cluster # 9099

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Schistosoma mansoni
cluster # 9099 cluster # 9099 Sequences # 8 consensus # 3

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consensusID : consensus_9099#0
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fasta sequence

                              [TCGAGGACTTTACAACTCTTTGATTCCTCTGATTGTACTCTGTTAGAAATTAATCCAATTTCTCAAGATATACATGGAAAAGTTGTTTGTATGGATTGTAAATTGAATTTCGATGATAATGCTTCATTTCGACAGAAAGAGATTTTTGCACAACGTGATTGGTCACAAGAAGATGAACGCGATGTGAAAGCATCAAAGGCTGGATTAAATTATATTGGTTTAGATGGAAATATTGGTTGTTTAGTTAACGGAGCTGGTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGTAGTCCAGCGAATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAGCGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCTTTTCGTCTAATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAGTAAATATTTTCGGTGGTATTATGCGTTGTGATGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATAAAAGTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAAGCAATTCTTGCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAGATGAAGCTGCTCAAATGTCTGTTAAACTGGCTAATATTGTTCATTTGGCTCGTGAAGTGCCTATAAATGTGAAATTTGAACTGCCCTATTAATTAATAATATAATGTTAGTTATATTATTATAATAAGTAAAGATGAATAATTCGAAGGAATGGGGACATCACACTATTTTGAATTGTGATGAATCCAATAGCTCTGTTTATATTATTATTACCAGTATTGTTATTATTATCATTATCATTATTATTATTATTATAACTTACTTTGGAAAGACAACAGTCATTGTATGGTCTCTTCAATTCCGTTTTGTTATATCCTCTGAAACAGATTCTTTTGTACGAATGAATGTGCAATTATGATAATAAGATTGTTTCATACGATAGATTTAAATATTTACTGCATTATGTAATACATAGATTTTGTTGCATAAGAGAAAAAAATTCCTTAATCAAACAATCATTTATTTTATTGCATGTCATTGTATTTTGTCCGCAGTCAACTCAACGACGCCACCCACCTCACCCCTCCACACACACACACACACCTTATTTCACCTTGAAAACAAAGAGTATACAAAAATTCATTTTCACTGTATAAAAATGCTAGTATACCTACTATACAACTGTATTTTGCCAGAAGAAAAAGATAAATTCAAATCTTTATTTCACATAAAATATTTTTCATCTTTATT-GTTTCTTCTATTTTTCATTGGTATTCACTATTAGTAACATATACTACTATNTATCGTTCTATGATAGTAGTAGTAAATGGCGTT]

[+] EMBL CD083153             [TCGAGGACTTTACAACTCTTTGATTCCTCTGATTGTACTCTGTTAGAAATTAATCCAATTTCTCAAGATATACATGGAAAAGTTGTTTGTATGGATTGTAAATTGAATTTCGATGATAATGCTTCATTTCGACAGAAAGAGATTTTTGCACAACGTGATTGGTCACAAGAAGATGAACGCGATGTGAAAGCATCAAAGGCTGGATTAAATTATATTGGTTTAGATGGAAATATTGGTTGTTTAGTTAACGGAGCTGGTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGTAGTCCAGCGAATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAGCGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCTTTTCGTCTAATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAGTAAATATTTTCGGTGGTATTATGCGTTGTGATGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATAAAAGTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAAGCAATTCTTGCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAGATGAAGCTGCTCANATGTCTGTTAAACTGGCTAATATTGTTCATTTGGCTCGTGAAGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
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[+] EMBL CD157873             [                                                                                                                                                                                                                                                                GTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGTAGTCCAGCGAATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAGCGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCTTTTCGTCTAATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAGTAAATATTTTCGGTGGTATTATGCGTTGTGATGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATAAAAGTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAAGCAATTCTTGCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAAATGAAGCTGCTCAAATGTCTGTTAAACTGGCTAATATTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
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>consensus_9099#0
TCGAGGACTTTACAACTCTTTGATTCCTCTGATTGTACTCTGTTAGAAATTAATCCAATT
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GATGTGAAAGCATCAAAGGCTGGATTAAATTATATTGGTTTAGATGGAAATATTGGTTGT
TTAGTTAACGGAGCTGGTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGT
AGTCCAGCGAATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAGCGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCT
TTTCGTCTAATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAGTAAATATTTTCGGTGGT
ATTATGCGTTGTGATGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATA
AAAGTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAAGCAATTCTT
GCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAGATGAAGCTGCTCAAATGTCT
GTTAAACTGGCTAATATTGTTCATTTGGCTCGTGAAGTGCCTATAAATGTGAAATTTGAA
CTGCCCTATTAATTAATAATATAATGTTAGTTATATTATTATAATAAGTAAAGATGAATA
ATTCGAAGGAATGGGGACATCACACTATTTTGAATTGTGATGAATCCAATAGCTCTGTTT
ATATTATTATTACCAGTATTGTTATTATTATCATTATCATTATTATTATTATTATAACTT
ACTTTGGAAAGACAACAGTCATTGTATGGTCTCTTCAATTCCGTTTTGTTATATCCTCTG
AAACAGATTCTTTTGTACGAATGAATGTGCAATTATGATAATAAGATTGTTTCATACGAT
AGATTTAAATATTTACTGCATTATGTAATACATAGATTTTGTTGCATAAGAGAAAAAAAT
TCCTTAATCAAACAATCATTTATTTTATTGCATGTCATTGTATTTTGTCCGCAGTCAACT
CAACGACGCCACCCACCTCACCCCTCCACACACACACACACACCTTATTTCACCTTGAAA
ACAAAGAGTATACAAAAATTCATTTTCACTGTATAAAAATGCTAGTATACCTACTATACA
ACTGTATTTTGCCAGAAGAAAAAGATAAATTCAAATCTTTATTTCACATAAAATATTTTT
CATCTTTATTGTTTCTTCTATTTTTCATTGGTATTCACTATTAGTAACATATACTACTAT
NTATCGTTCTATGATAGTAGTAGTAAATGGCGTT

