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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9041#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 914 fasta sequence
[CTCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAGAAATCATGCAGCTTGTTGGTTTTGTTTAGGTAATCCACAAGTTAAAAAACATTTAATTGTTAGTATTGGTACTCAAGCCTATGTAGCATTACCGCGTGGTCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAACTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATAAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAATTTGAAGACCCAACATTATCAACTTCAAGTTGTTCCTGTACCATTTTCAGTTGCAGCGGAGGTGAAACAAGTATTTCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG-CTAAAGATTTTC-GAAAAATGTTTTTG-CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATAACATAGTTTTTTTAATAACCATGAATTATC]
[+] EMBL CD079985 [CTCGCGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGAGAAATCATGCAGCTTGTTGGTTTTGTTTAGGTAATCCACAAGTTAAAAAACATTTAATTGTTAGTATTGGTACTCAAGCCTATGTAGCATTACCGCGTGGTCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAACTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATAAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAATTTGAAGACCCAACATTATCAACTTCAAGTTGTTCCTGTACCATTTTCAGTTGCAGCGGAGGTGAAACAAGTATTTCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCC AAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAG AAATCTTTCTC AATAGCATTTTGCTTTATTTTTTT AAGGATGAA TATTCATTC TTAAACTATCATC TCATATGTCTTG AGTAAG AACG AAAC AAAG ATGTAAA TGT CAGA TC ATTCCC TTTCTA ACATCTACATAGTTTTTTTAATAACCATGAATTATC]
[+] EMBL BG930981 [ ctcCCTATTGTACCTGACCATGCATTGATTTTAAGTATCGGTCATCATCAAAGCTGGATGTCTTGTCCAGAATATGTTCGTTCGGAAATTGAAGAATATGAATCCCGATTAAAACGTATGTATGCTGCACAAGGTAAAGCGATGGTAACATTTGAACGAAA ]
[-] EMBL AI974989 [ TCTCGAGCTATCTTCCAATACTGATTTTAGTCCATGCGAACTAAAACCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA ]
[-] EMBL AI976178 [ CTTCCAATACTATTTTTAGTCCATGCGAACTAAACCCAGTTCCTCGACGGACAGAATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGAAAAACTTTTTGGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGAAACTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAAACAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAAACGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA ]
[-] EMBL CD064466 [ CTCGACGGACAGTATTAGATGAAATTTGTAGAGTTGGAATTCCTTATTTTTTTGTTGAGCTCCCTACTGGTGTATAACTTTTTGGACGAATTCCGAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCTAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGTAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGAAGAAGATGAAGTCACTGATTTAG ATAAAGATTTTCAGAAAAATGTTTTTGTCCATTT ]
[-] EMBL CD064485 [ GGACGAATTCCAAAAGATCGTATTTCGAGTGCGAACTTACAATTTGGTCGTATTGTCCGAACAGATCCACGTATTTTAAATTGTCCAGAAAAAGCCGACTGGCATGATTGTACAGATGCAGAAGATGAAGTAACTGATTTAGCCTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTGTG CCATT ]
[-] EMBL BF936359 [ GAAGATGAAGAAGCTGATTTAG CTAAAGATTTTC GAAAAATGTTTTTG CCATTTGATGTCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATCCTGAATAAGCAGAACCAATTTTCAAAGAAATTCTTTCTCAAATAGCAT ]
[-] EMBL AW017196 [ TCAATGATGATGATGATGATAATAATAATAATACTGAATAACCAGAACCAATTTTCAAAGAAAATCTTTCTCAAATAGCATTTTGCTTTATTTTTTTAAAGGATGAATTATTCATTCTTTAAACTATCATCTTCATATGTCTTGTAGTAAGAACCGAAAACAAAAGAATGTAAATTGTACAGATTCAATTCCCTTTTTCTAGACAATA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||