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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8964#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1463 fasta sequence
[AGTCCGTTGTCATGCTTGGTTCGTCCCCTCGTAATGTTGTGCGTGTAGGGTCGAGGCGCAGTAATCTGGCACTTCTACAGACTGGAATGGCAGTTAATTTACTCCAAAAACAGAATCCACATATTCTCTTTGAAGTTGTGGAGATGGCAACTGTCGGCGACAAAATTCTTGACGTTTCGTTATCAAAGATAGGTGATAAAAGTTTATTCACAAAGGAACTTGAAAATGCCTTACTTAGTGGAGAAGTTGACCTTGTCGTACACTCACTTAAAGATGTCCCATCAACCCTCCCTTCTGGCTTAGTCCTTGGGTGTGTGTTTGCCAGAGTATCTCCAGAAGATGTTGTTTTGATGGCTCCACATTATCGTGGAAGAAAACTTTCTGATCTCCCTATCGGATCTACAGTTGGAAC-AGTGCTGTTCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGGAAATTTAAACACAA-GGCTTGCCAAACTCGATACTCCTCCAGCTTCCAAGGATAATTGCTGTTCAGGCAATCCATCTCCAAGTTATGATGCGATCATTCTAGCTAAGGCGGGCGTTGAGAGGATGGGCTGGTCGCACCGTATTGA-TCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTCAAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTATGATGACGTGAGCACAAATACACCAATAATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATTGGATGCAACATCTATATTTATGGGAGTTATAGTTACTCCATCATCCGAAATGTCCCGTCTCAGAATGGCTATTGCTC-AAGTTTGGGTTGCACAGTAGCANAAAGTCTACTTCTATCCGGTGCTGATGAAATTC-TTATGAAATACGTTCCCAATCTAGTGGGTGAAATAGATTCTCATGAACAGATAATAGNTTTCTTTAAATGACAATCCTTGCATTTTGNTTTGGNTCTTTTCAT-ANTTATGCTCTCCATAATGTNTATACTTTTGGGTTTTCATAGCAAAGANAATTTGTCGTGGTTACATGTAAATTGGTTAATTAAGNTTG-CCCATGAATGGTAAATACTAACAATGTGAAAATAA-CATTTGCACTTAAAATA-ATGTAG]
[+] EMBL AI975165 [AGTCCGTTGTCATGCTTGGTTCGTCCCCTCGTAATGTTGTGCGTGTAGGGTCGAGGCGCAGTAATCTGGCACTTCTACAGACTGGAATGGCAGTTAATTTACTCCAAAAACAGAATCCACATATTCTCTTTGAAGTTGTGGAGATGGCAACTGTCGGCGACAAAATTCTTGACGTTTCGTTATCAAAGATAGGTGATAAAAGTTTATTCACAAAGGAACTTGAAAATGCCTTACTTAGTGGAGAAGTTGACCTTGTCGTACACTCACTTAAAGATGTCCCATCAACCCTCCCTTCTGGCTTAGTCCTTGGGTGTGTGTTTGCCAGAGTATCTCCAGAAGATGTTGTTTTGATGGCTCCACATTATCGTGGAAGAAAACTTTCTGATCTCCCTATCGGATCTACAGTTGGAACAAGTGCTGTTCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGGAAATTTAAACACAA GGCTTGCCAAACTCGATACTCCT ]
[+] EMBL CD192202 [ ATGTTGTGCGTGTAGGGTTGAGGCGCAGTAATCTGGCACTTCTACAGACTGGAATGGCAGTTAATTTACTCCAAAAACAGAATCCACATATTCTCTTTGAAGTTGTGGAGATGGCAACTGTCGGCGACAAAATTCTTGACGTTTCGTTATCAAAGATAGGTGATAAAAGTTTATTCACAAAGGAACTTGAAAATGCCTTACTTAGTGGAGAAGTTGACCTTGTCGTACA ]
[+] EMBL CD166464 [ TATCGTGGAAGAAAACTTTCTGATCTCCCTATCGGATCTACAGTTGGAACAAGTGCTGTTCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGGAAATTTAAACACAA GGCTTGCCAAACTCGATACTCCTCCAGCTTCCAAGGATAATTGC ]