consensusID : consensus_9099#1
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consensus length = 546
fasta sequence

                              [GCCTCGAGGCAAGAATCGGCACGAGGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATAAAGTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAAGCAATTCTTGCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAGATGAAGCTGCTCAAATGTCTGTTAAACTGGCTAATATTGTTCATTTGGCTCGTGAAGTTGCTATAAATGTGAAATTTGAACTGCCCTATTAATTAATAATATAATGTTAGTTATATTATTATAATAAGTAAAGATGAATAATTCGAAGGAATGGGGACATCACACTATTTTGAATTGTGATGAATCCAATAGCTCTGTTTATATTATTATTACCAGTATTGTTATTATTATCATTATCATTATTATTATTATTATAACTTACTTTGGAAAGACAACAGTCATTGTATGGTCTCTTCAATTCCGTTTTGTTATATCCTCTGAAACAGATTCTTTTGTACGAATGAATGTTGCATTATGATAATAAGATTGTTTCATAC]

[+] EMBL CD083692             [GCCTCGAGGCAAGAATCGGCACGAGGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATAAAGTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAAGCAATTCTTGCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAGATGAAGCTGCTCAAATGTCTGTTAAACTGGCTAATATTGTTCATTTGGCTCGTGAAGTTGCTATAAATGTGAAATTTGAACTGCCCTATTAATTAATAATATAATGTTAGTTATATTATTATAATAAGTAAAGATGAATAATTCGAAGGAATGGGGACATCACACTATTTTGAATTGTGATGAATCCAATAGCTCTGTTTATATTATTATTACCAGTATTGTTATTATTATCATTATCATTATTATTATTATTATAACTTACTTTGGAAAGACAACAGTCATTGTATGGTCTCTTCAATTCCGTTTTGTTATATCCTCTGAAACAGATTCTTTTGTACGAATGAATGTTGCATTATGATAATAAGATTGTTTCATAC]




>consensus_9099#1
GCCTCGAGGCAAGAATCGGCACGAGGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGA
ATTAAACATAAAGTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAA
GCAATTCTTGCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAGATGAAGCTGCT
CAAATGTCTGTTAAACTGGCTAATATTGTTCATTTGGCTCGTGAAGTTGCTATAAATGTG
AAATTTGAACTGCCCTATTAATTAATAATATAATGTTAGTTATATTATTATAATAAGTAA
AGATGAATAATTCGAAGGAATGGGGACATCACACTATTTTGAATTGTGATGAATCCAATA
GCTCTGTTTATATTATTATTACCAGTATTGTTATTATTATCATTATCATTATTATTATTA
TTATAACTTACTTTGGAAAGACAACAGTCATTGTATGGTCTCTTCAATTCCGTTTTGTTA
TATCCTCTGAAACAGATTCTTTTGTACGAATGAATGTTGCATTATGATAATAAGATTGTT
TCATAC

consensusID : consensus_9099#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 536
fasta sequence

