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Schistosoma mansoni
cluster # 9075 cluster # 9075       Sequences # 8       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9075#0 length = 2345 sequences # 6  
consensus_9075#1 length = 759 sequences # 2  

consensusID : consensus_9075#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 2345
fasta sequence
                              [TTTGTCCTGTTGATGGAGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGTCGGCCTTGTAGCCCACTGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTATTGCTGTCGAATTGGGAAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGAATTGAAAGCACACCCTTTTTGTTGTACTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAACCTCGCAAAGAACCTCGGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACTCCCATTAAGTGTCAGCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTTCCTACATCAGAGGAACTCATGCTGCTAGTCAAAGACAGCCCTTCGGATCTATATCTCGTCGCTATATCTTTGCTAACCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATACTTCCTCTGGAGAAGGAAATCAGATCGGCAAAAACAGATCTCTTCTCAGAATGGTATTACATCTGATCATCTATGGACATCAGATAATATTGATAACAAATACTTGAAGGGACCCCTGCAAGTACCAGACACTTTAACTGTGAATAGTACCTATCCTGAAAATGCAAGAGTATTTCCCAATGATCCTTCTGCTGTTTCTGCCGGAATAACTAGCCGTGGCGCTAGTAGTCTGAGCCATTTTGGCAGTAGCGCTTTGGGAGCCACTCCTGGAAATATTAATTCATGTTCAAATTCCCCTACTGGAGCTATGACCATCACTAGTTCGGGATCAAATTCCGCTATGCCTACAACAGGTACTATTCCTGCAGACTTGATGGACCACACTTGCAGTGGGTCAGGTTCCGGAAAACCTTTACTAGTTCAGCGAACGGTCGCTAGGCAAGTTCAGTTGGAAGAACGTATCGGCGAAGGTCGATATGGTGTTGTATGGCGAGGTGTTTGGCAAGGTGATCTAGTAGCCGCTAAAATATTTTCTAGTCGAGATGAACGCTCTTGGTTCCGAGAGACAGACATTTATCAGACAGTGATGTTACGTCATGCAAATATTCTAGGTTTTATTGCAGCTGATAATAAGGATACAGGAT-TGTCTACTCAATTATGGCTTATAACTGACTATCATCCTTTGGGATCATTATATGAATTTCTACAGCAACATTGTCTGACACCGTTTGCCCTTTTACGGGCTGTTGCATCAATTACTAATGGTCTGGCACATTTGCACATGGAAATTACTGGGACACAGGGTAAACCTGCTATAGCTCATCGTGATCTGAAGTCTAGAAACATCTTAGTTAAAATGGATGGTGAATGTTGTATTGGAGATTTGGGTTTTGCTCTTAAATTAGACTCATCTATGAGTTCTGCATTAGAAGTTAATTCAAACTCAGATCGTGTTGGAACCAAACGTTATATGGCTCCTGAAGTGTTAGATAATACAATACGTTTAACAAGTCCAGAAGCATTTAAACAAGCTGATATGTACAGTTTAGGTCTGGTATTTTGGGAGGTTACAAGACGATGCTACGTTCGTAATTT-ATTCGGACCAGATGAATATCAACTACCTTATCAAGATCTTGTGTCTGCAGATCCTTCAGTGGAAGAAATGAAGTCTATTGTTTGTGAACAAGGTCTACGACCAGGTCTACCAGCCATATGGTCAAAGCATGAAATTATCCGAGCACTACAAGATATAATGAGTGAATGTTGGTATGCTAGTCCATCGGCTAGACTATCAGCTATGCGTGTTAAAAAATCACTAGCTGGTGTACGTAAACAATTAGATACTAATCCAGCATTGTCGGATCTTTCACATACTAATTATCTACCTCCAGAAGCTACTGATAAGCTTCCTTTTGGCATAATTCGTTGTCCATCTGTGCCACGTAATACTATGAATAATAATACTAATACTATTAATAATAAACAAATCAATTTATTACCAAATCTTACAAGTACCAGTTCTATTGGTGCTGCTACTACACCTGGTAATAAATCACTCATCTCAGGAAATCATATCAATACTACTTATAATGATACTAATAATCCTTTATTAACCACTACCATCACTATTACACCTACAACAATACTCAATAGTAATAATATTCATCATAGAAATTGCCAATGTAATGATGATAATAATATGTTATATTCATCATTATTATATAAAAATGGAAATAATCCTTCGTATTGGTCAAATTGTGAATATGATAAATTATTATTATTCAATACACACAATAATAATGATGATAATAATACTACTAATCATCATCATCCTAATGAAGAATCCAATAACAATAGTAATTCAAA]

