cluster # 9143

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9143 cluster # 9143 Sequences # 8 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9143#0 length = 1495 sequences # 8
consensusID : consensus_9143#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1495
fasta sequence
                              [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGAAAATAAACAAATGATTGCTTTTGTTTTATTTTCTCCATGTTCATTGTCAATTTACGAAAGTTTGTGTTTATATTAATTCTTCCATCACTTCCACATTTTATAACTGCGTTGTCTTTTTTGTTGAAAAGACTAACAGACTATTTCCGAAATACGATGTTGATTTACGCGTTACTTGCTTACTCACTTCACAATGATGCTTGAGTGTTTGTGTGAAAGGTGCATCTTCTTTTATTGACTAAAAAAGACAACTTACATTTTTCATATAAACTATTATGTCTTATTCATGTATTATCTTTCTGTTCTGTTCTTTTGGAATCTATCCTCAAATCTACTTGATTCATATGTGTATACCTTTGATAACAAGTAGTAGTGATTCATTTCGACTAATGGAATCCCTGATAAAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAAATAAACACACTCAATACCTCTATAGCCCATTATAATTATTGGTCCTTAATATAATTGGTAATTNTCCGGTTTCTACAAATCATATTTTCAAAAATACTACTATAAACCTTTACATGAATGTTTAAATTACTTGAGAGTACTTGTTACATACCATATATTTATTTATACAACAGATTTTTGACTGATTCAGTTTACATTTTTTTCGGATAAACTTATCTATACTGTTGTTGCCTATAGTCACAGTCTATGATTGTGCTTGTCTGTGCTTACATATATNGTCATTTCTGAGTATTACTATGTTCCGATTTATTCACCGTAAATCAGCTTCCCATAATACTTACAGAGACCAGAAATCAAGTATTTTGTACAAATACACCTTAGTATTATTGTTTTTTTCTAAATTTCACACTATCCGATAAGAAATGAATTGATGATAATTAACCAGATAATTTTATTGGATTGATTCTCTCAGTACTCACTATTTCACCTGAACATAACTAAACATAACAACTATAATAATGCACGGAAAACACAATTACAGTTATATTTACCTGTTTTATTGCC-TTGGC-TTCCATTTCTTATATATGTATCTCTGTTCCTCTTTTACCTCACTTTTTATACAAATTGACTAAACACTTTTAAACAAAATTCCGTGGTTTCTAAGTTGTATTATTTTTTTAATTC-GTTGATAAATTTAATTCTCAGTTGGTCGATAATTTTTTTTTCATTTTTTTAAAAACAAAATCTATTTGCAGACTTATTGGGAATATAAAAAGTTGTTTAATTTTGGATTGAACATTTTTCGCGCTAATTTTTGTAAATCATTTGTATCTATTTAATGTAAGTTATTAATTAGTAAAAATGTAATGAAATCAA]

[+] EMBL CD079297             [GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGAAAATAAACAAATGATTGCTTTTGTTTTATTTTCTCCATGTTCATTGTCAATTTACGAAAGTTTGTGTTTATATTAATTCTTCCATCACTTCCACATTTTATAACTGCGTTGTCTTTTTTGTTGAAAAGACTAACAGACTATTTCCGAAATACGATGTTGATTTACGCGTTACTTGCTTACTCACTTCACAATGATGCTTGAGTGTTTGTGTGAAAGGTGCATCTTCTTTTATTGACTAAAAAAGACAACTTACATTTTTCATATAAACTATTATGTCTTATTCATGTATTATCTTTCTGTTCTGTTCTTTTGGAATCTATCCTCAAATCTACTTGATTCATATGTGTATACCTTTGATAACAAGTAGTAGTGATTCATTTCGACTAATGGAATCCCTGATAAAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAAATAAACACACTCAATACCTCTATAGCCCATTATAATTATTGGTCCTTAATATAATTGGTAATTNTCCGGTTTCTACAAATCATATTTTCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD179796             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTCTGTTCTGTTCTTTTGGAATCTATCCTCAAATCTACTTGATTCATATGTGTATACCTTTGATAACAAGTAGTAGTGATTCATTTCGACTAATGGAATCCCTGATAAAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD179799             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD179797             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGTTCGTCAGAAGAGGNACGCTTTTGCTCTCTCTCTTACCAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD179794             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCTTTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTCTCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATCGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATGCAACTGAAATAGTACAGTATTACATGCCATACGTGCACACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD181584             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGAATGCCATACGTGCACACAAATAAACACACTCAATACCTCTATAGCCCATTATAATTATTGTTCCTTAATATAATTGGTAATTTTCCGGTTTCTACAAATCATATTTTCAAAAATACTACTATAAACCTTTACATGAATGTTTAAATTACTTGAGAGTACTTGTTACATACCATATATTTATTTATACAACAGATTTTTGACTGATTCAGTTTACATTTTTTTCGGATAAACTTATCTATACTGTTGTTGCCTATAGTCACAGTCTATGATTGTGCTTGTCTGTGCTTACATATATNGTCATTTCTGAGTATTACTATGTTCCGATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD073578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGTCTATGATTGTGCTTGTCTGTGCTTACATATATGTTCATTCTTGAGTATTACTATGTTCCGATTTATTCACCGTAAATCAGCTTCCCATAATACTTACAGAGACCAGAAATCAAGTATTTTGTACAAATACACCTTAGTATTATTGTTTTTTTCTAAATTTCACACTATCCGATAAGAAATGAATTGATGATAATTAACCAGATAATTTTATTGGATTGATTCTCTCAGTACTCACTATTTCACCTGAACATAACTAAACATAACAACTATAATAATGCACGGAAAACACAATTACAGTTATATTTACCTGTTTTATTGCC TTGGC TTCCATTTCTTATATATGTATCTCTGTTCCTCTTTTACCTCACTTTTTATACAAATTGACTAAACACTTTTAAACAAAATTCCGTGGTTTCTAAGTTGTATTATTTTTTTAATTC GTTGATAAATTTAATTCTCAGTTGGTCGATAATTTTTTTTTCATTTTTTTAAAAACAAAATCTATTTGCAGACTTATTGGGAATATAAAAAGTTGTTTAATTTTGGATTGAACATTTTTCGCGCTAATTTTTGTAAATCATTTGTATCTATTTAATGTAAGTTATTAATTAGTAAAAATGTAATGAAATCAA]
[+] EMBL SMAA28924            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAGAAATCAAGTATTTTGTACAAATACACCTTAGTATTATTGTTTTTTTCTAAATTTCACACTATCCGATAAGAAATGAATTGATGATAATTAACCAGATAATTTTATTGGATTGATTCTCTCAGTACTCACTATTTCACCTGAACATAACTAAACATAACAACTATAATAATGCACGGAAAACACAATTACAGTTATATTTACCTGTTTTATTGCCGTTGGCTTTCCATTTCTTATATATGTATCTCTGTTCCTCTTTTACCTCACTTTTTATACAAATTGACTAAACACTTTTAAACAAAATTCCGTGGTTTCTAAGTTGTATTATTTTTTTAATTCGGTAGATAAATT                                                                                                                                                                                     ]




