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Schistosoma mansoni
cluster # 8980 cluster # 8980       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8980#0 length = 774 sequences # 8  
consensusID : consensus_8980#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 774
fasta sequence 
                              [TGGCTATTTTTGAAGTCATATATAAGGAAAAAGCAACCGAAGATAAAACGGAACTTAAAAATAAACAATTCAGATAAAAGACAAAAATCAACGGTTGGGGGGAGGTAAGGTCATAAGGAAGACAATATCACTCTGACCACAAATAATCCCATGAACATATTATTTCAATAGGTCATACAAGAAATAAAGTAATGAGAATGAAGAGCCTTAATTGTTTTTTTTAAAAAAAGTAGTAATCATAGAAAAGGATCTAAACAAATTTTCAAAAACAAGTCTTATTTTGAACTTAATATAGTTAGGTGATTACATAATCATTCAAATAAAAGGTGAAGAGGAATTCGCGTCAAACCAAAATATGTAGGCATAAAATACTGTATAAAAATTAACAAGGTAATATGGGTTGGAAGATAAAAATTTACTCTTAGGCAGTGCTAAAAACGGGAAAATAAAAAAAAACAGTCTCCCAACTAGATTTTCTGTCATGGTTGTCAAATATTTTGTAGTATGATATGAATTATAGAAAATAGAATGAAAAGAAAAACAGGGA-GAAGAATCACAAAACGACAATTTGACAATAACGGAAAAGTTTAGTACAGTAATATCAAATATACACATAGTCAATGAGTTTAAAATAAGTCTACTGTAATAGTAGAAAGGAAGATTTTTAAACTTGTTTTAAGTTAATTCACACAAATTTGTATTATTTAAAATAAACAAAAACAAAATTAAAAGTTTCATTATGTATATATATTGAACATTGAACAGCTGTCATTG]

[-] EMBL CD185690             [TGGCTATTTTTGAAGTCATATATAAGGAAAAAGCAACCGAAGATAAAACGGAACTTAAAAATAAACAATTCAGATAAAAGACAAAAATCAACGGTTGGGGGGAGGTAAGGTCATAAGGAAGACAATATCACTCTGACCACAAATAATCCCATGAACATATTATTTCAATAGGTCATACAAGAAATAAAGTAATGAGAATGAAGAGCCTTAATTGTTTTTTTTAAAAAAAGTAGTAATCATAGAAAAGGATCTAAACAAATTTTCAAAAACAAGTCTTATTTTGAACTTAATATAGTTAGGTGATTACATAATCATTCAAATAAAAGGTGAAGAGGAATTCGCGTCAAACCAAAATATGTAGGCATAAAATACTGTATAAAAATTAACAAGGTAATATGGGTTGGAAGATAAAAATTTACTCTTAGGCAGTGCTAAAAACGGGAAAATAAAAAAAAACAGTCTCCCAACTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD122404             [                                                                                                                                                                                                                     GTTTTTTTT AAAAAAGTAGTAATCATAGAAAAGGATCTAAACAAATTTTCAAAAACAAGTCTTATTTTGAACTTAATATAGTTAGGTGATTACATAATCATTCAAATAAAAGGTGAAGAGGAATTCGCGTCAAACCAAAATATGTAGGCATAAAATACTGTATAAAAATTAACAAGGTAATATGGGTTGGAAGATAAAAATTTACTCTTAGGCAGTGCTAAAAACGGGAAAATAAAAAAAAACAGTCTCCCAACTAGATTTTCTGTCATGGTTGTCAAATATTTTGTAGTATGATATGAATTATAGAAAATAGAATGAAAAGAAAAACAGGGA GAAGAATCACAAAACGACAATTTGACAATAACGGAAAAGTTTAGTACAGTAATATCAAATATACACATAGTCAATGAGTTTAAAATAAGTCTACTGTAATAGTAGAAAGGAAGATTTTTAAACTTGTTTTAAGTTAATTCACACAAATTTGTATTATTTAAAATAAACAAAAACAAAATTAAAAGTNTCATTATGTATATATATTGAACATTGAACAGCTGTCATT ]
[+] EMBL CD122345             [                                                                                                                                                                                                                     GTTTTTTTTAAAAAAAGTAGTAATCATAGAAAAGGATCTAAACAAATTTTCAAAAACAAGTCTTATTTTGAACTTAATATAGTTAGGTGATTACATAATCATTCAAATAAAAGGTGAAGAGGAATTCGCGTCAAACCAAAATATGTAGGCATAAAATACTGTATAAAAATTAACAAGGTAATATGGGTTGGAAGATAAAAATTTACTCTTAGGCAGTGCTAAAAACGGGAAAATAAAAAAAAACAGTCTCCCAACTAGATTTTCTGTCATGGTTGTCAAATATTTTGTAGTATGATATGAATTATAGAAAATAGAATGAAAAGAAAAACAGGGAGGAAGAATCACAAAACGACAATTTGACAATAACGGAAAAGTTTAGTACAGTAATATCAAATATACACATAGTCAATGAGTT                