Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9195 cluster # 9195       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9195#0 length = 714 sequences # 8  
consensusID : consensus_9195#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 714
fasta sequence 
                              [ATTCAATTCCTGTTGTAGTTGTAACTATTGAAGATGTTGGAGAGGATTGAGGAATTATTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCCAATATTGCTGGATTTAAACCCAATGAATTGAAATAAATTTTAAATCGATTTAATTCAGATTGTTGATTGGACTTTTCTTCTTGTAGATTTATTACTTCTTCCTGAAGATCTTTACATTGTTCAGCCAATTTCTCTTTTTCTACTAGTAAGGCTTTGTATTGTTCCACTGTCTTACATAAACGATCTTCATAATCCATAGTATCACTGATGCTTAAACGAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTGTTGCACGGTTTCTTCCATCCCCATAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTAATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTGGTAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTCAATTCCCTCATTTAAAAATTCAATAACAGCTTTCAATATCTTCTTAAGATTACTGACCTTCAGTCTCCAGTTGATCTCAGCATCATAATTTAGTGTTTGCAACCATTCATCGGTGAAATGATTTGGAGCAATGGTATGCAAAACTTTACCTAATACAATCCCATCAGTAACATTATNGTATAGAATAAACATTTGTTGCTATGCTG]

[+] EMBL CD179044             [ATTCAATTCCTGTTGTAGTTGTAACTATTGAAGATGTTGGAGAGGATTGAGGAATTATTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCCAATATTGCTGGATTTAAACCCAATGAATTGAAATAAATTTTAAATCGATTTAATTCAGATTGTTGATTGGACTTTTCTTCTTGTAGATTTATTACTTCTTCCTGAAGATCTTTACATTGTTCAGCCAATTTCTCTTTTTCTACTAGTAAGGCTTTGTATTGTTCCACTGTCTTACATAAACGATCTTCATAATCCATAGTATCACTGATGCTTAAACGAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD190703             [                                                                                                                                                                                                 TTTACATTGTTCAGCCAATTTCTCTTTTTCTACTAGTAAGGCTTTGTATTGTTCCACTGTCTTACATAAACGATCTTCATAATCCATAGTATCACTGATGCTTAAACGAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTGTTGCACGGTTTCTTCCATCCCCATAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTAATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTGGTAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTC                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD187612             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTGTTGCACGGTTTCTTCCATCCCCATAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTAATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTGGTAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTCAATTCCCTCATTTAAAAATTCAATAACAGCTTTCAATATCTTCTTAAGATTACTGAC                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD132340             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTGTTGCACGGTTTCTTCCATCCCCATAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTAATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTGGTAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTCAATTCCCTCATTTAAAAATTCAATAACAGCTTTCAATATCTTCTTAAGATTACTGAC                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD132359             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTGTTGCACGGTTTCTTCCATCCCCATAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTAATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTGGTAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTCAATTCCCTCATTTAAAAATTCAATAACAGCTTTCAATATCTTCTTAAGATTACTGAC                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD187133             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTGTTGCACGGTTTCTTCCATCCCCATAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTAATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTGGTAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTCAATTCCCTCATTTAAAAATTCAATAACAGCTTTCAATATCTTCTTAAGATTACTGAC                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD187425             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTGTTGCACGGTTTCTTCCATCCCCATAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTAATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTGGCAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTCAATTCCCTCATTTAAAAATTCAATAACAGCTTCCAATATCTTCTTAAGATTACTGACC                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD130642             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTAATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTGGTAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTCAATTCCCTCATTTAAAAATTCAATAACAGCTTTCAATATCTTCTTAAGATTACTGACCTTCAGTCTCCAGTTGATCTCAGCATCATAATTTAGTGTTTGCAACCATTCATCGGTGAAATGATTTGGAGCAATGGTATGCAAAACTTTACCTAATACAATCCCATCAGTAACATTATNGTATAGAATAAACATTTGTTGCTATGCTG]




>consensus_9195#0
ATTCAATTCCTGTTGTAGTTGTAACTATTGAAGATGTTGGAGAGGATTGAGGAATTATTG
CTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCCAATATTGCTGGATTTAAACCCAATGAATTGAAATAAA
TTTTAAATCGATTTAATTCAGATTGTTGATTGGACTTTTCTTCTTGTAGATTTATTACTT
CTTCCTGAAGATCTTTACATTGTTCAGCCAATTTCTCTTTTTCTACTAGTAAGGCTTTGT
ATTGTTCCACTGTCTTACATAAACGATCTTCATAATCCATAGTATCACTGATGCTTAAAC
GAGTCGACATTAATTGTTGAATCGCTTCCATTATTGCTTGTTGCACGGTTTCTTCCATCC
CCATAATTGTTTGAATATAAGTTTGTTTATTATCACAATTTACAGCGCACGCAAGTATTA
ATTGTAATAAACGAAACGTTGACTCTTCATTTTCATGTTCGGCAATTTCTTGTAGATTTG
GTAAGAATTGAATAGATATCCTATCTTCAATTCCCTCATTTAAAAATTCAATAACAGCTT
TCAATATCTTCTTAAGATTACTGACCTTCAGTCTCCAGTTGATCTCAGCATCATAATTTA
GTGTTTGCAACCATTCATCGGTGAAATGATTTGGAGCAATGGTATGCAAAACTTTACCTA
ATACAATCCCATCAGTAACATTATNGTATAGAATAAACATTTGTTGCTATGCTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)