cluster # 9174

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Schistosoma mansoni
cluster # 9174 cluster # 9174 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_9174#0 length = 1103 sequences # 7

consensus_9174#1 length = 351 sequences # 1

consensusID : consensus_9174#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1103
fasta sequence

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[+] EMBL AW017474             [ATCTAATTTATTTATTTAAATGTAATGTAACATAACGTTTATTAGGAAAAGAATTAAAGGATTAAACATGTAAATAAATTATTCCATTGAACAAGATAACACATATACACTAATTAAATATATATGGATATGGATATATCTATCTATCAAGTAGTTAGATTAAAATAAGTTTCATCCATTCCCCAGATATTTTCGATACGACACATAATAAGAATTGATTGATTTAACATAGAAGAATACAATTCTGTTGTCAAAGGATAGCAGTTATTCGTATGCTTACATTCAAACCATTGAACGTATCCTGCCGGTTCGCCTTGTGTATTTATTGGACAGGTAAGTGGAAATTGAGAAATAGCCTTAGATAAATTGGTATTGCTTTTTTGAAGTTCTGGTGGATAACCTACAGATATGTTGAACTTATATAGTTCAATAAAATTGTTGTCATAATTAATACCACAGATCCAGATTCCTGTATGAAATTTAGGATTCGCGTGTTCAATTACCAGATATTCAGAATTTGCCTGTAAAATGTCTTCTCCATTTTTCTTCCATAAAGTGTCGCCTAAATACTGATAATGGGGACAGCTGATAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD072941             [ATCTAATTTATTTATTTAAATGTAATGTAACATAACGTTTATTAGGAAAAGAATTAAAGGATTAAACATGTAAATAAATTATTCCATTGAGCAAGATAACACATATACACTAATTAAATATATATGGATATGGATATATCTATCTATCAAGTAGTTAGATTAAAATAAGTTTCATCCATTCCCCAGATATTTTCGATACGACACATAATAAGAATTGATTGATTTAACATAGAAGAATACAATTCTGTTGTCAAAGGATAGCAGTTATTCGTATGCTTACATTCAAACCATTGAACGTATCCTGCCGGTTCGCCTTGTGTATTTATTGGACAGGTAAGTGGAAATTGAGAAATACCCTTACATAAATTGGTATTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD077540             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCAGAATTTGCCTGTAAAATGTCTTCTCCA TTTTCTTCCATAAAGTGTCGCCTAAATACTGATAATGGGGACAGCTGAGAAACACCAATCCATCCTTCGGTACCATGATCGTATCATGTGACGATACTGTATTTTGAGAACTCATATCAAGTATTTTGTTTGGTTGTAAAGAAACTACATTTAAAATAATAGTAGCTTTTGCATATTCTGTAGTTTCTAAATCGGAAGCTTCACAAACCCATCCTCCTGTATGCAACTGGGTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD078293             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCATTTTTCTTCCATAAAGTGTCGCCTAAATACTGATAATGGGGACAGCTGAGAAACACCAATCCATCCTTCGGTACCATGATCGTATCATGTGACGATACTGTATTTTGAGAACTCATATCAAGTATTTTGTTTGGTTGTAAAGAAACTACATTTAAAATAATAGTAGCTTTTGCATATTCTGTAGTTTCTAAATCGGAAGCTTCACAAACCCATCCTCCTGTATGCAACTGGGTTTTAGTATTATGTACTAATAAATGTGATATCCAAATATTTTTATTTTTAGAATGATGATGAACTGTCACTGGATACCTTTTTCCTGTTAATAGATGAATCCATTGAACATGTGGTTTATTTTGGGATACGATCAAACATGGGAGTTTAATGTGTTCATTTTCTAACACTTCTAATGTCAAAGTCTTCTTAAAATTTGACTGGTTGAAGGAATGTGTGACAGCTTGAAATATCTTGTTGTATTGCTTGTCTGTTATCATCTCGTAGTTTAGTGTTGGATAAACTGAATCATTTAAATGACCTGATAATTTAGATTTCTCGTCCAAAATCTT]
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[-] EMBL CD077873             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACANCAATCCATCCTTCGGTACCATGATCGTATCATGTGACGATACTGTATTTTGAGAACTCATATCAAGTATTTTGTTTGGTTGTAAAGAAACTACATTTAAAATAATAGTAGCTTTTGCATATTCTGTAGTTTCTAAATCGGAAGCTTCACAAACCCATCCTCCTGTATGCAACTGGGTTTTAGTATTATGTACTAATAAATGTGATATCCAAATATTTTTATTTTTAGAATGATGATGAACTGTCACTGGATACCTTTTTCCTGT   TAGATGCATCCATTGAACATGTGGTTTATTTTGGGATACGcc                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD200910             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATGTACTAATAAATGTGATATCCAAATATTTTTATTTTTAGAATGATGATGAACTGTCACTGGATACCTTTTTCCTGTTAATAGATGAATCC                                                                                                                                                                                                                                     ]




