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Schistosoma mansoni
cluster # 9197 cluster # 9197       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9197#0 length = 1132 sequences # 8  

consensusID : consensus_9197#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1132
fasta sequence
                              [TGAATTTGGCGTTACGATGGGTGAGGTTGTTGATGGAGTTCATCTAATGACAACAAAACCGAATCAAGGGCGAGGACAAATGGCTGATAAAGATGGCTATTTATCTGTGTCTATGGCAGATCTGCACAACCCACATCTCAGTTATCCAGTAGTTAGTCCCAATCGTTCTGGTAAATTTTATCGTGGTGAATGTATTCTTATCAATCAACGAGATTTTCACCCTTCAACTAATCAATCAAGACGTGATGGTACAGATGTTGATGCTGATCGTGTTGAAAGAGTTTTCAAGAGCTTAAATTATAAAGTAACGCGTATCCTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGCCTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTATCACATGGAGACAATAATATAATATACGCGAATGATGGGGGAAGTCTTAACAAGTTATATTATGGCTTTTTTTCGTGGTGATCGGTGTCCTTCCCTGATTGCAAAACCGAAATTATTCTTTTTCCAGGCATGTCGAGGTGCTGCATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATATCTTTCATGAAAAACAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTATCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTTAGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACAAATCATC]

[+] EMBL CD188871             [TGAATTTGGCGTTACGATGGGTGAGGTTGTTGATGGAGTTCATCTAATGACAACAAAACCGAATCAAGGGCGAGGACAAATGGCTGATAAAGATGGCTATTTATCTGTGTCTATGGCAGATCTGCACAACCCACATCTCAGTTATCCAGTAGTTAGTCCCAATCGTTCTGGTAAATTTTATCGTGGTGAATGTATTCTTATCAATCAACGAGATTTTCACCCTTCAACTAATCAATCAAGACGTGATGGTACAGATGTTGATGCTGATCGTGTTGAAAGAGTTTTCAAGAGCTTAAATTATAAAGTAACGCGTATCCTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGCCTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD097942             [  AATTTGGCGTTACGATGGGTGAGGTTGTTGATGGAGTTCATCTAATGACGACAAAACCGAATCAAGGGCGAGGACAAATGGCTGATAAAGATGGCTATTTATCTGTGTCTATGGCAGATCTGCACAACCCACACCTCAGTTATCCAGTAGTTAGTCCCAATCGTTCTGGTAAATTTTATCGTGGTGAATGTATTCTTATCAATCAACGAGATTTTCACCCTTCAACTAATCAATCAAGACGTGATGGTACAGATGTTGATGCTGATCGTGTTGAAAGAGTTTTCAAGAGCTTAAATTATAAAGTAACGCGTATCCTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGCCTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTATCACATGGAGACAATAATATAATATACGCGAATGATGGGGGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD078908             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGCCTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTATCACATGGAGACAATAATATAATATACGCGAATGAT GGGGAAGTCTTAACAAGTTATATTATGGCTTTTTTTCGTGGTGATCGGTGTCCTTCCCTGATTGCAAAACCGAAATTATTCTTTTTCCAGGCATGTCGAGGTGCTGCATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACANATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATANATGGACTANAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCG                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AI067589             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGGTGTCCTTCCCTGATTGCAAAACCGAAATTATTCTTTTTCCAGGCATGTCGAGGTGCTGCATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACAGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGT                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD150347             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATATCTTTCATGAAAAGCAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTATCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTTAGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACANATCAT ]
[-] EMBL CD150426             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATNTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGCCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATATCTTTCATGAAAAACAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTATCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTTAGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACAAATCATC]
[+] EMBL BG932121             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTGTATCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATCTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTT                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD150445             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGNTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTNTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATATATTTCATGAAAAACAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTATCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTTAGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACAAATCATC]


>consensus_9197#0 TGAATTTGGCGTTACGATGGGTGAGGTTGTTGATGGAGTTCATCTAATGACAACAAAACC GAATCAAGGGCGAGGACAAATGGCTGATAAAGATGGCTATTTATCTGTGTCTATGGCAGA TCTGCACAACCCACATCTCAGTTATCCAGTAGTTAGTCCCAATCGTTCTGGTAAATTTTA TCGTGGTGAATGTATTCTTATCAATCAACGAGATTTTCACCCTTCAACTAATCAATCAAG ACGTGATGGTACAGATGTTGATGCTGATCGTGTTGAAAGAGTTTTCAAGAGCTTAAATTA TAAAGTAACGCGTATCCTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGC CTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTATCACATGGAGA CAATAATATAATATACGCGAATGATGGGGGAAGTCTTAACAAGTTATATTATGGCTTTTT TTCGTGGTGATCGGTGTCCTTCCCTGATTGCAAAACCGAAATTATTCTTTTTCCAGGCAT GTCGAGGTGCTGCATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATT TAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAG GTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATG CACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAG TTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATA TGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAA AATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATA TCTTTCATGAAAAACAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTA TCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTT AGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACAAATCATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)