[+] EMBL CD159435             [TTTGTCCTGTTGATGGAGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGTCGGCCTTGTAGCCCACTGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTATTGCTGTCGAATTGGGAAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGAATTGAAAGCACACCCTTTTTGTTGTACTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAACCTCGCAAAGAACCTCGGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACTCCCATTAAGTGTCAGCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTTCCTACATCAGAGGAACTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AF031557             [   GTCCTGTTGATGGAGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGTCGGCCTTGTAGCCCACTGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTATTGCTGTCGAATTGGGAAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGGATTGAAAGCACACCCTTTTTGTTGTACTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAACCTCGCAAAGAACCTCGGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACTCCCATTAAGTGTCAGCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTTCCTACATCAGAGGAACTCATGCTGCTAGTCAAAGACAGCCCTTCGGATCTATATCTCGTCGCTATATCTTTGCTAACCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATACTTCCTCTGGAGAAGGAAATCAGATCGGCAAAAACAGATCTCTTCTCAGAATGGTATTACATCTGATCATCTATGGACATCAGATAATATTGATAACAAATACTTGAAGGGACCCCTGCAAGTACCAGACACTTTAACTGTGAATAGTACCTATCCTGAAAATGCAAGAGTATTTCCCAATGATCCTTCTGCTGTTTCTGCCGGAATAACTAGCCGTGGCGCTAGTAGTCTGAGCCATTTTGGCAGTAGCGCTTTGGGAGCCACTCCTGGAAATATTAATTCATGTTCAAATTCCCCTACTGGAGCTATGACCATCACTAGTTCGGGATCAAATTCCGCTATGCCTACAACAGGTACTATTCCTGCAGACTTGATGGACCACACTTGCAGTGGGTCAGGTTCCGGAAAACCTTTACTAGTTCAGCGAACGGTCGCTAGGCAAGTTCAGTTGGAAGAACGTATCGGCGAAGGTCGATATGGTGTTGTATGGCGAGGTGTTTGGCAAGGTGATCTAGTAGCCGCTAAAATATTTTCTAGTCGAGATGAACGCTCTTGGTTCCGAGAGACAGACATTTATCAGACAGTGATGTTACGTCATGCAAATATTCTAGGTTTTATTGCAGCTGATAATAAGGATACAGGAT TGTCTACTCAATTATGGCTTATAACTGACTATCATCCTTTGGGATCATTATATGAATTTCTACAGCAACATTGTCTGACACCGTTTGCCCTTTTACGGGCTGTTGCATCAATTACTAATGGTCTGGCACATTTGCACATGGAAATTACTGGGACACAGGGTAAACCTGCTATAGCTCATCGTGATCTGAAGTCTAGAAACATCTTAGTTAAAATGGATGGTGAATGTTGTATTGGAGATTTGGGTTTTGCTCTTAAATTAGACTCATCTATGAGTTCTGCATTAGAAGTTAATTCAAACTCAGATCGTGTTGGAACCAAACGTTATATGGCTCCTGAAGTGTTAGATAATACAATACGTTTAACAAGTCCAGAAGCATTTAAACAAGCTGATATGTACAGTTTAGGTCTGGTATTTTGGGAGGTTACAAGACGATGCTACGTTCGTAATTT