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consensusID : consensus_9063#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1414 fasta sequence
[CCCGAGGCCAANAATGCGGCACGAGGCTTAAAACTCACAACATTTGGGAAACGTACTTACACTTAGTCAAAATTGTATAAAGGAATAATATTTATCCTTTCAATACTCGTTTTTATGGTAGGTTGTTCATCTATATGACAAAAATCAAGTCATTCGTTGTTCAGTTGAAGTTGCTTTTCACATCAGACTTGAATCCGAAATTGACGTAACCCACCCCACAGAATCAAACTTGAAAATTCCAGAACCGGAAGTAAAAGTGACATCTTTACATCACTTATCAAAGACCCAGTGATCCATGCTTAGTTCAGCCAATTTGTAGTATAGTATGGTCATTGTTTACTACATATTAATGTATCTATCTCGATCAAATCTTACTATGTTGTACATATTTAGATTTGTTTCTATGGTCACCCTAATCTTAACACTTTTATGTAGTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTTAAAAAACAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACTAAAATTCAGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAAACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTT-CAGTTGATAAA-CCTTTGACAATAAACAAATATGATATGT-CT-CTTTT-CT-CAGAGAAG-CT-CAGATTTGTAATATA-CCAAGGAATTCACTAT-CATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTTTGCAACTGTTGTTTGGAGTTTTAATTGCTTAGTAAACAAATATTTTATCTAAGGTTAGATAATATTGCTAATGTTGTTTTTCAACCGAAATTTTTATAAAAAATGTATGTAACCAATGTCTGTCCTACTTTATCTTGTACGGTCTCATCGACATACGGAGTTTATGTAACTCATCGTCTACTAAGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTTAGCTACACGTATGAAGACAAATATTCCATCCTTATCTTAATTGTATAATATTTAAAGTGTATATTTTCGATTGTGATTTTTGTTATTATGTTTTCTATTGAAAAACAAACTGAAATTCCATTGGTAATTATCCTCTGTTTGGACATCTTTCATTACCCAAACGTTCTATTCGAATCTGCTAAGAACGAAGTTTTAAACCCTATATGGGAGCACATTTAATTTTTTTCAAACCACATTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACG-AATA-GACA-CTC-ATA-TACTG-ACTATTGAATATGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACGTACT]
[+] EMBL CD081364 [CCCGAGGCCAANAATGCGGCACGAGGCTTAAAACTCACAACATTTGGGAAACGTACTTACACTTAGTCAAAATTGTATAAAGGAATAATATTTATCCTTTCAATACTCGTTTTTATGGTAGGTTGTTCATCTATATGACAAAAATCAAGTCATTCGTTGTTCAGTTGAAGTTGCTTTTCACATCAGACTTGAATCCGAAATTGACGTAACCCACCCCACAGAATCAAACTTGAAAATTCCAGAACCGGAAGTAAAAGTGACATCTTTACATCACTTATCAAAGACCCAGTGATCCATGCTTAGTTCAGCCAATTTGTAGTATAGTATGGTCATTGTTTACTACATATTAATGTATCTATCTCGATCAAATCTTACTATGTTGTACATATTTAGATTTGTTTCTATGGTCACCCTAATCTTAACACTTTTATGTAGTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTTAAAAAACAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACTAAAATTCAGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAAACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTT CAGTTGATAAA CCTTTGAC ATAAACCAATATGATATGT CT CTTTT CT CAGAGAAG CT CAGATTTGT ATATA AC AGGAATTCACTAT CATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGNCGCTTAAATAATTTCTAAAAAtc ]
[-] EMBL CD075198 [ TTCACATCAGACTTGAATCCGAAATTGACGTAACCCACCCCACAGAATCAAACTTGAAAATTCCAGAACCGGAAGTAAAAGTGACATCTTTACATCACTTATCAAAGACCCAGTGATCCATGCTTAGTTCAGCCAATTTGTAGTATAGTATGGTCATTGTTTACTACATATTAATGTATCTATCTCGATCAAATCTTACTATGTTGTACATATTTAGATTTGTTTCTATGGTCACCCTAATCTTAACACTTTTATGTAGTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTTAAAAACCAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACTAAAATTCAGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAAACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTT CAGTTGATAAA CCTTTGCCAATAAACAAATATGATATGT CT CTTTT CT CAGAGAAG CT CAGATTTGTAATATA CCAAGGAATTCACTAT CATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCT ]
[-] EMBL AA999374 [ CGAATTTTCCAGTTGATAAACCCTTTGACAATAAACAAATATGATATGTCCTCCTTTTCCTCCAGAGAAGCCTCCAGATTTGTAATATACCCAAGGAATTCACTATCCATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTT ]
[-] EMBL CD074764 [ TATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTTTGCAACTGTTGTTTGGAGTTTTAATTGCTTAGTAAACAAATATTTTATCTAAGGTTAGATAATATTGCTAATGTTGTTTTTCAACCGAAATTTTTATAAAAAATGTATGTAACCAATGTCTGTCCTACTTTATCTTGTACGGTCTCATCGACATACGGAGTTTATGTAACTCATCGTCTACTAAGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTTAGCTACACGTATGAAGACAAATATTCCATCCTTATCTTAATTGTATAATATTTAAAGTGTATATTTTCGATTGTGATTTTTGTTATTATGTTTTCTATTGAAAAACAAACTGAAATTCCATTGGTAATTATCCTCTGTTTGGACATCTTTCATTACCCAAACGTTCTATTCGAATCTGCTAAGAACGAAGTTTTAAACCCTATATGGGAGCACATTTAATTTTTTTCAAACCACATTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACG AATA GACA CTCAATA TACTG ACTAT ]
