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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9196#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 480 fasta sequence
[GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTCC]
[+] EMBL CD071620 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTNTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTCC]
[+] EMBL CD071732 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTT ]
[+] EMBL CD071524 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACGTAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAACTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAATT ]
[+] EMBL CD071640 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT ]
[+] EMBL CD071625 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGCTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT ]
[+] EMBL CD071592 [GGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGCACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTTTATTACGTGGAGACCTAAT ]
[+] EMBL CD071575 [cGACTCTATATTGTTGATATCAGACAAAACATAAATACACGCATAGGTGCACGTAAACCACTTTATCAAACTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGTAAACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCGTTTGAAGGAATGAATTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATAGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAGTTNTATTACGTGGAGACCTAATTGACCTTGACTC ]
[-] EMBL CD118263 [ CACGCATAGGTGCACGTAAACCAGTTTATCAAGTTGAAGCATTAGCTGAAGAACTTCAACTAGCTGTTGCTATACAAGGT AACAACGATTCCTAAAATTAATACTGGTTGGATCATTTGAAGGAATGATTTTAAAACCAATCAAAATTACTGAACCAAAATTATGTACTCGATTCACTTGTTCAATGAGTCGAAACAATACAGTTTGTTTGATTTGTGTGGCCAGTAATCGTTCATTGTTTATTTTTGAAATCGCACGCGTACAAGGAAGACATAAACGTTTAAAAGAAATTTCATGTCCGTATATTGTTCAATCTATCAATTTCGTTCGAGATGGTGATTGGATATGTGTTGGATCATCAAATTATTTTGCTATGTTTAGCATATGGACTGATGGACCCGCGCAAG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||