ATTCGGACCAGATGAATATCAACTACCTTATCAAGATCTTGTGTCTGCAGATCCTTCAGTGGAAGAAATGAAGTCTATTGTTTGTGAACAAGGTCTACGACCAGGTCTACCAGCCATATGGTCAAAGCATGAAATTATCCGAGCACTACAAGATATAATGAGTGAATGTTGGTATGCTAGTCCATCGGCTAGACTATCAGCTATGCGTGTTAAAAAATCACTAGCTGGTGTACGTAAACAATTAGATACTAATCCAGCATTGTCGGATCTTTCACATACTAATTATCTACCTCCAGAAGCTACTGATAAGCTTCCTTTTGGCATAATTCGTTGTCCATCTGTGCCACGTAATACTATGAATAATAATACTAATACTATTAATAATAAACAAATCAATTTATTACCAAATCTTACAAGTACCAGTTCTATTGGTGCTGCTACTACACCTGGTAATAAATCACTCATCTCAGGAAATCATATCAATACTACTTATAATGATACTAATAATCCTTTATTAACCACTACCATCACTATTACACCTACAACAATACTCAATAGTAATAATATTCATCATAGAAATTGCCAATGTAATGATGATAATAATATGTTATATTCATCATTATTATATAAAAATGGAAATAATCCTTCGTATTGGTCAAATTGTGAATATGATAAATTATTATTATTCAATACACACAATAATAATGATGATAATAATACTACTAATCATCATCATCCTAATGAAGAATCCAATAACAATAGTAATTCAAA]
[+] EMBL CD152519             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GACATCANATGATGTGGATAACAAATACTTGAAGGGACCCCTGCAAGTACCACACACTTTAACTGTGAATAGTACCTATCCTGAAAATGCAAGAGTATTTCCCAATGATCCTTCTGCTGTTTCTGCCGGAATAACTAGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD134367             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTAGCCGTGGCGCTAGTAGTCTGAGCCATTTTGGCAGTAGCGCTTTGGGAGCCACTCCTGGAAATATTAATTCATGTTCAAATTCCCCTACTGGAGCTATGACCATCACTAGTTCGGGATCAAATTCCGCTATGCCTACAACAGGTACTATTCCTGCAGACTTGATGGACCACACTTGCAGTGGGTCAGGTTCCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD153188             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTCTAGGTTATATTGCAGCTGATAATAAGGATACAGGATGTGCCTACTCAATTATGGCTTATAACTGACTATCATCCTTTGGGATCATTATATGAATTTCTACAGCAACATTGTCTGACACCGTTTGCCCTTTTACGGGCTGATGCATCAATTACTAATGGTCTGGCACATTTGCACATGGAAATTACTGGGACACAGGGTAAACCTGCTATAGCTCATCGGGATCTGAAGTCTAGAAACATCTTAGTTAAAATGGATGGTGAATGTTGTATTGGAGATTTGGGTTTTGCTCTTAAATTAGACTCATCTATGAGTTCTGCATTAGAAGTTAATTCAAACTCAGATCGTGTTGGAACCAAACGTTATATGGCTCCTGAAGTGTTAGATAATACAATACGTTTAACAAGTCCAGAAGCATTTAAACAAGCTGATATGTACAGTTTAGGTCTGGTATTTTGGGAGGTTACAAGACGATGCTACGTTCGTAATTT ATTCGGACCAGATGAATATCAACTACCTTATCAAGATCTTGTGTCTGCAGATCCTTCAGTGGAAGAAATGAAGTCTATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD153377             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTCTAGGTTTTATTGCAGCTGATAATAAGGATACAGGAT TGTCTACTCAATTATGGCTTATAACTGACTATCATCCTTTGGGATCATTATATGAATTTCTACAGCAACATTGTCTGACACCGTTTGCCCTTTTACGGGCTGTTGCATCAATTACTAATGGTCTGGCACATTTGCACATGGAAATTACTGGGACACAGGGTAAACCTGCTATAGCTCATCGTGATCTGAAGTCTAGAAACATCTTAGTTAAAATGGATGGTGAATGTTGTATTGGAGATTTGGGTTTTGCTCTTAAATTAGACTCATCTATGAGTTCTGCATTAGAAGTTAATTCAAACTCAGATCGTGTTGGAACCAAACGTTATATGGCTCCTGAAGTGTTAGATAATACAATACGTTTAACAAGTCCAGAAGCATTTAAACAAGCTGATATGTACAGTTTAGGTCTGGTATTTTGGGAGGTTACAAGACGATGCTACGTTCGTAATTTAATTC GACCAGATGAATATCAACTACCTTATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]