                              [GCATCAAAGGCTGGATTAAATTATATTGGTTTAGATGGAAATATTGGTTGTTTAGTTAACGGAGCTGGTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGTAGTCCAGCGAATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAACGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCTTTTCGTCTAATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAATAAATATTTTCGGTGGTATTATGCGTTGTGATGTGATTGCACAAAGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATAAAAGTACCAATTGTTGTACCACTGCGAAGCGCTATAGTTGAAGAAGCTTAAGCCATTCTTGCTTCAAGTCATATGAAAATTCTATGGTGGAATGATTTAAAAGAAACTGGTCCAATGGCTGTGAAACCGGCTTATAATGGTCATTTCGCTTCGGGAAGTTGCTATTAATGTGAAATTTGAACCGGCCCTTTTATTAATAATATTATGTTAAGTATATTATTATAATAAGTAAAAATGAATAATTC]

[+] EMBL CD161962             [GCATCAAAGGCTGGATTAAATTATATTGGTTTAGATGGAAATATTGGTTGTTTAGTTAACGGAGCTGGTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGTAGTCCAGCGAATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAACGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCTTTTCGTCTAATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAATAAATATTTTCGGTGGTATTATGCGTTGTGATGTGATTGCACAAAGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATAAAAGTACCAATTGTTGTACCACTGCGAAGCGCTATAGTTGAAGAAGCTTAAGCCATTCTTGCTTCAAGTCATATGAAAATTCTATGGTGGAATGATTTAAAAGAAACTGGTCCAATGGCTGTGAAACCGGCTTATAATGGTCATTTCGCTTCGGGAAGTTGCTATTAATGTGAAATTTGAACCGGCCCTTTTATTAATAATATTATGTTAAGTATATTATTATAATAAGTAAAAATGAATAATTC]




>consensus_9099#2
GCATCAAAGGCTGGATTAAATTATATTGGTTTAGATGGAAATATTGGTTGTTTAGTTAAC
GGAGCTGGTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGTAGTCCAGCG
AATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAACGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCTTTTCGTCTA
ATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAATAAATATTTTCGGTGGTATTATGCGT
TGTGATGTGATTGCACAAAGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATAAAAGTACCA
ATTGTTGTACCACTGCGAAGCGCTATAGTTGAAGAAGCTTAAGCCATTCTTGCTTCAAGT
CATATGAAAATTCTATGGTGGAATGATTTAAAAGAAACTGGTCCAATGGCTGTGAAACCG
GCTTATAATGGTCATTTCGCTTCGGGAAGTTGCTATTAATGTGAAATTTGAACCGGCCCT
TTTATTAATAATATTATGTTAAGTATATTATTATAATAAGTAAAAATGAATAATTC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9099#0      TCGAGGACTTTACAACTCTTTGATTCCTCTGATTGTACTCTGTTAGAAATTAATCCAATT 60
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      TCTCAAGATATACATGGAAAAGTTGTTTGTATGGATTGTAAATTGAATTTCGATGATAAT 120
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      GCTTCATTTCGACAGAAAGAGATTTTTGCACAACGTGATTGGTCACAAGAAGATGAACGC 180
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      GATGTGAAAGCATCAAAGGCTGGATTAAATTATATTGGTTTAGATGGAAATATTGGTTGT 240
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ---------GCATCAAAGGCTGGATTAAATTATATTGGTTTAGATGGAAATATTGGTTGT 51
                                                                                  

consensus_9099#0      TTAGTTAACGGAGCTGGTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGT 300
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      TTAGTTAACGGAGCTGGTTTAGCTATGGCTACTATGGATTTAATTCAATTGCATGGTGGT 111
                                                                                  

consensus_9099#0      AGTCCAGCGAATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAGCGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCT 360
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      AGTCCAGCGAATTTTCTTGATGTTGGCGGCGGAACGACAGCTGATCAAGTGACTGAAGCT 171
                                                                                  

consensus_9099#0      TTTCGTCTAATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAGTAAATATTTTCGGTGGT 420
consensus_9099#1      -------------------------------------------------GCCTCGA-GGC 10
consensus_9099#2      TTTCGTCTAATCACATCTGATCCGAAGGTCAATGCTATACTAATAAATATTTTCGGTGGT 231
                                                                          ***  ** 

