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Schistosoma mansoni
cluster # 9155 cluster # 9155       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9155#0 length = 1302 sequences # 8  

consensusID : consensus_9155#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1302
fasta sequence
                              [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGCTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGNNCCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTGAATGGAAGCGCCAGAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATTCGCAGTTAATATTGATCTTATTCTTCAACACAAGAATGCTGGATTTGACTACAAACGTTTACGTGGAATGCAGGAATCACAATTTTTGTTAGGTCTTGGTTTAAAAAACTGGAGAGAATTGGAACCACTAGCAGATGGTTGTCGGAAGATCCTAGTGTGGCATACACGTACAGCAGAACCACTTTTAACACTATGGCATGAG-CTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATAT-AGTTCGTATCATACTACTAATTATTTATAGAAATAAAATAGTCTTGAATCTCTGTCATTTTTGTATATATTCTGGCTTGCTCGTCTCACTTGTTTATTTGTAATTTTGAGTTGTGGTTGTTTTAATTCATCTTGATAAATAGTTATNGTATAC]

[+] EMBL SM30260              [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGCTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGNNCCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTGAATGGAAGCGCCAGAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGNCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATTCGCAGTTAATATTGATCTTATTCTTCAACACAAGAATGCTGGATTTGACTACAAACGTTTACGTGGAATGCAGGAATCACAATTTTTGTTAGGTCTTGGTTTAAAAAACTGGAGAGAATTGGAACCACTAGCAGATGGTTGTCGGAAGATCCTAGTGTGGCATACACGTACAGCAGAACCACTTTTAACACTATGGCATGAG CTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATAT AGTTCGTATCATACTACTAATTATTTATAGAAATAAAATAGTCTTGAATCTCTGTCATTTTTGTATATATTCTGGCTTGCTCGTCTCACTTGTTTATTTGTAATTTTGAGTTGTGGTTGTTTTAATTCATCTTGATAAATAGTTATNGTATAC]
[+] EMBL CD140193             [                        ATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGTTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGAACCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTCAATGGTTGCGCCAGAATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD119698             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGCGCAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGAagct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD146280             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD119640             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAATTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCAAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD119710             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGTAATGCGTGGTACAAACAGAGTTTCTACACGGCCGGTTGGATGTGCAGGTGAATTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGAagct                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD146331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAAACAAAGTTTCAACATTGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD077627             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CATGAGCCTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATATNAG TCGTATCATACTACTAATTA TTATA                                                                                                                            ]


>consensus_9155#0 GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACC TTGCTCAAGTGGGCTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCG CTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTG AACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAA CTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAA GATAGCACAGNNCCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTT GTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGG TTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTGAATGGAAGCGCCAGAATCTT ATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTA CGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCA GGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATG TGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATTCGCAGTTAAT ATTGATCTTATTCTTCAACACAAGAATGCTGGATTTGACTACAAACGTTTACGTGGAATG CAGGAATCACAATTTTTGTTAGGTCTTGGTTTAAAAAACTGGAGAGAATTGGAACCACTA GCAGATGGTTGTCGGAAGATCCTAGTGTGGCATACACGTACAGCAGAACCACTTTTAACA CTATGGCATGAGCTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAA AATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTT AGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAAC GTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAA ATAATATATAGTTCGTATCATACTACTAATTATTTATAGAAATAAAATAGTCTTGAATCT CTGTCATTTTTGTATATATTCTGGCTTGCTCGTCTCACTTGTTTATTTGTAATTTTGAGT TGTGGTTGTTTTAATTCATCTTGATAAATAGTTATNGTATAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)