cluster # 9211

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Schistosoma mansoni
cluster # 9211 cluster # 9211 Sequences # 9 consensus # 3

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consensus_9211#0 length = 879 sequences # 7

consensus_9211#1 length = 534 sequences # 1
consensus_9211#2 length = 486 sequences # 1

consensusID : consensus_9211#0
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NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 879
fasta sequence

                              [AGGGTCCTTTACAGTACGAAGTATACTTTCTAACTTGGGATAATCGTGACGTCATTTCCTTCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAAAACTGCAGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTTGTAGAAAAGTCTCAAGAATTTCTGATTCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAATTCGGAATTTTACATGCAGCTGTGATACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCA-AAACCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGGGTATCTTACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAGTCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCTTGAAGCTAAAGATTATCTCCTATACTTTTACTATGGAGGAATGATTTATGGCGCAGTAAAGAATTGGGAAAGAAGCCTACACTTTTTTGAATTGTGTTTAATTATCCCTGCCGTATCATCAAGCTGTATTCTGATTGAAGCTGCAAAAAAGATAATATTAATCTCCTTGATATTACATGGGAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCATATTTCATGTCTCCAAGGCCTTGGAAATGCTACTGTCAGCCATATTTAGAACTAGCAACAGCATT]

[+] EMBL AI975624             [AGGGTCCTTTACAGTACGAAGTATACTTTCTAACTTGGGATAATCGTGACGTCATTTCCTTCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAAAACTGCAGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTTGTAGAAAAGTCTCAAGAATTTCTGATTCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAATTCGGAATTTTACATGCAGCTGTGATACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCA AAACCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGGGTATCTTACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGCTTGGATTAGCTGCTTGAATG TTAATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD161171             [                   AGTATACTTTCTAACTTGGGATAATCGTGACGTCATTTCCTTCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAAAACTGCAGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTTGTAGAAAAGTCTCAAGAATTTCTGATTCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAATTCGGAATTTTACATGCAGCTGTGATACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCA AAACCTCTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGGGTATCTTACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAGTCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCTTGAAGCTAAAGATTATCTCCTATACTTTTACTATGGA                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD178400             [                                                         CCTTCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAAAACTGCAGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTTGTAGAAAAGTCTCAAGAATTTCTGGTTCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAATTCGGAATTTTACATGCAGCTGTAATACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCA AAACCTTTTCAATCTTTGTGACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGGGTATCTTACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD133258             [                                                                                                                                                                    CTCAAGAATTTCTGATTCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAATTCGGAATTTTACATGCAGCTGTAATACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCA AAACCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATTTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTCGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTTACAAATGTCCCGGGTGTCTTACTCCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD161042             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACTCANAACCCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTNTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATNTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCCATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGGGTATCTTACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAGTCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCTTGAAGCTAAAGATTATCTCCTATACTTTTACTATGGAGGAATGATTTATGGCGCAGTAAAGAATTGGGAAAGAAGCCTACACTTTTTTGAATTGTGTTTAATTATCCCTGCCGTATCATCAAGCTGTATTCTGATTGAAGCTGCAAAAAAGATAATATTAATCTCCTTGATATTACATGGGAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCATATTTCATGTCTCCAAGGCCTTGGAAATGCTACTGTCAGCCATATTTAGAACTAGCAACAGCATT]
[+] EMBL CD193699             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACTCA AAACCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGGGTATCTTACTCCACTACACTGTGATCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD130541             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAGTCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCTTGAAGCTAAAGATTATCTCCTATACTTTTACTATGGAGGAATGATTTATGGCGCAGTAAAGAATTGGGAAAGAAGCCTACACTTTTTTGAATTGTGTTTAATTATCCCTGCCGTATCATCAAGCTGTATTCTGATTGAAGCTGCAAAAAAGATAATATTAATCTCCTTGATATTACATGGGAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCATATTTCATGTCTCCAAGGCCTTGNAA                                       ]




>consensus_9211#0
AGGGTCCTTTACAGTACGAAGTATACTTTCTAACTTGGGATAATCGTGACGTCATTTCCT
TCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAA
AACTGCAGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTTGTAGAAAAGTCTCAAGAATTTCTGAT
TCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAATTCGGAAT
TTTACATGCAGCTGTGATACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTG
GCTAGTAATCCAAACTCAAAACCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAAT
TCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGAT
TCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGG
GTATCTTACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAG
TCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCT
TGAAGCTAAAGATTATCTCCTATACTTTTACTATGGAGGAATGATTTATGGCGCAGTAAA
GAATTGGGAAAGAAGCCTACACTTTTTTGAATTGTGTTTAATTATCCCTGCCGTATCATC
AAGCTGTATTCTGATTGAAGCTGCAAAAAAGATAATATTAATCTCCTTGATATTACATGG
GAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCATATTTCATGTCTCCAAGGCCTTGGAA
ATGCTACTGTCAGCCATATTTAGAACTAGCAACAGCATT

consensusID : consensus_9211#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 534
fasta sequence

