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Schistosoma mansoni
cluster # 9072 cluster # 9072       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9072#0 length = 486 sequences # 8  

consensusID : consensus_9072#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 486
fasta sequence
                              [GATATTGGTCATATTCTTCCTGTAGTTGGTCTAAACTCCTCTTATAAAACATAGCATCAGCCCGTAATTTTGATTTGATTGATTCCCATTCTCTGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCAGTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTGTTNTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA-TCTAATA-TAGATATTTTATCATA-TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC-AGTTG-TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]

[+] EMBL CD197826             [GATATTGGTCATATTCTTCCTGTAGTTGGTCTAAACTCCTCTTATAAAACATAGCATCAGCCCGTAATTTTGATTTGATTGATTCCCATTCTCTGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCAGTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTGTTTTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTGTTTTTTTCATTTCAGCTA                                                   ]
[-] EMBL CD171357             [                                                                                             TGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCATTGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTATTNTGTTGTTCAAGTTTTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACCTAGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171252             [                                                                                                                                                                 tnNTGTGTTTCAAGTTNTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTACCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGTGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171269             [                                                                                                                                                                           CAAGTTNTGTACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171207             [                                                                                                                                                                                                                      AACATCTTTTAATGTACGTTGATTAATCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTA TCTAATA TAGATATTTTATCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171395             [                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACGCAATTGTCTATTCTAATAGTAGATATTTTTTCATA TAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATGTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTGTTTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171268             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATAGTAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATGTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]
[-] EMBL CD171439             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCGTTTCTTGTTTAACGATTTCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACC AGTTG TTTTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCTCTCTAG]


>consensus_9072#0 GATATTGGTCATATTCTTCCTGTAGTTGGTCTAAACTCCTCTTATAAAACATAGCATCAG CCCGTAATTTTGATTTGATTGATTCCCATTCTCTGGTTACTAAATCATCTTCTGGTTCAG TGTATTCACGTAATTCAGCTAATTGTTGTTCCAATTCTTTGTTNTGTTGTTCAAGTTTTG TACGCTTTCTTGATTCATCATCTAGAAGTTCTTGAACATCTTTTAATGTACGTTGATTAA TCATTTCTTTCTTTACAAGTTCATCGTATTCATCTTGTATATGACGCAATTGTCTATCTA ATATAGATATTTTATCATATAAACTAAAGTTTTCAGCTTCTAATTCTTCCCGATTTTCCG TTTCTTGTTTAACGATATCTTCTGATTCAGTCAACTGTTTATGCATAAGTACCAGTTGTT TTTTCATTTCAGCTAATTGATATGATGTATTACTTCTTGGAGTTAAATCATTCACTTCCT CTCTAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)