cluster # 9189

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Schistosoma mansoni
cluster # 9189 cluster # 9189 Sequences # 8 consensus # 2

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consensus_9189#0 length = 917 sequences # 7

consensus_9189#1 length = 540 sequences # 1

consensusID : consensus_9189#0
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 917
fasta sequence

                              [CCCAAGTGCATGAAAAGTTAATTGATTCTCACTTAATAAAAACAGCTCAAATATTGGAAGATACGTTAGATGAACAAATTAATCGTTTGGATAATTTAAATGATGATGACTTGGAAGCTATTCGACAACTTCGAATTAAGCAAATGAAAGAAGAATCAAAACAACGTTCTGAATGGTTAGCTTTAGGACATGGTGTTTATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTTTTTACTGCCTGTAAAACATCATCATTTGGCCTTGTTTGTCATTTTTATCGTGATTCAACATTTCGATGTAAAATTCTAGATAAACATTTAAGCTTATTAGCTTCGAAACATATTGAATGTAGAATGGTGAAGATAAATGCGGAGAAAGCGCCATTTTTAACAAAACGATTAAATATTCTAGTTATACCAACTTTAATTCTTGTTAAAAATGAAAAAGTATGCGATCGTATTGTTGGATTTGATGAACTTGGTGGTCATGATGAATTCTCTACTGCTATGCTTGAATGGCGTTTAGCTGTTGGTAAAGTGATTAAATATTCCGGTGATTTAACAGTTCCACCAGATATG-ACCAAAAGAA-TCTACATGTAGTAATTTATCGAATATCACTAAAAAACTATATGACAATAAATCTATATATAGTGAATGTTTTGACAATAACGCTGATGATGATGACGAAGATAGTGATTAATTAAATATTGTTACGCTAGCTGTAACTTTCTCATTGTCTATGTAACAATCTAGTTTTACGTGGCATGTTCTTTAGAAAAAAAATTTGTGACCATTATCTTTATATTCACATGTAAATATACAGAAATACAAATGACGGATCATATCTTACTTCTGAATAATGTGTCTTTGAGTTTTTGACTTCTCNCATGTTCAAAAGAAAAATGAAGGAATACACCTTCT]

