These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9186#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 457 fasta sequence [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT-CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA-CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC] [+] EMBL CD114821 [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATATAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACT ] [+] EMBL CD114695 [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTTAGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGAC ] [+] EMBL CD071949 [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATT ] [+] EMBL CD144888 [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCNAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCCATTAAACCAGGTGTCGGAAG ] [-] EMBL CD114731 [ ACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC] [-] EMBL CD114723 [ ACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC] [-] EMBL CD114700 [ ACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTGGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC] [-] EMBL CD114717 [ CTCGAA CTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCTCCCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||