cluster # 9026

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Schistosoma mansoni
cluster # 9026 cluster # 9026 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_9026#0 length = 1114 sequences # 4

consensus_9026#1 length = 626 sequences # 4

consensusID : consensus_9026#0
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Sequences nbr = 4
consensus length = 1114
fasta sequence

                              [CGGCACGAGGGCTTCAATAACCTTATGACTGAAATCATCCCAATTTTTTACGATAGAGTTAGATGGTAGTCATGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATTTTATCGGACTTATTATCTAAATTCGACAATAATCTGTCTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTCCCGGAACATTTTGCATTTCGATGGTTAAGTTTATTGTTGGCACGAGAATTCATGCTTCCAGATGTACTCCTATTATGGGATACACTTTTCTCAGATCCACACAGGTTCAACTTACTTCCATATGTTTGCTGTTCAATGTTAATTGGTATTCGTGATCAATTATTGAAAGCTGATTTTCCTACGGCTGTTCAGCTTGTCCAAAATTATCCATCAAATGTCGATGTAATGCATATTCTTTTGAAAGCCAGAGCATTCTATACAGATCGCCAGATTTGAAGCCTTATCTTTTCAACTGTTAGATTATTTTTTGTTATGACCACCTATTCTGAACAAGAAATAGAAATGTTAATGTGCTATATTTAAATGTGTGTACATGTGTATGCGCATATGTTCGTACTCACCTATCCACGAGTGTTCTTTTTTTTCTTCTCTTTCTCTCCTATTTACTAATCTCAAATATTTCTCCTTTATTTTGATTGAATATCAGTTACTTGGTGACTGATTACANNACATCGTTTTGATATCTTTGATGATT-AAATTACTGTTATTGTTATAATTTATTTCATATTAAATTTGTAATATGATCACTTTTATTTTGGTCTCTTTTTCCCCATCCATATTCTTTTTTAATAAAATGTTAATATTGTCTTATTCTAAATTGTTATTGCATCTTAATGGTAGTGCACCAATGATTTTCTCTTTTCCCTGATTATTAAATTTAAAATGGTTGTTTGAATATTACGATATATTGTTCAAGACAGTTACCTTTTTCTTTTTGAATTTTTACTTTCAGAATGATTATTTTTTTGTTGATTTGAAAACATTGAATTAAATCCTCATTTTGTAACACTATTGTTTAAATAGACATGTGTAATTTCAAAGAGAATGATTTATGTTGTATATTTATGAGAAGTGTTTGTTTGTTTTGTCAAATATTATTTGTAC]