>consensus_9075#0 TTTGTCCTGTTGATGGAGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGT CGGCCTTGTAGCCCACTGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTA TTGCTGTCGAATTGGGAAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGAATTGAAAGCA CACCCTTTTTGTTGTACTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAA CCTCGCAAAGAACCTCGGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACT CCCATTAAGTGTCAGCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTT CCTACATCAGAGGAACTCATGCTGCTAGTCAAAGACAGCCCTTCGGATCTATATCTCGTC GCTATATCTTTGCTAACCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATAC TTCCTCTGGAGAAGGAAATCAGATCGGCAAAAACAGATCTCTTCTCAGAATGGTATTACA TCTGATCATCTATGGACATCAGATAATATTGATAACAAATACTTGAAGGGACCCCTGCAA GTACCAGACACTTTAACTGTGAATAGTACCTATCCTGAAAATGCAAGAGTATTTCCCAAT GATCCTTCTGCTGTTTCTGCCGGAATAACTAGCCGTGGCGCTAGTAGTCTGAGCCATTTT GGCAGTAGCGCTTTGGGAGCCACTCCTGGAAATATTAATTCATGTTCAAATTCCCCTACT GGAGCTATGACCATCACTAGTTCGGGATCAAATTCCGCTATGCCTACAACAGGTACTATT CCTGCAGACTTGATGGACCACACTTGCAGTGGGTCAGGTTCCGGAAAACCTTTACTAGTT CAGCGAACGGTCGCTAGGCAAGTTCAGTTGGAAGAACGTATCGGCGAAGGTCGATATGGT GTTGTATGGCGAGGTGTTTGGCAAGGTGATCTAGTAGCCGCTAAAATATTTTCTAGTCGA GATGAACGCTCTTGGTTCCGAGAGACAGACATTTATCAGACAGTGATGTTACGTCATGCA AATATTCTAGGTTTTATTGCAGCTGATAATAAGGATACAGGATTGTCTACTCAATTATGG CTTATAACTGACTATCATCCTTTGGGATCATTATATGAATTTCTACAGCAACATTGTCTG ACACCGTTTGCCCTTTTACGGGCTGTTGCATCAATTACTAATGGTCTGGCACATTTGCAC ATGGAAATTACTGGGACACAGGGTAAACCTGCTATAGCTCATCGTGATCTGAAGTCTAGA AACATCTTAGTTAAAATGGATGGTGAATGTTGTATTGGAGATTTGGGTTTTGCTCTTAAA TTAGACTCATCTATGAGTTCTGCATTAGAAGTTAATTCAAACTCAGATCGTGTTGGAACC AAACGTTATATGGCTCCTGAAGTGTTAGATAATACAATACGTTTAACAAGTCCAGAAGCA TTTAAACAAGCTGATATGTACAGTTTAGGTCTGGTATTTTGGGAGGTTACAAGACGATGC TACGTTCGTAATTTATTCGGACCAGATGAATATCAACTACCTTATCAAGATCTTGTGTCT GCAGATCCTTCAGTGGAAGAAATGAAGTCTATTGTTTGTGAACAAGGTCTACGACCAGGT CTACCAGCCATATGGTCAAAGCATGAAATTATCCGAGCACTACAAGATATAATGAGTGAA TGTTGGTATGCTAGTCCATCGGCTAGACTATCAGCTATGCGTGTTAAAAAATCACTAGCT GGTGTACGTAAACAATTAGATACTAATCCAGCATTGTCGGATCTTTCACATACTAATTAT CTACCTCCAGAAGCTACTGATAAGCTTCCTTTTGGCATAATTCGTTGTCCATCTGTGCCA CGTAATACTATGAATAATAATACTAATACTATTAATAATAAACAAATCAATTTATTACCA AATCTTACAAGTACCAGTTCTATTGGTGCTGCTACTACACCTGGTAATAAATCACTCATC TCAGGAAATCATATCAATACTACTTATAATGATACTAATAATCCTTTATTAACCACTACC ATCACTATTACACCTACAACAATACTCAATAGTAATAATATTCATCATAGAAATTGCCAA TGTAATGATGATAATAATATGTTATATTCATCATTATTATATAAAAATGGAAATAATCCT TCGTATTGGTCAAATTGTGAATATGATAAATTATTATTATTCAATACACACAATAATAAT GATGATAATAATACTACTAATCATCATCATCCTAATGAAGAATCCAATAACAATAGTAAT TCAAA