                              [TACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGGTAAATGCTAATGTATGTACATGGTGTGCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAGTCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCTTGAAGCTAAAGATTATCTCCTATGCTTTTACTATGGAGGAATGATTTATGGCGCAGTAAAGAATTGGGAAAGAAGCCTACACTTTTTTGAATTGTGTTTAATTATCCCTGCCGTATCATCAAGCTGTATTCTGATTGAAGCTGCAAAAAAGATAATATTAATCTCCTTGATATTACATGGGAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCATATTTCATGTCTCCAAGGCCTTGGAAATGCTACTGTCAGCCATATTTAGAACTAGCAACAGCATTTCGATCTAACAATCCTGAGGACTTAACTAATTTTGTTGATCTTCATCGAGAATTATTTACAGCTGATTTCAACTTCGGACTTGTTAAACAAGTAATAAAGTGTCATGGAA]

[+] EMBL CD183276             [TACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGGTAAATGCTAATGTATGTACATGGTGTGCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAGTCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCTTGAAGCTAAAGATTATCTCCTATGCTTTTACTATGGAGGAATGATTTATGGCGCAGTAAAGAATTGGGAAAGAAGCCTACACTTTTTTGAATTGTGTTTAATTATCCCTGCCGTATCATCAAGCTGTATTCTGATTGAAGCTGCAAAAAAGATAATATTAATCTCCTTGATATTACATGGGAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCATATTTCATGTCTCCAAGGCCTTGGAAATGCTACTGTCAGCCATATTTAGAACTAGCAACAGCATTTCGATCTAACAATCCTGAGGACTTAACTAATTTTGTTGATCTTCATCGAGAATTATTTACAGCTGATTTCAACTTCGGACTTGTTAAACAAGTAATAAAGTGTCATGGAA]




>consensus_9211#1
TACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGGTAAATGCTAATGTATGTACATGGTGTGCAGC
TTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAGTCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAG
AAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCTTGAAGCTAAAGATTATCTCCTATGCTTTTACTATG
GAGGAATGATTTATGGCGCAGTAAAGAATTGGGAAAGAAGCCTACACTTTTTTGAATTGT
GTTTAATTATCCCTGCCGTATCATCAAGCTGTATTCTGATTGAAGCTGCAAAAAAGATAA
TATTAATCTCCTTGATATTACATGGGAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCAT
ATTTCATGTCTCCAAGGCCTTGGAAATGCTACTGTCAGCCATATTTAGAACTAGCAACAG
CATTTCGATCTAACAATCCTGAGGACTTAACTAATTTTGTTGATCTTCATCGAGAATTAT
TTACAGCTGATTTCAACTTCGGACTTGTTAAACAAGTAATAAAGTGTCATGGAA

consensusID : consensus_9211#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 486
fasta sequence

                              [TGACGTCATTTCCTTCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAAAACTGCAGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTTGTAGAAAAGTCTCAAGAATTTCTGATTCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAATTCGGAATTTTACATGCAGCTGTAATGTTAGTTGTCAACTATTTCACACTTACAGCAGACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCAAAACCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGNGTATCTTACTCCACTACACT]

[+] EMBL CD132747             [TGACGTCATTTCCTTCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAAAACTGCAGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTTGTAGAAAAGTCTCAAGAATTTCTGATTCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAATTCGGAATTTTACATGCAGCTGTAATGTTAGTTGTCAACTATTTCACACTTACAGCAGACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCAAAACCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTCGTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAATCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGNGTATCTTACTCCACTACACT]




>consensus_9211#2
TGACGTCATTTCCTTCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCT
TCCGCAGTCAACAAAACTGCAGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTTGTAGAAAAGTCT
CAAGAATTTCTGATTCGTAATGTCCACTCACTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATT
GCTAAATTCGGAATTTTACATGCAGCTGTAATGTTAGTTGTCAACTATTTCACACTTACA
GCAGACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAA
CTCAAAACCTTTTCAATCTTTGTAACTCAGAGTCTTTGCAAAAAATTCCATCTTATGTTC
GTGTAATTTCACATGAATTTACGAACTGCCTGATTAATATGGGGATTCCACACAAGGGAA
TCAGTTGTATGGTCACTGCTATTCACAAACTTCAGAAATGTCCGGNGTATCTTACTCCAC
TACACT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9211#0      AGGGTCCTTTACAGTACGAAGTATACTTTCTAACTTGGGATAATCGTGACGTCATTTCCT 60
consensus_9211#2      ----------------------------------------------TGACGTCATTTCCT 14
consensus_9211#1      -----------------------------------------------TACTCCACTACAC 13
                                                                      **  ** * *  

consensus_9211#0      TCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAA 120
consensus_9211#2      TCGCGATATCTGTCTAATGGTGTCCGGATCATTAAGCAACTTTTCTTCCGCAGTCAACAA 74
consensus_9211#1      T-GTGATCTATGCCAGGTAA-ATGCTAAT--GTATGTACATGGTGTGCAGC--TTGGATT 67
                      * * *** * ** *   *    * *  **   ** * *  *  * * * **  *      