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD122322             [                                                                                                                                                                                                                     GTTTTTTTTAAAAAAAGTAGTAATCATAGAAAAGGATCTAAACAAATTTTCAAAAACAAGTCTTATTTTGAACTTAATATAGTTAGGTGATTACATAATCATTCAAATAAAAGGTGAAGAGGAATTCGCGTCAAACCAAAATATGTAGGCATAAAATACTGTGTAAAAATTAACAAGGTAATATGTGTTGGAAGATAAAAATTTACTCTTACGCAGTGCTAAAAACGGGAAAATAAAAAAAAACAGTCTCCCAACTAGATTTTCTGTCATGGCTGTCAAATATTTcgcccta                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD122303             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 anAAGGTGAAGAGGAATTCGCGTCAAACCAAAATATGTAGGCATAAAATACTGTATAAAAATTAACAAGGTAATATGGGTTGGAAGATAAAAATTTACTCTTAGGCAGTGCTAAAAACGGGAAAATAAAAAAAAACAGTCTCCCAACTAGATTTTCTGTCATGGTTGTCAAATATTTTGTAGTATGATATGAATTATAGAAAATAGAATGAAAAGAAAAACAGGGA GAAGAATCACAAAACGACAATTTGACAATAACGGAAAAGTTTAGTACAGTAATATCAAATATACACATAGTCAATGAGTTTAAAATAAGTCTACTGTAATAGTAGAAAGGAAGATTTTTAAACTTGTTTTAAGTTAATTCACACAAATTTGTATTATTTAAAATAAACAAAAACAAAATTAAAAGTTTCATTATGTATATATATTGAACATTGAACAGCTGTCATTG]
[-] EMBL CD122305             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CAAAATATGTAGGCATAAAATACTGTATAAAAATTAACAAGGTAATATGGGTTGGAAGATAAAAATTTACTCTTAGGCAGTGCTAAAAACGGGAAAATAAAAAAAAACAGTCTCCCAACTAGATTTTCTGTCATGGTTGTCAAATATTTTGTAGTATGATATGAATTATAGAAAATAGAATGAAAAGAAAAACAGGGA GAAGAATCACAAAACGACAATTTGACAATAACGGAAAAGTTTAGTACAGTAATATCAAATATACACATAGTCAATGAGTTTAAAATAAGTCTACTGTAATAGTAGAAAGGAAGATTTTTAAACTTGTTTTAAGTTAATTCACACAAATTTGTATTATTTAAAATAAACAAAAACAAAATTAAAAGTTTCATTATGTATATATATTGAACATTGAACAGCTGTCATTG]
[-] EMBL CD122308             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCATAGCAAATAGAATGAAAAGAAAAACAGGGA GAAGAATCACAAAACGACAATTTGACAATTACGGAAAAGTTTAGTACAGTAATATCAAATAGACACATAGTCAATGAGTTTAAAATAAGTCTACTGTAATAGTAGAAAGGAAGATTTTTCAACTTGTTTTAAGTTAATTCACACAAATTTGTATTATTTAAAATAAACAAAAACAAAATTAAAAGTTTCATTATGTATATATATTGAACATTGAACAGCTGTCATTG]
[-] EMBL CD122301             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTTGACAATAACGGAAAAGTTTAGTACAGTAATATCAAATAGACACATAGTCAATGAGTTTAAAATAAGTCTACTGTAATAGTAGAAAGGAAGATTTTTACACTTGTTTTAAGTTAATTCACACAAATTTGTATTATTTAAAATAAACAAAAACAAAATTAAAAGTTTCATTATGTATATATATTGAACATTGAACAGCTGTCATTG]




>consensus_8980#0
TGGCTATTTTTGAAGTCATATATAAGGAAAAAGCAACCGAAGATAAAACGGAACTTAAAA
ATAAACAATTCAGATAAAAGACAAAAATCAACGGTTGGGGGGAGGTAAGGTCATAAGGAA
GACAATATCACTCTGACCACAAATAATCCCATGAACATATTATTTCAATAGGTCATACAA
GAAATAAAGTAATGAGAATGAAGAGCCTTAATTGTTTTTTTTAAAAAAAGTAGTAATCAT
AGAAAAGGATCTAAACAAATTTTCAAAAACAAGTCTTATTTTGAACTTAATATAGTTAGG
TGATTACATAATCATTCAAATAAAAGGTGAAGAGGAATTCGCGTCAAACCAAAATATGTA
GGCATAAAATACTGTATAAAAATTAACAAGGTAATATGGGTTGGAAGATAAAAATTTACT
CTTAGGCAGTGCTAAAAACGGGAAAATAAAAAAAAACAGTCTCCCAACTAGATTTTCTGT
CATGGTTGTCAAATATTTTGTAGTATGATATGAATTATAGAAAATAGAATGAAAAGAAAA
ACAGGGAGAAGAATCACAAAACGACAATTTGACAATAACGGAAAAGTTTAGTACAGTAAT
ATCAAATATACACATAGTCAATGAGTTTAAAATAAGTCTACTGTAATAGTAGAAAGGAAG
ATTTTTAAACTTGTTTTAAGTTAATTCACACAAATTTGTATTATTTAAAATAAACAAAAA
CAAAATTAAAAGTTTCATTATGTATATATATTGAACATTGAACAGCTGTCATTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)