Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9218 cluster # 9218       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9218#0 length = 1257 sequences # 9  

consensusID : consensus_9218#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1257
fasta sequence
                              [AGACAATAAATTTATATAGAAGGTTGAATAGAACATTTCAAACTAAATTGTAAATATTTAAAGAAAGTGTCATTTATTGTCATGTAAAGTTCATACATTATAGAATTTATGGAAAAAGAAACAACGACAAATGATCATTTATATTATATCACAATTGAGCAACACATTATACTCCTTGAGTTGAAATACACATCCACATAAAGAA-TTCAAGTTATAAAATAAATTGAATGTAGTAAAAAAAGACAAACTAACTAAAACAAAAATAACTCATAATTGCGCATCATGAAGAATAAAAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCATTGTTCCATCAAATTTGTTGGGCTTGGTTGTAAGCATCGGATTAGCATGATTCAATTTCTGTACTAACATTCCACCTGAGCTAACAGTAATAACACGAGCATCAGGTGATTTTTTTAATGCAGGTATTAGACTTTCAGTAAGTATATAAGTACCAAGTGTATTTGTGGCGAAATTAGCTTCTAAACCATTTTCATCAGTTTTATATTCATTAATCATGCAGCCAGCATTATTAATCAGAATATCTAGACGTGAATCATTATTATTGGCAAATTGTTTTCCAAAATTGCGGACATCATTCGGTTTAGAAAGATCCAATGGATGAATAATTATAAGCGAATCCTTGACTCCAGTTTCAGAGATTATCTGTTGACGTGCCTCTTCAGCACGAGGTTTACTGCGACAAACCATATGGATTTCTGCACCATGTTTGGCTAATTCTTTGCAACACACGAGACCGATCCCTGAATTGGCTCCAGTTACTAAAACACGGCGATTGTCTAAGCGTACATTTTTCAACTCATTAGGATCAAAGTCCTC]

[+] EMBL CD161908             [AGACAATAAATTTATATAGAAGGTTGAATAGAACATTTCAAACTAAATTGTAAATATTTAAAGAAAGTGTCATTTATTGTCATGTAAAGTTCATACATTATAGAATTTATGGAAAAAGAAACAACGACAAATGATCATTTATATTATATCACAATTGAGCAACACATTATACTCCTTGAGTTGAAATACACATCCACATAAAGAA TTCAAGTTATAAAATAAATTGAATGTAGTAAAAAAAGACAAACTAACTAAAACAAAAATAACTCATAATTGCGCATCATGAAGAATAAAAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGNATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACC CATTTCAGTCATGACAACTTGNTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCATTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD161864             [              TATAAGAGGTTGAATAGACCA TTCAAACTAAA TGTAAATATTT AAGAAAGTGTCATTTA TGTCATG AAAG TCAT CCTTATAG ATTTAT GAAAAAGAAAC ACGGCCAATGATCATTTATA TATATCA AATTGAGCAACACATTATACTCCTTGAGTTGAAATACACATCCACAT AAGAATTTCAAGTTATAAAATANATTGAATGTAGTAAAAAAAGACAAACTAACTAAAACAAAAATAACTCATAATTGCGCATCATGAAGAATAANAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD075707             [                                                                                                                                      TCATTTATATTATATCACAATTGAGCAACACATTATACTCCTTGAGTTGAAATACACATCCACATAAAGAA TTCAAGTTATAAAATAAATTGAATGTAGTAAAAAAAGACAAACTAACTAAAACAAAAATAACTCATAATTGCGCATCATGAAGAATAAAAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD161823             [                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCGCATCATGAAGAATAAAAACCACGCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD161792             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTATTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATCCTTTGAATGTGTACAGGTTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAAAGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCAGCATCTGCACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAGAGCGACAGGTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD082092             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCATTGTTCCATCAAATTTGTTGGGCTTGGTTGTAAGCATCGGATTAGCATGATTCAATTTCTGTACTAACATTCCACCTGAGCTAACAGTAATAACACGAGCATCAGGTGATTTTTTTAATGCAGGTATTAGACTTTCAGTAAGTATATAAGTACCAAGTGTATTTGTGGCGAAATTAGCTTCTAAACCATTTTCATCAGTTTTATATTCATTAATCATGCAGCCAGCATTATTAATCAGAATATCTAGACGTGAATCATTATTATTGGCAAATTGTTTTCCAAAATTGCGGACATCATTCGGTTTAGAAAGATCCAATGGATGAATAATTATAAGCGAATCCTTGACTCCAGTTTCAGAGATTATCTGTTGACGTGCCTCTTCAGCACGAGGTTTACTGCGACAAACCATATGGATTTCTGCACCATGTTTGGCTAATTCTTTGCAACACACGAGACCGATCCCTGAATTGGCTCCAGTTACTGAAACACGGCGATTGTCAAAGCGTACATTTTTCAACTCATTAGGATCAAAGTCCTC]
[+] EMBL CD152882             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATAGTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCATTGTTCCATCAAATTTGTTGGGCTTGGTTGTAACCATCAGATTAGCATGATTCAATTTCTGTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD194283             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAAGTGTATTTGTGGCGAAATTAGCTTCTAAACCATTTTCATCAGTTTTATATTCATTAATCATGCAGCCAGCATTATTAATCAGAATATCTAGACGTGAATCATTATTATTGGCAAATTGTTTTCCAAAATTGCGGACATCATTCGGTTTAGAAAGATCCAATGGATGAATAATTATAAGCGAATCCTTGACTCCAGTTTCAGAGATTATCTGTTGACGTGCCTCTTCAGCACGAGGTTTACTGCGACAAACCATATGGATTTCTGCACCATGTTTGGCTAATTCTTTGCAACACACGAGACCGATCCCTGAATTGGCTCCAGTTACTAAAACACGGCGATTGTCTAAGCG                                 ]
[-] EMBL CD194559             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGTGTATTTGTGGCGAAATTAGCTTCTAAACCATTTTCATCAGTTTTATATTCATTAATCATGCAGCCAGCATTATTAATCAGAATATCTAGACGTGAATCATTATTATTGGCAAATTGTTTTCCAAAATTGCGGACATCATTCGGTTTAGAAAGATCCAATGGATGAATAATTATAAGCGAATCCTTGACTCCAGTTTCAGAGATTATCTGTTGACGTGCCTCTTCAGCACGAGGTTTACTGCGACAAACCATATGGATTTCTGCACCATGTTTGGCTAATTCTTTGCAACACACGAGACCGATCCCTGAATTGGCTCCAGTTACTAAAACACGGCGATTGTCTAAGCGT                                ]