>consensus_9174#0
ATCTAATTTATTTATTTAAATGTAATGTAACATAACGTTTATTAGGAAAAGAATTAAAGG
ATTAAACATGTAAATAAATTATTCCATTGAACAAGATAACACATATACACTAATTAAATA
TATATGGATATGGATATATCTATCTATCAAGTAGTTAGATTAAAATAAGTTTCATCCATT
CCCCAGATATTTTCGATACGACACATAATAAGAATTGATTGATTTAACATAGAAGAATAC
AATTCTGTTGTCAAAGGATAGCAGTTATTCGTATGCTTACATTCAAACCATTGAACGTAT
CCTGCCGGTTCGCCTTGTGTATTTATTGGACAGGTAAGTGGAAATTGAGAAATAGCCTTA
GATAAATTGGTATTGCTTTTTTGAAGTTCTGGTGGATAACCTACAGATATGTTGAACTTA
TATAGTTCAATAAAATTGTTGTCATAATTAATACCACAGATCCAGATTCCTGTATGAAAT
TTAGGATTCGCGTGTTCAATTACCAGATATTCAGAATTTGCCTGTAAAATGTCTTCTCCA
TTTTTCTTCCATAAAGTGTCGCCTAAATACTGATAATGGGGACAGCTGAGAAACACCAAT
CCATCCTTCGGTACCATGATCGTATCATGTGACGATACTGTATTTTGAGAACTCATATCA
AGTATTTTGTTTGGTTGTAAAGAAACTACATTTAAAATAATAGTAGCTTTTGCATATTCT
GTAGTTTCTAAATCGGAAGCTTCACAAACCCATCCTCCTGTATGCAACTGGGTTTTAGTA
TTATGTACTAATAAATGTGATATCCAAATATTTTTATTTTTAGAATGATGATGAACTGTC
ACTGGATACCTTTTTCCTGTTAATAGATGAATCCATTGAACATGTGGTTTATTTTGGGAT
ACGATCAAACATGGGAGTTTAATGTGTTCATTTTCTAACACTTCTAATGTCAAAGTCTTC
TTAAAATTTGACTGGTTGAAGGAATGTGTGACAGCTTGAAATATCTTGTTGTATTGCTTG
TCTGTTATCATCTCGTAGTTTAGTGTTGGATAAACTGAATCATTTAAATGACCTGATAAT
TTAGATTTCTCGTCCAAAATCTT

consensusID : consensus_9174#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 351
fasta sequence

                              [AACACATATACACTAATTAAATATTTATGGATTTGGATATATCTATCTATCAAGTAGTTAGTATTAAAATAAGTTTCATTCTTTCCCCAGATATTTTCTATATTACACATAATAAGAATTGATTGATTTAACATAGAATAATACAATTCTGTGGTCAAAGGATAGCAGTTATTCGGATGCTTACATTCAAACCATNGTTGTTTTTCCTGCCGGTTCGCCTTGTGTATTTATTGGGACAGGTAAGTGGAAATTGAGAAATAGGCTTAGATAAATTGGTATTGCNTTTTTGAAGTTCTGGTGGGNNGCCTACAGATATGTTGAACTTATATAGTTCAATAAAATTGTTGTCTT]

[+] EMBL AI740242             [AACACATATACACTAATTAAATATTTATGGATTTGGATATATCTATCTATCAAGTAGTTAGTATTAAAATAAGTTTCATTCTTTCCCCAGATATTTTCTATATTACACATAATAAGAATTGATTGATTTAACATAGAATAATACAATTCTGTGGTCAAAGGATAGCAGTTATTCGGATGCTTACATTCAAACCATNGTTGTTTTTCCTGCCGGTTCGCCTTGTGTATTTATTGGGACAGGTAAGTGGAAATTGAGAAATAGGCTTAGATAAATTGGTATTGCNTTTTTGAAGTTCTGGTGGGNNGCCTACAGATATGTTGAACTTATATAGTTCAATAAAATTGTTGTCTT]