consensusID : consensus_9075#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 759
fasta sequence
                              [AGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGTCGGCCTTGTAGCCCACTGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTATTGCTGTCGAATTGGGAAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGAATTGAAAGCACACCCTTTTTGTTGTACTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAACCTCGCAAAGAACCTCGGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACTCCCATTAAGTGTCAGCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTTCCTACATCAGAGGAACTCATGCTGCTTGTCAAAGACAGCCCTTCGGATCTATATCTTGTCGCTATATCTTTGCTAACCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATACTTCCTCTGGAGAAGGAAATCAGATGCCCCTATCGGTAGGGACTACATTATTACAGCATTGAATTGTGATGATGAAGGGCATTCGAATTCTGATGATTNTTTGTATAACGTTGCAAAAATATTTCTATCAATTGGTTGCTCGGTGTTAATCATGGTTATTAAATTTATGAGTAATCTCATATAACGTTCAATGTCCAGTATCCTGACTGGTGCATTNCCTCA-TGCTGACATTNNTCTCG-TTTATCAAGCTTATCTGGCTTCTGAAATATTTAGAA-TTGTACNGAT-ATTATATTGGG]

[+] EMBL CD081897             [AGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGTCGGCCTTGTAGCCCACTGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTATTGCTGTCGAATTGGGAAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGAATTGAAAGCACACCCTTTTTGTTGTACTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAACCTCGCAAAGAACCTCGGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACTCCCATTAAGTGTCAGCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTTCCTACATCAGAGGAACTCATGCTGCTTGTCAAAGACAGCCCTTCGGATCTATATCTTGTCGCTATATCTTTGCTAACCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATACTTCCTCTGGAGAAGGAAATCAGATGCCCCTATCGGTAGGGACTACATTATTACAGCATTGAATTGTGATGATGAAGGGCATTCGAATTCTGATGATTNTTTGTATAACGTTGCAAAAATATTTCTATCAATTGGTTGCTCGGTGTTAATCATGGTTATTAAATTTATGAGTAATCTCATATAACGTTCAATGTCCAGTATCCTGACTGGTGCATTNCCTCA TGCTGACATTNNTCTCG TTTATCAAGCTTATCTGGCTTCTGAAATATTTAGAA TTGTACNGAT ATTATATTGGG]
[-] EMBL CD075599             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTTCCTACATCAGAGGAACTCATGCTGCTTGTCAAAGACAGCCCTTCGGATTTATATCTTGTCGCTATATTTTTGCTAACCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATACTTCCTTTGGAGAAGGAAATCAGATGCCCCTATCGGTAGGGGCTACATTATTACAGCATTGAATTGTGATGATGAAGGGCATTCGAATTTTGATGATTTTTTGTATAACGTTGCAAAAATATTTTTATCAATTGGTTGGTCGGTGTTAATCATGGTTATTAAATTTATGAGTAATTTCATATAACGTTCAATGTCCAGTATCCTGACTGTTGCATT CCTCATTGCTGACATT TTTTCGTTTTATCAAGCTTATTTGGGTTTTGAATAATTTAGAATTTGTAC GATAATTATATTGGt]


>consensus_9075#1 AGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGTCGGCCTTGTAGCCCAC TGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTATTGCTGTCGAATTGGG AAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGAATTGAAAGCACACCCTTTTTGTTGTA CTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAACCTCGCAAAGAACCTC GGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACTCCCATTAAGTGTCAGC AAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTTCCTACATCAGAGGAAC TCATGCTGCTTGTCAAAGACAGCCCTTCGGATCTATATCTTGTCGCTATATCTTTGCTAA CCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATACTTCCTCTGGAGAAGGA AATCAGATGCCCCTATCGGTAGGGACTACATTATTACAGCATTGAATTGTGATGATGAAG GGCATTCGAATTCTGATGATTNTTTGTATAACGTTGCAAAAATATTTCTATCAATTGGTT GCTCGGTGTTAATCATGGTTATTAAATTTATGAGTAATCTCATATAACGTTCAATGTCCA GTATCCTGACTGGTGCATTNCCTCATGCTGACATTNNTCTCGTTTATCAAGCTTATCTGG CTTCTGAAATATTTAGAATTGTACNGATATTATATTGGG