[+] EMBL CD081184 [ cgcaggCCTATCGGATCTACANTTTGAAC AGTGCTGTTCGGCGCGTAGCCACACTTACACGCAAGTACCCACATCTAAAGTTTGTATCCATACGTGGAAATTTAAACACAAGGGCTTGCCAAACTCGATACTCCTCCAGCTTCCAAGGATAATTGCTGTTCAGGCAATCCATCTCCAAGTTATGATGCGATCATTCTAGCTAAGGCGGGCGTTGAGAGGATGGGCTGGTCGCACCGTATTGA TCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTT AAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTCAAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTAACATGACGTGAGCACAAATACACCAATAATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATTGGATGCCACATCTATATTTATGGGAGTTATAGTTACTCCATCATCCGAAATGTCCCGTCTCAGAATGGCTATTGCTC AAGTTTGGGTTGCACAGTAGCANAAAGTCTACTTCTATCCGGTGCTGATGAAATTC TTATGAAATACGTTCCCAATCTAGTGGGTGAAATAGATTCTCATGAACAGATAATAGNTTTCTTTAAATGACAATCCTTGCATTTTGNTTTGGNTCTTTTCAT ANTTATGCTCTCCATAATGTNTATACTTTTGGGTTTTCATAGCAAAGANAATTTGTCGTGGTTACATGTAAATTGGTTAATTAAGNTTG CCCATGAATGGTAAATACTAACAATGTGAAAATAA CATTTGCACTTAAAATA ATGTA ]
[+] EMBL CD149476 [ GGTCGCACCGTATGGA TCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAAT ]
[+] EMBL CD149512 [ GGTCGCACCGTGTGGAGTGAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTACTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAACGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTT ]
[+] EMBL CD149609 [ GGTCGCACCGTATTGA TCAGGTTTTAACCGATTCTTTTTATGCTGTGAGTCAAGGTGCATTGGCTTGTGAATGTCGTCTAGTCGATAATTTCATTATGGATTTGTTATCGCATATCCATGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTTTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTCAAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTATGATGACGTGAGCACAAATACACCAATAATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATTGGATGCAACATCTATATTTATGGGAAGTATAGTTACTCCATCATCCG ]
[-] EMBL CD075010 [ TGACGAGTCAGCTGCCTTAACAACTATTGCTGAGCGCAGTNTGATGCGTCAACTTGATGGTGGTTGTTCTATCCCGATTGGTGTGCGCAGTGATCTTGTTTTAAAAGGAGATTTGAACTATTATCAACTTACTCTTCATGCAAATATACTAAGTGTTGATGGTGGAAAGAGTATAGAAAGATCTGCCTCTGTTGTTTTCCCGGATAAAATGCCCATAAATGATTGTGTGGAGTCAAGCTGCAAATTAGTGCAAAAATCGGGCAGTTATGATGACGTGAGCACAAATACACCAATAATCAAAAATAAGGGGACCTCACTAACCTCTCCTACTAAGGATGAGTTAAAAGCAGCATTGGATGCAACATCTATATTTATGGGAGTTATAGTTACTCCATCATCCGAAATGTCCCGTCTCAGAATGGCTATTGCTCAAAGTTTGGGTTGCACAGTAGCAAAAAGTCTACTTCTATCCGGTGCTGATGAAATTCTTTATGAAATACGTTCCCAATCTAGTGGGTGAAATAGATTCTCATGAACAGATATTAGTTTTCTTTAAATGACAATCCTTGCATTTTGTTTTGGTTC TTTCATAATTTATGCTCTCCATATTGTTTAT CTTTTGGTTTTTCATAGCAAAGTAGATTTGTCGTGTTTACATGTAAATT GTTTATTAAAGTTGCCCCATGAATTGTAAATACTAACATTGTGAAAATAACCATTTGCAAATAAAATAGATGTAG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||