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Schistosoma mansoni
cluster # 898 cluster # 898       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_898#0 length = 921 sequences # 2  

consensusID : consensus_898#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 921
fasta sequence
                              [AGCCCATTATNTCGGCACGACGGTGGTGACGAATTAGAATCATGATCTACAGTTGATGGTTAGGAACCAAATTTAGAGTTTTCATCACAAAGTGACATCAACTATAATGTCGACATAGTAATTAGCCAAATGAGTAGACGAATTTCGCTCTAAAATCCGTGACCTATTATCTCAGATCTGATTGGTTCGTCCATAAATTATATTTTCACCTGGGTATATATGCAAAACGATATTCTAATTGGAAATTATTCAAGTTGAAACAGTGGTCTTGGTTTGTTATAGACGACCAAAATTATGACAGTAACTCAACGAGGAAAAAGTACTCAGACTGTGGACTGAAATACTTCGAAGAGATTAAACAAAGTGATCAGTTAAGCAATTTTAGGTTTACGATATGATTGTTCCTATTCATTCTTTATGTTTAGAATCTCTGAATCCATGGTGAGCTGAGGGATGCAAAGATAAAGCAGTACTTTAGTCAGAAACTTCAGAACTATTTTTTAGAAAATGTCATACAAACGACAGGAGAAAATTCATGAGTCCAGAATTGAAAAATCGCTAGAGGATGATTATCTTTTCCTCAGGATTTGCAGCTGTTGGTGATTGTATGCAAGAGATTTTAGGATTCTTTTAATTAGTGCTTCCTGCTGCATAATATTTCATATCCTTGTGAAGTACGGATAACTCCCAGGAATTAACAATGGACTATTATTATATATATCTTTATTCATCTTCATTTTGACCTATGAATTATAAATATACGATTTACTGCCATTAAATTATATTCAGTTTATTGATTACTATATCCCATGTTCATAGCCATATTTGGCTTGATCTTGTACANATGTTATTATCTATTTTATGGTGTGGTGCGGTCCGTCTGTCTGGTATATAAACCGAGTATGCTTTGAAT-AATGATTC]

[+] EMBL CD081799             [AGCCCATTATNTCGGCACGACGGTGGTGACGAATTAGAATCATGATCTACAGTTGATGGTTAGGAACCAAATTTAGAGTTTTCATCACAAAGTGACATCAACTATAATGTCGACATAGTAATTAGCCAAATGAGTAGACGAATTTCGCTCTAAAATCCGTGACCTATTATCTCAGATCTGATTGGTTCGTCCATAAATTATATTTTCACCTGGGTATATATGCAAAACGATATTCTAATTGGAAATTATTCAAGTTGAAACAGTGGTCTTGGTTTGTTATAGACGACCAAAATTATGACAGTAACTCAACGAGGAAAAAGTACTCAGACTGTGGACTGAAATACTTCGAAGAGATTAAACAAAGTGATCAGTTAAGCAATTTTAGGTTTACGATATGATTGTTCCTATTCATTCTTTATGTTTAGAATCTCTGAATCCATGGTGAGCTGAGGGATGCAAAGATAAAGCAGTACTTTAGTCAGAAACTTCAGAACTATTTTTTAGAAAATGTCATACAAACGACAGGAGAAAATTCATGAGTCCAGAATTGAAAAATCGCTAGAGGATGATTATCTTTTCCTCAGGATTTGCAGCTGTTGGTGATTGTATGCAAGAGATTTTAGGATTCTTTTAATTAGTGCTTCCTGCTGCATAATATTTCATATCCTTGTGAAGTACGGATAACTCCCAGGAATTAACAATGGACTATTATTATATATATCTTTATTCATCTTCATTTTGACCTATGAATTATAAATATACGATTTACTGCCATTAAATTATATTCAGTTTATTGATTACTATATCCCATGTTCATAGCCATATTTGGCTTGATCTTGTACANATGTTATTATCTATTTTATGGTGTGGTGCGGTCCGTCTGTCTGGTATATAAACCGAGTATGCTTTGAAT AATGATT ]
[-] EMBL CD075530             [                                                                                                                                                                                                                                                      TATTCAAGTTGAAACAGTGGTCTTGGTTTGTTATAGACGACCAAAATTATGACAGTAACTCAACGAGGAAAAAGTACTCAGACTGTGGACTGAAATACTTCGAAGAGATTAAACAAAGTGATCAGTTAAGCAATTTTAGGTTTACGATATGATTGTTCCTATTCATTCTTTATGTTTAGAATCTCTGAATCCATGGTGAGCTGAGGGATGCAAAGATAAAGCAGTACTTTAGTCAGAAACTTCAGAACTATTTTTTAGAAAATGTCATACAAACGACAGGAGAAAATTCATGAGTCCAGAATTGAAAAATCGCTAGAGGATGATTATCTTTTCCTCAGGATTTGCAGCTGTTGGTGATTGTATGCAAGAGATTTTAGGATTCTTTTAATTAGTGCTTCCTGCTGCATAATATTTCATATCCTTGTGAAGTACGGATAACTCCCAGGAATTAACAATGGACTATTATTATATATATCTTTATTCATCTTCATTTTGACCTATGAATTATAAATATACGATTTACTGCCATTAAATTATATTCAGTTTATTGATTACTATATCCCATGTTCATAGCCATATTTGGCTTGATCTTGTACAAATGTTATTATCTATTTTATGGTGTGGTGCGGTCCGTCTGTCTGGTATATAAACCGAGTATGCTTGAAATAAATGGTTC]


>consensus_898#0 AGCCCATTATNTCGGCACGACGGTGGTGACGAATTAGAATCATGATCTACAGTTGATGGT TAGGAACCAAATTTAGAGTTTTCATCACAAAGTGACATCAACTATAATGTCGACATAGTA ATTAGCCAAATGAGTAGACGAATTTCGCTCTAAAATCCGTGACCTATTATCTCAGATCTG ATTGGTTCGTCCATAAATTATATTTTCACCTGGGTATATATGCAAAACGATATTCTAATT GGAAATTATTCAAGTTGAAACAGTGGTCTTGGTTTGTTATAGACGACCAAAATTATGACA GTAACTCAACGAGGAAAAAGTACTCAGACTGTGGACTGAAATACTTCGAAGAGATTAAAC AAAGTGATCAGTTAAGCAATTTTAGGTTTACGATATGATTGTTCCTATTCATTCTTTATG TTTAGAATCTCTGAATCCATGGTGAGCTGAGGGATGCAAAGATAAAGCAGTACTTTAGTC AGAAACTTCAGAACTATTTTTTAGAAAATGTCATACAAACGACAGGAGAAAATTCATGAG TCCAGAATTGAAAAATCGCTAGAGGATGATTATCTTTTCCTCAGGATTTGCAGCTGTTGG TGATTGTATGCAAGAGATTTTAGGATTCTTTTAATTAGTGCTTCCTGCTGCATAATATTT CATATCCTTGTGAAGTACGGATAACTCCCAGGAATTAACAATGGACTATTATTATATATA TCTTTATTCATCTTCATTTTGACCTATGAATTATAAATATACGATTTACTGCCATTAAAT TATATTCAGTTTATTGATTACTATATCCCATGTTCATAGCCATATTTGGCTTGATCTTGT ACANATGTTATTATCTATTTTATGGTGTGGTGCGGTCCGTCTGTCTGGTATATAAACCGA GTATGCTTTGAATAATGATTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)