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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8977#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 589 fasta sequence
[ATTGGGATTTATTCTAACTAGTTCGTGATTGGTAAAACCTCTTCGGGTCAAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT-AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT-CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]
[+] EMBL CD187442 [ATTGGGATTTATTCTAACTAGTTCGTGATTGGTAAAACCTCTTCGGGTCAAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAA ]
[+] EMBL CD122342 [ AAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCAT ]
[+] EMBL CD122318 [ AAAAGGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTTTATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCATAAAATACTtg ]
[+] EMBL CD122304 [ AAAAAGTTATCTGTGTGAAAAATATACTACCTGGTGGAGCAGCTCTAATCGATGGTCAATTAAAACCTGGTGATCTTCTAATGAAGGTTGATAATATTAATGTAAATGAAATTGGTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCATGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCA ]
[-] EMBL CD122323 [ GTCAAGCACAAACTGTTGCATTATTACGAAGCAAACCTGTAAATACCCTTGTTACTTTAGTTGTCAAACGATCAAGAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]
[-] EMBL CD122332 [ GAAATAATTCTCATAATGAAGATATCAATAATAATAACAATAATAATGATAATAGCAATAATACTAATGACGATAATAATCTTGATCAAGCATGTCTACCTGATTTGAAAACTATGCAACCATCTGTTATATGTACAATAACATCAAGTTGTTGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCAATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]
[-] EMBL CD122316 [ TTGTGGCAT AAATACTGTAAATGAACAACCAACAAAATCGATATTATCTACAATACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACAACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCAT CTAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]
[-] EMBL CD122298 [ TTATCTACAANACCCCCATTATCATCAACATCACAACCAATAACACCACAACATAATGAAACAGTGATTGTGGAACAACCATAATAGTCATGATATAAAAATACCTGATAAGCTATCCGAATGGAACTGTTGTTCATCCGACATCTCTCAAAAATTTCATC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||