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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9021#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1177 fasta sequence
[TCGTCATCTGTTGTTTTTTCCAACCCAAATGATCGTCGTTATTCGTATGAAAGTTCTAAATTTTCAAATACTTCAACTGAGAATAATACAAATAAATCGCCTTATATATTGTTTTATGTACACGGTGGTGGATTTATTGCTTTAACATCTCAGTCACAGGATAACTTTTTACGTATATGGGCTGAACAGTTAAACTGTCCAATTATAGCAGTAGATTATTCACTTTCACCTGAAGCTCCTTATCCACGTGCATTAGAAGAATGTTATTATGCCTATTGTTGGATAACATTAAATCGTGAAAACTTGGGTTGTATATCGGATGCGAAAATTGTTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTAC-TAATAAACCAAGTGCGATATTTTTGGCTTATACACCTGTATTGGTTTCTTTTACACCATCTCCTTCAAGATTATTATCGCTTTGTGATCCCCTACCTTGCC-TATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTTGTCTGCCAGGC]
[-] EMBL CD062417 [TCGTCATCTGTTGTTTTTTCCAACCCAAATGATCGTCGTTATTCGTATGAAAGTTCTAAATTTTCAAATACTTCAACTGAGAATAATACAAATAAATCGCCTTATATATTGTTTTATGTACACGGTGGTGGATTTATTGCTTTAACATCTCAGTCACAGGATAACTTTTTACGTATATGGGCTGAACAGTTAAACTGTCCAATTATAGCAGTAGATTATTCACTTTCACCTGAAGCTCCTTATCCACGTGCATTAGAAGAATGTTATTATGCCTATTGTTGGATAACATTAAATCGTGAAAACTTGGGTTGTATATCGGATGCGAAAATTGTTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTAC TAATAAACCAAGTGCGA ]
[-] EMBL CD197868 [ TTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTACTTAATAAACCAAGTGGGATATTTTTGGCTTATACACCTGTATTGGTTTCTTTTACACCATCTCCTTCAAGATTATTATCGCTTTGTGATCCCCTA CTT CC TATCGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAA ]
[+] EMBL CD113751 [ CCCCTACCTTGCC TATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATAT ]
[+] EMBL CD113842 [ tacTGCCGTATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGTATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCG ]
[+] EMBL CD112309 [ tCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTT ]
[+] EMBL CD192385 [ GGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATGCTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCT ]
[-] EMBL CD063265 [ CACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATT ]
[+] EMBL CD193827 [ CAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATACACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTTGTCTGCCAGGC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||