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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9190#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 702 fasta sequence
[CATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT-GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCTTG]
[+] EMBL CD085910 [ ATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGCGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGA TATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGTGGGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCTTG]
[+] EMBL CD086083 [ ATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGCGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCNGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGTTGCGTCCGGATTATCCCCGTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTtcgc ]
[+] EMBL CD085932 [ ATACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCTTGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGTCCCGCTGGTGGNTACCCTGAAATCGGCGATCATGGGCATC ]
[+] EMBL CD085963 [ccTACCAGCCCGGGCTGGTGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCC ]
[-] EMBL CD085889 [ TGGTGGACATCGGCGTGTGATCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCACCATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGAGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCT ]
[+] EMBL CD085994 [ TGGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCAACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGCGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCT ]
[-] EMBL CD085920 [ GGACATCGGCGTGTTGTCGCGCCCGGTGTATGGTGATCCGGACTCAGTGACGGTCAGTTTCAAAGATCTACCCTTGCATGGCTACGAGCCAACATCAGAAACCGAATACGTGGATTCCGGCGCTGTTCTGGACACCAGTGTCGACAGCCTGCTCGATGGCCTGGACATTACCGCGAACGTGGCCTGTCTGTCCCTGGGCGGGCTGCTCGACCCGCTGGTGGATACCCTGAAATCGGCGATCAAGGGCATCGTGACGCCGTTGGCCACGGGGATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCTGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCT ]
[-] EMBL CD085966 [ nGGCCACGGGAATACTCGGGCCGCTGCTCGATTCACTCGGCATCAGCCTCGGAAAGGCCACCGTTCATGTGCAGGCCAATGAGCAGCCCGCTGTGCAACTGCTGCGCTACTGTGGCCCGGAGGGCTGCTAGGGCGTGAGTGGCTACCTGTGGGGCGAGAGGGGCGTCAGGGAAGACGGCTCCGTATTGTTGCTGCTGGCCTTGGTGCTGGCAGGCAGTGCACTCGCTGCTGACATCGCAGGCGTGGCGGATCGCTACTCCCTGTTGGTCTATCCGGAAGTGGCCGCGCTGCTGGCGCTGGCGGCGGGCGGCTTCGGGGTGTACAGCCTGGGGGTCATGCTGCTGGTGCGTCCGGATTATCCCGTTCGTTATGTTGCCCGGCAGTGTGT GGCCCTGGTGCGTCGCGTGGGCTTGCTTCGGCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||