[+] EMBL CD083652             [CGGCACGAGGGCTTCAATAACCTTATGACTGAAATCATCCCAATTTTTTACGATAGAGTTAGATGGTAGTCATGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATTTTATCGGACTTATTATCTAAATTCGACAATAATCTGTCTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTCCCGGAACATTTTGCATTTCGATGGTTAAGTTTATTGTTGGCACGAGAATTCATGCTTCCAGATGTACTCCTATTATGGGATACACTTTTCTCAGATCCACACAGGTTCAACTTACTTCCATATGTTTGCTGTTCAATGTTAATTGGTATTCGTGATCAATTATTGAAAGCTGATTTTCCTACGGCTGTTCAGCTTGTCCAAAATTATCCATCAAATGTCGATGTAATGCATATTCTTTTGAAAGCCAGAGCATTCTATACAGATCGCCAGATTTGAAGCCTTATCTTTTCAACTGTTAGATTATTTTTTGTTATGACCACCTATTCTGAACAAGAAATAGAAATGTTAATGTGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD082918             [                                                                        TGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATTTTATCGGACTTATTATCTAAATTCGACAATAATCTGTCTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTTCCGGAACATTTTGCATTTCGATGGTTAAGTTTATTGTTGGCACGAGAATTCATGCTTCCAGATGTACTCCTATTATGGGATACACTTTTCTCAGATCCACACAGGTTCAACTTACTTCCATATGTTTGCTGTTCAATGTTAATTGGTATTCGTGATCAATTATTGAAAGCTGATTTTCCTACGGCTGTTCAGCTTGTCCAAAATTATCCATCAAATGTCGATGTAATGCATATTCTTTTGAAAGCCAGAGCATTCTATACAGATCGCCAGATTTGAAGCCTTATCTTTTCAACTGTTAGATTATTTTTTGTTATGACCACCTATTCTGAACAAGAAATAGAAATGTAAATGTGCTATATTTAAATGTGTGTACATGTGTATGCGCATATGTTCGTACTCACCTATCCACGAGTGTTCTTTTTTTTCTTCTCTTTCTCTCCTATTTACTAATCTCAAATATTTCTCCTTTATTTTGATTGAATATCAGTTACTTGGTGACTGATTACANNACATCGTTTTGATATCTTTGATGATT AAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD076501             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTACTCACCTATCCACGAGTGTTCTTTTTTTTCTTCTCTTTCTCTCCTATTTACTAATCTCAAATATTTCTCCTTTATTTTGATTGAATATCAGTTACTTGGTGACTGATTACAAAACATCGTTTTGATATCTTTGATGATTAAAATTACTGTTATTGTTATAATTTATTTCATATTAAATTTGTAATATGATCACTTTTATTTTGGTCTCTTTTTCCCCATCCATATTCTTTTTTAATAAAATGTTAATATTGTCTTATTCTAAATTGTTATTGCATCTTAATGGTAGTGCACCAATGATTTTCTCTTTTCCCTGATTATTAAATTTAAAATGGTTGTTTGAATATTACGATATATTGTTCAAGACAGTTACCTTTTTCTTTTTGAATTTTTACTTTCAGAATGATTATTTTTTTGTTGATTTGAAAACATTGAATTAAATCCTCATTTTGTAACACTATTGTTTAAATAGACATGTGTAATTTCAAAGAGAATGATTTATGTTGTATATTTATGAGAAGTGTTTGTTTGTTTTGTCAAATATTATTTGTAC]
[-] EMBL SMW745               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTTTTTTAATAAAATGTTAATATTGTCTTATTCTAAATTGTTATTGCATCTTAATGGTAGTGCACCAATGATTTTCTCTTTTCCCTGATTATTAAATTTAAAATGGTTGTTTGAATATTACGATATATTGTTCAAGACAGTTACCTTTTTCTTTCTGAATTTTTACTTTCAGAATGATTATTTTTTTGTTGATTTGAAAACATTGAATTAAATCCTCATTTTGTAACACTATTGTTTAAATAGACATGTGTAAT                                                                      ]




>consensus_9026#0
CGGCACGAGGGCTTCAATAACCTTATGACTGAAATCATCCCAATTTTTTACGATAGAGTT
AGATGGTAGTCATGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATTTTATCGGACTTATTATC
TAAATTCGACAATAATCTGTCTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTCCCGGAACATTT
TGCATTTCGATGGTTAAGTTTATTGTTGGCACGAGAATTCATGCTTCCAGATGTACTCCT
ATTATGGGATACACTTTTCTCAGATCCACACAGGTTCAACTTACTTCCATATGTTTGCTG
TTCAATGTTAATTGGTATTCGTGATCAATTATTGAAAGCTGATTTTCCTACGGCTGTTCA
GCTTGTCCAAAATTATCCATCAAATGTCGATGTAATGCATATTCTTTTGAAAGCCAGAGC
ATTCTATACAGATCGCCAGATTTGAAGCCTTATCTTTTCAACTGTTAGATTATTTTTTGT
TATGACCACCTATTCTGAACAAGAAATAGAAATGTTAATGTGCTATATTTAAATGTGTGT
ACATGTGTATGCGCATATGTTCGTACTCACCTATCCACGAGTGTTCTTTTTTTTCTTCTC
TTTCTCTCCTATTTACTAATCTCAAATATTTCTCCTTTATTTTGATTGAATATCAGTTAC
TTGGTGACTGATTACANNACATCGTTTTGATATCTTTGATGATTAAATTACTGTTATTGT
TATAATTTATTTCATATTAAATTTGTAATATGATCACTTTTATTTTGGTCTCTTTTTCCC
CATCCATATTCTTTTTTAATAAAATGTTAATATTGTCTTATTCTAAATTGTTATTGCATC
TTAATGGTAGTGCACCAATGATTTTCTCTTTTCCCTGATTATTAAATTTAAAATGGTTGT
TTGAATATTACGATATATTGTTCAAGACAGTTACCTTTTTCTTTTTGAATTTTTACTTTC
AGAATGATTATTTTTTTGTTGATTTGAAAACATTGAATTAAATCCTCATTTTGTAACACT
ATTGTTTAAATAGACATGTGTAATTTCAAAGAGAATGATTTATGTTGTATATTTATGAGA
AGTGTTTGTTTGTTTTGTCAAATATTATTTGTAC

