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Schistosoma mansoni
cluster # 8976 cluster # 8976       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8976#0 length = 1096 sequences # 8  

consensusID : consensus_8976#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1096
fasta sequence
                              [TATTTTTCTCTCACATTCACTTATTTATCTGTTTCACTTCTATAGTAACTTTTCTCATGTCACAAGTGTAAACTTTATTTACTCATAGTGTGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAGAGTTGTCTGTGCTTTGTCGTTGATGTGAATATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGTTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTTTTATTCTGTTCCCTTTCCTTTCTTCCTCCCTATCCATGTATAATCTGTTTATTGTTTTTGATTTCACTTCCCCTCCCTATTTTTTCCTGTTTTTGAATTTATAACTTCAGAAAACATTGATTCTATACATAGAGTGTGATTTTTCGATCTTAATTAATCCAGATTGTATTTCGCTATCGTAATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGTTCTTTTTTGTTTTCTCTTGTTGTTTTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATCTGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTATATTTACATGCATATGATTAAATAGTTTGATTCATCATATTTAGTTCCTTCTCATTTTGTTCTTCAGTCCATCTTTTGCTAGTTATATTCAAAACGTT]

[-] EMBL CD169215             [TATTTTTCTCTCACATTCACTTATTTATCTGTTTCACTTCTATAGTAACTTTTCTCATGTCACAAGTGTAAACTTTATTTACTCATAGTGTGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAGAGTTGTCTGTGCTTTGTCGTTGATGTGAATATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGTTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD169462             [                                                CTTTTCTCATGTCACAAGTGTAAACTTTATTTACTCATAGTGTGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAGAGTTGTCTGTGCTTTGTCGTTGATGTGAACATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGCTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD091389             [                                                                                        TGAGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAGAGTTGTCTGTGCTTTGTCGCTGATGTGAATATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGTTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATNTTTATTCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD067240             [                                                                                                                                                                ATGGAAATTGTTTACGTTATACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCTCTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCATGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTACCGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGTGGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGTAGCAAATTCATTATGCGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTTTTATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD160720             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGCAAATTCATANTGTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTTTTATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI976368             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCACTGATATATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTGATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTTTTATTCTGTTCCCTTTCCTTTCTTCCTCCCTATCCATGTATAATCTGTTTATTGTTTTTGATTTCACTTCCCCTCCCTATTTTTTCCTGTTTTTGAATTTATAACTTCAGAAAACATTGATTCTATACATAGAGTGTGATTTTTCGATCTTAATTAATCCAGATTGTATTTCGCTATCGTAATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGGTCTTTTTTGGTTTCTCTTGTTGTTCTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATCTGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTATATTTA                                                                                            ]
[-] EMBL CD090174             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCCTGTTTTTGAATTTATAACTTCAGAAAACATTGATTCTATACATAGAGTGTGATTTTTCGATCTTAATTAATCCAGATTGTATTTCGCTATCGTGATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGTTCTTTTTTGTTTTCTCTTGTTGTTTTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATCTGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTACATTTACATGCATATGATTAAATAGTTTGATTCATCATATTTAGTTCCTTCTCATTTTGTTCTTCAGTCCATCTTTTGCTAGTTATATTCAAAACGTT]
[+] EMBL SMAA69086            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTCGCTATCGTAATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGTTCTTTTTTGTTTTCTCTTGTTGTTTTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATCTGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTATATTTACATGCATATGATTAAGTAGTTTGATTCATCATATTTAGTTCCTTCTCATTTCGTTCTTCAGTCCATCTTTTGCTAGTTATATTCAAAACGT ]


>consensus_8976#0 TATTTTTCTCTCACATTCACTTATTTATCTGTTTCACTTCTATAGTAACTTTTCTCATGT CACAAGTGTAAACTTTATTTACTCATAGTGTGTACGTTAACCTATTCAGCATATACAGAG AGTTGTCTGTGCTTTGTCGTTGATGTGAATATTGTTTTCAATGGAAATTGTTTACGTTAT ACGAGATCCATTCACAATTTTTAATTTCAAACGATTAATTTGCTTTACTATATTGTCCCT CTTCCAGCGTTTCTCTAGGCTGCACCTTGTTATATCAGTTTTAACTGCATATGAAAAGCA TGTAATGGAATCTATCTTATTTTAATTTTCTTTGTTATCTGAAAATTAGAGAAAACTTAC CGTATTCACATATTTTTAGTCCGACATTACGTTCTGTTTTTCCCCTGTGGAGATATTCGT GGTTACTATGACTTATTAAATCTAATGACTAATTTTTGCTTTGAAAGAAAACAGTTACGT AGCAAATTCATTATGTGTTCATCGTAAAATAGCATTTTCTTCCTCTTTAATCCCTGATAT ATGAACATAAAAGACAATTTGCTATGATATAAATCTATTTGTCTTTTTACTTGATGTGTG ATATAAACATTAATTTCATTTCTTAAAGCGCCCCGTTCTCGTTTACGTAATCATGTATTT TTATTCTGTTCCCTTTCCTTTCTTCCTCCCTATCCATGTATAATCTGTTTATTGTTTTTG ATTTCACTTCCCCTCCCTATTTTTTCCTGTTTTTGAATTTATAACTTCAGAAAACATTGA TTCTATACATAGAGTGTGATTTTTCGATCTTAATTAATCCAGATTGTATTTCGCTATCGT AATTTTCAATTGAATCTTCTTTTTCCGTTCTGTCAGTACAGGAAATAATTTCATTTTGTT CTTTTTTGTTTTCTCTTGTTGTTTTATGATTTATTCTCTTTTAATATAAACTTATCTATC TGAGTTTTCTCAAATAGATGTTTTGCTCTGAACTATTATATTTACATGCATATGATTAAA TAGTTTGATTCATCATATTTAGTTCCTTCTCATTTTGTTCTTCAGTCCATCTTTTGCTAG TTATATTCAAAACGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)