGGTTCTTCTGTATTTTTCCCACGTATCTGTGATAGCTAGGATATAAAATCTAGCTACTTTCGTTTTGTTCTTTGTATTGTATCTCTCAGAAA                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD076322             [                                                                                                                                                                                                                               TGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTTTAATCCGACAATCTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCTTATCCCCCTTCAAATAATCATAGTACTACTACTAACAATAAGATAAATGGTGTGAATTCACTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAATTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTTTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATTATCAAAATACATCGCTATCAGTTGAAAATTACTCTGAATACTTGGATTTTTTAGGATGTTAACTTCCCCGTGCTTCTGTTCATTTGGTTCTTCTGTATTTTTCCCACGTATCTGTGATAGCTAGGATATAAAATCTAGCTACTTTCGTTTTGTTCTTTGTATTGTATCTCTCAGAAACTTCTGATTTCTTTTCTCATCTTTTTAATAATAAATGTTTCGGTGTTTTGCCAATTACTAGCTCTAAATAAGGGTTGTCAAAATACATTAC                                                        ]
[-] EMBL AI975668             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCCCCCTTCAAATAATCATAGTACTACTACTAACAATAAGATAAATGGTGTGAATTCATTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAATTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTTTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATTATCAAAATACATCGCTATCAGTTGAAAATTACTCTGAATACTTGGATTTTTTAGGATGTTAACTTCCCCGTGCTTCTGTTCATTTGGTTCTTCTGTATTTTTCCCACGTATCTGTGATAGCTAGGATATAAAATCTAGCTACTTTCGTTTTGTTCTTTGTATTGTATCTCTCAGAAACTTCTGATTTCTTTTCTCATCTTTTTGATAATAAATGTTTCGGTGTTTTGCCAATTACTAGCTCTAAATAAGGGTTGTCAAAATACATTACTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACGTCTG]




>consensus_8954#1
GCTATACGTAATATACAGTTGGCATTCTACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTAT
TTGAAAGATGGTAAAGAGGTTGCTAGGAAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACTCTGTTGTA
TGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTAGGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTAT
GCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCCACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTA
TCAATATTCTGGTTTGATTTTAATCCGACAATCTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTA
GTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCTTATCCCCCTTCAAATAATCATAGTACTACTACT
AACAATAAGATAAATGGTGTGAATTCACTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGA
CATAATTTATCTGTCTAGCTGTTTCGATTTTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTT
AATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAAAATTATCAAAATACATCGCTATCAGTTGAAAAT
TACTCTGAATACTTGGATTTTTTAGGATGTTAACTTCCCCGTGCTTCTGTTCATTTGGTT
CTTCTGTATTTTTCCCACGTATCTGTGATAGCTAGGATATAAAATCTAGCTACTTTCGTT
TTGTTCTTTGTATTGTATCTCTCAGAAACTTCTGATTTCTTTTCTCATCTTTTTAATAAT
AAATGTTTCGGTGTTTTGCCAATTACTAGCTCTAAATAAGGGTTGTCAAAATACATTACT
TTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACGTCTG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_8954#0      GGAGCCATAATTCGGCACGAGGCTTTCGTCTCTTTTATATACAGTTTAAGGGAGAATATA 60
consensus_8954#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8954#0      TTGAGAGATCCGAAGGATTGTCTTTTGGTGTCCGTCCCTGGAATGATCTACACAATTCAA 120
consensus_8954#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8954#0      AACAACTTGCTATTTGTTGGTTATTCAAATTTAGATGCTGTTTCCTTTCAGATATCATAT 180
consensus_8954#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8954#0      CAATTGAAGATTTTCACAACAGCAATCTTCTTTAGAATAATCTTATCGAAACATTTAAGT 240
consensus_8954#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8954#0      CGGATACAGTGGTGCTCCCTAGGTGTTCTGTTCACCGGTGTTGTATTAACACAACTGAGT 300
consensus_8954#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8954#0      GATGTAGTCGATTCTAGTACTGAAAAAACGAAAAATGTTGCAGAAAATAGTAATCTACTT 360
consensus_8954#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8954#0      GTCGGTCTTTCTTCTGTTGTATTGGCTTGTAGTTGTTCGGGTTTTGCTGGTGTTTTCTTT 420
consensus_8954#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_8954#0      GAGAAATTATTAAAGGGTAGTCATAAAAGTGTAGCTATACGTAATATACAGTTGGCATTC 480
consensus_8954#1      ---------------------------------GCTATACGTAATATACAGTTGGCATTC 27
                                                       ***************************

