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Schistosoma mansoni
cluster # 9080 cluster # 9080       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9080#0 length = 1123 sequences # 8  

consensusID : consensus_9080#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1123
fasta sequence
                              [CCCTCGAGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGTTAGTTATACATTTGCAATCATTTTTCAAGTATTACATTTCTCCTGTCATTAAAACTTATGTAACTGACATTGTTATGCTTAAATTTAAGTTTTTTATGCCCTAATTAACCCATTTACTGCCTAATGATAGCTAATATAGTATAAGTGTTTACCATTATTATCTCACTGTCATCCACACACACACACACGTACACAGTAATTGAATTTACGCAATTCATGTTCTCATATTTTTTGGTGAGAAAGTTAGTGATAAAACTAAAGCATTTTAATCTTCTAGCCAATCGTACCGAAGAACATCAGCTGCATAAATATGTGTATATCTATGTGTGTGTATGTGTGATCGTCTGTGTTTCGATGTTATCACGCTGCTAGTAATTAACAACTACATTATTCCAACACAAACTCATCAACAATCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA-TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAATTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTATTTGCATTATCATAACGTTGTCATGTTGTCTGTCATTTTGATCACTTATTCAATGAATAATCAGTGTATTGTCATTTTTTCATGCTTACTTCCTTTGCTTCAATAAATAAATG]

[+] EMBL CD082907             [CCCTCGAGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGTTAGTTATACATTTGCAATCATTTTTCAAGTATTACATTTCTCCTGTCATTAAAACTTATGTAACTGACATTGTTATGCTTAAATTTAAGTTTTTTATGCCCTAATTAACCCATTTACTGCCTAATGATAGCTAATATAGTATAAGTGTTTACCATTATTATCTCACTGTCATCCACACACACACACACGTACACAGTAATTGAATTTACGCAATTCATGTTCTCATATTTTTTGGTGAGAAAGTTAGTGATAAAACTAAAGCATTTTAATCTTCTAGCCAATCGTACCGAAGAACATCAGCTGCATAAATATGTGTATATCTATGTGTGTGTATGTGTGATCGTCTGTGTTTCGATGTTATCACGCTGCTAGTAATTAACAACTACATTATTCCAACACAAACTCATCAACAATCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTNTACCAAACTTTATATCTNTATTTTGTTNTAATTTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD134554             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTGTATATCTATGTGTGTGTATGTGTGATCGTCTGTGTTTCGATGTTATCACGCTGCTAGTAATTAACAACTACATTATTCCAACACAAACTCATCAACAATCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTG                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD111568             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAA TTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACATTTACTTAc                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD111107             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTGTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTGGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTT                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD110835             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATTCACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTA                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD076491             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGCGAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTGCAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAATTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTATTTGCATTATCATAACGTTGTCATGTTGTCTGTCATTTTGATCACTTATTCAATGAATAATCAGTGTATTGTCATTTTTTCATGCTTACTTCCTTTGCTTCAATAAATAAATG]
[-] EMBL CD077027             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCTTATTGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAATTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTATTTGCATTATCATAACGTTGTCATGTTGTCTGTCATTTTGATCACTTATTCAATGAATAATCAGTGTATTGTCATTTTTTCATGCTTACTTCCTTTGCTTCAATAAATAAATG]
[+] EMBL CD145046             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTTTTGTGGAGGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCACCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATACATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTCTGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACA TTACCTAACAATTGCAATATGTATATCTTATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAATTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTA                                                                                                                 ]


>consensus_9080#0 CCCTCGAGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGTTAGTTATACATTTGCAATCATTTTTCAAGT ATTACATTTCTCCTGTCATTAAAACTTATGTAACTGACATTGTTATGCTTAAATTTAAGT TTTTTATGCCCTAATTAACCCATTTACTGCCTAATGATAGCTAATATAGTATAAGTGTTT ACCATTATTATCTCACTGTCATCCACACACACACACACGTACACAGTAATTGAATTTACG CAATTCATGTTCTCATATTTTTTGGTGAGAAAGTTAGTGATAAAACTAAAGCATTTTAAT CTTCTAGCCAATCGTACCGAAGAACATCAGCTGCATAAATATGTGTATATCTATGTGTGT GTATGTGTGATCGTCTGTGTTTCGATGTTATCACGCTGCTAGTAATTAACAACTACATTA TTCCAACACAAACTCATCAACAATCACCACATCAAAAAATCCTAAATTATAACAGTCATT CACATCTTGATTTGAAATTCCTTCTTGTCTTCGTTCGTTTTCACTGCTGTTATTTTGAGC GAGTTCTTCTCGTATTACTTCACTCATTTCTAGTTATTTGTGTTTGTTTTTTCTTCTTTG CAATTTTACCAAACTTTATATCTTTATTTTGTTTTAATTTGTTCCTTATTGTTTTGTGGA GGAATTTTATTGATTACATCGAACTCTGCCAGAATTTCTCACTTCTCTCTATTCATCCCA CCTTCGGAGATACCGTAGGATGGGCGTTAATTTTTTTTTGATCAGTACTGAGGAATTATA CATGTGATGTGAACATGTAGTTAGGAAAAATGTTGTGCTTTGTTTATTTGAAGGTGCTTC TGGCTGAGCTTCCTTCTTTTTACGTTTCAACATTACCTAACAATTGCAATATGTATATCT TATGATTTGTTTGATTTAAACGTGCAACCTAGTTGTTAATCTTTATTAACGACTATCCAA TTATCTGTTTGTTCATTTCCCTTATGTTTTATCTCGAATTTTAACCCTTATTTGCATTAT CATAACGTTGTCATGTTGTCTGTCATTTTGATCACTTATTCAATGAATAATCAGTGTATT GTCATTTTTTCATGCTTACTTCCTTTGCTTCAATAAATAAATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)