cluster # 9199

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Schistosoma mansoni
cluster # 9199 cluster # 9199 Sequences # 8 consensus # 4

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consensus_9199#0 length = 879 sequences # 3
consensus_9199#1 length = 877 sequences # 3

consensus_9199#2 length = 557 sequences # 1
consensus_9199#3 length = 291 sequences # 1

consensusID : consensus_9199#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 879
fasta sequence

                              [CTGCAGGTTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATATCAAAAGAATTACAGATAATGAAATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGTTTCGTATGGTTCATCTTGTGTAGTCCTTATATAGTTGATGTAGAAACACTTATATATCTTGTCCTGCAGATCCTAGAAAAGCACTGGGCATTAAATTACCTTTCCTAGTGTTAATTGTAAAAAATCTCAATAAGTACTTTACGTTTGAAATTCAGATCCTTGATGACGAGGGTGTTAAGAGACGTTTTAGGGCCAGTAACTACCAGAGCACTACTCGAGTAAAGCCATTTATTTGCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGCAGAGTTCAAATTATACCTCCCTGTTCAAGTAAACCGGAACACATAGGTATTTTCATTGCAAATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTTTAACACTTTTCAAACTATCATGTATATGTTTCAGTTTGGTGCATAATATGTATTTTGTGTTATCCATTACCCCGAATATTTCTACTTTATAATAAAATAATTCGTGAGAATTTTCTAATACCAGTTATTTGTTAAATTTCATGTTCATTTATGTTAATCTTCTTGGTTAACGTTCTTCAGTGTGTTGAAACTACTGCTGAATTACACATTGTTTTCTCAGTTGCATCATAATTTTACTGGGTTAACGTCATGTTGTAACTATCATGCTTAAAATGTTTG]

[+] EMBL CD191778             [CTGCAGGTTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATATCAAAAGAATTACAGATAATGAAATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGTTTCGTATGGTTCATCTTGTGTAGTCCTTATATAGTTGATGTAGAAACACTTATATATCTTGTCCTGCAGATCCTAGAAAAGCACTGGGCATTAAATTACCTTTCCTAGTGTTAATTGTAAAAAATCTCAATAAGTACTTTACGTTTGAAATTCAGATCCTTGATGACGAGGGTGTTAAGAGACGTTTTAGGGCCAGTAACTACCAGAGCACTACTCGAGTAAAGCCATTTATTTGCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD076600             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTAAAGCCATTTATTTGCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGCAGAGTTCAAATTATACCTCCCTGTTCAAGTAAACCGGAACACATAGGTATTTTCATTGCAAATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTTTAACACTTTTCAAACTATCATGTATATGTTTCAGTTTGGTGCATAATATGTATTTTGTGTTATCCATTACCCCGAATATTTCTACTTTATAATAAAATAATTCGTGAGAATTTTCTAATACCAGTTATTTGTTAAATTTCATGTTCATTTATGTTAATCTTCTTGGTTAACGTTCTTCAGTGTGTTGAAACTACTGCTGAATTACACATTGTTTTCTCAGTTGCATCATAATTTTACTGGGTTAACGTCATGTTGTAACTATCATGCTTAAAATGTTTG]
[-] EMBL CD075749             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGCAGAGTTCAAATTATACCTCCCTGTTCAAGTAAACCGGAACACATAGGTATTTTCATTGCAAATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTTTAACACTTTTCAAACTATCATGTATATGTTTCAGTTTGGTGCATAATATGTATTTTGTGTTATCCATTACCCCGAATATTTCTACTTTATAATAAAATAATTCGTGAGAATTTTCTAATACCAGTTATTTGTTAAATTTCATGTTCATTTATGTTAATCTTCTTGGTTAACGTTCTTCAGTGTGTTGAAACTACTGCTGAATTACACATTGTTTTCTCAGTTGCATCATAATTTTACTGGGTTAACGTCATGTTGTAACTATCATGCTTAAAATGTTTG]




