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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9185#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1139 fasta sequence
[TTATGGAGAGGTATGATTACCTGCTGAAGTTTCTGATCATTGGAAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA-GCTTATACA-TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG-ATGCATTCACCGCTGCTG-TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCACGTAAAGATCTTTGGACGTATGATAATTCAAAACATACTACTTATTATGTCTGTGATAAATTATGATTTTTATTGTTTATATGAATAATATCTAAATTTCATAAGTTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGAGAGAGAATTATANCATTTCATTTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTNCTTCCCCCTCCCGCCTTTTTCTTTATTATCCTTTTTATATCGTTCAAGGAATTTCTCTCCAGTCATTGGTTCATTCATTATTGTGTTTTTTTTTAAAATAAAAAAAGTCTATTTTTTTGATTTTCTCATTTTCATTTCTTTTTTTTTGAAAAAAATAATCTATGATATTTTGAGTTGATAAGTTAGTTACTATTATGGTGATATATATATGATATGTTTAAAATACAGTTATATAC]
[+] EMBL AI977151 [TTATGGAGAGGTATGATTACCTGCTGAAGTTTCTGATCATTGGAAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTC ]
[+] EMBL CD186028 [ GATCATTGATAATGCTGCTACTGGCAAAACATGTTTGATGAGATGGTTTCTTGAGGGAAAGTTTAAACAGGATTCGCTACACACAATAGGTGTCGAGTTCGGAACAAAAGTGCTTAGAGTTGATTCAAAGTCTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGGTAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAATGTTCTAGAACAAATTCAAAtg ]
[+] EMBL CD091376 [ CTGTAAAGCTGCAGATTTGGGATACGGCTGGTCAGGAGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACTCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTNTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCA ]
[-] EMBL BG932590 [ AGAGATTTCAGTGTATTACACGCTCATATTATCGAGGTGCGGCTTGTGCGTTGGTAGTTTACGACATCACTGACAGAGAATCATTTAACGCAGTTAATTCATGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTG ]
[+] EMBL CD078428 [ TGGATTTCCTCTGTTAGAGAGTTAGCTCTTCCAAACCTGACAGTTATACTGATAGGAAACAAAGTTGATTTAGATGCAAATTTACGTGAGGTCACTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAGAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGTCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTAAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCTTTCCACGTAAAGATCTTTGGACGTATGATAATTCAAAACATACTACTTATTATGTCTGTGATAAATTATGATTTTTATTGTTTATATGAATAATATCTAAATTTCATAAGTTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGAGAGAGAATTATANCATTTCATTTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTN ]
[+] EMBL AI381060 [ TACGTGAGGTCACTGAATTTGCAGGGGAACAGTGTGCTATTGATAATGGAGGCTTATACATTTTTTGGAAACATCCGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGGCATGCATTCACCGCTGCTGTTTCGGAGTGTTCTTGAACAGATTCAAAAT ]
[+] EMBL CD177902 [ tggaaggCTGAATTAGAAGGGAAACAGTGTGCTATTGATAATGGA GCTTATACA TTTTTGGAAACATCAGCTAAAAATGGTTCGAATGTTTTGG ATGCATTCACCGCTGCTG TTCGGAGTGTTCTAAAACAAATTCAAAATGGTTCTAACCCAACCCAAATGCCCTATCCAGTTGGAATTGGTCCTGCCCACTTAACTTTTCCCGGATCAAATGAATCTGTCAACAGTACAAAGTCATCTGAGCTATGTTGTCGTTCTTAGTGTTTGTTCGTTTTTGAATCACAGTTGTCTTTATACCCTTCC ]
[-] EMBL SMAA25696 [ TAAATTTCATAAGGTTATATATAAACGTTCAACTGTAGGTGATCCAGTTGAAAAGNGNGGGAATTATACAATTTCA TTTGGAATCCGTTTGACTTCTATTCATTCATCATAATTTTCCTTCCCCCTCCCGCCTTTTTCTTTATTATCCTTTTTATATCGTTCAAGGAATTTCTCTCCAGTCATTGGTTCATTCATTATTGTGTTTTTTTTTAAAATAAAAAAAGTCTATTTTTTTGATTTTCTCATTTTCATTTCTTTTTTTTTGAAAAAAATAATCTATGATATTTTGAGTTGATAAGTTAGTTACTATTATGGTGATATATATATGATATGTTTAAAATACAGTTATATAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||