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Schistosoma mansoni
cluster # 9094 cluster # 9094       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9094#0 length = 577 sequences # 8  

consensusID : consensus_9094#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 577
fasta sequence
                              [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTATTCCTATTATAAACCATATTTAAGGTTATTTTATTACCTGGTCATAATAATTAAACTAAAAGTCATCGGCACTTCAATATAAGCTT]

[+] EMBL CD087996             [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACTAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTAT                                                                                     ]
[+] EMBL CD088006             [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTTTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTAT                                                                                     ]
[+] EMBL CD088038             [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTA                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD088048             [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATCTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAAT                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD088063             [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCGTTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTAC                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD088004             [GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGAACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTACATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATAGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAACTCTGTTTTACAAGGTGTTGTCATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTAT                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD088008             [                                                                                                                          ttTTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGGCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTATTCCTATTATAAACCATATTTAAGGTTATTTTATTACCTGGTCATAATAATTAAACTAAAAGTCATCGGCACTTCAATATAAGCTT]
[-] EMBL CD088054             [                                                                                                                                                 GCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAAGCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACACCAACCTTACACTTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAGATGTAACATGAAGTATTTCCACACACACTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTCTTACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAACTTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAACGTCGACATCTATTCCTATTATAAATCATATTTAAGGTTATTTTATTACCTGGTCATAATAATTAAACTAAAAGTTATCGGCACTTCAATATAAGCTT]


>consensus_9094#0 GGGCTGATTTGTATTTCTCAAAACTATTCAGGTTGCTTGACAACACGGTGGTGATGGGGA ACAAAATCAGTTAATGTGGCAGCCGCAGAAGTGAAAACTAAAATAGGCATTGCAAAACTA CATATTTGCCAGGAATTGAAAGAGAGCTTCAATAGGAAAATTGAGTAAATCTAATGTCAA GCAAACCAAAACATATGGTTAGTTCTCAAATAAAAACCTCACAGAACGCCAACCTTACAC TTAGGTGAAGACAACAATTTGTCGTCACAATAAATGTAACATGAAGTATTTCCACACACA CTCATATAAAAGCATATTAAAAGATCTTACACCTTACACTTTTATTTGGTAATTCTGTTT TACAAGGTGTTGTAATAGTTGGTGACTATACCTGTCAAGTGTTGTTCAGTATTATGAAAC TTTAGATTCTACCAATTCTACTACTTGCACCACTCTATTTTTAGTAATCTGTTAGTAAAC GTCGACATCTATTCCTATTATAAACCATATTTAAGGTTATTTTATTACCTGGTCATAATA ATTAAACTAAAAGTCATCGGCACTTCAATATAAGCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)