consensus_8954#0      TACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGAAAGATGGTAAAGAGGTTGCTAGG 540
consensus_8954#1      TACGGTGTTACAGCCGGTATCCTAACTGTCTATTTGAAAGATGGTAAAGAGGTTGCTAGG 87
                      ************************************************************

consensus_8954#0      AAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACTCTGTTGTATGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTA 600
consensus_8954#1      AAAGGGTTTTTCTTTGGTTACGACTCTGTTGTATGGGCAGCAATATTAATTCAATCATTA 147
                      ************************************************************

consensus_8954#0      GGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCC 660
consensus_8954#1      GGTGGTTTGCTGATCGCCGCAACTATTCGGTATGCCGATAATATACGCAAAGGATTTGCC 207
                      ************************************************************

consensus_8954#0      ACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTNTAATCCG 720
consensus_8954#1      ACATCAATGGCTATAGTGCTTACTTTTATTTTATCAATATTCTGGTTTGATTTTAATCCG 267
                      **************************************************** *******

consensus_8954#0      ACAATTTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCT 780
consensus_8954#1      ACAATCTTATTTTATGTTGGTGCTATCCTAGTAGTTGTTGCTACTATCTTGTATTCATCT 327
                      ***** ******************************************************

consensus_8954#0      TATCCCCCTTCAA-TAATCATAGTACTACTACTAANCATAAGATANATGGTGTGAATTCA 839
consensus_8954#1      TATCCCCCTTCAAATAATCATAGTACTACTACTAACAATAAGATAAATGGTGTGAATTCA 387
                      ************* *********************  ******** **************

consensus_8954#0      TTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAANTTATCTGTCTAGCTGTTTCGA 899
consensus_8954#1      CTCCAAAATTTCTTATCGGAGTCGAATTTCAGACATAATTTATCTGTCTAGCTGTTTCGA 447
                       ************************************* *********************

consensus_8954#0      TTNTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAA 959
consensus_8954#1      TTTTCGCTATTGAGTATTTGGTAACTGTGATTTAATTTTTGCCTTCATCTGCCTTTTAAA 507
                      ** *********************************************************

consensus_8954#0      AAT-ATCAAA-TACATCGCTATC-GTTGAAAAT-ACTCTGA-TACTTGA--TTTTTANGA 1012
consensus_8954#1      AATTATCAAAATACATCGCTATCAGTTGAAAATTACTCTGAATACTTGGATTTTTTAGGA 567
                      *** ****** ************ ********* ******* ******   ****** **

consensus_8954#0      TGTTA----CTCCCCGGCTCTGTC------ATTGTTCTCTGATTT--CCACG-ATCTG-G 1058
consensus_8954#1      TGTTAACTTCCCCGTGCTTCTGTTCATTTGGTTCTTCTGTATTTTTCCCACGTATCTGTG 627
                      *****    * **  *  *****        ** **** *  ***  ***** ***** *

consensus_8954#0      AT-GCTAGAATAATCTA-CTACTCGTTGTCTTGATGATCTTAGACTCGATCCTCTCACTT 1116
consensus_8954#1      ATAGCTAGGATATAAAATCTAGCTACTTTCGTTTTGTTCTTTGTATTGTATCTCTCAGAA 687
                      ** ***** ***    * ***     * ** *  ** **** *  * *   ******   

consensus_8954#0      GAATAAAGTCGGTTGCATACTCTTATAGGTGAAA-------------------------- 1150
consensus_8954#1      ACTTCTGATTTCTTTTCTCATCTTTTTAATAATAAATGTTTCGGTGTTTTGCCAATTACT 747
                         *    *   **   *  **** *   * * *                          

consensus_8954#0      ------------------------------------------------------------
consensus_8954#1      AGCTCTAAATAAGGGTTGTCAAAATACATTACTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 807
                                                                                  

consensus_8954#0      ----------------------------
consensus_8954#1      AACATGCCATGCAGCTGCATTACGTCTG 835