cluster # 9120

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Schistosoma mansoni
cluster # 9120 cluster # 9120 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_9120#0 length = 1426 sequences # 6

consensus_9120#1 length = 423 sequences # 2

consensusID : consensus_9120#0
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Sequences nbr = 6
consensus length = 1426
fasta sequence

                              [CGAGGACTAATGTTACTAATCCATTAAATGCTGTTGCTTCTCTCAAGGATGTTGAGGGTCTGAATCCTTATAATACAGCTGTATTAAGTCGTGGGGATATACTATGCCCTTATTGTGAAAACGTAAAACAACAGCATGTTCATATACCTTGTACAGCAGCCGCATGCTATGCTTTTATTCGTCATGTTAATTTTCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTGTCGGAGCACCCACAGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTCACATACAGTCAAATAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAGTTGGACATCCAAGATTAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATTGCGGCTATTCTGTTCTGAATGATCCTCGAAATCCAAACAAATCACGATGCGTCGGTGATGTAGAATTTGAAACAGCTATAGAGAATGCGAAGTGGATTACACCAGTTCCAGGTGGAGTTGGTCCAGTTTCAATCGCTATGTTATTTCGTAATACCGTGAATAGTGCTAAATGGTCTGTAGGATTAAATAATTCCATATGTTCTTGTTCAAATTATTCTGAAAATGACATCTTATCTAAAGAACATGCCGACAGAAAAGTATCTAGATAAAAGGGATGATAACAGCTATCTTAGTTAATCTAATCAATGGATATTGTTTTTAGTTAAACATTCTGTACTTATTCAATTATCTTGAACGAATTCTAAACCAGACATTTATTTTAAACTGTTTCTACTACCTTCTATTAATTAGCGTATCGCTAATCGTAATATAGGCAGAAGTGATATTAAGCTCTCTGTTGCTTATTTGTATACTCAATTACTATTACTTTCAACTGAGTATTTTAACTT-CATGCAATTAGCATCTTGTGATGTATAATGTAAAATACCCCAACTACAAACAAAAGCACACAGCTCTTATTGTTCATATGAAATAAAAACATATTTTAAGTAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGATCTTTTCCTCTTAACCCTTCTCCCCTCTTGATCAAGCATTAAGGTTGTGGCTTTTATTATTTATTGTCTTTTTAATAAGTTGTTTTTCGAACTTGACTGGTACTAACCGTCTATTTCTTAGTTCTCTATTGGAATCAACTTTTTCTTTTTTTTACTTTACCTACCACCATGACAACCTAGCTTATTTTTCTTATGTGAACCTGGTTTTTTTCAATATGGAAGTGATCATTCAAATATTCGTCACGCTACGATTATTACTCTATATTGTAGTCAGCATTTTTTTCTCCTCACAGTCTTTATCTTCCCCACAATATTTGGAGAACATCTCGGGTGTATATGTTGTAGTATATATACTAGTTTTTTAAGTGAAGGG]

