These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9011#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 591 fasta sequence [GTNTTCTATCAAAATCACA--GAGTATTATGAATAGTGATTGGAAAAGGCCAGATTTACCAAGCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGTTTCTAGTATCAGAAAAATTAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAATC] [+] EMBL CD153113 [GTTTTCTATCAAAATCACA GAGTATTATGAATAGTGATTGGAAAAGGCCAGATTTACCAAGCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGGTTCTAGTATCAGAAAAATTAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAAT ] [-] EMBL CD153022 [ TNTTCTATCANAATCACA GAGTANTATGAATAGTGA TGGAAAAGGCCAGATNTACCAAGCAAATGTACATTCTCTNTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCNCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGTTTCTAGTATCGGAAAAATTAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAATC] [-] EMBL CD164958 [ atttacTCAATAACATATCTACTATTATGAATAGTGATTGGAAAAGGCCAGATTNACCAAGCAAATGTACATTCTCTNTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATACTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCT GAAATACTGG ] [+] EMBL CD060792 [ gcaggGGAAAAGGCCAGATTTACCAAGCAAATGTACATTTTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTGGTGATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAAACAAAATGAGTAGTGAAAAGGA ] [+] EMBL CD061032 [ CAGATTTACCAAGCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGAATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAA ] [+] EMBL CD061031 [ CAGATTTACCAAGCAAATGTACATTCTCTTTAGACCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATTAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATA ] [-] EMBL CD153319 [ CTTTAGAGCAATCCATAAATGAAAGTCCTCATCATCATATTCCAATTCCCAAGAGGAATAAAATTATAAAAAAGTCATCAGAATTAATTGGTAATACACCTTTAATTCAACTTGATCGAATTGCAAAGCATGAAGATATAGAATGTGAACTTTTAGGAAAATGTGAATTTCTTAATATTGGAGGTAGTGTTAAAGATAGAATTGGAAAACGTATGATTGAAGAGGCTGGATTGGAAGGTAAACTGAAGCCTGGTGATACAATTATTGAACCCACCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCTTACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATAATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACGATGCCTTGGAGCTGAAATTGTTCGTACACCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCCTGATTCATTGTTTCTAGTATCAGAAAAATTAAAAAATGAAATTGGTCCATCTGCGCATATCATGAATCAATATACCAATC] [-] EMBL CD061003 [ CCCTCCTCTGGAAATACTGGTATTGGATTGGCGCATACTGCTGCTCTTAAAGGTTACCGATGTATCATTGTAATGTCAGACAAAATGAGTAGTGAAAAGGAATCGTATTTACAATGCATTGGAGCTGTAATTGTTCGTACCCCGGCTTCTGCGAATTTCGACAATCC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||