|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9013#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 848 fasta sequence
[GGTTTTCGTGCTTCCAGTGAAGTTGATACCAGCAAGTTGAGGGTGCTCACAAATTACTTTACCAAATGTTGGGCCATCTGCTGGGACAAAGTTGATTACGCCAGGGGGTAAACCTGCTTCGCGGAATAACCTGTAAACAAGGTAATTAGAATATACGGATGTATCAGAGGGTTTCCAAATCACAACATTCCCCATTAAAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTTTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAAATTGGCCAATGTTTTCGAATGCTCAAATGGCAAAATCTGCCTTCGAGGTTGTCCGGATGATAACTCGTTTGAATCAATGCATATAGGCACATGATAAGGCCCGTTCGAAATCATAGTATCCAACGTACTATCCAACCTCTGACGTTCCGTACTACCAGGCTTATGCAACAGAACTGGTTCGTTTGTGACCTGGAAAAGTCTGCTCAGTAGTTTTTGATACTGCCATTTCGGAACACAACGACAAACGTTACACGACC]
[+] EMBL CD060833 [GGTTTTCGTGCTTCCAGTGAAGTTGATACCAGCAAGTTGAGGGTGCTCACAAATTACTTTACCAAATGTTGGGCCATCTGCTGGGACAAAGTTGATTACGCCAGGGGGTAAACCTGCTTCGCGGAATAACCTGTAAACAAGGTAATTAGAATATACGGATGTATCAGAGGGTTTCCAAATCACAACATTCCCCATTAAAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTC ]
[-] EMBL CD159215 [ ATTACGCCAGGGGGTAAACCTGCTTCGCGGAATAACCTGTAAACAAGGTAATTAGAATATACGGATGTATCAGAGGGTTTCCAAATCACAACATTCCCCATTAAAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACT ]
[+] EMBL CD166544 [ tccatTCAGAGGGTT CAAATCACAACATTCCCCATT AAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTTTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAAATTGGCCAATGTTTTCGAATGCTCAAATGGCAAAATCTGCCTTCGAGGTTGTCCGGATGATAACTCGT ]
[+] EMBL CD152895 [ ATCACAACATTCCCCATTAAAGCTGGGGCACTTGCTAGGTTCCCTGCAATAGCGGTAAAATTAAATGGTGATATAGCAGCCCAAAACCCTTCATTTGCTCGGTAAACTACTTTATTCTTTGCATCCTGGGTATTGATTGGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCAACAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTNTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAA ]
[+] EMBL CD189580 [ GGTTTATATCGCAGAGCTTCTGAAGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAGTTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTTTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAAATTGGCCAATGTTTTCGAATGCTCAAATGGCAAAATCTGCCTTCGAGGTTGTCCGGATGATAACTCGTTTGAATCAATGCATATAGGCACATGATAAGGCCCGTTCGAAATCATAGTATCCAACGTACTATCCAACCTCTGACGTTCCGTACTACCAGGCTTATGCAACAGAACTGGT ]
[-] EMBL CD133457 [ GTTTATATCGCAGAGCTTCTGAGGCAAATTGCACATTAAAACGCAAGAAATCTGCTAATTCTGCAGCCGCGTCAATCTCAGCCTGAAAAATTGTTTTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGTACGTGACCACGTTTTGCGAGCTATTAAACAAGACTCAATTGCACTTTTGATTTGCTCTCCTGAGGCATGATAAAAATTGGCCAATGTTTTCGAATGCTCAAATGGCAAAATCTGCCTTCGAGGTTGTCCGGATGATAACTCGTTTGAATCAATGCATATAGGCACATGATAAGGCCCGTTCGAAATCATAGTATCCAACGTACTATCCGACCTCTGACGTTCCGTACTACCAGGCTTATGCAACAGAACTGGTT ]
[+] EMBL CD189221 [ TTTGCTTGACCGAGTATAGTTGATGCCAACAATTCCATGCGATATTTATCACTAACAAGGTCCGCTGCTTTTAAGAATACCTTAGCGCGTTCATCAAAACTTGT ]
[-] EMBL CD152685 [ GAATCAATGCATATAGGCACATGATAAGGCCCGTTCAAAATCATAGTATCCAACGTACTATCCAACCTCTGACGTTCCGTACTACCAGGCTTATGCAACAGAAATGGTTCGTTTGTGACCTGGAAAAGTCTGCTCAGTAGTTTTTGATACTGCCATTTCGGAACACAACGACAAACGTTACACGACC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||