>consensus_9199#0
CTGCAGGTTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATATCAAAAGAATTACAGATAATGAA
ATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGTTTCGTATGGTTCATCTTGTGTA
GTCCTTATATAGTTGATGTAGAAACACTTATATATCTTGTCCTGCAGATCCTAGAAAAGC
ACTGGGCATTAAATTACCTTTCCTAGTGTTAATTGTAAAAAATCTCAATAAGTACTTTAC
GTTTGAAATTCAGATCCTTGATGACGAGGGTGTTAAGAGACGTTTTAGGGCCAGTAACTA
CCAGAGCACTACTCGAGTAAAGCCATTTATTTGCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAA
CTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTT
CGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTG
TGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGCAGAGTTCAAATTATACCTCCCTGTTCA
AGTAAACCGGAACACATAGGTATTTTCATTGCAAATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTT
TAACACTTTTCAAACTATCATGTATATGTTTCAGTTTGGTGCATAATATGTATTTTGTGT
TATCCATTACCCCGAATATTTCTACTTTATAATAAAATAATTCGTGAGAATTTTCTAATA
CCAGTTATTTGTTAAATTTCATGTTCATTTATGTTAATCTTCTTGGTTAACGTTCTTCAG
TGTGTTGAAACTACTGCTGAATTACACATTGTTTTCTCAGTTGCATCATAATTTTACTGG
GTTAACGTCATGTTGTAACTATCATGCTTAAAATGTTTG

consensusID : consensus_9199#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 877
fasta sequence

                              [TTAACTGTACGCTACACAAATGTTCAGGAATACATTCCAGAGTGGGTTTTTATCTATACTATTCAGTGTTGGGACAAAACCTCTGCAGATTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATATCAAAAGAATTACAGATAATGAAATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGTTTCAAACACTTATATATCTTGTCCTGCAGATCCTAGAAAAGCACTGGGCATTAAATTACCTTTCCTAGTGTTAATTGTAAAAAATCTCAATAAGTACTTTACGTTTGAAATTCAGATCCTTGATGACGAGGGTGTTAAGAGACGTTTTAGGGCCAGTAACTACCAGAGCACTACTCGAGTAAAGCCATTTATTTGCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGCAGAGTTCAAATTATACCTCCCTGTTCAAGTAAACCGGAACACATAGGTATTTTCATTGCAAATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTTTAACACTNTTCAAACTATCATGTATATGTTTCAGTTTGGTGCATAATATGTATTNTGTGTTATCCATTACACCGAATATTTCTACTTTATAATAAAAATAATCGTGAGAATTTTCTAATCCAGNTNNATTGTAAATTTCATGTCATTATGTAAATCTCTGGNTAACGTCTCATGTGTGAACTACGTGATACACATGTTTCAGTGCATATATTCTGGTACGCAGTGACTTAGCTAA]

[+] EMBL CD083015             [TTAACTGTACGCTACACAAATGTTCAGGAATACATTCCAGAGTGGGTTTTTATCTATACTATTCAGTGTTGGGACAAAACCTCTGCAGATTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATATCAAAAGAATTACAGATAATGAAATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGTTTCAAACACTTATATATCTTGTCCTGCAGATCCTAGAAAAGCACTGGGCATTAAATTACCTTTCCTAGTGTTAATTGTAAAAAATCTCAATAAGTACTTTACGTTTGAAATTCAGATCCTTGATGACGAGGGTGTTAAGAGACGTTTTAGGGCCAGTAACTACCAGAGCACTACTCGAGTAAAGCCATTTATTTGCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD082134             [                           ctaaACATTCCAGAGTGGGTTTTTATCTA ACTTTTCAGTGTTGGGACACAACCTCTGCAGATTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATATCAAAAGAATTACAGATAATGAAATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGTTTCAAACACTTATATATCTTGTCCTGCAGATCCTAGAAAAGCACTGGGCATTAAATTACCTTTCCTAGTGTTAATTGTAAAAAATCTCAATAAGTACTTTACGTTTGAAATTCAGATCCTTGATGACGAGGGTGTTAAGAGACGTTTTAGGGCCAGTAACTACCAGAGCACTACTCGAGTAAAGCCATTTATTTGCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGCAGAGTTCAAATTATACCTCCCTGTTCAAGTAAACCGGAACACATAGGTATTTTCATTGCAAATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTTTAACACTNTTCAAACTATCATGTATATGTTTCAGTTTGGTGCATAATATGTATTNTGTGTTATCCATTACACCGAATATTTCTACTTTATAATAAAAATAATCGTGAGAATTTTCTAATCCAGNTNNATTGTAAATTTCATGTCATTATGTAAATCTCTGGNTAACGTCTCATGTGTGAACTACGTGATACACATGTTTCAGTGCATATATTCTGGTACGCAGTGACTTAGCTAA]
[+] EMBL CD115093             [                                    CCAGAGTGGGTTTGGATGTATACTATTCAGTGTTGGGACAAAACCTCTGCAGATTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATATCAAAAGAATTACAGATAATGAAATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_9199#1
TTAACTGTACGCTACACAAATGTTCAGGAATACATTCCAGAGTGGGTTTTTATCTATACT
ATTCAGTGTTGGGACAAAACCTCTGCAGATTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATAT
CAAAAGAATTACAGATAATGAAATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGT
TTCAAACACTTATATATCTTGTCCTGCAGATCCTAGAAAAGCACTGGGCATTAAATTACC
TTTCCTAGTGTTAATTGTAAAAAATCTCAATAAGTACTTTACGTTTGAAATTCAGATCCT
TGATGACGAGGGTGTTAAGAGACGTTTTAGGGCCAGTAACTACCAGAGCACTACTCGAGT
AAAGCCATTTATTTGCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTT
CAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGT
TCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGA
GGAAGAGCTCCCTGCAGAGTTCAAATTATACCTCCCTGTTCAAGTAAACCGGAACACATA
GGTATTTTCATTGCAAATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTTTAACACTNTTCAAACTAT
CATGTATATGTTTCAGTTTGGTGCATAATATGTATTNTGTGTTATCCATTACACCGAATA
TTTCTACTTTATAATAAAAATAATCGTGAGAATTTTCTAATCCAGNTNNATTGTAAATTT
CATGTCATTATGTAAATCTCTGGNTAACGTCTCATGTGTGAACTACGTGATACACATGTT
TCAGTGCATATATTCTGGTACGCAGTGACTTAGCTAA