[-] EMBL AI974994 [ ATGTAACTCATCGTCTATAAAGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTTAGCTACACGTATGAAGACAAATATTCCATCCTTATCTTAATTGTATAATATTTAAAGTGTATATTTTCGATTGTGATTTTTGTTATTATGTTTTCTATTGAAAAACAAACTGAAATTCCATTGGTAATTATCCTCTGTTTGGACATCTTTCATTACCCAAACGTTCTATTCGAATTTGCTAAGAACGAAGTTTTAAACCCTATATGGGAGCACATTTAATTTTTTTCAAACCACATTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACG AATA GACA CTCAATA TACTG ACTATTGAATATGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACGTACT]
[+] EMBL SM0281 [ TTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACGTAATAGGACAGCTC ATATTACTGTACTAT ]
[+] EMBL AA938827 [ TTATTAATAATAGATACTTAAACCCTGATGTGTTTTAGTGAATGAAATGTTATTGGTTACTAAGTGTGGACGTAATAGGACAGCTC ATATTACTGTACTAT ]
consensusID : consensus_9063#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 852 fasta sequence
[GCAAAGATGAATGGTAAAATGGAAAAAGGCTGGGAAAAGTATTCTAAATTTATTATACCTTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTTAAAAAACAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACNNNNNNTCAGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAAACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTTCAGTTGATAAACCTTTGACAATAAACAAATATGATATGTCTCTTTTCTCAGAGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAGGAATTCACTATCATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTTTGCAACTGTTGTTTGGAGTTTTAATTGCTTAGTAAACAAATATTTTATCTAAGGTTAGATAATATTGCTAAATGTATGTAACCAATGTCTGTCCTACTTTATCTTGTACGGTCTCATCGACATACGGAGTTTATGTAACTCATCGTCTACTAAGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTTAGCTACACGTATGAAGACAATATTCCATCCTTATTNTTGGTATTATGTNTTCTATTGAAAAAACAACTGAATTCATTGGGTATATCCTCTGTTGGACATCTTCATTACCCAACGTTTATTCGATCTGCTAAGACGAGTTTAAACCTATATGGAGCCATTTATTTTTCAACACTATTATATAGATCTAACCTGAGTGTTTATGATGAAGTATGGTACTATTGGGACATAACCTATTCTG]
[+] EMBL CD080930 [GCAAAGATGAATGGTAAAATGGAAAAAGGCTGGGAAAAGTATTCTAAATTTATTATACCTTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTTAAAAAACAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACNNNNNNTCAGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAAACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTTCAGTTGATAAACCTTTGACAATAAACAAATATGATATGTCTCTTTTCTCAGAGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAGGAATTCACTATCATTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTTTGCAACTGTTGTTTGGAGTTTTAATTGCTTAGTAAACAAATATTTTATCTAAGGTTAGATAATATTGCTAAATGTATGTAACCAATGTCTGTCCTACTTTATCTTGTACGGTCTCATCGACATACGGAGTTTATGTAACTCATCGTCTACTAAGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTTAGCTACACGTATGAAGACAATATTCCATCCTTATTNTTGGTATTATGTNTTCTATTGAAAAAACAACTGAATTCATTGGGTATATCCTCTGTTGGACATCTTCATTACCCAACGTTTATTCGATCTGCTAAGACGAGTTTAAACCTATATGGAGCCATTTATTTTTCAACACTATTATATAGATCTAACCTGAGTGTTTATGATGAAGTATGGTACTATTGGGACATAACCTATTCTG]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_9063#0 CCCGAGGCCAANAATGCGGCACGAGGCTTAAAACTCACAACATTTGGGAAACGTACTTAC 60
consensus_9063#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9063#0 ACTTAGTCAAAATTGTATAAAGGAATAATATTTATCCTTTCAATACTCGTTTTTATGGTA 120
consensus_9063#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9063#0 GGTTGTTCATCTATATGACAAAAATCAAGTCATTCGTTGTTCAGTTGAAGTTGCTTTTCA 180
consensus_9063#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9063#0 CATCAGACTTGAATCCGAAATTGACGTAACCCACCCCACAGAATCAAACTTGAAAATTCC 240
consensus_9063#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9063#0 AGAACCGGAAGTAAAAGTGACATCTTTACATCACTTATCAAAGACCCAGTGATCCATGCT 300
consensus_9063#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9063#0 TAGTTCAGCCAATTTGTAGTATAGTATGGTCATTGTTTACTACATATTAATGTATCTATC 360
consensus_9063#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9063#0 TCGATCAAATCTTACTATGTTGTACATATTTAGATTTGTTTCTATGGTCACCCTAATCTT 420