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9075#0      TTTGTCCTGTTGATGGAGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGT 60
consensus_9075#1      ----------------AGTGTATGCTTTTGCTGTGTCCTGCAGCTAATCAGTCAGATTGT 44
                                      ********************************************

consensus_9075#0      CGGCCTTGTAGCCCACTGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTA 120
consensus_9075#1      CGGCCTTGTAGCCCACTGTCCAAGAAACACCAGAAAAACTGGAACAGATATATTGACTTA 104
                      ************************************************************

consensus_9075#0      TTGCTGTCGAATTGGGAAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGAATTGAAAGCA 180
consensus_9075#1      TTGCTGTCGAATTGGGAAGACAAGCTACACCTTCCTACCTATTATCGCGAATTGAAAGCA 164
                      ************************************************************

consensus_9075#0      CACCCTTTTTGTTGTACTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAA 240
consensus_9075#1      CACCCTTTTTGTTGTACTCCAGGTCCAGGCTATTCCTGTCGTCTAAATCTTATTCACGAA 224
                      ************************************************************

consensus_9075#0      CCTCGCAAAGAACCTCGGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACT 300
consensus_9075#1      CCTCGCAAAGAACCTCGGCAATTCTATGATCTCACGTGTGCGAAAGATGACTTCTTTACT 284
                      ************************************************************

consensus_9075#0      CCCATTAAGTGTCAGCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTT 360
consensus_9075#1      CCCATTAAGTGTCAGCAAGATAATGACATTAGATGTTGTTCGGAAAAGCATTGTAATGTT 344
                      ************************************************************

consensus_9075#0      CCTACATCAGAGGAACTCATGCTGCTAGTCAAAGACAGCCCTTCGGATCTATATCTCGTC 420
consensus_9075#1      CCTACATCAGAGGAACTCATGCTGCTTGTCAAAGACAGCCCTTCGGATCTATATCTTGTC 404
                      ************************** ***************************** ***

consensus_9075#0      GCTATATCTTTGCTAACCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATAC 480
consensus_9075#1      GCTATATCTTTGCTAACCATACTATGCATCATCCTTTTTATTGTATCAGGAACTTTATAC 464
                      ************************************************************

consensus_9075#0      TTCCTCTGGAGAAGGAAATCAGAT--CGGCAAAAACAGATCTCTTCTCAGAATGGTATTA 538
consensus_9075#1      TTCCTCTGGAGAAGGAAATCAGATGCCCCTATCGGTAGGGACTACATTATTACAGCATTG 524
                      ************************  *   *     **        * *  *  * *** 

consensus_9075#0      CATC-TGATCATCTATGGACATCAGATAATATTGATAACAAATAC----TTGAAGGGACC 593
consensus_9075#1      AATTGTGATGATGAAGGGCATTCGAATTCTGATGATTNTTTGTATAACGTTGCAAAAATA 584
                       **  **** **  * **   **  **  *  ****      **     *** *   *  

consensus_9075#0      CCTGCAAGTACCAGACACTTTAACTGTGAATAGTACCTATCCTGAAAATGCAAGAGTATT 653
consensus_9075#1      TTTCTATCAATTGGTTGCTCGG--TGTTAATCATGGTTATT----AAATTTATGAGTAAT 638
                        *  *   *   *   **     *** ***  *   ***     ****  * ***** *

consensus_9075#0      TCCCAATGATCCTTCTGCTGTTTCTGCCGGAATAACTAGCCGTGGCGCTAGTAGTCTGAG 713
consensus_9075#1      CTCATATAACGTT----CAATGTCCAGTATCCTGACTGGTGCATTNCCTCATGCTGACAT 694
                        *  ** *   *    *  * **        * *** *        **  *  *   * 