[+] EMBL CD082194             [CGAGGACTAATGTTACTAATCCATTAAATGCTGTTGCTTCTCTCAAGGATGTTGAGGGTCTGAATCCTTATAATACAGCTGTATTAAGTCGTGGGGATATACTATGCCCTTATTGTGAAAACGTAAAACAACAGCATGTTCATATACCTTGTACAGCAGCCGCATGCTATGCTTTTATTCGTCATGTTAATTTTCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTGTCGGAGCACCCACAGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTCACATACAGTCAAATAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAGTTGGACATCCAAGATTAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATTGCGGCTATTCTGTTCTGAATGATCCTCGAAATCCAAACAAATCACGATGCGTCGGTGATGTAGAATTTGAAACAGCTATAGAGAATGCGAAGTGGATTACACCAGTTCCAGGTGGAGTTGGTCCAGTTTCAATCGCTATGTTATTTCGTAATACCGTGAATAGTGCTAAATGGTCTGTAGGATTAAATAATTCCATATGTTCTTGTTC AATTATTCTGAAAATGACATCTTATCTAAAGAACATGCCGACAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
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[+] EMBL SMAA14095            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACCAGGAGCATTGGTAATTGATTGCGGCTATTCTGTTCTGAATGATCCTCGAAATCCAAACAAATCACGATGCGTCGGTGATGTAGAATTTGTTTCAGCTATAGAGAATGCGAAGTGGATTACACCAGTTCCAGGTGGAGTTGGTCCAGTTTCAATCGCTATGTTATTTCGTAATACCGTGAATAGTGCTAAATGGTCTGTAGGATTAAATAATTCCATATGTTCTTGTTCAAATTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
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[-] EMBL CD076923             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTTAATCTAATCAATGGATATTGTTTTTAGTTAAACATTCTGTACTTATTCAATTATCTTGAACGAATTATAAACCAGACATTTATTTTAAACTGTTTCTACTACCTTCTATTAATTAGCGTATCGCTAATCGTAATATAGGCAGAAGTGATATTAAGCTCTCTGTTGCTTATTTGTATACTCAATTACTATTACTTTCAACTGAGTATTTTAACTT CATGCAATTAGCATCTTGTGATGTATAATGTAAAATACCCCAACTACAAACAAAAGCACACAGCTCTTATTGTTCATATGAAATAAAAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AW497768             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAATACCCCAACTACAAACAAAAGCACACAGCTCTTATTGTTCATATGAAATAAAAACATATTTTAAGTAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGATCTTTTCCTCTTAACCCTTCTCCCCTCTTGATCAAGCATTAAGGTTGTGGCTTTTATTATTTATTGTCTTTTTAATAAGTTGTTTTTCGAACTTGACTGGTACTAACCGTCTATTTCTTAGTTCTCTATTGGAATCAACTTTTTCTTTTTTTTACTTTACCTACCACCATGACAACCTAGCTTATTTTTCTTATGTGAACCTGGTTTTTTTCAATATGGAAGTGATCATTCAAATATTCGTCACGCTACGATTATTACTCTATATTGTAGTCAGCATTTTTTTCTCCTCACAGTCTTTATCTTCCCCACAATATTTGGAGAACATCTCGGGTGTATATGTTGTAGTATATATACTAGTTTTTTAAGTGAAGGG]




>consensus_9120#0
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TGAATCCTTATAATACAGCTGTATTAAGTCGTGGGGATATACTATGCCCTTATTGTGAAA
ACGTAAAACAACAGCATGTTCATATACCTTGTACAGCAGCCGCATGCTATGCTTTTATTC
GTCATGTTAATTTTCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTG
TCGGAGCACCCACAGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTC
ACATACAGTCAAATAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAG
TTGGACATCCAAGATTAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATT
GCGGCTATTCTGTTCTGAATGATCCTCGAAATCCAAACAAATCACGATGCGTCGGTGATG
TAGAATTTGAAACAGCTATAGAGAATGCGAAGTGGATTACACCAGTTCCAGGTGGAGTTG
GTCCAGTTTCAATCGCTATGTTATTTCGTAATACCGTGAATAGTGCTAAATGGTCTGTAG
GATTAAATAATTCCATATGTTCTTGTTCAAATTATTCTGAAAATGACATCTTATCTAAAG
AACATGCCGACAGAAAAGTATCTAGATAAAAGGGATGATAACAGCTATCTTAGTTAATCT
AATCAATGGATATTGTTTTTAGTTAAACATTCTGTACTTATTCAATTATCTTGAACGAAT
TCTAAACCAGACATTTATTTTAAACTGTTTCTACTACCTTCTATTAATTAGCGTATCGCT
AATCGTAATATAGGCAGAAGTGATATTAAGCTCTCTGTTGCTTATTTGTATACTCAATTA
CTATTACTTTCAACTGAGTATTTTAACTTCATGCAATTAGCATCTTGTGATGTATAATGT
AAAATACCCCAACTACAAACAAAAGCACACAGCTCTTATTGTTCATATGAAATAAAAACA
TATTTTAAGTAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGATCTTTTCCTCTTAACCCTTCTCCCCTC
TTGATCAAGCATTAAGGTTGTGGCTTTTATTATTTATTGTCTTTTTAATAAGTTGTTTTT
CGAACTTGACTGGTACTAACCGTCTATTTCTTAGTTCTCTATTGGAATCAACTTTTTCTT
TTTTTTACTTTACCTACCACCATGACAACCTAGCTTATTTTTCTTATGTGAACCTGGTTT
TTTTCAATATGGAAGTGATCATTCAAATATTCGTCACGCTACGATTATTACTCTATATTG
TAGTCAGCATTTTTTTCTCCTCACAGTCTTTATCTTCCCCACAATATTTGGAGAACATCT
CGGGTGTATATGTTGTAGTATATATACTAGTTTTTTAAGTGAAGGG

