These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9021#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1177 fasta sequence [TCGTCATCTGTTGTTTTTTCCAACCCAAATGATCGTCGTTATTCGTATGAAAGTTCTAAATTTTCAAATACTTCAACTGAGAATAATACAAATAAATCGCCTTATATATTGTTTTATGTACACGGTGGTGGATTTATTGCTTTAACATCTCAGTCACAGGATAACTTTTTACGTATATGGGCTGAACAGTTAAACTGTCCAATTATAGCAGTAGATTATTCACTTTCACCTGAAGCTCCTTATCCACGTGCATTAGAAGAATGTTATTATGCCTATTGTTGGATAACATTAAATCGTGAAAACTTGGGTTGTATATCGGATGCGAAAATTGTTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTAC-TAATAAACCAAGTGCGATATTTTTGGCTTATACACCTGTATTGGTTTCTTTTACACCATCTCCTTCAAGATTATTATCGCTTTGTGATCCCCTACCTTGCC-TATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTTGTCTGCCAGGC] [-] EMBL CD062417 [TCGTCATCTGTTGTTTTTTCCAACCCAAATGATCGTCGTTATTCGTATGAAAGTTCTAAATTTTCAAATACTTCAACTGAGAATAATACAAATAAATCGCCTTATATATTGTTTTATGTACACGGTGGTGGATTTATTGCTTTAACATCTCAGTCACAGGATAACTTTTTACGTATATGGGCTGAACAGTTAAACTGTCCAATTATAGCAGTAGATTATTCACTTTCACCTGAAGCTCCTTATCCACGTGCATTAGAAGAATGTTATTATGCCTATTGTTGGATAACATTAAATCGTGAAAACTTGGGTTGTATATCGGATGCGAAAATTGTTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTAC TAATAAACCAAGTGCGA ] [-] EMBL CD197868 [ TTCTTGCTGGTGATTCCGCTGGTGGGAATCTGGCACTAGGTGTTTGTATGCGCGCTGTACGAGATCGCTTACTTAATAAACCAAGTGGGATATTTTTGGCTTATACACCTGTATTGGTTTCTTTTACACCATCTCCTTCAAGATTATTATCGCTTTGTGATCCCCTA CTT CC TATCGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAA ] [+] EMBL CD113751 [ CCCCTACCTTGCC TATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATAT ] [+] EMBL CD113842 [ tacTGCCGTATAGGTGTTCTTTCTAAATGTTTATTGGCTTATGCTGGTATAGACGAAGCAAGATTGGATTCCGACAAACTTGGTGATAATTTTGAAGTTGATGAAAATCCTTCAAACTTAACAACTGAACAAAATTCCCCAATATGGTCCCGATTATTTTCAACATTTTGGTCCAATCCACCAAAATTAGATTTAAATAATTCTAAAGAGTTAAAAATTGGACATTTACGTCGATATTCAAACATAACAATGTCTCCTTTATATGATACTTATTTTCAAAATCCAAAAGATCAATCTATGCCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGTATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCG ] [+] EMBL CD112309 [ tCCTCTAATTTATATCGGTTAAGTGAAAACTCTCACTTCCTACATAAATCCCCAAAGTGGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTT ] [+] EMBL CD192385 [ GGAATAAATCAGAGAAAGGAAAAAACCCAGACCATAATGAGGATGAATGCACACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATGCTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCT ] [-] EMBL CD063265 [ CACCAATATCTAAACATCCTCGTCGACCCCCAACCGATTTGAACCGTATTCGAAATATTCACTTAATTCAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATATACGTGTCTTAGATGATT ] [+] EMBL CD193827 [ CAGAATGGATTCATGTCACCATACTTAGCTTCAGATGATATGCTACGTGGATTACCTCCTGTTGTTATTGTCTGTTCACATTTCGATCCATTTTTGGATGATGGACTGGAGTTGGCTAAACGCCTTTCTAAACTTGATGTCTCAGTAGATACACGTGTCTTAGATGATTTACCTCATGCATTTCTTAATTTTTGTCTGCCAGGC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||