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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9080#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1123 fasta sequence
[CCCTCGAGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGTTAGTTATACATTTGCAATCATTTTTCAAGTATTACATTTCTCCTGTCATTAAAACTTATGTAACTGACATTGTTATGCTTAAATTTAAGTTTTTTATGCCCTAATTAACCCATTTACTGCCTAATGATAGCTAATATAGTATAAGTGTTTACCATTATTATCTCACTGTCATCCACACACACACACACGTACACAGTAATTGAATTTACGCAATTCATGTTCTCATATTTTTTGGTGAGAAAGTTAGTGATAAAACTAAAGCATTTTAATCTTCTAGCCAATCGTACCGAAGAACATCAGCTGCATAAATATGTGTATATCTATGTGTGTGTATGTGTGATCGTCTGTGTTTCGATGTTATCACGCTGCTAGTAATTAACAACTACATTATTCCAACACAAACTCATCAACAATCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA-TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAATTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTATTTGCATTATCATAACGTTGTCATGTTGTCTGTCATTTTGATCACTTATTCAATGAATAATCAGTGTATTGTCATTTTTTCATGCTTACTTCCTTTGCTTCAATAAATAAATG]
[+] EMBL CD082907 [CCCTCGAGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGTTAGTTATACATTTGCAATCATTTTTCAAGTATTACATTTCTCCTGTCATTAAAACTTATGTAACTGACATTGTTATGCTTAAATTTAAGTTTTTTATGCCCTAATTAACCCATTTACTGCCTAATGATAGCTAATATAGTATAAGTGTTTACCATTATTATCTCACTGTCATCCACACACACACACACGTACACAGTAATTGAATTTACGCAATTCATGTTCTCATATTTTTTGGTGAGAAAGTTAGTGATAAAACTAAAGCATTTTAATCTTCTAGCCAATCGTACCGAAGAACATCAGCTGCATAAATATGTGTATATCTATGTGTGTGTATGTGTGATCGTCTGTGTTTCGATGTTATCACGCTGCTAGTAATTAACAACTACATTATTCCAACACAAACTCATCAACAATCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTNTACCAAACTTTATATCTNTATTTTGTTNTAATTTGT ]
[-] EMBL CD134554 [ GTGTATATCTATGTGTGTGTATGTGTGATCGTCTGTGTTTCGATGTTATCACGCTGCTAGTAATTAACAACTACATTATTCCAACACAAACTCATCAACAATCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTG ]
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[+] EMBL CD111107 [ TCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTGTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTGGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTT ]
[-] EMBL CD110835 [ CACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTA ]
[-] EMBL CD076491 [ CGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAATTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTATTTGCATTATCATAACGTTGTCATGTTGTCTGTCATTTTGATCACTTATTCAATGAATAATCAGTGTATTGTCATTTTTTCATGCTTACTTCCTTTGCTTCAATAAATAAATG]
[-] EMBL CD077027 [ CCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAATTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTATTTGCATTATCATAACGTTGTCATGTTGTCTGTCATTTTGATCACTTATTCAATGAATAATCAGTGTATTGTCATTTTTTCATGCTTACTTCCTTTGCTTCAATAAATAAATG]
[+] EMBL CD145046 [ TGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAATTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||