cluster # 9153

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9153 cluster # 9153 Sequences # 8 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9153#0 length = 1075 sequences # 8
consensusID : consensus_9153#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1075
fasta sequence
                              [CGCGGCCTATGATCTGAGACGTTGGTGTGTTACTAATTCAACGCTCAGTAATACTAATATTTGCTTGGCGTATTGGCTGTTCTTAAATATCGGTAATATTCACTGAACGAAATTTCAACTCTCACCGCTTACGCTGTTATCGATTGTACATTGAAACCTGATATGTCTACAGGCAGCAGTGCTCGTCGAACTGAAGTGACAAATGCCAAAGTACGAATCAAAGCTTTTCCTCCTTCAATAGATGAGAGATATGCCAATCAGTTATGGGATCAGATTAAAAGTGCGATAATCGAGATTCAAAAGAAAAATAACAGTTGTTTGAGCTTTGAAGAACTCTACCGCAATGCGTACACTTTGATATTACAAAAACACGGCGAGCGTCTATATGCGGGAACAGAGGCTGTTGTACGTGAACATATGATCAAGATCCGCGATAGTATTGTTGAAAATTTAAATAATAAGTTTTTAACTTATCTTAACTCATGTTGGAAAGATCACCAAACTGCTATGGGAATGATCCGTGATATTCTTATGTACATGGATCGTGTCTACGTCGGTCCACATAACCTGGATGGAGTTTATAAAATGGGAATGACTGTTTTCTGCGATCTTGTCGTACGTTATCCAATTATTAGAGAGCACTTGCAGAAAACTCTGTTGGATATGGTGCGCAGGGAACGTCGGGGTGAAGTAATATCGCGTTCTCAGATTCGCGATGCCTGTCAGATGTTTGTGCAGTTAGGGGCAGGATCATTACGCGTTTATCTCGAAGATTTTGAACAGCCATTTTTGGAGCAGTCAAGAGAATTTTACCGCACAGAAAGTGAAAATTTTCTTGCTGAGAATACTTCTGCTTCCTTGTATATTAAAAAAGTCGAGCAAAGAATTGAGGAGGAAGTTCGAAGAGCACATCATCATCTCGATCCATCCACGGAACCCAAAATTGTTGTCGTATTGGAAGAGGAGCTTATAAGTCGACATATGGAAACTATTGTCGGTATGGAGGATTCAGGATTAACTTACATGTTAACTCATGATCACTTCAGTGATATCGCTGCTATGTATGGCGTTTTAA]

[-] EMBL CD183689             [CGCGGCCTATGATCTGAGACGTTGGTGTGTTACTAATTCAACGCTCAGTAATACTAATATTTGCTTGGCGTATTGGCTGTTCTTAAATATCGGTAATATTCACTGAACGAAATTTCAACTCTCACCGCTTACGCTGTTATCGATTGTACATTGAAACCTGATATGTCTACAGGCAGCAGTGCTCGTCGAACTGAAGTGACAAATGCCAAAGTACGAATCAAAGCTTTTCCTCCTTCAATAGATGAGAGATATGCCAATCAGTTATGGGATCAGATTAAAAGTGCGATAATCGAGATTCAAAAGAAAAATAACAGTTGTTTGAGCTTTGAAGAACTCTACCGCAATGCGTACACTTTGATATTACAAAAACACGGCGAGCGTCTATATGCGGGAACAGAGGCTGTTGTACGTGAACATATGATCAAGATCCGCGATAGTATTGTTGAAAATTTAAATAATAAGTTTTTAACTTATCTTAACTCATGTTGGAAAGATCACCAAACTGCTATGGGAATGATCCGTGATATTCTTATGTACATGGATCGTGTCTACGTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD123581             