consensusID : consensus_9199#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 557
fasta sequence

                              [GCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGGTTTGTAATGACCATTAAAATAAGATCTAATTTCAAGCATGTTGCCAGATGCATTTTCATATGATTTTAGAATGAAATTACTTGTTATTAAGGAATTAGATTCCCTCTAAAGTGGTTTTATCAGCACTTGTTATGTTACGCGATGTCACGGAAAGTGGTAAGTATTAGGCTTACGATGCTTAAAACACGAAAAATATGAGGGAAAATGAAGAGATGTGTGTGGATACTTACATAACCGCATCTAAATGCAAGTTAATGTATAGGAATATAATGCAGTAATTTCAGTGGGTTATTATTTGCAAGTTGGTTACTTCCGAAAAATCGTTAACGATGTGTAAATTAATGCGCATAAACCACATTAGATATAAACAATCCAGTTAGAATGTCGGGAGCGTGTTCTCCTGATGATTCACCACTTATTGATTATGTGCTGTGTGTATGACTCCA]

[-] EMBL CD090094             [GCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGGTTTGTAATGACCATTAAAATAAGATCTAATTTCAAGCATGTTGCCAGATGCATTTTCATATGATTTTAGAATGAAATTACTTGTTATTAAGGAATTAGATTCCCTCTAAAGTGGTTTTATCAGCACTTGTTATGTTACGCGATGTCACGGAAAGTGGTAAGTATTAGGCTTACGATGCTTAAAACACGAAAAATATGAGGGAAAATGAAGAGATGTGTGTGGATACTTACATAACCGCATCTAAATGCAAGTTAATGTATAGGAATATAATGCAGTAATTTCAGTGGGTTATTATTTGCAAGTTGGTTACTTCCGAAAAATCGTTAACGATGTGTAAATTAATGCGCATAAACCACATTAGATATAAACAATCCAGTTAGAATGTCGGGAGCGTGTTCTCCTGATGATTCACCACTTATTGATTATGTGCTGTGTGTATGACTCCA]




>consensus_9199#2
GCACCATGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACT
TTACAAAGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGGTTTGTAATG
ACCATTAAAATAAGATCTAATTTCAAGCATGTTGCCAGATGCATTTTCATATGATTTTAG
AATGAAATTACTTGTTATTAAGGAATTAGATTCCCTCTAAAGTGGTTTTATCAGCACTTG
TTATGTTACGCGATGTCACGGAAAGTGGTAAGTATTAGGCTTACGATGCTTAAAACACGA
AAAATATGAGGGAAAATGAAGAGATGTGTGTGGATACTTACATAACCGCATCTAAATGCA
AGTTAATGTATAGGAATATAATGCAGTAATTTCAGTGGGTTATTATTTGCAAGTTGGTTA
CTTCCGAAAAATCGTTAACGATGTGTAAATTAATGCGCATAAACCACATTAGATATAAAC
AATCCAGTTAGAATGTCGGGAGCGTGTTCTCCTGATGATTCACCACTTATTGATTATGTG
CTGTGTGTATGACTCCA

consensusID : consensus_9199#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 291
fasta sequence