>consensus_9174#1
AACACATATACACTAATTAAATATTTATGGATTTGGATATATCTATCTATCAAGTAGTTA
GTATTAAAATAAGTTTCATTCTTTCCCCAGATATTTTCTATATTACACATAATAAGAATT
GATTGATTTAACATAGAATAATACAATTCTGTGGTCAAAGGATAGCAGTTATTCGGATGC
TTACATTCAAACCATNGTTGTTTTTCCTGCCGGTTCGCCTTGTGTATTTATTGGGACAGG
TAAGTGGAAATTGAGAAATAGGCTTAGATAAATTGGTATTGCNTTTTTGAAGTTCTGGTG
GGNNGCCTACAGATATGTTGAACTTATATAGTTCAATAAAATTGTTGTCTT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9174#0      ATCTAATTTATTTATTTAAATGTAATGTAACATAACGTTTATTAGGAAAAGAATTAAAGG 60
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      ATTAAACATGTAAATAAATTATTCCATTGAACAAGATAACACATATACACTAATTAAATA 120
consensus_9174#1      -------------------------------------AACACATATACACTAATTAAATA 23
                                                           ***********************

consensus_9174#0      TATATGGATATGGATATATCTATCTATCAAGTAGTTAG-ATTAAAATAAGTTTCATCCAT 179
consensus_9174#1      TTTATGGATTTGGATATATCTATCTATCAAGTAGTTAGTATTAAAATAAGTTTCATTCTT 83
                      * ******* **************************** ***************** * *

consensus_9174#0      TCCCCAGATATTTTCGATACGACACATAATAAGAATTGATTGATTTAACATAGAAGAATA 239
consensus_9174#1      TCCCCAGATATTTTCTATATTACACATAATAAGAATTGATTGATTTAACATAGAATAATA 143
                      *************** ***  ********************************** ****

consensus_9174#0      CAATTCTGTTGTCAAAGGATAGCAGTTATTCGTATGCTTACATTCAAACCATTGA-ACGT 298
consensus_9174#1      CAATTCTGTGGTCAAAGGATAGCAGTTATTCGGATGCTTACATTCAAACCATNGTTGTTT 203
                      ********* ********************** ******************* *     *

consensus_9174#0      ATCCTGCCGGTTCGCCTTGTGTATTTATTGG-ACAGGTAAGTGGAAATTGAGAAATAGCC 357
consensus_9174#1      TTCCTGCCGGTTCGCCTTGTGTATTTATTGGGACAGGTAAGTGGAAATTGAGAAATAGGC 263
                       ****************************** ************************** *

consensus_9174#0      TTAGATAAATTGGTATTGCTTTTTTGAAGTTCTGGTGGATAACCTACAGATATGTTGAAC 417
consensus_9174#1      TTAGATAAATTGGTATTGCNTTTTTGAAGTTCTGGTGGGNNGCCTACAGATATGTTGAAC 323
                      ******************* ******************    ******************

consensus_9174#0      TTATATAGTTCAATAAAATTGTTGTCATAATTAATACCACAGATCCAGATTCCTGTATGA 477
consensus_9174#1      TTATATAGTTCAATAAAATTGTTGTCTT-------------------------------- 351
                      ************************** *                                

consensus_9174#0      AATTTAGGATTCGCGTGTTCAATTACCAGATATTCAGAATTTGCCTGTAAAATGTCTTCT 537
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      CCATTTTTCTTCCATAAAGTGTCGCCTAAATACTGATAATGGGGACAGCTGAGAAACACC 597
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      AATCCATCCTTCGGTACCATGATCGTATCATGTGACGATACTGTATTTTGAGAACTCATA 657
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      TCAAGTATTTTGTTTGGTTGTAAAGAAACTACATTTAAAATAATAGTAGCTTTTGCATAT 717
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      TCTGTAGTTTCTAAATCGGAAGCTTCACAAACCCATCCTCCTGTATGCAACTGGGTTTTA 777
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      GTATTATGTACTAATAAATGTGATATCCAAATATTTTTATTTTTAGAATGATGATGAACT 837
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      GTCACTGGATACCTTTTTCCTGTTAATAGATGAATCCATTGAACATGTGGTTTATTTTGG 897
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      GATACGATCAAACATGGGAGTTTAATGTGTTCATTTTCTAACACTTCTAATGTCAAAGTC 957
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      TTCTTAAAATTTGACTGGTTGAAGGAATGTGTGACAGCTTGAAATATCTTGTTGTATTGC 1017
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      TTGTCTGTTATCATCTCGTAGTTTAGTGTTGGATAAACTGAATCATTTAAATGACCTGAT 1077
consensus_9174#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9174#0      AATTTAGATTTCTCGTCCAAAATCTT 1103
consensus_9174#1      --------------------------