[+] EMBL CD071783             [CCCAAGTGCATGAAAAGTTAATTGATTTTCCCTTAATAAAAACAGCTCAAATATTGGAAGATACGTTAGATGAACAAATTAATCGTTTGGATAATTTAAATGATGATGACTTGGAAGCTATTCGACAACTTCGAATTAAGCAAATGAAAGAAGAATCAAAACAACGTTCTGAATGGTTAGCTTTAGGACATGGTGTTTATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTTTTTACTGCCTGTAAAACATCATCATTTGGCCTTGTTTGTCATTTTTATCGTGATTCAACATTTCGATGTAAAATTCTAGATAAACATTTAAGCTTATTAGCTTCGAAACATATTGAATGTAGAATGGTGAAGATAAATGCGGAAAAAGCGCCATTTTTAACAANACGATTAAATATTCTAGTTATACCAACTTTAATTCTTGTTAAAAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD201275             [                    ATTGAGTCTCAGTTAATAAAAACAGCTCAAATATTGGAAGATACGTTAGATGAACAAATTAATCGTTTGGATAATTTAAATGATGATGACTTGGAAGCTATTCGACAACTTCGAATTAAGCAAATGAAAGAAGAATCAAAACAACGTTCTGAATGGTTAGCTTTAGGACATGGTGTTTATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTTTTTACTGCCTGTAAAACATCATCATTTGGCCTTGTTTGTCATTTTTATCGTGATTCAACATTTCGATGTAAAATTCTAGATAAACATTTAAGCTTATTAGCTTCGAAACATATTGAATGTAGAATGGTGAAGAATAATGCGGAGAAAGCGCCATTTTT ACAAAACGATTAAATATTCTAGTTATACCna                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD201266             [                    ATTGATTCTCAATTAATAAAAACAGCTCGCATATTGGAAGATACGTTAGATGAACAGGTTAATCGTTTGGATAATTTAAATGATGATGACTTGGAAGCTATTCAACAACTTCGAATTAAGCAAATGAGACAAGAATCAAAACAACGTTCTGAATGGTTATCTTTAGGACATGGTGTTTATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD201265             [                    gTTGATTCTCACTTAATAAAAACCGCTCGAATATTGGAAGATACGGTAGATGAACAAATTAATCGTTTGGATAATTTAAATGATGATGACTTGGAAGCTATTCGACAACTTCGAATTAAGCAAATGAAAGAAGAATCAAAACAACGTTCTGAATGGTTAGATTTAGGACATGGTGTTTATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTTTTTACTGCCTGTAAAACATCATCATTTGGCCTTGTTTGTCATTTTTATCGTGATTNCACATTTCGATGTAAAATTCTAGATAAACATTTAAGCTTATTAGCTTCTAAACATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD083712             [                                                       ggcacgaggGTTAGAT AACAAATTAATCGTTTGGAT ATTTAAATGATGATGACTTGGAAGCTATTCGACAACTTCGAATTAAGCAAATGAAAGAAGAATCAAAACAACGTTCTGAATGGTTAGCTTTAGGACATGGTGTTTATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTTTTTACTGCCTGTAAAACATCATCATTTGGTCTTGTTTGTCATTTTTATCGTGATTCAACATTTCGATGTAAAATTCTAGATAAACATTTAAGCTTATTAGCTTCGAAACATATTGAATGTAGAATGGTGAAGATAAATGCGGAGAAAGCGCCATTTTTAACAAAACGATTAAATATTCTAGTTATACCAACTTTAATTCTTGTTAAAAATGAAAAAGTATGCGATCGTATTGTTGGATTTGATGAACTTGGTGGTCATGATGAATTCTCTACTGCTATGCTTGAATGGCGTTTAGCTGTTGGTAAAGTGATTAAATATTCCGGTGATTTAACAGTTCCACCAGATATG ACCAAAAGAA TCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD201243             [                                                                                                                                                                                            CATGGTGTCCATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTTTTTACTGCCTGTAAAACATCATCATTTGGTCTTGTTTGTCATTTTTATCGTGACTCAACATTTCGATGTAAAATTCTAGATAAACATTTAAGCTTATTAGCTTCGAAACATATTGAATGTAGAATGGTGAAGATAAATGCGGAGAAAGCGCCATTTTTAACAAAACGATTAAATATTCTAGTTATACCAACTTTAATTCTTGTTAAAAATGAAAAAGTATGCGATCGCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD196432             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAATTCTTGTTAAAAATGAAAAAGTATGCGATCGTATTGTTGGATTTGATGAACTTGGTGGTCATGATGAATTCTCTACTGCTATGCTTGAATGGCGTTTAGCTGTTGGTAAAGTGATTAAATATTCCGGTGATTTAACAGTTCCACCAGATATGAACAAAAAGAAGTCTACATGTAGTAATTTATCGAATATCACTAAAAAACTATATGACAATAAATCTATATATAGTGAATGTTTTGACAATAACGCTGATGATGATGACGAAGATAGTGATTAATTAAATATTGTTACGCTAGCTGTAACTTTCTCATTGTCTATGTAACAATCTAGTTTTACGTGGCATGTTCTTTAGAAAAAAAATTTGTGACCATTATCTTTATATTCACATGTAAATATACAGAAATACAAATGACGGATCATATCTTACTTCTGAATAATGTGTCTTTGAGTTTTTGACTTCTCNCATGTTCAAAAGAAAAATGAAGGAATACACCTTCT]




