cluster # 9186

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Schistosoma mansoni
cluster # 9186 cluster # 9186 Sequences # 8 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_9186#0 length = 457 sequences # 8

consensusID : consensus_9186#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 457
fasta sequence

                              [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT-CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA-CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC]

[+] EMBL CD114821             [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATATAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACT ]
[+] EMBL CD114695             [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTTAGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGAC  ]
[+] EMBL CD071949             [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATT        ]
[+] EMBL CD144888             [CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCNAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCCATTAAACCAGGTGTCGGAAG                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD114731             [ ACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC]
[-] EMBL CD114723             [ ACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC]
[-] EMBL CD114700             [ ACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAATCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCT CCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTGGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC]
[-] EMBL CD114717             [                                                                                CTCGAA CTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAACTGTCAAATCGCTTCTCCCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAGTCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTATGACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTTCTCAAAATAATTCGATTAAA CAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGACATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGTGGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC]




>consensus_9186#0
CACTCGTCTTAATGCTACAATGTTTTATTGAGGACTATTGATACTGATTGTCTATCCAAA
TCAATGTTAATGGAACATGGCTCGAACCTGTCTCACCAGTTGTAAATCGAATGCTTTAAC
TGTCAAATCGCTTCTCCATTCCTATTGTAAACAAGTTTATGCTGATAGAGTAATTTCTAG
TCTCCGTCTAGTTCGTCTTCACCTAGTCAAGAAATCACCACTCATGTAAATACCATTTAT
GACACTTCTATTGCATATAACACGTCCAGTGGCGACTTGCAAGTAGCGGTGCTCTTATTT
CTCAAAATAATTCGATTAAACAAGTGTCGGAAGTACCAGTCATCAGACCAAACCATGGGA
CATATTGAACTTGCAACGTAATGTTTAACTACACATAATAAATGGGATGTAGCTGTCAGT
GGAATCCAGAACGCGCATTTTGTCCTATTCGGGACTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case