These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9143#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1495 fasta sequence [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGAAAATAAACAAATGATTGCTTTTGTTTTATTTTCTCCATGTTCATTGTCAATTTACGAAAGTTTGTGTTTATATTAATTCTTCCATCACTTCCACATTTTATAACTGCGTTGTCTTTTTTGTTGAAAAGACTAACAGACTATTTCCGAAATACGATGTTGATTTACGCGTTACTTGCTTACTCACTTCACAATGATGCTTGAGTGTTTGTGTGAAAGGTGCATCTTCTTTTATTGACTAAAAAAGACAACTTACATTTTTCATATAAACTATTATGTCTTATTCATGTATTATCTTTCTGTTCTGTTCTTTTGGAATCTATCCTCAAATCTACTTGATTCATATGTGTATACCTTTGATAACAAGTAGTAGTGATTCATTTCGACTAATGGAATCCCTGATAAAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAAATAAACACACTCAATACCTCTATAGCCCATTATAATTATTGGTCCTTAATATAATTGGTAATTNTCCGGTTTCTACAAATCATATTTTCAAAAATACTACTATAAACCTTTACATGAATGTTTAAATTACTTGAGAGTACTTGTTACATACCATATATTTATTTATACAACAGATTTTTGACTGATTCAGTTTACATTTTTTTCGGATAAACTTATCTATACTGTTGTTGCCTATAGTCACAGTCTATGATTGTGCTTGTCTGTGCTTACATATATNGTCATTTCTGAGTATTACTATGTTCCGATTTATTCACCGTAAATCAGCTTCCCATAATACTTACAGAGACCAGAAATCAAGTATTTTGTACAAATACACCTTAGTATTATTGTTTTTTTCTAAATTTCACACTATCCGATAAGAAATGAATTGATGATAATTAACCAGATAATTTTATTGGATTGATTCTCTCAGTACTCACTATTTCACCTGAACATAACTAAACATAACAACTATAATAATGCACGGAAAACACAATTACAGTTATATTTACCTGTTTTATTGCC-TTGGC-TTCCATTTCTTATATATGTATCTCTGTTCCTCTTTTACCTCACTTTTTATACAAATTGACTAAACACTTTTAAACAAAATTCCGTGGTTTCTAAGTTGTATTATTTTTTTAATTC-GTTGATAAATTTAATTCTCAGTTGGTCGATAATTTTTTTTTCATTTTTTTAAAAACAAAATCTATTTGCAGACTTATTGGGAATATAAAAAGTTGTTTAATTTTGGATTGAACATTTTTCGCGCTAATTTTTGTAAATCATTTGTATCTATTTAATGTAAGTTATTAATTAGTAAAAATGTAATGAAATCAA] [+] EMBL CD079297 [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGAAAATAAACAAATGATTGCTTTTGTTTTATTTTCTCCATGTTCATTGTCAATTTACGAAAGTTTGTGTTTATATTAATTCTTCCATCACTTCCACATTTTATAACTGCGTTGTCTTTTTTGTTGAAAAGACTAACAGACTATTTCCGAAATACGATGTTGATTTACGCGTTACTTGCTTACTCACTTCACAATGATGCTTGAGTGTTTGTGTGAAAGGTGCATCTTCTTTTATTGACTAAAAAAGACAACTTACATTTTTCATATAAACTATTATGTCTTATTCATGTATTATCTTTCTGTTCTGTTCTTTTGGAATCTATCCTCAAATCTACTTGATTCATATGTGTATACCTTTGATAACAAGTAGTAGTGATTCATTTCGACTAATGGAATCCCTGATAAAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAAATAAACACACTCAATACCTCTATAGCCCATTATAATTATTGGTCCTTAATATAATTGGTAATTNTCCGGTTTCTACAAATCATATTTTCAAA ] [-] EMBL CD179796 [ TTCTGTTCTGTTCTTTTGGAATCTATCCTCAAATCTACTTGATTCATATGTGTATACCTTTGATAACAAGTAGTAGTGATTCATTTCGACTAATGGAATCCCTGATAAAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAA ] [-] EMBL CD179799 [ AAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAA ] [-] EMBL CD179797 [ AGTTCGTCAGAAGAGGNACGCTTTTGCTCTCTCTCTTACCAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAA ] [-] EMBL CD179794 [ CAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTCTCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATGCAACTGAAATAGTACAGTATTACATGCCATACGTGCACACAA ] [+] EMBL CD181584 [ CGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAAATAAACACACTCAATACCTCTATAGCCCATTATAATTATTGTTCCTTAATATAATTGGTAATTTTCCGGTTTCTACAAATCATATTTTCAAAAATACTACTATAAACCTTTACATGAATGTTTAAATTACTTGAGAGTACTTGTTACATACCATATATTTATTTATACAACAGATTTTTGACTGATTCAGTTTACATTTTTTTCGGATAAACTTATCTATACTGTTGTTGCCTATAGTCACAGTCTATGATTGTGCTTGTCTGTGCTTACATATATNGTCATTTCTGAGTATTACTATGTTCCGATTTA ] [-] EMBL CD073578 [ CAGTCTATGATTGTGCTTGTCTGTGCTTACATATATGTTCATTCTTGAGTATTACTATGTTCCGATTTATTCACCGTAAATCAGCTTCCCATAATACTTACAGAGACCAGAAATCAAGTATTTTGTACAAATACACCTTAGTATTATTGTTTTTTTCTAAATTTCACACTATCCGATAAGAAATGAATTGATGATAATTAACCAGATAATTTTATTGGATTGATTCTCTCAGTACTCACTATTTCACCTGAACATAACTAAACATAACAACTATAATAATGCACGGAAAACACAATTACAGTTATATTTACCTGTTTTATTGCC TTGGC TTCCATTTCTTATATATGTATCTCTGTTCCTCTTTTACCTCACTTTTTATACAAATTGACTAAACACTTTTAAACAAAATTCCGTGGTTTCTAAGTTGTATTATTTTTTTAATTC GTTGATAAATTTAATTCTCAGTTGGTCGATAATTTTTTTTTCATTTTTTTAAAAACAAAATCTATTTGCAGACTTATTGGGAATATAAAAAGTTGTTTAATTTTGGATTGAACATTTTTCGCGCTAATTTTTGTAAATCATTTGTATCTATTTAATGTAAGTTATTAATTAGTAAAAATGTAATGAAATCAA] [+] EMBL SMAA28924 [ CAGAAATCAAGTATTTTGTACAAATACACCTTAGTATTATTGTTTTTTTCTAAATTTCACACTATCCGATAAGAAATGAATTGATGATAATTAACCAGATAATTTTATTGGATTGATTCTCTCAGTACTCACTATTTCACCTGAACATAACTAAACATAACAACTATAATAATGCACGGAAAACACAATTACAGTTATATTTACCTGTTTTATTGCCGTTGGCTTTCCATTTCTTATATATGTATCTCTGTTCCTCTTTTACCTCACTTTTTATACAAATTGACTAAACACTTTTAAACAAAATTCCGTGGTTTCTAAGTTGTATTATTTTTTTAATTCGGTAGATAAATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||