>consensus_9143#0
GAGGCCAGAATTCGGCACGAGGGAAAATAAACAAATGATTGCTTTTGTTTTATTTTCTCC
ATGTTCATTGTCAATTTACGAAAGTTTGTGTTTATATTAATTCTTCCATCACTTCCACAT
TTTATAACTGCGTTGTCTTTTTTGTTGAAAAGACTAACAGACTATTTCCGAAATACGATG
TTGATTTACGCGTTACTTGCTTACTCACTTCACAATGATGCTTGAGTGTTTGTGTGAAAG
GTGCATCTTCTTTTATTGACTAAAAAAGACAACTTACATTTTTCATATAAACTATTATGT
CTTATTCATGTATTATCTTTCTGTTCTGTTCTTTTGGAATCTATCCTCAAATCTACTTGA
TTCATATGTGTATACCTTTGATAACAAGTAGTAGTGATTCATTTCGACTAATGGAATCCC
TGATAAAATACTTTGTGTTATCTCAGTTCGTCAGAAGAGGGACGCTTTTGCTCTCTCTCT
TTACAGTGGACCTGTAATCTATTTTTCGTATCATTTTTTTAACCATAAATAATTATGATC
GGGATACACGTATAGGGATGTACAAAATACTTATATACAACTGAAATAGTACAGTATTGA
ATGCCATACGTGCACACAAATAAACACACTCAATACCTCTATAGCCCATTATAATTATTG
GTCCTTAATATAATTGGTAATTNTCCGGTTTCTACAAATCATATTTTCAAAAATACTACT
ATAAACCTTTACATGAATGTTTAAATTACTTGAGAGTACTTGTTACATACCATATATTTA
TTTATACAACAGATTTTTGACTGATTCAGTTTACATTTTTTTCGGATAAACTTATCTATA
CTGTTGTTGCCTATAGTCACAGTCTATGATTGTGCTTGTCTGTGCTTACATATATNGTCA
TTTCTGAGTATTACTATGTTCCGATTTATTCACCGTAAATCAGCTTCCCATAATACTTAC
AGAGACCAGAAATCAAGTATTTTGTACAAATACACCTTAGTATTATTGTTTTTTTCTAAA
TTTCACACTATCCGATAAGAAATGAATTGATGATAATTAACCAGATAATTTTATTGGATT
GATTCTCTCAGTACTCACTATTTCACCTGAACATAACTAAACATAACAACTATAATAATG
CACGGAAAACACAATTACAGTTATATTTACCTGTTTTATTGCCTTGGCTTCCATTTCTTA
TATATGTATCTCTGTTCCTCTTTTACCTCACTTTTTATACAAATTGACTAAACACTTTTA
AACAAAATTCCGTGGTTTCTAAGTTGTATTATTTTTTTAATTCGTTGATAAATTTAATTC
TCAGTTGGTCGATAATTTTTTTTTCATTTTTTTAAAAACAAAATCTATTTGCAGACTTAT
TGGGAATATAAAAAGTTGTTTAATTTTGGATTGAACATTTTTCGCGCTAATTTTTGTAAA
TCATTTGTATCTATTTAATGTAAGTTATTAATTAGTAAAAATGTAATGAAATCAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case