consensus_9063#1 ----GCAAA----GATGAATGGTAAA-ATGGAAAAAGGCTGGGAAAAGTATTCTAAATTT 51
**** * * *** * ** * * * * * * **** **
consensus_9063#0 AACACTTTTATGTAGTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTT 480
consensus_9063#1 A------TTATACCTTTAGAAGAAGCTGAGTGGATTGGTTTAACACTCGAAGAAGCTGTT 105
* **** *********************************************
consensus_9063#0 AAAAAACAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACTAAAATTC 540
consensus_9063#1 AAAAAACAAATGAAAATAGAACATGAAATATCCAGAAGTCAGCTAAAGCCACNNNNNNTC 165
**************************************************** **
consensus_9063#0 AGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAA 600
consensus_9063#1 AGTTTAGCGGAAAAACTGATTGACAGTTTAAGAAACCCTGTCAAAGATAAGAATGAAGAA 225
************************************************************
consensus_9063#0 ACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTTCAGTTGATAAACCTTTGACAATAAACAAATA 660
consensus_9063#1 ACTCCGTCCAGCTACTCGTCTCGAATTTTCAGTTGATAAACCTTTGACAATAAACAAATA 285
************************************************************
consensus_9063#0 TGATATGTCTCTTTTCTCAGAGAAGCTCAGATTTGTAATATACCAAGGAATTCACTATCA 720
consensus_9063#1 TGATATGTCTCTTTTCTCAGAGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAGGAATTCACTATCA 345
************************* * *****************
consensus_9063#0 TTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTTTGC 780
consensus_9063#1 TTTTGTATCTACTTTGCATGTACAGTCGCTAAAATAATTTCTAAAAAATCTACTGTTTGC 405
************************************************************
consensus_9063#0 AACTGTTGTTTGGAGTTTTAATTGCTTAGTAAACAAATATTTTATCTAAGGTTAGATAAT 840
consensus_9063#1 AACTGTTGTTTGGAGTTTTAATTGCTTAGTAAACAAATATTTTATCTAAGGTTAGATAAT 465
************************************************************
consensus_9063#0 ATTGCTAATGTTGTTTTTCAACCGAAATTTTTATAAAAAATGTATGTAACCAATGTCTGT 900
consensus_9063#1 ATTGCTAA-------------------------------ATGTATGTAACCAATGTCTGT 494
******** *********************
consensus_9063#0 CCTACTTTATCTTGTACGGTCTCATCGACATACGGAGTTTATGTAACTCATCGTCTACTA 960
consensus_9063#1 CCTACTTTATCTTGTACGGTCTCATCGACATACGGAGTTTATGTAACTCATCGTCTACTA 554
************************************************************
consensus_9063#0 AGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTT 1020
consensus_9063#1 AGAACTGAAACAGGGATTTGATAAACCGTTGGTCAACAAACTCACCACAATGAATGTTTT 614
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consensus_9063#0 AGCTACACGTATGAAGACAAATATTCCATCCTTATCTTAATTGTATAATATTTAAAGTGT 1080
consensus_9063#1 AGCTACACGTATGAAGACAA-TATTCCATCCTTAT------------------------- 648
******************** **************
consensus_9063#0 ATATTTTCGATTGTGATTTTTGTTATTATGTTTTCTATTGAAAAACAAACTGAAATTCCA 1140
consensus_9063#1 -----------------TNTTGGTATTATGTNTTCTATTGAAAAAACAACTGAA--TTCA 689
* *** ******** ************* ******* * **
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consensus_9063#1 TTGGGTAT-ATCCTCTGTT-GGACATCTT-CATTACCCAA-CGTT-TATTCGA-TCTGCT 743
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consensus_9063#0 AAGAACGAAGTTTTAAACCCTATATGGGAGCACATTTAATTTTTTTCAAACCACATTATT 1260
consensus_9063#1 AAGA-CGAG--TTTAAACC-TATATGG-AGC-CATTTA---TTTTTCAA----CACTATT 790
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consensus_9063#1 AT--ATAGATCT---AACCTGAGTGTTTATGATGAAGTATGGTACTATTGGG-ACATAAC 844
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consensus_9063#0 GTGGACGAATAGACACTCATATACTGACTATTGAATATGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1380
consensus_9063#1 CTATTCTG---------------------------------------------------- 852
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consensus_9063#0 AAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACGTACT 1414
consensus_9063#1 ----------------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||