consensusID : consensus_9026#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 626
fasta sequence

                              [TCGATTCTTTTCGTCGTCCCACAGAGTATTCTTGTCTGTCATGATTTGGAAAGGAAGTACCTCTTGGGGTATTACGGAGAAGAGGGGAAACCTCTGCACTTCACTCCCGTTCATTGAGTAAAAATCTTGCTGCTCTTACAAATATGATTCATCTGTCTACTTACGCTCCTTACCAACCAAACCATCGGTTATCTTCCTGGTTTAGTAACCCAATCACAAACAAGTAAGATGATCCGTAATAGCGATTGGAATTCGACCTCACCGCATGAGGAACCTCACTGGGAAGTGATTGAAAGAATTCTATATGTATATTACAAAACTCATGTGTCTCAGGGTTATGTTCAAGGAATGAATGAAATTATTGCACCGATATACTATGTTTTCGCCACTGACCCCGATGAATCCTGGAGAAAATATGCAGAAATGGATACATTTTATTGCTTCAATAACCTTATGACTGAAATTCATCCCAATTTTTTACGAAAGTTAGATGGTAGTCATGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATATTATCGGACTTATTATCTAAATTCGACAATAATCTGTCTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTTCCGGAACATTTTGCCCTTCCATGGTTAAG]

[-] EMBL BG930970             [TCGATTCTTTTCGTCGTCCCACAGAGTATTCTTGTCTGTCATGATTTGGAAAGGAAGTACCTCTTGGGGTATTACGGAGAAGAGGGGAAACCTCTGCACTTCACTCCCGTTCATTGAGTAAAAATCTTGCTGCTCTTACAAATATGATTCATCTGTCTACTTACGCTCCTTACCAACCAAACCATCGGTTATCTTCCTGGTTTAGTAACCCAATCACAAACAAGTAAGATGATCCGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD178247             [              tGTCCCACAAAGTATTCTTGCCTGTCATTATTTGGAAAGGAAGTACCTGTTGGGGTATTACGGAGAAGAGGGGAAACCTCTGCACTTCAGTCCCGTTCATTGAATAAAAATCTTGCTGGTGTTACAAATATGATTCATCTGTCTACTTACGCTCCTTACCAACCAAACCATCGGTTATCTT CTGGTTTAGTAACGCAATCACAAATAAGTAAGATGAACCGTAATAGCGATTGGAATTCGACCTCACCGCATGAGGAACCTCACTGGGAAGTGATTGAAAGAATTCTATATGTATATTACAAAACTCATGTGTCTCAGGGTTATGTTCAAGGAATGAATGAAATTATTGCACCGATATACTATGTTTTCGCCACTGACCCCGATGAATCCTGGAGAAAATATGCAGAAATGGATACATTTTATTGCTTCAATAACCTTATGACTGAAATTCATCCCAATTTTTTACGAAAGTTAGATGGTAGTCATGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATATTATCGGACTTATTATCTAAATTCGACAATAATCTGTCTAAACA                                                   ]
[-] EMBL CD118278             [                                                                                                                                                                                                                                                     TTGGAATTCGACCTCACCGCATGAGGAACCTCACTGGGAAGTGATTGAAAGAATTCTATATGTATATTACAAAACTCATGTGTCTCAGGGTTATGTTCAAGGAATGAATGAAATTATTGCACCGATATACTATGTTTTCGCCACTGACCCCGATGAATCCTGGAGAAAATATGCAGAAATGGATACATTTTATTGCTTCAATAACCTTATGACTGAAATTCATCCCAATTTTTTACGAAAGTTAGATGGTAGTCATGAAG                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD062690             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCAGAAATGGAGACATTTTATTGCTTCAATACCCTTATGACTGAAATTCATCCCAATTTTTTTTAACAGTTAGATGGTAGTCATGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATTTTATCGGACTTATTATCTAAATTCGACAATAATCTGTTTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTTCCGGAACATTTTGCCCTTCCATGGTTAAG]