                              [CTCCTTTATTGAAGCATTAACACTTACTATTAATTTCTAACTGTTGACTAGATGCAATAGCCATTGCAATTGAGAATAAAAAAAATATCTTAACTAGTATGCTTATAATAAGTTTTCAAGTCTTAAAAATAGTTTTGTATGAGGTTGTATACTTTGTAGCACCAAAAGATATATCAATGACTATTAGAGCGAAATTGTTACTTTAAAAACATCGCTTTTCGAAACCTATTTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGA]

[+] EMBL CD188486             [CTCCTTTATTGAAGCATTAACACTTACTATTAATTTCTAACTGTTGACTAGATGCAATAGCCATTGCAATTGAGAATAAAAAAAATATCTTAACTAGTATGCTTATAATAAGTTTTCAAGTCTTAAAAATAGTTTTGTATGAGGTTGTATACTTTGTAGCACCAAAAGATATATCAATGACTATTAGAGCGAAATTGTTACTTTAAAAACATCGCTTTTCGAAACCTATTTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGA]




>consensus_9199#3
CTCCTTTATTGAAGCATTAACACTTACTATTAATTTCTAACTGTTGACTAGATGCAATAG
CCATTGCAATTGAGAATAAAAAAAATATCTTAACTAGTATGCTTATAATAAGTTTTCAAG
TCTTAAAAATAGTTTTGTATGAGGTTGTATACTTTGTAGCACCAAAAGATATATCAATGA
CTATTAGAGCGAAATTGTTACTTTAAAAACATCGCTTTTCGAAACCTATTTTCAGATTCA
CGCTAATTGTCGAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9199#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9199#1      TTAACTGTACGCTACACAAATGTTCAGGAATACATTCCAGAGTGGGTTTTTATCTATACT 60
consensus_9199#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      ----------------------CTGCAGGTTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATAT 38
consensus_9199#1      ATTCAGTGTTGGGACAAAACCTCTGCAGATTTGGGACAAAAAGGTTCGTAACGGTCATAT 120
consensus_9199#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      CAAAAGAATTACAGATAATGAAATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGT 98
consensus_9199#1      CAAAAGAATTACAGATAATGAAATCCAGTCATTGGTCTTGGAATTATTAGGAAGCAATGT 180
consensus_9199#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      TTCGTATGGTTCATCTTGTGTAGTCCTTATATAGTTGATGTAGAAACACTTATATATCTT 158
consensus_9199#1      TTC----------------------------------------AAACACTTATATATCTT 200
consensus_9199#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      GTCCTGCAGATCCTAGAAAAGCACTGGGCATTAAATTACCTTTCCTAGTGTTAATTGTAA 218
consensus_9199#1      GTCCTGCAGATCCTAGAAAAGCACTGGGCATTAAATTACCTTTCCTAGTGTTAATTGTAA 260
consensus_9199#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      AAAATCTCAATAAGTACTTTACGTTTGAAATTCAGATCCTTGATGACGAGGGTGTTAAGA 278
consensus_9199#1      AAAATCTCAATAAGTACTTTACGTTTGAAATTCAGATCCTTGATGACGAGGGTGTTAAGA 320
consensus_9199#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      GACGTTTTAGGGCCAGTAACTACCAGAGCACTACTCGAGTAAAGCCATTTATTTGCACCA 338
consensus_9199#1      GACGTTTTAGGGCCAGTAACTACCAGAGCACTACTCGAGTAAAGCCATTTATTTGCACCA 380
consensus_9199#2      ------------------------------------------------------GCACCA 6
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      TGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAA 398
consensus_9199#1      TGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAA 440
consensus_9199#2      TGCCTCTCCGTTTGGAAGCCAACTGGAATAACATTTACTTCAACGTTGCAGACTTTACAA 66
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      AGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTC 458
consensus_9199#1      AGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGATTCACGCTAATTGTC 500
consensus_9199#2      AGCGTGCATACGGGACTAATTTCGTCGAGGTGCTGCGAGTTCAGGTTTGTAATGACCATT 126
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      GAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGCAGAGT 518
consensus_9199#1      GAATAAGACGTATATATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGAGGAAGAGCTCCCTGCAGAGT 560
consensus_9199#2      AAAATAAG---ATCTAATTTCAAGCATGTTGCCAGATGCATTTTCATATGATTTTAGAAT 183
consensus_9199#3      -----------------CTCCTTTATTGAAGC-ATTAACACTTACTATTAATTTCTAACT 42
                                        *        *   * *     *        *   *    * *

