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Schistosoma mansoni
cluster # 9172 cluster # 9172       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9172#0 length = 778 sequences # 8  
consensusID : consensus_9172#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 778
fasta sequence 
                              [ACAACTGATTATCTCCATAGGATACAATGAAATGAATGATTTATTTGGTAATAAATCATTCGATGTTCTAGAAAACATATCGGAATACGATGACCCGCCAATGATATTCTTTGGACTATTTGTGTATAATCGATTTGTA-TTATAATTCACACTTGATGTTCCACTATAAGTAAGCGATGGAAGTAGACGAATCGAACGACTGCCGCGTAGTTTTTCTTCATATTCTAATAATTGTCGCCAAAATCCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTTATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGCAAGACTCATATTTGTGTGACGCATTAAATAAGCTAATATGAGTGTA-CTGGAGCGTGAAACACCCGCCATACAATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAGCTATTCGATCGGATACTCTGTCAAAGTGAGCACGTAAATTTGCACTCTCTATATCTTCAACGGGGACATGAACAGTATTCATCACAGCATTACGAATATGGACCGGTGGTGAATCAATCATTGCAGACACTAACAATGTAATGCCATGTTGACGTAATCTGTCCGGTGTGATGGCATTTAAACTACTCAGAAACAGATGATTATTGATGCGTGCAATCTGACTAAACATTTGCATAAAATCTATTTGATAAACAGTATTGTACGGTATGAGTGGAGTGACAGTATTATTTCGATTCCCAATAGCAGAATTATTACTTCCTGATTTCGTAATTGTACCACAGTTTTTCTGTGATTTATCTGACAAATTA]

[+] EMBL CD110956             [ACAACTGATTATCTCCATAGGATACAATGAAATGAATGATTTATTTGGTAATAAATCATTCGGTGTTCTAGAAAACATATCGGAATACGATGACCCGCCAATGATATTCTTTGGACTATTTGTGTATAATCGATTTGTA TTATAATTCACACTTGATGTTCCACTATAAGTAAGCGATGGAAGTAGACGAATCGAACGACTGCCGCGTAGTTTTTCTTCATATTCTAATAATTGTCGCCAAAATCCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTTATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGCAAGACTCATATTTGTGTGACGCATTAAATAAGCTAATATGAGTGTA CTGGAGCGTGAAACACCCGCCATACAATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAGCTATTCGATCGGATACTCTGTCAAAGTGAGCACGTAAATTTGCACTCTCTATATCTTCAACGGGGACATGAACAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD111516             [ACAACTGATTATCTCCATAGGATACAATGAAATGAATGATTTATTTGGTCATAAATCATTCGATGTTCTAGAAAACATATCGGAATACGATGACCCGCCAATGATATTCTTTGGACTATTTGTGTATAATCGATTTGTA TTATAATTCACACTTGATGTTCCACTATAAGTAAGCGATGGAAGTAGACGAATCGAACGACTGCCGCGTAGTTTTTCTTCATATTCTAATAATTGTCGCCAAAATCCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTTATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGCAAGACTCATATTTGTGTGACGCATTAAATAAGCTAATATGAGTGTA CTGGAGCGTGAAACACCCGCCATACAATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAGCTATTCGATCGGATACTCTGTCAAAGTGAGCACGTATATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD120098             [                             AAATGAATGATTTATTTGGTAATAAATCATTCGATGTTCTAGAAAACATATCGGAATACGATGACCCACCAATGATATTCTTTGGACTATTTGTGTATAATCGATTTGTA TTATAATTCACACTTGATGTTCCACTATAAGTAAGCGATGGAAGTAGACGAATCGAACGACTGCCGCGTAGTTTTTCTTCATATTCTAATAATTGTCGCCAAAATCCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTTATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGCAAGACTCATATTTGTGTGACGCATTAAATAAGCTAATATGAGTGTA CTGGAGCGCGAAACACCCGCCATACAATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD120490             [                             AAATGAATGA TTATTNGGTAATAAATCATTCGATGTTCTAGAAAACATATCGGAATACGATGACCCGCCAATGATATTCTTTGGACTATTTGTGTATAATCGA TTGTATTTATAATTCACACTTGATGTTCCACTATAAGTAAGCGATGGAAGTAGACGAATCGAACGACTGCCGCGTAGTTTTTCTTCATATTCTAATAATTGTCGCCAAAATCCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTTATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGCAAGACTCATATTTGTGTGACGCATTAAATAAGCTAATATGAGTGTA CTGGAGCGTGAAACACCCGCCATACAATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD090115             [                                                                                                  