These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9092#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1112 fasta sequence [GTTTGGCTTAAACTTTTCATTCATACAACCTTGACGATAGTGAATACCGGAAGTTAAATCTTTCTATTCAATTATCAATCAACTAATATAACACCCCTTCCATTTTTCTATTCTCATTTGGTATATGATTGTGATTGTTTATTGATCACGTTATACATTTGGTATCAAAAGTTTTAACCAATTTATTGTATTGTATAGTTACCTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGACATCTATTTCAAAAAAAGATTTATACAACTTTTGCTATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATTCAATGTACAATGTATTATCTATCATTCAATGGAATTATTCTTTGATCTGTATCTAGTTTATATGTTGTACTCTCTTAGACTTCATTTTCGAAAAAACACATGTTG] [+] EMBL CD083840 [GTTTGGCTTAAACTTTTCATTCATACAACCTTGACGATAGTGAATACCGGAAGTTAAATCTTTCTATTCAATTATCAATCAACTAATATAACACCCCTTCCATTTTTCTATTCTCATTTGGTATATGATTGTGATTGTTTATTGATCACGTTATACATTTGGTATCAAAAGTTTTAACCAATTTATTGTATTGTATAGTTACCTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTAC AAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCATGTAATAGT ] [+] EMBL CD083550 [ TTACCTTATCAGAATATCACTTAT CATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTTATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGT ] [+] EMBL CD077543 [ CTTATCAGAATATCACTTATACATATCCTCCTATTTTAATTAATCAGTATTATATAGAGACACAGGGAGAACAAGATCAAGGGAAAATAAACGACCGAGTTCATACACCATTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTANATGTTATC ] [+] EMBL CD083054 [ gacTTCTGGAAATAAAATAGTTTTACAGATTACAAAATACTATACAAATATGCAAGTGTTCAATAAAATTGTTATTCAGTTTATTTTGCTTCTATACACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAG ] [-] EMBL CD185466 [ CACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGA ] [+] EMBL CD185583 [ CACTACCAGTTATGTTATATCACTTAAATGTTATCAATGTAATTCACATAATGATAATTCCTGTAATAGTATTACCGATTCACGAGAACGACCTAAAGAATGTCCTCCACATCTACAAGCATCATGTAAAACTATAGTTCAGGAAGCACCATATATGTACAGTCATAATGTTACAAATAGACCAACTGTGCGAATCTATCGTGATTGTAGTGCAATTTCAGCTGAATTCCCTCAATGTCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTACCTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGGGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGAC ] [-] EMBL CD076629 [ TCTAGACAGAGTGGGTACAGATAAAGTGAAAATGCGTTATTGTATCTGTACAGATGATGCATGTAATCAAAGTGTTCTAACTAATAGTGTTCATGTCAAATCAATGTTACTTTCAACAGCATTCAGTATGCTAATTTATTTATTCTCTTCACATTAATTAAAATTGAGCGACTCGATCAACGCGGTAGAAATCAATCAAGTGAAGAGAAATGATGAACCTGAAAGACATCTATTTCAAAAAAAGATTTATACAACTTTTGCTATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATTCAATGTACAATGTATTATCTATCATTCAATGGAATTATTCTTTGATCTGTATCTAGTTTATATGTTGTACTCTCTTAGACTTCATTTTCGAAAAAACACATGTTG] [+] EMBL SMRAP163 [ ATTCATTCTTTTTAGATTCTAAACTTATTATTATTAATAATTAGATCATTAGTTTGTATTCATTCAAATGTATGTAACTAACTAGTATCTATATTAATTTATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||