consensus_9099#0      ATTATGCGTTGTGATGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATA 480
consensus_9099#1      AAGAATCGGCACGAGGTGATTGCACAAGGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATA 70
consensus_9099#2      ATTATGCGTTGTGATGTGATTGCACAAAGTATTGTAGCTGCTGCTACGGAATTAAACATA 291
                      *  *  **    ** ************ ********************************

consensus_9099#0      AAAGTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAAGCAATTCTT 540
consensus_9099#1      AA-GTACCAATTGTTGTACGACTGCAAGGCACTAGAGTTGAAGATGCTAAAGCAATTCTT 129
consensus_9099#2      AAAGTACCAATTGTTGTACCACTGCGAAGCGCTATAGTTGAAGAAGCTTAAGCCATTCTT 351
                      ** **************** ***** * ** *** ********* *** **** ******

consensus_9099#0      GCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAGATGAAGCTGCTCAAATGTCT 600
consensus_9099#1      GCTACAAGTCATATGAAAATTCTAGGTTGTAGTGATTTAGATGAAGCTGCTCAAATGTCT 189
consensus_9099#2      GCTTCAAGTCATATGAAAATTCTATGGTGGAATGATTTAAAAGAAACTGGTCCAATGGCT 411
                      *** ******************** * ** * ******* * *** *** ** **** **

consensus_9099#0      GTTAAACTGGCTAATATTGTTCATTTGGCT-CGTGAAGTGCCTATAAATGTGAAATTTGA 659
consensus_9099#1      GTTAAACTGGCTAATATTGTTCATTTGGCT-CGTGAAGTTGCTATAAATGTGAAATTTGA 248
consensus_9099#2      GTGAAACCGGCTTATAATGGTCATTTCGCTTCGGGAAGTTGCTATTAATGTGAAATTTGA 471
                      ** **** **** *** ** ****** *** ** *****  **** **************

consensus_9099#0      ACTGCCCTATTAATTAATAATATAATGTTAGTTATATTATTATAATAAGTAAAGATGAAT 719
consensus_9099#1      ACTGCCCTATTAATTAATAATATAATGTTAGTTATATTATTATAATAAGTAAAGATGAAT 308
consensus_9099#2      ACCGGCCCTTTTATTAATAATATTATGTTAAGTATATTATTATAATAAGTAAAAATGAAT 531
                      ** * **  ** *********** ******  ********************* ******

consensus_9099#0      AATTCGAAGGAATGGGGACATCACACTATTTTGAATTGTGATGAATCCAATAGCTCTGTT 779
consensus_9099#1      AATTCGAAGGAATGGGGACATCACACTATTTTGAATTGTGATGAATCCAATAGCTCTGTT 368
consensus_9099#2      AATTC------------------------------------------------------- 536
                      *****                                                       

consensus_9099#0      TATATTATTATTACCAGTATTGTTATTATTATCATTATCATTATTATTATTATTATAACT 839
consensus_9099#1      TATATTATTATTACCAGTATTGTTATTATTATCATTATCATTATTATTATTATTATAACT 428
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      TACTTTGGAAAGACAACAGTCATTGTATGGTCTCTTCAATTCCGTTTTGTTATATCCTCT 899
consensus_9099#1      TACTTTGGAAAGACAACAGTCATTGTATGGTCTCTTCAATTCCGTTTTGTTATATCCTCT 488
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      GAAACAGATTCTTTTGTACGAATGAATGTGCAATTATGATAATAAGATTGTTTCATACGA 959
consensus_9099#1      GAAACAGATTCTTTTGTACGAATGAATGTTGCATTATGATAATAAGATTGTTTCATAC-- 546
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      TAGATTTAAATATTTACTGCATTATGTAATACATAGATTTTGTTGCATAAGAGAAAAAAA 1019
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      TTCCTTAATCAAACAATCATTTATTTTATTGCATGTCATTGTATTTTGTCCGCAGTCAAC 1079
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      TCAACGACGCCACCCACCTCACCCCTCCACACACACACACACACCTTATTTCACCTTGAA 1139
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      AACAAAGAGTATACAAAAATTCATTTTCACTGTATAAAAATGCTAGTATACCTACTATAC 1199
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      AACTGTATTTTGCCAGAAGAAAAAGATAAATTCAAATCTTTATTTCACATAAAATATTTT 1259
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      TCATCTTTATTGTTTCTTCTATTTTTCATTGGTATTCACTATTAGTAACATATACTACTA 1319
consensus_9099#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9099#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9099#0      TNTATCGTTCTATGATAGTAGTAGTAAATGGCGTT 1354
consensus_9099#1      -----------------------------------
consensus_9099#2      -----------------------------------