>consensus_9026#1
TCGATTCTTTTCGTCGTCCCACAGAGTATTCTTGTCTGTCATGATTTGGAAAGGAAGTAC
CTCTTGGGGTATTACGGAGAAGAGGGGAAACCTCTGCACTTCACTCCCGTTCATTGAGTA
AAAATCTTGCTGCTCTTACAAATATGATTCATCTGTCTACTTACGCTCCTTACCAACCAA
ACCATCGGTTATCTTCCTGGTTTAGTAACCCAATCACAAACAAGTAAGATGATCCGTAAT
AGCGATTGGAATTCGACCTCACCGCATGAGGAACCTCACTGGGAAGTGATTGAAAGAATT
CTATATGTATATTACAAAACTCATGTGTCTCAGGGTTATGTTCAAGGAATGAATGAAATT
ATTGCACCGATATACTATGTTTTCGCCACTGACCCCGATGAATCCTGGAGAAAATATGCA
GAAATGGATACATTTTATTGCTTCAATAACCTTATGACTGAAATTCATCCCAATTTTTTA
CGAAAGTTAGATGGTAGTCATGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATATTATCGGAC
TTATTATCTAAATTCGACAATAATCTGTCTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTTCCG
GAACATTTTGCCCTTCCATGGTTAAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9026#0      CGGCACGAGGGCTTCAATAACCTTATGACTGAAATCATCCCAATTTTTTACGATAGAGTT 60
consensus_9026#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9026#0      AGATGGTAGTCATGAAGCTGGTCTGGGTGGGCAAATGAAAATTTTATCGGACTTATTATC 120
consensus_9026#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9026#0      TAAATTCGACAATAATCTGTCTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTCCCGGAACATTT 180
consensus_9026#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9026#0      TGCATTTCGATGGTTAAGTTTATTGTTGGCACGAGAATTCATGCTTCCAGATGTACTCCT 240
consensus_9026#1      ------TCGATTCTT---TTCGTCGTCCCACAGAGTATTCTTGTCT---GTCATGATTTG 48
                            *****  **   **  * **      *** **** **  *   *   *  *   

consensus_9026#0      ATTATGGGATACACTTTTCTCAGATCCACACAGGTTCAACTTA-CTTCCATATGTTTGCT 299
consensus_9026#1      G--AAAGGAAGTACCTCTTGGGGTATTACGGAGAAGAGGGGAAACCTCTGCAC-TTCACT 105
                         *  ***   ** * *    *    **  **         * * **   *  **  **

consensus_9026#0      GTTCAATGTTAATTGGTATTCGTGATCAATTATTGAAAGCTGATTTTCCTACGGCTGTTC 359
consensus_9026#1      CCCGTTCATTGAGTAAAAATCTTG-CTGCTCTTACAAATATGATTCATCTGTCTACTTAC 164
                              ** * *   * ** **     *  *  ***  *****   **       * *