consensus_9075#0      CCATTTTGGCAGTAGCGCTTTGGGAGCCACTCCTGGAAATATTAATTCATGTTCAAATTC 773
consensus_9075#1      TNNTCTCGTTTATCAAGCTT----ATCTGGCTTCTGAAATATTTAGAATTGTACNGATAT 750
                         * * *    *   ****    * *        ******** *    *** *  **  

consensus_9075#0      CCCTACTGGAGCTATGACCATCACTAGTTCGGGATCAAATTCCGCTATGCCTACAACAGG 833
consensus_9075#1      TA-TATTGGG-------------------------------------------------- 759
                         ** ***                                                   

consensus_9075#0      TACTATTCCTGCAGACTTGATGGACCACACTTGCAGTGGGTCAGGTTCCGGAAAACCTTT 893
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      ACTAGTTCAGCGAACGGTCGCTAGGCAAGTTCAGTTGGAAGAACGTATCGGCGAAGGTCG 953
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      ATATGGTGTTGTATGGCGAGGTGTTTGGCAAGGTGATCTAGTAGCCGCTAAAATATTTTC 1013
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TAGTCGAGATGAACGCTCTTGGTTCCGAGAGACAGACATTTATCAGACAGTGATGTTACG 1073
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TCATGCAAATATTCTAGGTTTTATTGCAGCTGATAATAAGGATACAGGATTGTCTACTCA 1133
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      ATTATGGCTTATAACTGACTATCATCCTTTGGGATCATTATATGAATTTCTACAGCAACA 1193
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TTGTCTGACACCGTTTGCCCTTTTACGGGCTGTTGCATCAATTACTAATGGTCTGGCACA 1253
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TTTGCACATGGAAATTACTGGGACACAGGGTAAACCTGCTATAGCTCATCGTGATCTGAA 1313
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      GTCTAGAAACATCTTAGTTAAAATGGATGGTGAATGTTGTATTGGAGATTTGGGTTTTGC 1373
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TCTTAAATTAGACTCATCTATGAGTTCTGCATTAGAAGTTAATTCAAACTCAGATCGTGT 1433
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TGGAACCAAACGTTATATGGCTCCTGAAGTGTTAGATAATACAATACGTTTAACAAGTCC 1493
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      AGAAGCATTTAAACAAGCTGATATGTACAGTTTAGGTCTGGTATTTTGGGAGGTTACAAG 1553
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      ACGATGCTACGTTCGTAATTTATTCGGACCAGATGAATATCAACTACCTTATCAAGATCT 1613
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TGTGTCTGCAGATCCTTCAGTGGAAGAAATGAAGTCTATTGTTTGTGAACAAGGTCTACG 1673
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      ACCAGGTCTACCAGCCATATGGTCAAAGCATGAAATTATCCGAGCACTACAAGATATAAT 1733
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      GAGTGAATGTTGGTATGCTAGTCCATCGGCTAGACTATCAGCTATGCGTGTTAAAAAATC 1793
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      ACTAGCTGGTGTACGTAAACAATTAGATACTAATCCAGCATTGTCGGATCTTTCACATAC 1853
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TAATTATCTACCTCCAGAAGCTACTGATAAGCTTCCTTTTGGCATAATTCGTTGTCCATC 1913
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TGTGCCACGTAATACTATGAATAATAATACTAATACTATTAATAATAAACAAATCAATTT 1973
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      ATTACCAAATCTTACAAGTACCAGTTCTATTGGTGCTGCTACTACACCTGGTAATAAATC 2033
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      ACTCATCTCAGGAAATCATATCAATACTACTTATAATGATACTAATAATCCTTTATTAAC 2093
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      CACTACCATCACTATTACACCTACAACAATACTCAATAGTAATAATATTCATCATAGAAA 2153
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TTGCCAATGTAATGATGATAATAATATGTTATATTCATCATTATTATATAAAAATGGAAA 2213
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TAATCCTTCGTATTGGTCAAATTGTGAATATGATAAATTATTATTATTCAATACACACAA 2273
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TAATAATGATGATAATAATACTACTAATCATCATCATCCTAATGAAGAATCCAATAACAA 2333
consensus_9075#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9075#0      TAGTAATTCAAA 2345
consensus_9075#1      ------------
                                  




Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)