>consensus_9218#0 AGACAATAAATTTATATAGAAGGTTGAATAGAACATTTCAAACTAAATTGTAAATATTTA AAGAAAGTGTCATTTATTGTCATGTAAAGTTCATACATTATAGAATTTATGGAAAAAGAA ACAACGACAAATGATCATTTATATTATATCACAATTGAGCAACACATTATACTCCTTGAG TTGAAATACACATCCACATAAAGAATTCAAGTTATAAAATAAATTGAATGTAGTAAAAAA AGACAAACTAACTAAAACAAAAATAACTCATAATTGCGCATCATGAAGAATAAAAACCAC GCATATGTGTTTTAATTATAAGCTGTGATAATTTTCTTCTGCTGACTAGGGTAGAGATTA TTTAAGGAATGGTGCTGCAATATCAGCTAAATTAGACATGAATTTTCGTTTTTCATCATC CTTTGAATGTGTACAGGCTAATTTTAAGTGTTGATTAACCACTTGACGATCTTGAAAGAA AGAACCGTTTTGAAATCTTCTCACATTTGGTACCAAAGCTAACCAGATTGCTGCATCTGC ACCTTGTTCTGGTGTTCTTAGTTTATTTTTCATTTTATTGTAAAACGATGGCATAGACAG AGCGACAGCTGGTGTATCAGCCCAACCAGGATGCATTGAACAGAAGAATATTTCTGGATA GTTTTGAGACCACATTTCAGTCATAACAACTTGTTGACGTTTATTTTGTGCATAAACCAT TGTTCCATCAAATTTGTTGGGCTTGGTTGTAAGCATCGGATTAGCATGATTCAATTTCTG TACTAACATTCCACCTGAGCTAACAGTAATAACACGAGCATCAGGTGATTTTTTTAATGC AGGTATTAGACTTTCAGTAAGTATATAAGTACCAAGTGTATTTGTGGCGAAATTAGCTTC TAAACCATTTTCATCAGTTTTATATTCATTAATCATGCAGCCAGCATTATTAATCAGAAT ATCTAGACGTGAATCATTATTATTGGCAAATTGTTTTCCAAAATTGCGGACATCATTCGG TTTAGAAAGATCCAATGGATGAATAATTATAAGCGAATCCTTGACTCCAGTTTCAGAGAT TATCTGTTGACGTGCCTCTTCAGCACGAGGTTTACTGCGACAAACCATATGGATTTCTGC ACCATGTTTGGCTAATTCTTTGCAACACACGAGACCGATCCCTGAATTGGCTCCAGTTAC TAAAACACGGCGATTGTCTAAGCGTACATTTTTCAACTCATTAGGATCAAAGTCCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)