Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 8988 cluster # 8988       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8988#0 length = 553 sequences # 8  
consensusID : consensus_8988#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 553
fasta sequence 
                              [GATTCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT-GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCTCCAGGTTCAGGAGCCAATTGACGTTGTTCAATTTTGTATCCTGTCAATGGGCTACCACCATCATCTTCAGGTGGTTTCCATAATA]

[+] EMBL CD067130             [GATTCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACCAAATACATATTCTGTATTTGCTTGAAGATTATCAATTTGTGCCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGGCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD066512             [   TCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTC ATAGTGGAATGATTTATTGGTTTGGGCAGT AGTTGGTTTTGAATTTTCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCT                                                                                     ]
[+] EMBL CD066529             [   TCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAGTTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATAT                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD066414             [   TCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACA                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD066775             [   TCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATCGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAA                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD066643             [   TCACTTTTACCACCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCTTCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATCCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD184874             [                                                                                        ATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGATACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACTGGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCTCCAGGTTCAGGAGCCAATTGACGTTGTTCAATTTTGTATCCTGTCAATGGGCTACC                             ]
[-] EMBL CD186918             [                                                                                                                                                                                         TTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTT GGCAGTAAGTTGTTTTGGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTTGGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTTAATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTAATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCTCCAGGTTCAGGAGCCAATTGACGTTGTTCAATTTTGTATCCTGTCAATGGGCTACCACCATCATCTTCAGGTGGTTTCCATAATA]




>consensus_8988#0
GATTCACTTTTACCAGCCAAATTAGTACAGCTTACACAAAATTCATATTCTGTATTTGCT
TCAAGTTTATCAATTTGTACCATAGAACATGGTTCAAATGATTGAGTCTTCCATCTTGAT
ACATTCTTAGGACGATATTCAACAATTACACTAGTTAAAGGTGCTTCCACATGAGTCACT
GGTAATTTGAATTCTAATTCAATAGTGGAATGATTTATTGGTTTGGCAGTAAGTTGTTTT
GGAATTTCCGGAATATCATAAGGAGATTTCATTAATAAGCCATCGGAAATTTCTTTCCTT
GGTCCACTTCCACAATCATTAACTGCAGAAACACCAAACAAATAAGTAGCTCCTTCAGTT
AATCCTGTGATACGATGTACAAATGGTTCTTCGTCATCAGATGTTTTCGATTTTGAACTA
ATATTTGCAATTGACTTCCACTCTTTAGCCTGAGAACGTAAAACACCTCCAGGTTCAGGA
GCCAATTGACGTTGTTCAATTTTGTATCCTGTCAATGGGCTACCACCATCATCTTCAGGT
GGTTTCCATAATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)