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Schistosoma mansoni
cluster # 8989 cluster # 8989       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8989#0 length = 582 sequences # 8  
consensusID : consensus_8989#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 582
fasta sequence 
                              [GGAAAAATTTGTTTCTGCTCTCAACT-ACATAATGAGTAGGTTTCGTTGACTTTTCATGATCCTTGTAACAATAT-AAATCTCTGTTACTTACACCAAAAATCATGTTCCATTTGTATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATAAATAATGTGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACATGTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAATGTGATATAATAACTAATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGTGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACATCGTGTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTATAATTGCAGTCTTGTGTCGTTCGTGTCTTTTCGTTTGGTCTATTCATTCATTTCCCTTTTTTGCTTTATTTGCATTGTTGTGCTGACAATACGTACATGTANGCTTT]

[+] EMBL CD083411             [GGAAAAATTTGTTTCTGCTCTCAACT ACATAATGAGTAGGTTTCGTTGACTTTTCATGATCCTTGTAACAATAT AAATCTCTGTTACTTACACCAAAAATCATGTTCCATTTGTATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATAAATAATGTGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACATGTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAATGTGATATAATAACTAATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGTGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACATCGTGTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTA                                                                                                           ]
[+] EMBL CD202073             [       TTTGTTTCTGCTCTCAACTAACATAATGAGTAGGTTTCGTTGACTTTTCATGATCCTTGTAACAATATAAAATCTCTGTTACTTACACCAAAAATCATGTTCCATTTGTATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATAAATAATGTGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACATGTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAATGTGATATAATAACTAATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGTGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACATCGTGTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTATAATTGCAGTCTTGTGTCGTTCGTGTCTTTTCGTTTGGTCTATTCATTCATTTCCCTTTTTTGCTTTATTTGCATTGTTGNGCTGACAATA                ]
[-] EMBL CD145209             [                                                                                     ggggaagccCCAAAAATCATGTTCCATTTGTATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATAAATAATGTGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACATGTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAATGTGATATAATAACTAATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGTGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACATCGTGTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTATAATTGCAGTCTTGTGTCGTTCGTGTCTTTTCGTTTGGTCTATTCATTCATTTCCCTTTTTTGCTTTATTTGCATTGTTGTGCTGACAATAC               ]
[+] EMBL CD145292             [                                                                                                       ATGTTCCATTTGTATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATCAATAATGTGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACATGTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAATGTGATATAATAACTAATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGTGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACATCGTGTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTATAATTGCAGTCTTGTGTCGTTCGTGTCTTTTCGTTTGGTCTATTCATTCATTTCCCTTTTTTGCTTTATTTGCATTGTTGTGCTGACAATACGTACATGTANGCTTT]
[+] EMBL CD145280             [                                                                                                       ATGTTCCATTTGTATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATAAATAATGTGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACATGTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAATGTGATATAATAACCAATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGTGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACACCGTGTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTATAATTGCAGTCTTGTGTCGTTCGTGTCTTTTCGTTTGGTCTATTCATTCATTTCCCTTTTTTGCTTTATTTGCATTGNTGTGCTGACAATA                ]
[+] EMBL CD145319             [                                                                                                       ATGTTCCATTTGTATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATAAATAATGTGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACATGTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAGTGTGATATAATAACTAATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGTGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACATCGTGTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTATAATTGCAGTCTTGTGTCGTTCGTGTCTTTTCGTTTGGTCTATTCATTCATTTCCCTTTTTTGCTTTATTTGCATTGTTGTGCTGACAATA                ]
[+] EMBL CD145243             [                                                                                                       ATGTTCCATTTGAATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTGTATAAATAATGTGTTACTTGAATTGTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD145159             [                                                                                                        TGTTCCATTTGTATTTATTCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATAAATAATGTGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTTTGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACATGTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAATGTGATATAATAACTAATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGCGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACATCGTGTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTATAATTGCAGTCTTGTGTCGTTCGTGTCTTTTCGTTTGGTCTATTCATTCATTTCCCTTTTTTGCTTTATTTGCATTGTTGTGCTGACAATAC               ]




>consensus_8989#0
GGAAAAATTTGTTTCTGCTCTCAACTACATAATGAGTAGGTTTCGTTGACTTTTCATGAT
CCTTGTAACAATATAAATCTCTGTTACTTACACCAAAAATCATGTTCCATTTGTATTTAT
TCACATTTTCCAATTTTCATGTATTTACTCTTTTTCTAAAAACTAAGTATATAAATAATG
TGTTAGTTTAATTTTTTTCTCTGCCTGAATTATTCGAAATACACCCAATAACTGCACTTT
TGTAACTTGGTGTTTTGCAATACTAATATTTTTTTATAACTATTATGTATATCTAAACAT
GTATTTTGGTCGTGCATAATGTCTGACAAAGTGTTATCAACTGAATGTGATATAATAACT
AATCGTTTCCTTTTTTCAAGCGAACTATTTTGTGAGATTTTCAAAGTTTTTTCACATCGT
GTGAATGCTTGTCTATGTGTTATCACTACACAAATATCTATGAATCGTTTGTTTATAATT
GCAGTCTTGTGTCGTTCGTGTCTTTTCGTTTGGTCTATTCATTCATTTCCCTTTTTTGCT
TTATTTGCATTGTTGTGCTGACAATACGTACATGTANGCTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)