consensusID : consensus_9120#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 423
fasta sequence

                              [TCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTGTCGGAGCACCCACAGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTCACATACAGTCAAATAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAGTTGGACATCCAAGATTAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATTGCGGCTATTCTGTTCTGAATGGTAGGTGGGAATAGATCTGTTGTTTTAAGCTTTAATATGTCTTTTTGTAAACATTACTTTCATGCTTGTTTGTCTACGTTCACTGAAATGTTGATGAAGTATGCTAGTTTGAACTGACAGTTGTTCGTTCTAACTTCTACAACTCGAATACCTGATGGACATAGTACGTTGGTGG]

[+] EMBL CD159455             [TCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTGTCGGAGCACCCACAGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTCACATACAGTCAAATAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAGTTGGACATCCAAGATTAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATTGCGGCTATTCTGTTCTGAATGGTAGGTGGGAATAGATCTGTTGTTTTAAGCTTTAATATGTCTTTTTGTAAACATTACTTTCATGCTTGTTTGTCTACGTTCACTGAAATGTTGATGAAGTATGCTAGTTTGAACTGACAGTTGTTCGTTCTAACTTCTACAACTCGAATACCTGATGGACATAGTACGTTGGTGG]
[+] EMBL CD159664             [TCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTGTCGGAGCACCCACAGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTCACATACAGTCAAATAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAGTTGGACATCCAAGATCAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATTGCGGCTATTCTGTTCTGAATGGTAGGTGGGAATAGATCTGTTGTTTTAAGCTTTAATATGTCTTTTTGTAAACATTACTTTCATGCTTGTTTGTCTACGTTCACTGAAATGTTGATGAAGTATGCTAGTTTGAACTGACAGTTGTTCGTTCTAACTTCTACAACTCGAATAACTGATGGACATAG           ]




>consensus_9120#1
TCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTGTCGGAGCACCCAC
AGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTCACATACAGTCAAA
TAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAGTTGGACATCCAAG
ATTAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATTGCGGCTATTCTGT
TCTGAATGGTAGGTGGGAATAGATCTGTTGTTTTAAGCTTTAATATGTCTTTTTGTAAAC
ATTACTTTCATGCTTGTTTGTCTACGTTCACTGAAATGTTGATGAAGTATGCTAGTTTGA
ACTGACAGTTGTTCGTTCTAACTTCTACAACTCGAATACCTGATGGACATAGTACGTTGG
TGG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9120#0      CGAGGACTAATGTTACTAATCCATTAAATGCTGTTGCTTCTCTCAAGGATGTTGAGGGTC 60
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      TGAATCCTTATAATACAGCTGTATTAAGTCGTGGGGATATACTATGCCCTTATTGTGAAA 120
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      ACGTAAAACAACAGCATGTTCATATACCTTGTACAGCAGCCGCATGCTATGCTTTTATTC 180
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      GTCATGTTAATTTTCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTG 240
consensus_9120#1      -------------TCCTATAATTGGTTCACGCTGTGTAATCATTGGTGGTGGTCGTCTTG 47
                                   ***********************************************

