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Schistosoma mansoni
cluster # 8964 cluster # 8964       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8964#0 length = 1463 sequences # 8  

consensusID : consensus_8964#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1463
fasta sequence
                              [AGTCCGTTGTCATGCTTGGTTCGTCCCCTCGTAATGTTGTGCGTGTAGGGTCGAGGCGCAGTAATCTGGCACTTCTACAGACTGGAATGGCAGTTAATTTACTCCAAAAACAGAATCCACATATTCTCTTTGAAGTTGTGGAGATGGCAACTGTCGGCGACAAAATTCTTGACGTTTCGTTATCAAAGATAGGTGATAAAAGTTTATTCACAAAGGAACTTGAAAATGCCTTACTTAGTGGAGAAGTTGACCTTGTCGTACACTCACTTAAAGATGTCCCATCAACCCTCCCTTCTGGCTTAGTCCTTGGGTGTGTGTTTGCCAGAGTATCTCCAGAAGATGTTGTTTTGATGGCTCCACATTATCGTGGAAGAAAACTTTCTGATCTCCCTATCGGATCTACAGTTGGAAC-AGTGCTGTTCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGGAAATTTAAACACAA-GGCTTGCCAAACTCGATACTCCTCCAGCTTCCAAGGATAATTGCTGTTCAGGCAATCCATCTCCAAGTTATGATGCGATCATTCTAGCTAAGGCGGGCGTTGAGAGGATGGGCTGGTCGCACCGTATTGA-TCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTCAAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTATGATGACGTGAGCACAAATACACCAATAATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATTGGATGCAACATCTATATTTATGGGAGTTATAGTTACTCCATCATCCGAAATGTCCCGTCTCAGAATGGCTATTGCTC-AAGTTTGGGTTGCACAGTAGCANAAAGTCTACTTCTATCCGGTGCTGATGAAATTC-TTATGAAATACGTTCCCAATCTAGTGGGTGAAATAGATTCTCATGAACAGATAATAGNTTTCTTTAAATGACAATCCTTGCATTTTGNTTTGGNTCTTTTCAT-ANTTATGCTCTCCATAATGTNTATACTTTTGGGTTTTCATAGCAAAGANAATTTGTCGTGGTTACATGTAAATTGGTTAATTAAGNTTG-CCCATGAATGGTAAATACTAACAATGTGAAAATAA-CATTTGCACTTAAAATA-ATGTAG]

