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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9155#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1302 fasta sequence
[GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGCTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGNNCCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTGAATGGAAGCGCCAGAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATTCGCAGTTAATATTGATCTTATTCTTCAACACAAGAATGCTGGATTTGACTACAAACGTTTACGTGGAATGCAGGAATCACAATTTTTGTTAGGTCTTGGTTTAAAAAACTGGAGAGAATTGGAACCACTAGCAGATGGTTGTCGGAAGATCCTAGTGTGGCATACACGTACAGCAGAACCACTTTTAACACTATGGCATGAG-CTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATAT-AGTTCGTATCATACTACTAATTATTTATAGAAATAAAATAGTCTTGAATCTCTGTCATTTTTGTATATATTCTGGCTTGCTCGTCTCACTTGTTTATTTGTAATTTTGAGTTGTGGTTGTTTTAATTCATCTTGATAAATAGTTATNGTATAC]
[+] EMBL SM30260 [GGTTTTACTCTTGTGATTTGTTGCATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGCTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGNNCCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTGAATGGAAGCGCCAGAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGNCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATTCGCAGTTAATATTGATCTTATTCTTCAACACAAGAATGCTGGATTTGACTACAAACGTTTACGTGGAATGCAGGAATCACAATTTTTGTTAGGTCTTGGTTTAAAAAACTGGAGAGAATTGGAACCACTAGCAGATGGTTGTCGGAAGATCCTAGTGTGGCATACACGTACAGCAGAACCACTTTTAACACTATGGCATGAG CTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATAT AGTTCGTATCATACTACTAATTATTTATAGAAATAAAATAGTCTTGAATCTCTGTCATTTTTGTATATATTCTGGCTTGCTCGTCTCACTTGTTTATTTGTAATTTTGAGTTGTGGTTGTTTTAATTCATCTTGATAAATAGTTATNGTATAC]
[+] EMBL CD140193 [ ATGACTGTATGGAGGTTGTCTTGTATAATTCGGACCTTGCTCAAGTGGGTTTGTGCTACTCGATGTAGGCTTGCTGTTTTTCTCTGTATTTTTCCGCTGACAGTTTTCTTGTATACCATCGGGAAACAGTATCAAAAAAGTTACGGTAGTCATGTGAACAAACCCATTTTGTACATAATTACTGCTACATACCAAAGAAACGTCCAGCGTGCAGAACTTACAAGAATGTGTAATACCTTACGTAATTTGAAGGATATTTTATGGATTCTTGTAGAAGATAGCACAGAACCTTCATGGGTTGTATCAAATATTTTAAATGATTGTGGTGTACCTTTTGTACATTTAAACATCCCAACACCACAGTCAGAAAAACCTAAAGCGAGGGAACCCTTCTGGTTTCGTCCTAAGGGCATACTTCAACGTAATCTTGGGCTTCAATGGTTGCGCCAGAATCT ]
[-] EMBL CD119698 [ GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGCGCAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGAagct ]
[-] EMBL CD146280 [ GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGT ]
[-] EMBL CD119640 [ GAATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGAAATGCGTGGTACAAACAAAGTTTCAACATGGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAATTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCAAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGT ]
[-] EMBL CD119710 [ ATCTTATTTTAGGTAGAAACAAAGGTGTCTTATACATCGCTGACGATGACAACTCCTATAATTTACGTATTTTTGAGGTAATGCGTGGTACAAACAGAGTTTCTACACGGCCGGTTGGATGTGCAGGTGAATTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGAagct ]
[+] EMBL CD146331 [ ACAAACAAAGTTTCAACATTGCCGGTTGGATTTGCAGGTGAACTCCCATGGGAGGGTTGTGTGACATCTAAAAATCGAACACAGATTGTACGTATGTGGTCAGTGTACAAACCCGAGCGTCCTTTTCCAATTGATATGGCAGGATT ]
[+] EMBL CD077627 [ CATGAGCCTGGAATCGCAAGGAGTCATATCTCCACCTATAGATGATTGGCCCTAAAATATGTAGTATGATTCTAAAAGAAAACAATTATAATCTCTGTCAGAATACTTTTTATTTAGGCAGTATTCACTTAATAAATCAACTATATTTAAAACAAACCAAAAGTTGCATCTAAACGTCATGTATAATCAGTTATTCAAATTGTTTGTAATACAATGCATGCATTTTCTTATATAAATAATATATNAG TCGTATCATACTACTAATTA TTATA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||