cluster # 9169

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Schistosoma mansoni
cluster # 9169 cluster # 9169 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_9169#0 length = 859 sequences # 6

consensus_9169#1 length = 625 sequences # 2

consensusID : consensus_9169#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 859
fasta sequence

                              [AGATTTGGC-CGAGGCCATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAATCATGTTATTATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATCATTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACAATTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTTATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAAAATTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATATAGAGGACCAAACAATTGGTCAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGATTTTGTGTAGGTCAAGT-GGTTCGATGTTCC-AATGATTTCCTTACATCATA-T-CC-TTTTCACAAATATAG-AAT-ACTTCATCCATGTATTGG-GTTTGATTTCAGTTGATTCTTGGATCTCTTTTCGCTTTTGGATTTTCAGC-TATTTTGTAAATAGAAATGT]

[+] EMBL CD083126             [ GATTTGGC CGAGGCCATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAATCATGTTATTATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATCATTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACAATTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTTATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAAAATTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATATAGAGGACCNAAC ATTGGTCAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGATTNTGTGTAGGTCAAGT GGTTCGATGTTCC AATGATTNCCTTACATCATA T CC TTTTCAC AATATAG AAT ACTTCATCCATGTATTGG GTTTGATTNCAGTTGATNCTTGGATCTCTTTTCGC TTTGGATTTTCAGC TATTTTGTAAATAGAAATG ]
[+] EMBL CD081107             [anaaTTGGCACGAGG    TGCAGCTTATTATTCTGTTAAATCATGTTATANTCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGAT  ATAATGGTAAACCAAATGAATCATTCTATAATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACAATTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTTATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAAAATTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATATAGAGGACC AACAATTGGTCAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGATTNTGTGTAGGTCAAGT GGTTCGATGTTCCAAATGA TTCCTTACATCATA T CCNTTNTCACAAATATAGAAAT ACTTCATCCATGTATTGGNNGTTGA TTCAGNTGATTCTTGGATCTCTTTTCGCTTTTGGATTTTCAGC TATTTTG AAATA AAATG ]
[+] EMBL CD080025             [               caATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAATCATGTTA TATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATCATTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACAATTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTTATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAAAATTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATATAGAGGACC AACAATTGGTCAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGATTTTGTGTAGGTC AGTGGGTTCGATGTTCC AATGATTTCCTTACATCATATT TC TTTTCAC AATATAG AAT AACTNATCCATGTATTGG GTTNGATTTCAGNTGATTCTT GATCT TTTTCGCTTT  GAATTTCAGC TA TTTG AAATAAAA    ]
[-] EMBL CD074930             [                                                                                                                                                                                                     AATTTTACCATCTAATAAGAACTTATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAAAATTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATATAGAGGA CAAACAATTGGTCAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGATTTTGTGTAGGTCAAGT GGTTCGATGTTCC AATGATTTCCTTACATCATA TCCC TTTTCACAAATATAG AATAACTTCATCCATGTATTGT GTTTGATTTCAGTTGATTCTTGTATCTCTTTTCGCTTTTGTATTTTCAGC TATTTTGTAAATAGAAATGT]
[-] EMBL CD076700             [                                                                                                                                                                                                                                    ATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAAAATTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATATAGAGGA CAAACAATTGGTCAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGATTTTGTGTAGGTCAAGT GGTTCGATGTTCC AATGATTTCCTTACATCATATT CC TTTTCACAAATATAG AATAACTTCATCCATGTATTGT GTTTGATTTCAGTTGATTCTTGTATCTCTTTTCGCTTTTGTATTTTCAGCNTATTTTGTAAATAGAAATGT]
[-] EMBL CD072993             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAAAATTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATATAGAGGA CAAACAATTGGTCAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGATTTTGTGTAGGTCAAGT GGTTCGATGTTCC AATGATTTCCTTACATCATATT CC TTTTCACAAATATAG AATAACTTCATCCATGTATTGT GTTTGATTTCAGTTGATTCTTGTATCTCTTTTCGCTTTTGTATTTTCAGC TATTTTGTAAATAGAAATGT]




>consensus_9169#0
AGATTTGGCCGAGGCCATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAATCATGTTATTATCGCTCCAA
AAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATCATTCTATCATCCACAAAACT
TATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACAATTATATACTACTCATTATT
GTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTTATTCCAAATCATCAGACCGA
AATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAA
GTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTA
AACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTG
TGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATA
TTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAA
CTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAAAA
TTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATATAGAGGACCAAACAATTGGT
CAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGATTTTGTGTAGGTCAAGTGGT
TCGATGTTCCAATGATTTCCTTACATCATATCCTTTTCACAAATATAGAATACTTCATCC
ATGTATTGGGTTTGATTTCAGTTGATTCTTGGATCTCTTTTCGCTTTTGGATTTTCAGCT
ATTTTGTAAATAGAAATGT

consensusID : consensus_9169#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 625
fasta sequence