[+] EMBL AI975165             [AGTCCGTTGTCATGCTTGGTTCGTCCCCTCGTAATGTTGTGCGTGTAGGGTCGAGGCGCAGTAATCTGGCACTTCTACAGACTGGAATGGCAGTTAATTTACTCCAAAAACAGAATCCACATATTCTCTTTGAAGTTGTGGAGATGGCAACTGTCGGCGACAAAATTCTTGACGTTTCGTTATCAAAGATAGGTGATAAAAGTTTATTCACAAAGGAACTTGAAAATGCCTTACTTAGTGGAGAAGTTGACCTTGTCGTACACTCACTTAAAGATGTCCCATCAACCCTCCCTTCTGGCTTAGTCCTTGGGTGTGTGTTTGCCAGAGTATCTCCAGAAGATGTTGTTTTGATGGCTCCACATTATCGTGGAAGAAAACTTTCTGATCTCCCTATCGGATCTACAGTTGGAACAAGTGCTGTTCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGGAAATTTAAACACAA GGCTTGCCAAACTCGATACTCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD192202             [                                 ATGTTGTGCGTGTAGGGTTGAGGCGCAGTAATCTGGCACTTCTACAGACTGGAATGGCAGTTAATTTACTCCAAAAACAGAATCCACATATTCTCTTTGAAGTTGTGGAGATGGCAACTGTCGGCGACAAAATTCTTGACGTTTCGTTATCAAAGATAGGTGATAAAAGTTTATTCACAAAGGAACTTGAAAATGCCTTACTTAGTGGAGAAGTTGACCTTGTCGTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD166464             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TATCGTGGAAGAAAACTTTCTGATCTCCCTATCGGATCTACAGTTGGAACAAGTGCTGTTCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGGAAATTTAAACACAA GGCTTGCCAAACTCGATACTCCTCCAGCTTCCAAGGATAATTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD081184             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgcaggCCTATCGGATCTACANTTTGAAC AGTGCTGTTCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGGAAATTTAAACACAAGGGCTTGCCAAACTCGATACTCCTCCAGCTTCCAAGGATAATTGCTGTTCAGGCAATCCATCTCCAAGTTATGATGCGATCATTCTAGCTAAGGCGGGCGTTGAGAGGATGGGCTGGTCGCACCGTATTGA TCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTT AAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTCAAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTAACATGACGTGAGCACAAATACACCAATAATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATTGGATGCCACATCTATATTTATGGGAGTTATAGTTACTCCATCATCCGAAATGTCCCGTCTCAGAATGGCTATTGCTC AAGTTTGGGTTGCACAGTAGCANAAAGTCTACTTCTATCCGGTGCTGATGAAATTC TTATGAAATACGTTCCCAATCTAGTGGGTGAAATAGATTCTCATGAACAGATAATAGNTTTCTTTAAATGACAATCCTTGCATTTTGNTTTGGNTCTTTTCAT ANTTATGCTCTCCATAATGTNTATACTTTTGGGTTTTCATAGCAAAGANAATTTGTCGTGGTTACATGTAAATTGGTTAATTAAGNTTG CCCATGAATGGTAAATACTAACAATGTGAAAATAA CATTTGCACTTAAAATA ATGTA ]
[+] EMBL CD149476             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTCGCACCGTATGGA TCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD149512             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTCGCACCGTGTGGAGTGAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTACTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAACGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD149609             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTCGCACCGTATTGA TCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTCAAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTATGATGACGTGAGCACAAATACACCAATAATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATTGGATGCAACATCTATATTTATGGGAAGTATAGTTACTCCATCATCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD075010             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTNTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTCAAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTATGATGACGTGAGCACAAATACACCAATAATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATTGGATGCAACATCTATATTTATGGGAGTTATAGTTACTCCATCATCCGAAATGTCCCGTCTCAGAATGGCTATTGCTCAAAGTTTGGGTTGCACAGTAGCAAAAAGTCTACTTCTATCCGGTGCTGATGAAATTCTTTATGAAATACGTTCCCAATCTAGTGGGTGAAATAGATTCTCATGAACAGATATTAGTTTTCTTTAAATGACAATCCTTGCATTTTGTTTTGGTTC TTTCATAATTTATGCTCTCCATATTGTTTAT CTTTTGGTTTTTCATAGCAAAGTAGATTTGTCGTGTTTACATGTAAATT GTTTATTAAAGTTGCCCCATGAATTGTAAATACTAACATTGTGAAAATAACCATTTGCAAATAAAATAGATGTAG]


>consensus_8964#0 AGTCCGTTGTCATGCTTGGTTCGTCCCCTCGTAATGTTGTGCGTGTAGGGTCGAGGCGCA GTAATCTGGCACTTCTACAGACTGGAATGGCAGTTAATTTACTCCAAAAACAGAATCCAC ATATTCTCTTTGAAGTTGTGGAGATGGCAACTGTCGGCGACAAAATTCTTGACGTTTCGT TATCAAAGATAGGTGATAAAAGTTTATTCACAAAGGAACTTGAAAATGCCTTACTTAGTG GAGAAGTTGACCTTGTCGTACACTCACTTAAAGATGTCCCATCAACCCTCCCTTCTGGCT TAGTCCTTGGGTGTGTGTTTGCCAGAGTATCTCCAGAAGATGTTGTTTTGATGGCTCCAC ATTATCGTGGAAGAAAACTTTCTGATCTCCCTATCGGATCTACAGTTGGAACAGTGCTGT TCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGG AAATTTAAACACAAGGCTTGCCAAACTCGATACTCCTCCAGCTTCCAAGGATAATTGCTG TTCAGGCAATCCATCTCCAAGTTATGATGCGATCATTCTAGCTAAGGCGGGCGTTGAGAG GATGGGCTGGTCGCACCGTATTGATCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCA AGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCA TATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACT TGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTT GAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTAT AGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTC AAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTATGATGACGTGAGCACAAATACACCAAT AATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATT GGATGCAACATCTATATTTATGGGAGTTATAGTTACTCCATCATCCGAAATGTCCCGTCT CAGAATGGCTATTGCTCAAGTTTGGGTTGCACAGTAGCANAAAGTCTACTTCTATCCGGT GCTGATGAAATTCTTATGAAATACGTTCCCAATCTAGTGGGTGAAATAGATTCTCATGAA CAGATAATAGNTTTCTTTAAATGACAATCCTTGCATTTTGNTTTGGNTCTTTTCATANTT ATGCTCTCCATAATGTNTATACTTTTGGGTTTTCATAGCAAAGANAATTTGTCGTGGTTA CATGTAAATTGGTTAATTAAGNTTGCCCATGAATGGTAAATACTAACAATGTGAAAATAA CATTTGCACTTAAAATAATGTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)