CAATGATATTCTTTGGACTATTTGTGTATAATCGATTTGTA TTATAATTCACACTTGATGTTCCACTATAAGTAAGCGATGGAAGTAGACGAATCGAACGACTGCCGCGTAGTTTTTCTTCATATTCTAATAATTGTCGCCAAAATCCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTTATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGCAAGACTCATATTTGTGTGACGCATTAAATAAGCTAATATGAGTGTA CTGGAGCGTGAAACACCCGCCATACAATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAGCTATTCGATCGGATACTCTGTCAAAGTGAGCACGTAAATTTGCACTCTCTATATCTTCAACGGGGACATGAACAGTATTCATCACAGCATTACGAATATGGACCGGTGGTGAATCAATCATTGCAGACACTAACAATGTAATGCCATGTTGACGTAATCTGTCCGGTGTGATGGCATTTAAACTACTCAGAAACAGATGATTATTGATGCGTGCAATCTGACTAAACATTTGCATAAAATCTATTTGATAAACAGTAT                                                                                                              ]
[-] EMBL CD185293             [                                                                                                                                                                                                                                              CCAAAATCCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTCATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGCAAGACTCATATTTGTGTGACGCATTAAATAAGCTAATATGAGTGTA CTGGAGCGTGAAACACCCGCCATACAATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAGCTATTCGATCGGATACTCTGTCAAAGTGAGCACGTAAATTTGCACTCTCTATATCTTCAACGGGGACATGAACAGTATTCATCACAGCATTACGAATATGGACCGGTGGTGAATCAATCATTGCAGACACTAACAATGTAATGCCATGTTGACGTAATCTGTCCGGTGTGATGGCATTTAAACTACTCAGAAACAGATGATTATTGATGCGTGCAATCTGACTAAACATTTGCATAAAATCTATTTGATAAACAGTATTGTACGGTATGAGTGGAGTGACAGTATTATTTCGATTCCCAATAGCAGAATTATTACTTCCTGATTTCGTAATTGTACCACAGTTTTTCTGTGAT               ]
[-] EMBL CD092470             [                                                                                                                                                                                                                                                     CCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTTATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGCAAGACTCATATTTGTGGTACGCATTAAATAAGCTAATATCAGTGTATCTGGAGCGTGATACACCCGCCATGCCATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAGCTATTCGATCGGATACTCTGTCAAAGTGAGCACGTAAATTTGCACTCTCTATATCATCAACGGGGACATGAACAGTATTCATCGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD149086             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGACATGAATTGTATTCATCACAGCATTACGAATATGGACCGGTGGTGAATCAATCATTGCAGACACTAACAATGTAATGCCATGTTGACGTAATCTGTCCGGTGTGATGGCATTTAAACTACTCAGAAACAGATGATTATTGATGCGTGCAATCTGACTAAACATTTGCATAAAATCTATTTGATAAACAGTATTGTACGGTATGAGTGGAGTGACAGTATTATTTCGATTCCCAATAGCAGAATTATTACTTCCTGATTTCGTAATTGTACCACAGTTTTTCTGTGATTTATCTGACAAATTA]




>consensus_9172#0
ACAACTGATTATCTCCATAGGATACAATGAAATGAATGATTTATTTGGTAATAAATCATT
CGATGTTCTAGAAAACATATCGGAATACGATGACCCGCCAATGATATTCTTTGGACTATT
TGTGTATAATCGATTTGTATTATAATTCACACTTGATGTTCCACTATAAGTAAGCGATGG
AAGTAGACGAATCGAACGACTGCCGCGTAGTTTTTCTTCATATTCTAATAATTGTCGCCA
AAATCCAGGATTTGGCTGAATACATGGTCTTATACTGCGCACGTGTTGATAAGCATCAGC
AAGACTCATATTTGTGTGACGCATTAAATAAGCTAATATGAGTGTACTGGAGCGTGAAAC
ACCCGCCATACAATGTATTAATGTTTTACCACCACGCCGATTTTCAGCAGCTATTCGATC
GGATACTCTGTCAAAGTGAGCACGTAAATTTGCACTCTCTATATCTTCAACGGGGACATG
AACAGTATTCATCACAGCATTACGAATATGGACCGGTGGTGAATCAATCATTGCAGACAC
TAACAATGTAATGCCATGTTGACGTAATCTGTCCGGTGTGATGGCATTTAAACTACTCAG
AAACAGATGATTATTGATGCGTGCAATCTGACTAAACATTTGCATAAAATCTATTTGATA
AACAGTATTGTACGGTATGAGTGGAGTGACAGTATTATTTCGATTCCCAATAGCAGAATT
ATTACTTCCTGATTTCGTAATTGTACCACAGTTTTTCTGTGATTTATCTGACAAATTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)