                              [TGGAGTTTATCTACATTGAATACTAGTTATCTACCAATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAATCATGTTATATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATCATTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACAATTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTTATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACANATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAANATTAGCC]

[+] EMBL CD078524             [TGGAGTTTATCTACATTGAATACTAGTTATCTACCAATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAATCATGTTATATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATCATTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACAATTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTTATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGATTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATAGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTAACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTATAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACANATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCTAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCACCATCAATAGTTCAGAANATTAGCC]
[+] EMBL SMAA69222            [                  AATACTAGTTATCTACCAATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAATCATGTTATATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATCATTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATA  CCATCAAAACAATTATATACTACTCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]




>consensus_9169#1
TGGAGTTTATCTACATTGAATACTAGTTATCTACCAATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAA
TCATGTTATATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATCA
TTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACAA
TTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTTA
TTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGAT
TTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTATA
GTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGTA
ACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTAT
AATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACANATGAGATTCTGCAAGGTGAATTCT
AAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTCA
CCATCAATAGTTCAGAANATTAGCC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9169#0      -------------------AGATTTGGCCGAGGCCA-TTGAAGCTTATTATTCTGTTAAA 40
consensus_9169#1      TGGAGTTTATCTACATTGAATACTAGTTATCTACCAATTGAAGCTTATTATTCTGTTAAA 60
                                         * * * *       *** ***********************

consensus_9169#0      TCATGTTATTATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATC 100
consensus_9169#1      TCATGTTAT-ATCGCTCCAAAAGCTTCCATATTGATAGATAATGGTAAACCAAATGAATC 119
                      ********* **************************************************

consensus_9169#0      ATTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACA 160
consensus_9169#1      ATTCTATCATCCACAAAACTTATTGCTCTATCCAGTAGAATTATATAACCCATCAAAACA 179
                      ************************************************************

consensus_9169#0      ATTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTT 220
consensus_9169#1      ATTATATACTACTCATTATTGTCATTCATCCATTTCAATTTTACCATCTAATAAGAACTT 239
                      ************************************************************

consensus_9169#0      ATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGA 280
consensus_9169#1      ATTCCAAATCATCAGACCGAAATTATTATTACAGTCTATTAATGACTTTATACAACTTGA 299
                      ************************************************************

consensus_9169#0      TTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTAT 340
consensus_9169#1      TTTGTATATAACTTTTAAAAGTCATAAATTCAATTTCATATGCATCATTATACTACTTAT 359
                      ************************************************************

consensus_9169#0      AGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGT 400
consensus_9169#1      AGTAGTGTGCTATTTTTGTAAACGTGGTATCATGTTTTGCGGTGACAGTGTATTATATGT 419
                      ************************************************************

consensus_9169#0      AACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTA 460
consensus_9169#1      AACAGGATGGATTTTCTGTGTGATTCGATATGTGCTGGTGCGTATTTTATTTCGTTTGTA 479
                      ************************************************************

consensus_9169#0      TAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACAAATGAGATTCTGCAAGGTGAATTC 520
consensus_9169#1      TAATTTATGGCGTACTTATATTAGTGATTGTTCACANATGAGATTCTGCAAGGTGAATTC 539
                      ************************************ ***********************

consensus_9169#0      TAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTC 580
consensus_9169#1      TAAAAATACTTCTACTACAACTAGTAACAGTAATACTACTGTTGAAATATCACGATTGTC 599
                      ************************************************************

consensus_9169#0      ACCATCAATAGTTCAGAAAATTAGCCAACAGAACAGATCTAATATACATATATGAGTATA 640
consensus_9169#1      ACCATCAATAGTTCAGAANATTAGCC---------------------------------- 625
                      ****************** *******                                  

consensus_9169#0      TAGAGGACCAAACAATTGGTCAGCTTGTGAATTGCATATTCCTGTATTGATCGATTACGA 700
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      TTTTGTGTAGGTCAAGTGGTTCGATGTTCCAATGATTTCCTTACATCATATCCTTTTCAC 760
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      AAATATAGAATACTTCATCCATGTATTGGGTTTGATTTCAGTTGATTCTTGGATCTCTTT 820
consensus_9169#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9169#0      TCGCTTTTGGATTTTCAGCTATTTTGTAAATAGAAATGT 859
consensus_9169#1      ---------------------------------------