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAAAGAAAAATAACAGTTGTTTGAGCTTTGAAGAACTCTACCGCAATGCGTACACTTTGATATTACAAAAACACGGCGAGCGTCTATATGCGGGAACAGAGGCTGTTGTACGTGAACATATGATCAAGATCCGCGATAGTATTGTTGAAAATTTAAATAATAAGTTTTTAACTTATCTTAACTCATGTTGGAAAGGTCACCAAACTGCTATGGGAATGATCCGTGATATTCTTATGTACATGGATCGTGTCTACGTCGGTCCACATAACCTGGATGGAGTTTATAAAATGGGAATGACTGTTTTCTGCGATCTTGTCGTACGTTATCCAATTATTAGAGAGCACTTGCAGAAAACTCTGTTGGATATGGTGCGCAGGGAACGTCGGGGTGAAGTAATATCGCGTTCTCAGATTCGCGATGCCTGTCAGATGTTTGTGCAGTTAGGGGCAGGATCATTACGCGTTTATCTCGAAGATTTTGAACAGCCATTTTTGGAGCAGTCGAGAGAATTTTACCGCACAGAAAGTGAAAATTTTCTTGCTGAGAATACTTCTGCTTCCTTGTATATTA                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD123583             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAAAGAAAAATAACAGTTGTTTGAGCTTTGAAGAACTCTACCGCAATGCGTACACTTTGATATTACAAAAACACGGCGAGCGTCTATATGCGGGAACAGAGGCTGTTGTACGTGAACATATGATCAAGATCCGCGATAGTATTGTTGAAAATTTAAATAATAAGTTTTTAACTTATCTTAACTCATGTTGGAAAGATCACCAAACTGCTATGGGAATGATCCGTGATATTCTTATGTACATGGATCGTGTCTACGTCGGTCCACATAACCTGGATGGAGTTTATAAAATGGGAATGACTGTTTTCTGCGATCTTGTCGTACGTTATCCAATTATTAGAGAGCACTTGCAGAAAACTCTGTTGGATATGGTGCGCAGGGAACGTCGGGGTGAAGTAATATCGCGTTCTCAGATTCGCGATGCCTGTCAGATGTTTGTGCAGTTAGGGGCAGGATCATTACGCGTTTATCTCGAAGATTNTGAACAGCCATTTTTGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD137485             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GAGTTTATAAAATGGGGATGACTGTTTTCTGCGATCTTGTCGCACGTTATCCAATTATTAGAGAGCACTTGCAGAAAACTCTGTTGGATATGGTGCGCAGGGAACGTCGGGGTGAAGTTATATCGCGTTCTCAGATTCGAGATGCTTGTCAGATGTTTGTGCAGTTAGGGGCCGGTTCATTACGTGTTTACCTGGAAGATTTTGAACAACCATTTTTGGAGCAGTCAAGAGAATTTTACCGCTCAGAAAGTGAAAATTTCCTTGCTGAGAATACTTCTGCTTCCTTGTATATTAAAAAAGTCAAACAAAGAATTGAGGAGGAAGTTCGAAGGGCACATCATCATCTTGATCCGTCCACGGAAC                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD120460             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTTATAAAATGGGGATGACTGTTTTCTGCGATCTTGTCGTGCGTTATCCAATTATTAGAGAGCACTTGCAGAAAACTCTGTTGGATATGGTGCGCAGGGAACGTCGGGGTGAAGTTATATCGCGTTCTCAGATTCGAGATG CTGTCAGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD165406             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGTGCAGTTAGGGGCAGGATCATTACGCGTTTATCTCGAAGATTTTGAACAGCCATTTTTGGAGCAGTCAAGAGAATTTTACCGCACAGAAAGTGAAAATTTTCTTGCTGAGAATACTTCTGCTTCCTTGTATATTAAAAAAGTCGAGCAAAGAATTGAGGAGGAAGTTCGAAGAGCATATCATCATCTCGATCCATCCACGGAACCCAAAATTGTTGTCGTAGTGGAAGAGGAGCTTATAAGTCGACATATGGAAACTATTGTCGGTATGGAGGATTCAGGATTAACTTACATGTTAACTCATGATCACTTCAGTGATATCGCTGCTA               ]
