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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9179#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 751 fasta sequence
[GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACANACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTTACAAAGTTTTTACAGATGTACTACCCCACGCTCACAACCGCCAAACTTTTGTTTGATTCTTTGGATGTATCACTTCGTTCTATTCAATCCAAAGACCACAATTTACCAGAGCTCT]
[+] EMBL AI068264 [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGA TACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACA ]
[+] EMBL AI067945 [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACCAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAA ]
[+] EMBL AI068336 [GCCTCTTAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCANACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTT ]
[+] EMBL AI067876 [ TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACANACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTTACAAAGTTTTTACAGA ]
[+] EMBL AI067728 [ TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCAGGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTG ]
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[+] EMBL AI068279 [ TAAGTCCCCAGCTTATCTGTGTTGCATAAATATTTCACAGGGATGGTTGGTGGCTATACAGTCCTGCGCGAAAAGTCAGAAAAGACTATCAGATACAAGACTCCCAGAGGTAAAGAGGTTTGTTTGACAAGAGAAGTCTATCTTCGGGACGACATACCATGCAGAAGTTTGTCGTGCTCTCATGTTGAGTGCCATCAAGGTGGACATTGCTTACCAAGAGACTTGGAAACGTACATTTTAATCGATGGATTTTATGCTCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCGGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGA ]
[+] EMBL CD116173 [ AGAGACTTGGAAACGTACCTTTTAATCGATGGATTTTATGCGCTCAACTACTGGGAACTATTTGAGCTTGAAGACATAAAGGGTGTTATTGTTTCACTGTCGTCAGTGAATTTTGTTCAGCAACAGGCCTCAACGAAACGCCCATATAAGAGAATTCGTTCAAGTCTTGAAGATGCTAGCCAAACATGCATTTTATTTGATAACGAGTTTAATCGCTCCTGTTTTCGTCCTCCTTTTGCGGACGAGATCCTTAAAGATTACACAACAAGAATGAATTGGGTTGCTGCTAACTGGTACATAAATCACTTGAAAGGCCACGTTTCACTAGTTTTCGTAACAGATAACGAGAATTATGTCCACACTTATTCATCTGAAACAAACACCACATCTTGTAAATTAACTGTCTTGGATTTACCAGGGTTTTTACAGATGTACTACCCCACGCTCACAACCGCCAAACTTTTGTTTGATTCTTTGGATGTATCACTTCGTTCTATTCAATCCAAAGACCACAATTTACCAGAGCTCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||