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Schistosoma mansoni
cluster # 9041 cluster # 9041       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9041#0 length = 914 sequences # 8  

consensusID : consensus_9041#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 914
fasta sequence
                              [CTCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAGAAATCATGCAGCTTGTTGGTTTTGTTTAGGTAATCCACAAGTTAAAAAACATTTAATTGTTAGTATTGGTACTCAAGCCTATGTAGCATTACCGCGTGGTCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAACTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATAAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAATTTGAAGACCCAACATTATCAACTTCAAGTTGTTCCTGTACCATTTTCAGTTGCAGCGGAGGTGAAACAAGTATTTCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG-CTAAAGATTTTC-GAAAAATGTTTTTG-CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATAACATAGTTTTTTTAATAACCATGAATTATC]

[+] EMBL CD079985             [CTCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAGAAATCATGCAGCTTGTTGGTTTTGTTTAGGTAATCCACAAGTTAAAAAACATTTAATTGTTAGTATTGGTACTCAAGCCTATGTAGCATTACCGCGTGGTCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAACTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATAAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAATTTGAAGACCCAACATTATCAACTTCAAGTTGTTCCTGTACCATTTTCAGTTGCAGCGGAGGTGAAACAAGTATTTCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCC AAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAG AAATCTTTCTC AATAGCATTTTGCTTTATTTTTTT AAGGATGAA TATTCATTC TTAAACTATCATC TCATATGTCTTG AGTAAG AACG AAAC AAAG ATGTAAA TGT CAGA TC ATTCCC  TTTCTA ACATCTACATAGTTTTTTTAATAACCATGAATTATC]
[+] EMBL BG930981             [                                                                                                                              ctcCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAAGTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATGAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL AI974989             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA                              ]
[-] EMBL AI976178             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTCCAATACTATTTTTAGTCCATGCGAACTAAACCCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA                              ]
[-] EMBL CD064466             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTCGACGGACAGTATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGTATAACTTTTTGGACGAATTCCGAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGTAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGTCACTGATTTAG ATAAAGATTTTCAGAAAAATGTTTTTGTCCATTT                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD064485             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCGAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGCAGAAGATGAAGTAACTGATTTAGCCTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTGTG CCATT                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BF936359             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GAAGATGAAGAAGCTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATCCTGAATAAGCAGAACCAATTTTCAAAGAAATTCTTTCTCAAATAGCAT                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL AW017196             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAACCAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAACCGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA                              ]


>consensus_9041#0 CTCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAGAAATCATGCAGCTTGTTGGTTTTGTTTAGGT AATCCACAAGTTAAAAAACATTTAATTGTTAGTATTGGTACTCAAGCCTATGTAGCATTA CCGCGTGGTCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAACTATCGGTCATCATCAAAGC TGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATAAATCCCGATTAAAA CGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAATTTGAAGACCCAA CATTATCAACTTCAAGTTGTTCCTGTACCATTTTCAGTTGCAGCGGAGGTGAAACAAGTA TTTCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGA CGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCT ACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAA TTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGG CATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAGCTAAAGATTTTCGAAAAATG TTTTTGCCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACA GAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGAT GAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAA AGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATAACATAGTTTTTTTAAT AACCATGAATTATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)