[-] EMBL CD165402             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTGCAGTTAGGGGCAGGATCATTACGCGTTTATCTCGAAGATTTTGAACAGCCATTTTTGGAGCAGTCAAGAGAATTTTACCGCACAGAAAGTGAAAATTTTCTTGCTGAGAATACTTCTGCTTCCTTGTATATTAAAAAAGTCGAGCAAAGAATTGAGGAGGAAGTTCGAAGAGCACATCATCATCTCGATCCATCCACGGAACCCAAAATTGTTGTCGTATTGGAAGAGGAGCTTATAAGTCGACATATGGAAACTATTGTCGGTATGGAGGATTCAGGATTAACTTACATGTTAACTCATGATCACTTCAGTGATATCGCTGCTATGTATGGCGTTTTAA]
[-] EMBL CD165511             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTGCAGTTAGGGGCAGGATCATTACGCGTTTATCTCGAAGATTTTGAACAGCCATTTTTGGAGCAGTCAAGAGAATTTTACCGCACAGAAAGTGAAAATTTTCTTGCTGAGAATACTTCTGCTTCCTTGTATATTAAAAAAGTCGAGCAAAGAATTGAGGAGGAAGTTCGAAGAGCACATCATCATCTCGATCCATCCACGGAACCCAAAATTGTTGTCGTATTGGAAGAGGAGCTTATAAGTCGACATATGGAAACTATTGTCGGTATGGAGGATTCAGGATTAACTTACATGTTAACTCATGATCACTTCAGTGATATCGCTGCTATGTATGGCGTTTTAA]




>consensus_9153#0
CGCGGCCTATGATCTGAGACGTTGGTGTGTTACTAATTCAACGCTCAGTAATACTAATAT
TTGCTTGGCGTATTGGCTGTTCTTAAATATCGGTAATATTCACTGAACGAAATTTCAACT
CTCACCGCTTACGCTGTTATCGATTGTACATTGAAACCTGATATGTCTACAGGCAGCAGT
GCTCGTCGAACTGAAGTGACAAATGCCAAAGTACGAATCAAAGCTTTTCCTCCTTCAATA
GATGAGAGATATGCCAATCAGTTATGGGATCAGATTAAAAGTGCGATAATCGAGATTCAA
AAGAAAAATAACAGTTGTTTGAGCTTTGAAGAACTCTACCGCAATGCGTACACTTTGATA
TTACAAAAACACGGCGAGCGTCTATATGCGGGAACAGAGGCTGTTGTACGTGAACATATG
ATCAAGATCCGCGATAGTATTGTTGAAAATTTAAATAATAAGTTTTTAACTTATCTTAAC
TCATGTTGGAAAGATCACCAAACTGCTATGGGAATGATCCGTGATATTCTTATGTACATG
GATCGTGTCTACGTCGGTCCACATAACCTGGATGGAGTTTATAAAATGGGAATGACTGTT
TTCTGCGATCTTGTCGTACGTTATCCAATTATTAGAGAGCACTTGCAGAAAACTCTGTTG
GATATGGTGCGCAGGGAACGTCGGGGTGAAGTAATATCGCGTTCTCAGATTCGCGATGCC
TGTCAGATGTTTGTGCAGTTAGGGGCAGGATCATTACGCGTTTATCTCGAAGATTTTGAA
CAGCCATTTTTGGAGCAGTCAAGAGAATTTTACCGCACAGAAAGTGAAAATTTTCTTGCT
GAGAATACTTCTGCTTCCTTGTATATTAAAAAAGTCGAGCAAAGAATTGAGGAGGAAGTT
CGAAGAGCACATCATCATCTCGATCCATCCACGGAACCCAAAATTGTTGTCGTATTGGAA
GAGGAGCTTATAAGTCGACATATGGAAACTATTGTCGGTATGGAGGATTCAGGATTAACT
TACATGTTAACTCATGATCACTTCAGTGATATCGCTGCTATGTATGGCGTTTTAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case