consensus_9211#0      AACTGC-AGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTT---GTAGAAAAGTCTCAAGAATTTC 176
consensus_9211#2      AACTGC-AGGATCTGCAAATGCATTATGTGAACTT---GTAGAAAAGTCTCAAGAATTTC 130
consensus_9211#1      AGCTGCTAGAATGTTTAGTCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGA 127
                      * **** ** ** *  *    ** * * * ** *     **  **  * * *  ****  

consensus_9211#0      TGAT--TCGTAATGTCCACTCA-CTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAAT 233
consensus_9211#2      TGAT--TCGTAATGTCCACTCA-CTAGACTTTATTTTGGATGACTTTGATATTGCTAAAT 187
consensus_9211#1      TAAAAGCAGTACAGCCCTTGAAGCTAAAGATTATCTCCTATGCTTTTACTATGGAGGAAT 187
                      * *     ***  * **    * *** *  **** *   ***  ***  *** *   ***

consensus_9211#0      ---TCGGAATTTTACATGCAGCTGTGAT-------------------------------- 258
consensus_9211#2      ---TCGGAATTTTACATGCAGCTGTAATGTTAGTTGTCAACTATTTCACACTTACAGCAG 244
consensus_9211#1      GATTTATGGCGCAGTAAAGAATTGGGAAAGAAGCCTACA-CTTTTTTGAATTGTGTTTAA 246
                         *           *   *  **  *                                 

consensus_9211#0      ACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCA 318
consensus_9211#2      ACATGCCAAATATATTTCACAGTCAGTTGTTGATAAAGAGTGGCTAGTAATCCAAACTCA 304
consensus_9211#1      TTATCCCTGCCGTATCATCAAGCTGTATTCTGATTGA-AGCTGCAAAAAAGATAATATTA 305
                        ** **     ***     **     *  ****  * **  ** *  **   **  * *

consensus_9211#0      AAACCTTTTCAATC---TTTGTAACTCAG---AGTCTTTGCAAAA--AATTCCATCTTAT 370
consensus_9211#2      AAACCTTTTCAATC---TTTGTAACTCAG---AGTCTTTGCAAAA--AATTCCATCTTAT 356
consensus_9211#1      ATCTCCTTGATATTACATGGGAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCATATTTC 365
                      *   * **   **    *  * ** ****    *** *** **       * *** **  

consensus_9211#0      GTTCGTGTAATTTCACATGAAT-TTACGAACTGCCTGATTAATA--TGGGGATTCCACAC 427
consensus_9211#2      GTTCGTGTAATTTCACATGAAT-TTACGAACTGCCTGATTAATA--TGGGGATTCCACAC 413
consensus_9211#1      ATGTCTCCAAGGCCTTGGAAATGCTACTGTCAGCCATATTTAGAACTAGCAACAGCATTT 425
                       *   *  **   *     ***  ***   * ***  *** * *  * *  *   **   

consensus_9211#0      AAGGGAATCAGTTGTATGGTC---ACTGCTATTCACAAACTTCA----GAAATGTCCGGG 480
consensus_9211#2      AAGGGAATCAGTTGTATGGTC---ACTGCTATTCACAAACTTCA----GAAATGTCCGGN 466
consensus_9211#1      CGATCTAACAATCCTGAGGACTTAACTAATTTTGTTGATCTTCATCGAGAATTATTTACA 485
                            * ** *  *  ** *   ***  * **    * *****    *** * *     

consensus_9211#0      GTATCTTACTCCACTACACTGTGATCTATGCCAGCTTGGATTAGCTGCTAGAATGTTTAG 540
consensus_9211#2      GTATCTTACTCCACTACACT---------------------------------------- 486
consensus_9211#1      GCTGATTTCAACTTCGGACTTGTTAAACAAGTAATAAAGTGTCATGGAA----------- 534
                      *    ** *  *     ***                                        

consensus_9211#0      TCCCACTCTTTCAATTCTCGATATTAATATTTTAGAAATTGATAAAAGCAGTACAGCCCT 600
consensus_9211#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9211#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9211#0      TGAAGCTAAAGATTATCTCCTATACTTTTACTATGGAGGAATGATTTATGGCGCAGTAAA 660
consensus_9211#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9211#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9211#0      GAATTGGGAAAGAAGCCTACACTTTTTTGAATTGTGTTTAATTATCCCTGCCGTATCATC 720
consensus_9211#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9211#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9211#0      AAGCTGTATTCTGATTGAAGCTGCAAAAAAGATAATATTAATCTCCTTGATATTACATGG 780
consensus_9211#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9211#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9211#0      GAAATTCAGTACGGTCCTTGAAACTCCGGCTGCATATTTCATGTCTCCAAGGCCTTGGAA 840
consensus_9211#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9211#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9211#0      ATGCTACTGTCAGCCATATTTAGAACTAGCAACAGCATT 879
consensus_9211#2      ---------------------------------------
consensus_9211#1      ---------------------------------------