|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9197#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1132 fasta sequence
[TGAATTTGGCGTTACGATGGGTGAGGTTGTTGATGGAGTTCATCTAATGACAACAAAACCGAATCAAGGGCGAGGACAAATGGCTGATAAAGATGGCTATTTATCTGTGTCTATGGCAGATCTGCACAACCCACATCTCAGTTATCCAGTAGTTAGTCCCAATCGTTCTGGTAAATTTTATCGTGGTGAATGTATTCTTATCAATCAACGAGATTTTCACCCTTCAACTAATCAATCAAGACGTGATGGTACAGATGTTGATGCTGATCGTGTTGAAAGAGTTTTCAAGAGCTTAAATTATAAAGTAACGCGTATCCTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGCCTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTATCACATGGAGACAATAATATAATATACGCGAATGATGGGGGAAGTCTTAACAAGTTATATTATGGCTTTTTTTCGTGGTGATCGGTGTCCTTCCCTGATTGCAAAACCGAAATTATTCTTTTTCCAGGCATGTCGAGGTGCTGCATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATATCTTTCATGAAAAACAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTATCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTTAGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACAAATCATC]
[+] EMBL CD188871 [TGAATTTGGCGTTACGATGGGTGAGGTTGTTGATGGAGTTCATCTAATGACAACAAAACCGAATCAAGGGCGAGGACAAATGGCTGATAAAGATGGCTATTTATCTGTGTCTATGGCAGATCTGCACAACCCACATCTCAGTTATCCAGTAGTTAGTCCCAATCGTTCTGGTAAATTTTATCGTGGTGAATGTATTCTTATCAATCAACGAGATTTTCACCCTTCAACTAATCAATCAAGACGTGATGGTACAGATGTTGATGCTGATCGTGTTGAAAGAGTTTTCAAGAGCTTAAATTATAAAGTAACGCGTATCCTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGCCTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTAT ]
[+] EMBL CD097942 [ AATTTGGCGTTACGATGGGTGAGGTTGTTGATGGAGTTCATCTAATGACGACAAAACCGAATCAAGGGCGAGGACAAATGGCTGATAAAGATGGCTATTTATCTGTGTCTATGGCAGATCTGCACAACCCACACCTCAGTTATCCAGTAGTTAGTCCCAATCGTTCTGGTAAATTTTATCGTGGTGAATGTATTCTTATCAATCAACGAGATTTTCACCCTTCAACTAATCAATCAAGACGTGATGGTACAGATGTTGATGCTGATCGTGTTGAAAGAGTTTTCAAGAGCTTAAATTATAAAGTAACGCGTATCCTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGCCTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTATCACATGGAGACAATAATATAATATACGCGAATGATGGGGGAAG ]
[+] EMBL CD078908 [ CTCAACATTACAAAAAGCGTACTTCATCAGACTCTGTTGGAAGCCTCTCAAGCAGATCATTCATCATATGATAGTTTTATTTTTGTCATGTTATCACATGGAGACAATAATATAATATACGCGAATGAT GGGGAAGTCTTAACAAGTTATATTATGGCTTTTTTTCGTGGTGATCGGTGTCCTTCCCTGATTGCAAAACCGAAATTATTCTTTTTCCAGGCATGTCGAGGTGCTGCATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACANATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATANATGGACTANAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCG ]
[+] EMBL AI067589 [ CGGTGTCCTTCCCTGATTGCAAAACCGAAATTATTCTTTTTCCAGGCATGTCGAGGTGCTGCATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACAGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGT ]
[+] EMBL CD150347 [ CATTTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATATCTTTCATGAAAAGCAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTATCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTTAGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACANATCAT ]
[-] EMBL CD150426 [ ATNTGATAAAGGTGTTTCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGCCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATATCTTTCATGAAAAACAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTATCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTTAGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACAAATCATC]
[+] EMBL BG932121 [ GGTGTATCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATCTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGTTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTTTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTT ]
[-] EMBL CD150445 [ TCCACTATGGTAACAGATGCAGGTGAAGATTTAATTGTGCACAAGTTACCGATAGAAGCAGATATACTAGNTGCATACTCCACAGTACCAGGTTTTTNTGCTTGGCGTAACTCCTCTTCAGGCAGTTGGTTTATTCAAGAACTATGTAATGCACTTGAATCTGATATGAAAAATGCAAACCATTCAGATATTATGTCTCTTCTCACAGTAGTTGCCCGTGTAGTAGCCTATCAATATCGATCGAATACAGGTCAGATTGAGACGGATAATATGAAACAAATGACGAGTACTGTTAGTACTTTAACACGACTATTTTACATAAATGGACTAAAATCATGAACGCTGAAGTTTTGCGGTCAATGAAGAAATAAACTTCAGAAAAATTAACATATATTTCATGAAAAACAAAAGACACTCGCCTACAGTTTTGCACGATTGTGTTTCGCTCTTATCATAAGCATATTCACATTGAAATTTTTATTTGTTTAATGTTTGTGTTTACAAACTTTTTAGACATGAGACGCTTTTTTCCAATTAAATCAGTAACTTTGAAACAAATCATC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||