These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9155#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1302 fasta sequence [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGCTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGNNCCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTGAATGGAAGCGCCAGAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATTCGCAGTTAATATTGATCTTATTCTTCAACACAAGAATGCTGGATTTGACTACAAACGTTTACGTGGAATGCAGGAATCACAATTTTTGTTAGGTCTTGGTTTAAAAAACTGGAGAGAATTGGAACCACTAGCAGATGGTTGTCGGAAGATCCTAGTGTGGCATACACGTACAGCAGAACCACTTTTAACACTATGGCATGAG-CTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATAT-AGTTCGTATCATACTACTAATTATTTATAGAAATAAAATAGTCTTGAATCTCTGTCATTTTTGTATATATTCTGGCTTGCTCGTCTCACTTGTTTATTTGTAATTTTGAGTTGTGGTTGTTTTAATTCATCTTGATAAATAGTTATNGTATAC] [+] EMBL SM30260 [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGCTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGNNCCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTGAATGGAAGCGCCAGAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGNCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATTCGCAGTTAATATTGATCTTATTCTTCAACACAAGAATGCTGGATTTGACTACAAACGTTTACGTGGAATGCAGGAATCACAATTTTTGTTAGGTCTTGGTTTAAAAAACTGGAGAGAATTGGAACCACTAGCAGATGGTTGTCGGAAGATCCTAGTGTGGCATACACGTACAGCAGAACCACTTTTAACACTATGGCATGAG CTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATAT AGTTCGTATCATACTACTAATTATTTATAGAAATAAAATAGTCTTGAATCTCTGTCATTTTTGTATATATTCTGGCTTGCTCGTCTCACTTGTTTATTTGTAATTTTGAGTTGTGGTTGTTTTAATTCATCTTGATAAATAGTTATNGTATAC] [+] EMBL CD140193 [ ATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGTTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGAACCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTCAATGGTTGCGCCAGAATCT ] [-] EMBL CD119698 [ GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGCGCAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGAagct ] [-] EMBL CD146280 [ GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGT ] [-] EMBL CD119640 [ GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAATTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCAAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGT ] [-] EMBL CD119710 [ ATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGTAATGCGTGGTACAAACAGAGTTTCTACACGGCCGGTTGGATGTGCAGGTGAATTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGAagct ] [+] EMBL CD146331 [ ACAAACAAAGTTTCAACATTGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATT ] [+] EMBL CD077627 [ CATGAGCCTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATATNAG TCGTATCATACTACTAATTA TTATA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||