consensus_9199#0      TCAAATTATACCTCCCTGTTCAAGTAAACCGGAAC-ACATAGGTATTTTCATTGCAA--- 574
consensus_9199#1      TCAAATTATACCTCCCTGTTCAAGTAAACCGGAAC-ACATAGGTATTTTCATTGCAA--- 616
consensus_9199#2      G-AAATTACTTGTTATTAAGGAATTAGATTCCCTCTAAAGTGGTTTTATCAGCACTTGTT 242
consensus_9199#3      GTTGACTAGATGCAATAGCCATTGCAATTGAGAATAAAAAAAATATCTTAACTAGTA--- 99
                          * **                 *          * *    * *  * *         

consensus_9199#0      ATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTTTAACACTTTTCAAACTATCATGTATATGTTTC-- 632
consensus_9199#1      ATGTTTCCCTGTTTCAATGACACTTTTAACACTNTTCAAACTATCATGTATATGTTTC-- 674
consensus_9199#2      ATGTTACGCGATGTCACGGAAAGTGGTAA--GTATTAGGCTTACGATGCTTAAAACACGA 300
consensus_9199#3      -TGCTT---------ATAATAAGTTTTCAAGTCTTAAAAATAGTTTTGTATGAGGTTG-- 147
                       ** *          *     * *  * *     *           **  *         

consensus_9199#0      --AGTTTGGTGCATAAT-ATGTATTTTGT-GTTATCCATTACCCCGAATATTTCTACTTT 688
consensus_9199#1      --AGTTTGGTGCATAAT-ATGTATTNTGT-GTTATCCATTACACCGAATATTTCTACTTT 730
consensus_9199#2      AAAATATGAGGGAAAATGAAGAGATGTGT-GTGGATACTTACAT-AACCGCATCTAAATG 358
consensus_9199#3      --TATACTTTGTAGCACCAAAAGATATATCAATGACTATTAGAGCGAAATTGTTACTTTA 205
                          *     * *  *  *     * * *         ***     *     *     * 

consensus_9199#0      ATAATAAAATAATTCGTG-AGAATTTTCTAATACCAGTTATTTGTTAAATTTCA--TGTT 745
consensus_9199#1      ATAATAAAAATAATCGTG-AGAATTTTCTAAT-CCAGNTNNATTGTAAATTTCA--TGTC 786
consensus_9199#2      CAAGTTAATGTATAGGAATATAATGCAGTAATTTCAGTGGGTTATTATTTGCAAGTTGGT 418
consensus_9199#3      AAAACATCGCTTTTCGAAACCTATTTTCAGATTCACGCTAATTGTCGAATAAGACGTATA 265
                        *            *      **      **    *     *      *   *  *   

consensus_9199#0      CATTTATGTTAATCTTCTTGGTTAACGTTCTTCAGTGTGTTGAAACTACTGCTGA-ATTA 804
consensus_9199#1      A--TTATGTAAATCT--CTGGNTAACGT-CTCATGTGTGAACTACGTGATACACATGTTT 841
consensus_9199#2      TACTTCCGAAAAATCGTTAACGATGTGTAAATTAATGCGCATAAACCACATTAGATATAA 478
consensus_9199#3      TATTTTTGTGACCGCCTCTATTCGGA---------------------------------- 291
                         **  *  *                                                 

consensus_9199#0      -CACATTGTTTTCTCAGTTGCATCATAATTTTACTGGGTTAACGTCATGTTGTAACTATC 863
consensus_9199#1      -CAGTGCATATATTCTGGTACGCAGTGACTTAGCTAA----------------------- 877
consensus_9199#2      ACAATCCAGTTAGAATGTCGGGAGCGTGTTCTCCTGATGATTCACCACTTATTGATTAT- 537
consensus_9199#3      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9199#0      ATGCTTAAAATGTTTG---- 879
consensus_9199#1      --------------------
consensus_9199#2      GTGCTGTGTGTATGACTCCA 557
consensus_9199#3      --------------------