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Schistosoma mansoni
cluster # 9179 cluster # 9179       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9179#0 length = 751 sequences # 8  

consensusID : consensus_9179#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 751
fasta sequence
                              [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACANACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTTACAAAGTTTTTACAGATGTACTACCCCACGCTCACAACCGCCAAACTTTTGTTTGATTCTTTGGATGTATCACTTCGTTCTATTCAATCCAAAGACCACAATTTACCAGAGCTCT]

[+] EMBL AI068264             [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGA TACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACA                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AI067945             [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACCAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAA                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI068336             [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCANACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI067876             [      TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACANACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTTACAAAGTTTTTACAGA                                                                                                   ]
[+] EMBL AI067728             [      TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI067113             [      TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI068279             [      TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCATGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD116173             [                                                                                                                                                                                                                              AGAGACTTGGAAACGTACCTTTTAATCGATGGATTTTATGCGCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCAGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACAAACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTACCAGGGTTTTTACAGATGTACTACCCCACGCTCACAACCGCCAAACTTTTGTTTGATTCTTTGGATGTATCACTTCGTTCTATTCAATCCAAAGACCACAATTTACCAGAGCTCT]


>consensus_9179#0 GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGC TATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAA GAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCG TGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTAC ATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATA AAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAA CGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTT GATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGAT TACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCAC GTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACA NACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTTACAAAGTTTTTACAGATGTACTAC CCCACGCTCACAACCGCCAAACTTTTGTTTGATTCTTTGGATGTATCACTTCGTTCTATT CAATCCAAAGACCACAATTTACCAGAGCTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)