consensus_9026#0      AGCTTGTCCAAAATTATCCATCAAATGTCGATGTAATGCA-TATTCTTTTGAAAGCCAGA 418
consensus_9026#1      GCTCCTTACCAACCAAACCATCGGTTATCTTCCTGGTTTAGTAACCCAATCACAAACAAG 224
                            * * **   * *****   * **    *  *  * **  *   * * *  **  

consensus_9026#0      GCATTCTATACAGATCGCCAGATTTGAAGCCTTATCTTTTCAACTGTTAGATTATTTTTT 478
consensus_9026#1      TAAGATGATCCGTAATAGCGA--TTGGAATTCGACCTCACCGCATGAGGAACCTCACTGG 282
                        *    ** *  *    *    *** *     * **   *   **    *      *  

consensus_9026#0      GTTATGACC--ACCTATTCTGAACAAGAAATAGAAATGTTAATGTGCTATATTTAAATGT 536
consensus_9026#1      GAAGTGATTGAAAGAATTCTATATGTATATTACAAA-ACTCATGTGTC----TCAGGGTT 337
                      *   ***    *   *****  *     * ** ***   * *****      * *    *

consensus_9026#0      GTGTACATGTGTATGCGCATATGTTCGTACTCACCTATCCACGAGTGTTCTTTTTTTTCT 596
consensus_9026#1      ATGTTCAAG---GAATGAATGAAATTAT-TGCACCGATATACTA-TGTTTTCGCCACTGA 392
                       *** ** *       * **    *  *   **** **  ** * **** *      *  

consensus_9026#0      TCTCTTTCTCTCCTATTTACTAATCTCAAATATTTCTCCTTTATTTTGATTGAATATCAG 656
consensus_9026#1      CCCCGATGAATCCTGGAGAAAATATGCAGAAATGGATACATTTTATTGCTTCAATA---- 448
                       * *  *   ****    *  *    ** * **   * * ** * *** ** ****    

consensus_9026#0      TTACTTGGTGACTGATTACANNACATCGTTTTGATATCTTTGATGATTAAATTACTGTTA 716
consensus_9026#1      --ACCTTATGACTGA----AATTCATC--CCAATTTTTTACGAAAGTTAGATGGTAGTCA 500
                        ** *  *******    *   ****       * * *  **   *** **    ** *

consensus_9026#0      TTGTTATAATTTATTTCATATTAAATTTGTAATATGATCACTTTTATTTTGGTCTCTTTT 776
consensus_9026#1      TGAAGCTGGTCTGG---GTGGGCAAATGAAAATATTATCGGACTTATT---ATCTAAATT 554
                      *     *  * *      *    ** *   ***** ***    *****    ***   **

consensus_9026#0      TCCCCATCCATATTCTTTTTTAATAAAATGTTAATATTGT-CTTATTCTAAATTGTTATT 835
consensus_9026#1      ----CGACAATAATCTGTCTAAACACTTTAAAAAAATAGAACTTGTTCCGGAACATT-TT 609
                          *  * *** *** * * ** *   *   ** ** *  *** ***   *   ** **

consensus_9026#0      GCATCTTAATGGTAGTGCACCAATGATTTTCTCTTTTCCCTGATTATTAAATTTAAAATG 895
consensus_9026#1      GCCCTTCCATGGTTAAG------------------------------------------- 626
                      **   *  *****   *                                           

consensus_9026#0      GTTGTTTGAATATTACGATATATTGTTCAAGACAGTTACCTTTTTCTTTTTGAATTTTTA 955
consensus_9026#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9026#0      CTTTCAGAATGATTATTTTTTTGTTGATTTGAAAACATTGAATTAAATCCTCATTTTGTA 1015
consensus_9026#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9026#0      ACACTATTGTTTAAATAGACATGTGTAATTTCAAAGAGAATGATTTATGTTGTATATTTA 1075
consensus_9026#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9026#0      TGAGAAGTGTTTGTTTGTTTTGTCAAATATTATTTGTAC 1114
consensus_9026#1      ---------------------------------------