consensus_9120#0      TCGGAGCACCCACAGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTC 300
consensus_9120#1      TCGGAGCACCCACAGCGGATTTGTTGTCACGATCGTGCGGTGCAACGGTTATACAATGTC 107
                      ************************************************************

consensus_9120#0      ACATACAGTCAAATAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAG 360
consensus_9120#1      ACATACAGTCAAATAATATTAACGAAGAAATTAATCGAGGTGATGTTGTCATCTCAGCAG 167
                      ************************************************************

consensus_9120#0      TTGGACATCCAAGATTAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATT 420
consensus_9120#1      TTGGACATCCAAGATTAATAAAGGGTGAATGGATTAAACCAGGAGCATTGGTAATTGATT 227
                      ************************************************************

consensus_9120#0      GCGGCTATTCTGTTCTGAATGATCCTCGAAATCCAAACAAAT-CACGATGCGTCGGTGAT 479
consensus_9120#1      GCGGCTATTCTGTTCTGAATGGTAGGTGGGAATAGATCTGTTGTTTTAAGCTTTAAT-AT 286
                      ********************* *    *  *    * *   *     * ** *   * **

consensus_9120#0      GTAGAATTTGAAACA--GCTATAGAGAATGCGAAGTGGATTACACC-AGTTCCAGGTGGA 536
consensus_9120#1      GTCTTTTTGTAAACATTACTTTCATGCTTGTTTGTCTACGTTCACTGAAATGTTGATGAA 346
                      **    **  *****   ** *   *  **          * ***  *  *   * ** *

consensus_9120#0      GTTGGTCCAGTTTCAATCGCTATGTTATTTCGTAATACCGTGAATAGTGCTAAATGGTCT 596
consensus_9120#1      GTATG-CTAGTTTGAACTGACA-GTTGTT-CGTTCTAACTTCTACAACTCGAA--TACCT 401
                      **  * * ***** **  *  * *** ** ***  ** * *  * *   * **     **

consensus_9120#0      GTAGGATTAAATAATTCCATATGTTCTTGTTCAAATTATTCTGAAAATGACATCTTATCT 656
consensus_9120#1      GATGGACATAGTACGTTGGTGG-------------------------------------- 423
                      *  ***   * **  *   *                                        

consensus_9120#0      AAAGAACATGCCGACAGAAAAGTATCTAGATAAAAGGGATGATAACAGCTATCTTAGTTA 716
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      ATCTAATCAATGGATATTGTTTTTAGTTAAACATTCTGTACTTATTCAATTATCTTGAAC 776
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      GAATTCTAAACCAGACATTTATTTTAAACTGTTTCTACTACCTTCTATTAATTAGCGTAT 836
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      CGCTAATCGTAATATAGGCAGAAGTGATATTAAGCTCTCTGTTGCTTATTTGTATACTCA 896
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      ATTACTATTACTTTCAACTGAGTATTTTAACTTCATGCAATTAGCATCTTGTGATGTATA 956
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      ATGTAAAATACCCCAACTACAAACAAAAGCACACAGCTCTTATTGTTCATATGAAATAAA 1016
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      AACATATTTTAAGTAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGATCTTTTCCTCTTAACCCTTCTCC 1076
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      CCTCTTGATCAAGCATTAAGGTTGTGGCTTTTATTATTTATTGTCTTTTTAATAAGTTGT 1136
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      TTTTCGAACTTGACTGGTACTAACCGTCTATTTCTTAGTTCTCTATTGGAATCAACTTTT 1196
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      TCTTTTTTTTACTTTACCTACCACCATGACAACCTAGCTTATTTTTCTTATGTGAACCTG 1256
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      GTTTTTTTCAATATGGAAGTGATCATTCAAATATTCGTCACGCTACGATTATTACTCTAT 1316
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      ATTGTAGTCAGCATTTTTTTCTCCTCACAGTCTTTATCTTCCCCACAATATTTGGAGAAC 1376
consensus_9120#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9120#0      ATCTCGGGTGTATATGTTGTAGTATATATACTAGTTTTTTAAGTGAAGGG 1426
consensus_9120#1      --------------------------------------------------