>consensus_9189#0
CCCAAGTGCATGAAAAGTTAATTGATTCTCACTTAATAAAAACAGCTCAAATATTGGAAG
ATACGTTAGATGAACAAATTAATCGTTTGGATAATTTAAATGATGATGACTTGGAAGCTA
TTCGACAACTTCGAATTAAGCAAATGAAAGAAGAATCAAAACAACGTTCTGAATGGTTAG
CTTTAGGACATGGTGTTTATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTTTTTACTGCCTGTA
AAACATCATCATTTGGCCTTGTTTGTCATTTTTATCGTGATTCAACATTTCGATGTAAAA
TTCTAGATAAACATTTAAGCTTATTAGCTTCGAAACATATTGAATGTAGAATGGTGAAGA
TAAATGCGGAGAAAGCGCCATTTTTAACAAAACGATTAAATATTCTAGTTATACCAACTT
TAATTCTTGTTAAAAATGAAAAAGTATGCGATCGTATTGTTGGATTTGATGAACTTGGTG
GTCATGATGAATTCTCTACTGCTATGCTTGAATGGCGTTTAGCTGTTGGTAAAGTGATTA
AATATTCCGGTGATTTAACAGTTCCACCAGATATGACCAAAAGAATCTACATGTAGTAAT
TTATCGAATATCACTAAAAAACTATATGACAATAAATCTATATATAGTGAATGTTTTGAC
AATAACGCTGATGATGATGACGAAGATAGTGATTAATTAAATATTGTTACGCTAGCTGTA
ACTTTCTCATTGTCTATGTAACAATCTAGTTTTACGTGGCATGTTCTTTAGAAAAAAAAT
TTGTGACCATTATCTTTATATTCACATGTAAATATACAGAAATACAAATGACGGATCATA
TCTTACTTCTGAATAATGTGTCTTTGAGTTTTTGACTTCTCNCATGTTCAAAAGAAAAAT
GAAGGAATACACCTTCT

consensusID : consensus_9189#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 540
fasta sequence

                              [CTTCTCTTACTATGCGTACTGCGTTGAAGTGGCGGTTTAGCGTGGTCTGGGTAAAGGTGATTAAATATTCCGGGTGATTTAACGAGTTCCACCGAGATATGAACAAAAAGAAGTCTACATGTAGTAATTTATCGAATATCACTAAAAAACTATATGACAATAAATCTATATATAGTAAATGTTTTGACAATAACGCTGATGATGATGACGAAGATAGTGATTAATTAAATATTGTTACGCAGCTGTAACTTTCTCATTGTCTATGTAACAATCTAGTTTTACGTGGCATGTTCTTTAGAAAAAAATTTGTGGACAATATCTTATATTCACATGTAAATTTACAGGAATTCAATTGCGGTCTATCTTACTCTGAAAAAGGGGCTTTGAGTTTTGACTCTCCAATGTCAAAAGAAATGAGGGATACACCTTCAATGGTGATATCACTTTTGGAAAAGAGGAATTGTTTCCTCCAATTTATTGGAAAAAGGGTACACCTTGTTAAATTACAAAATCGAGTGGGGGAAATCCAAAAAGGAAATG]

[+] EMBL AI618995             [CTTCTCTTACTATGCGTACTGCGTTGAAGTGGCGGTTTAGCGTGGTCTGGGTAAAGGTGATTAAATATTCCGGGTGATTTAACGAGTTCCACCGAGATATGAACAAAAAGAAGTCTACATGTAGTAATTTATCGAATATCACTAAAAAACTATATGACAATAAATCTATATATAGTAAATGTTTTGACAATAACGCTGATGATGATGACGAAGATAGTGATTAATTAAATATTGTTACGCAGCTGTAACTTTCTCATTGTCTATGTAACAATCTAGTTTTACGTGGCATGTTCTTTAGAAAAAAATTTGTGGACAATATCTTATATTCACATGTAAATTTACAGGAATTCAATTGCGGTCTATCTTACTCTGAAAAAGGGGCTTTGAGTTTTGACTCTCCAATGTCAAAAGAAATGAGGGATACACCTTCAATGGTGATATCACTTTTGGAAAAGAGGAATTGTTTCCTCCAATTTATTGGAAAAAGGGTACACCTTGTTAAATTACAAAATCGAGTGGGGGAAATCCAAAAAGGAAATG]




