These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9041#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 914 fasta sequence [CTCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAGAAATCATGCAGCTTGTTGGTTTTGTTTAGGTAATCCACAAGTTAAAAAACATTTAATTGTTAGTATTGGTACTCAAGCCTATGTAGCATTACCGCGTGGTCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAACTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATAAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAATTTGAAGACCCAACATTATCAACTTCAAGTTGTTCCTGTACCATTTTCAGTTGCAGCGGAGGTGAAACAAGTATTTCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG-CTAAAGATTTTC-GAAAAATGTTTTTG-CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATAACATAGTTTTTTTAATAACCATGAATTATC] [+] EMBL CD079985 [CTCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAGAAATCATGCAGCTTGTTGGTTTTGTTTAGGTAATCCACAAGTTAAAAAACATTTAATTGTTAGTATTGGTACTCAAGCCTATGTAGCATTACCGCGTGGTCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAACTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATAAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAATTTGAAGACCCAACATTATCAACTTCAAGTTGTTCCTGTACCATTTTCAGTTGCAGCGGAGGTGAAACAAGTATTTCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCC AAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAG AAATCTTTCTC AATAGCATTTTGCTTTATTTTTTT AAGGATGAA TATTCATTC TTAAACTATCATC TCATATGTCTTG AGTAAG AACG AAAC AAAG ATGTAAA TGT CAGA TC ATTCCC TTTCTA ACATCTACATAGTTTTTTTAATAACCATGAATTATC] [+] EMBL BG930981 [ ctcCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAAGTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATGAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAA ] [-] EMBL AI974989 [ TCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA ] [-] EMBL AI976178 [ CTTCCAATACTATTTTTAGTCCATGCGAACTAAACCCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA ] [-] EMBL CD064466 [ CTCGACGGACAGTATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGTATAACTTTTTGGACGAATTCCGAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGTAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGTCACTGATTTAG ATAAAGATTTTCAGAAAAATGTTTTTGTCCATTT ] [-] EMBL CD064485 [ GGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCGAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGCAGAAGATGAAGTAACTGATTTAGCCTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTGTG CCATT ] [-] EMBL BF936359 [ GAAGATGAAGAAGCTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATCCTGAATAAGCAGAACCAATTTTCAAAGAAATTCTTTCTCAAATAGCAT ] [-] EMBL AW017196 [ TCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAACCAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAACCGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||