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Schistosoma mansoni
cluster # 9160 cluster # 9160       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9160#0 length = 1126 sequences # 8  

consensusID : consensus_9160#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1126
fasta sequence
                              [CCCAGGTACGCTCATCGATTGGGATACAGGAGTGTCACAGAACTTTTCGTCATCGCTATCATGGACACCATCGACCTGTGTTTGTTTAAACTGCCCAAGATCTGAAGCCATGGAATTGTTGGTTGCCACACTTGGATTACCTATGTACTGAGGAACAGCCAGATGAACACCAGGTTGACGGACTGCTGTTAACGGCTGAGGGACGAGATAAGTCTGTTGGCCGATTTGTACAAGATGTCCTGTAAGACCTGAAGGCAGTGTGGCCAGCTGGGGTGTTGTGACCTGTTGAACGTTTGTAGTTGCGGTAGGTCTTGTTTGAGCTCCACTTGGATTGGAAGTAAGCATAGAGGGAAGAACCTTTGAATTCAGAGGATGATGCGAGTGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATGTTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATGAATGGCGTTTTCATCTGAAGGACGGGATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAGCCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG-TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT--AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTGACACCAGTATTCCTCACTAGCTATTCGATCCTAATTATGGTTTAAAAGTTCCTACCTTTATTCTTTCTCCACTCATCCTATCTGTTCACGTTTCATACTATAGAAAAACTTATAGTTATTGGGCATATATTATTCATTACTTTATTACATCCAGTTTTATTGGGATTATCTTTTGTTTGNGTATTTTTTAAAGAANAGAAATTTTATTACTGTC]

[-] EMBL CD112551             [CCCAGGTACGCTCATCGATTGGGATACAGGAGTGTCACAGAACTTTTCGTCATCGCTATCATGGACACCATCGACCTGTGTTTGTTTAAACTGCCCAAGATCTGAAGCCATGGAATTGTTGGTTGCCACACTTGGATTACCTATGTACTGAGGAACAGCCAGATGAACACCAGGTTGACGGACTGCTGTTAACGGCTGAGGGACGAGATAAGTCTGTTGGCCGATTTGTACAAGATGTCCTGTAAGACCTGAAGGCAGTGTGGCCAGCTGGGGTGTTGTGACCTGTTGAACGTTTGTAGTTGCGGTAGGTCTTGTTTGAGCTCCACTTGGATTGGAAGTAAGCATAGAGGGAAGAACCTTTGAATTCAGAGGATGATGCGAGTGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATGTTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATAAATGGCGTTTTCATCTGAAGGACGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD088540             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATGTTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATGAATGGCGTTTTCATCTGAAGGACGGGATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAGCCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT  AAAAAAATGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTG                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD088553             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATGTTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATGAATGGCGTTTTCATCTGAAGGACGGGATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAGCCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT  AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACANAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTG                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD152233             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAGTCGAATGGTAG TTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTTTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT  AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTGA                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD078523             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGAAGCCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAGATTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGGTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT  AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTGACACCAGTATTCCTCACTAGCTATTCGATCCTAATTATGGTTTAAAAGTTCCTACCTTTATTCTTTCTCCACTCATCCTATCTGTTCACGTTTCATACTATAGAAAAACTTATAGTTATTGGGCATATATTATTCATTACTTTATTACATCCAGTTTTATTGGGATTATCTTTTGTTTGNGTATTTTTTAAAGAANAGAAATTTTATTACTGT ]
[-] EMBL CD097667             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTCGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGTAAAAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAA                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD097680             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAATGGAATGTATTTGATTACTAG TTTCTTCACATCAAACGATATTGTCGAAAGACGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGTA AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAA                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD072991             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCCATGCCATTATGTTTAGTCATTTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATGCCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTCCTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGT  AAAAAAAAGAATAAATTGAAAACATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAATTGTATGACTTGACACCAGTATTCCTCACTAGCTATTCGATCCTAATTATGGTTTAAAAGTTCCTACCTTTATTCTTTCTCCACTCATCCTATCTGTTCACGTTTCATACTATAGAAAAACTTATAGTTATTGTGCATATATTATTCATTACTTTATTACATCCAGTTTTATTGTGATTATCTTTTGTTTGTGTATTTTTTAAAGAAAAGAAATTTTATTACTGTC]


>consensus_9160#0 CCCAGGTACGCTCATCGATTGGGATACAGGAGTGTCACAGAACTTTTCGTCATCGCTATC ATGGACACCATCGACCTGTGTTTGTTTAAACTGCCCAAGATCTGAAGCCATGGAATTGTT GGTTGCCACACTTGGATTACCTATGTACTGAGGAACAGCCAGATGAACACCAGGTTGACG GACTGCTGTTAACGGCTGAGGGACGAGATAAGTCTGTTGGCCGATTTGTACAAGATGTCC TGTAAGACCTGAAGGCAGTGTGGCCAGCTGGGGTGTTGTGACCTGTTGAACGTTTGTAGT TGCGGTAGGTCTTGTTTGAGCTCCACTTGGATTGGAAGTAAGCATAGAGGGAAGAACCTT TGAATTCAGAGGATGATGCGAGTGATGAAGAACCTGAAGTGCTATTCGAATCGGATAATG TTGTTGTTTGTCAGTATGATAAGATTCATCGAGCTCGAAATGAATGGCGTTTTCATCTGA AGGACGGGATAATGTCCATAAATGGTCGAGATCATATTTTCCAAAAGGCTGTCGGTGAAG CCGAATGGTAGTTTGAATGGAATGTATTTGATTACTAGTTTCTTCACATCAAACGATATT GTCGAAAGATGAATTTGGCTACTGTTTCCTCTGTTTCCCGATGCCATTATGTTTAGTCAT TTATATTAATTAATGCGAATGTAAACCTTTTTGAGTGACTATAGTTGCACTTGTTGTATG CCTCTTTTAACCAACTTTGCGTTGTGTAAAGAAAAAGATAACTATAACCCATTTCATTTC CTTACAGTTATAGTAAGGTACTTTTATAGTCATTTGTAAAAAAAAGAATAAATTGAAAAC ATTAAAAAAAACCGAACTAAATCACCACACAAAATTGACGGGTTGCACGACAAAGATGAA TTGTATGACTTGACACCAGTATTCCTCACTAGCTATTCGATCCTAATTATGGTTTAAAAG TTCCTACCTTTATTCTTTCTCCACTCATCCTATCTGTTCACGTTTCATACTATAGAAAAA CTTATAGTTATTGGGCATATATTATTCATTACTTTATTACATCCAGTTTTATTGGGATTA TCTTTTGTTTGNGTATTTTTTAAAGAANAGAAATTTTATTACTGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)