>consensus_9189#1
CTTCTCTTACTATGCGTACTGCGTTGAAGTGGCGGTTTAGCGTGGTCTGGGTAAAGGTGA
TTAAATATTCCGGGTGATTTAACGAGTTCCACCGAGATATGAACAAAAAGAAGTCTACAT
GTAGTAATTTATCGAATATCACTAAAAAACTATATGACAATAAATCTATATATAGTAAAT
GTTTTGACAATAACGCTGATGATGATGACGAAGATAGTGATTAATTAAATATTGTTACGC
AGCTGTAACTTTCTCATTGTCTATGTAACAATCTAGTTTTACGTGGCATGTTCTTTAGAA
AAAAATTTGTGGACAATATCTTATATTCACATGTAAATTTACAGGAATTCAATTGCGGTC
TATCTTACTCTGAAAAAGGGGCTTTGAGTTTTGACTCTCCAATGTCAAAAGAAATGAGGG
ATACACCTTCAATGGTGATATCACTTTTGGAAAAGAGGAATTGTTTCCTCCAATTTATTG
GAAAAAGGGTACACCTTGTTAAATTACAAAATCGAGTGGGGGAAATCCAAAAAGGAAATG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9189#0      CCCAAGTGCATGAAAAGTTAATTGATTCTCACTTAATAAAAACAGCTCAAATATTGGAAG 60
consensus_9189#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9189#0      ATACGTTAGATGAACAAATTAATCGTTTGGATAATTTAAATGATGATGACTTGGAAGCTA 120
consensus_9189#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9189#0      TTCGACAACTTCGAATTAAGCAAATGAAAGAAGAATCAAAACAACGTTCTGAATGGTTAG 180
consensus_9189#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9189#0      CTTTAGGACATGGTGTTTATTCTGAATTATCAAGTGAAAAAGACTTTTTTACTGCCTGTA 240
consensus_9189#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9189#0      AAACATCATCATTTGGCCTTGTTTGTCATTTTTATCGTGATTCAACATTTCGATGTAAAA 300
consensus_9189#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9189#0      TTCTAGATAAACATTTAAGCTTATTAGCTTCGAAACATATTGAATGTAGAATGGTGAAGA 360
consensus_9189#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9189#0      TAAATGCGGAGAAAGCGCCATTTTTAACAAAACGATTAAATATTCTAGTTATACCAACTT 420
consensus_9189#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9189#0      TAATTCTTGTTAAAAATGAAAAAGTATGCGATCGTATTGTTGGATTTGATGAACTTGGTG 480
consensus_9189#1      -----------------------------------------------------CTTCTC- 6
                                                                           ***    

consensus_9189#0      GTCATGATGAATTCTCTACTGCTATGCTTGAATGGCGTTTAGCTGTTGGTAAAG-TGATT 539
consensus_9189#1      -TTACTATGCGTACTGCGTTGAAGTGGCGGTTTAGCGT---GGTCTGGGTAAAGGTGATT 62
                       * *  ***  * **    **   **   *  * ****   * * * ******* *****

consensus_9189#0      AAATATTCCGG-TGATTTAAC-AGTTCCACC-AGATATGACCAAAAGAA--TCTACATGT 594
consensus_9189#1      AAATATTCCGGGTGATTTAACGAGTTCCACCGAGATATGAACAAAAAGAAGTCTACATGT 122
                      *********** ********* ********* ******** *****  *  *********

consensus_9189#0      AGTAATTTATCGAATATCACTAAAAAACTATATGACAATAAATCTATATATAGTGAATGT 654
consensus_9189#1      AGTAATTTATCGAATATCACTAAAAAACTATATGACAATAAATCTATATATAGTAAATGT 182
                      ****************************************************** *****

consensus_9189#0      TTTGACAATAACGCTGATGATGATGACGAAGATAGTGATTAATTAAATATTGTTACGCTA 714
consensus_9189#1      TTTGACAATAACGCTGATGATGATGACGAAGATAGTGATTAATTAAATATTGTTACGC-A 241
                      ********************************************************** *

consensus_9189#0      GCTGTAACTTTCTCATTGTCTATGTAACAATCTAGTTTTACGTGGCATGTTCTTTAGAAA 774
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                      ************************************************************

consensus_9189#0      AAAAATTTGTGACCATTATCTTTATATTCACATGTAAATATACAGAAATACAAATGACGG 834
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                      **** ******  ** ****** **************** ***** *** *** **   *

consensus_9189#0      ATCATATCTTACTTCTGAATAATGTGTCTTTGAGTTTTTGACTTCTCNCATGTTCAAAAG 894
consensus_9189#1      GTC-TATCTTACT-CTGAA-AAAGGGGCTTTGAGTTTT-GACT-CTCCAATGTC---AAA 409
                       ** ********* ***** ** * * *********** **** ***  ****    ** 

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                      * ****** *** *********                                      

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consensus_9189#1      TCCAATTTATTGGAAAAAGGGTACACCTTGTTAAATTACAAAATCGAGTGGGGGAAATCC 528
                                                                                  

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consensus_9189#1      AAAAAGGAAATG 540