cluster # 922

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Schistosoma mansoni
cluster # 922 cluster # 922 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_922#0 length = 930 sequences # 2

consensusID : consensus_922#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 930
fasta sequence

                              [GCAATTGACAGGTTAAAACCCGCTTTCATAGAGTCTGAAACACATAACAGTCGAAAGCCTTCTAAAGACAACAACTGCACAACACAGCTTCCTGCGTTTCCAGCTAATTCTTCACCTACTTCTGTGAAATCGCCAACTCAAACAATGTGTGATGCTAATGTTACGCCTCCTACAAACTTAGTTCCTAATTCCACTACCTTACCTTTTTTTAAAAACTACTCGTACAGGAAGACAGGTACATATTCCTAAACGTTATGTTGAACTCATTACTTAATCTTCATTTGGTCATATTCTGTAATGTGAGTAAATACCTATATGCTAAGAGTTACTCATGATGCTCATTATTAACTGTAACGATATCCAACTTAGTTGTATTTGTTCATTTTATAATTGATCGTTTACATTGATATATACAGATATTAAAAGTTTTTCCGGTAATATATCAATTTAATTAACGTTATTATTAATACCACTATTATTTTTATTATACGTTCAATTATCTTTGCTAAATTTTTTTTTTTACATACATTAAAGATAATAAACACAAAATTTTTTTTTTTCTAACCACACAAAGCATTTTGTTTCATAAGTATATATACTTATTAAATTNTTTTTTTGATAACCTCTATTTATTCTTTCCTTTGTTGTGTAATAATTTTTTTTCCCCTCCAAAGCACTTAGAATTTACGTCGGGCATACCTCCACCGACGCATGCCCTAGGGAGGGAGTTATATAGTGACATTTATGTCTAGTGATTTTTTGTAACAACAAATTGAAGGTCACATATTTTCCCTAGTTGTCACACTTTTTATGTAATCACACTCATATTTGATATCTATTGTTTTTCTGTATCAATCGTAAAGAAACGAATACTTTTGTTTGGTTATATATAACACGACTTCACTACCGCGCTTCTTAAAATATAAACGT]

[+] EMBL CD081841             [GCAATTGACAGGTTAAAACCCGCTTTCATAGAGTCTGAAACACATAACAGTCGAAAGCCTTCTAAAGACAACAACTGCACAACACAGCTTCCTGCGTTTCCAGCTAATTCTTCACCTACTTCTGTGAAATCGCCAACTCAAACAATGTGTGATGCTAATGTTACGCCTCCTACAAACTTAGTTCCTAATTCCACTACCTTACCTTTTTTTAAAAACTACTCGTACAGGAAGACAGGTACATATTCCTAAACGTTATGTTGAACTCATTACTTAATCTTCATTTGGTCATATTCTGTAATGTGAGTAAATACCTATATGCTAAGAGTTACTCATGATGCTCATTATTAACTGTAACGATATCCAACTTAGTTGTATTTGTTCATTTTATAATTGATCGTTTACATTGATATATACAGATATTAAAAGTTTTTCCGGTAATATATCAATTTAATTAACGTTATTATTAATACCACTATTATTTTTATTATACGTTCAATTATCTTTGCTAAATTTTTTTTTTTACATACATTAAAGATAATAAACACAAAATTTTTTTTTTTCTAACCACACAAAGCATTTTGTTTCATAAGTATATATACTTATTAAATTNTTTTTTTGATAACCTCTATTTATTCTTTCCTTTGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD075560             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTTGTATTTGTTCATTTTATAATTGATCGTTTACATTGATATATACAGATATTAAAAGTTTTTCCGGTAATATATCAATTTAATTAACGTTATTATTAATACCACTATTATTTTTATTATACGTTCAATTATCTTTGCTAAATTTTTTTTTTTACATACATTAAAGATAATAAACACAAAATTTTTTTTTTTCTAACCACACAAAGCATTTTGTTTCATAAGTATATATACTTATTAAATTTTTTTTTTGATAACCTCTATTTATTCTTTCCTTTGTTGTGTAATAATTTTTTTTCCCCTCCAAAGCACTTAGAATTTACGTCGGGCATACCTCCACCGACGCATGCCCTAGGGAGGGAGTTATATAGTGACATTTATGTCTAGTGATTTTTTGTAACAACAAATTGAAGGTCACATATTTTCCCTAGTTGTCACACTTTTTATGTAATCACACTCATATTTGATATCTATTGTTTTTCTGTATCAATCGTAAAGAAACGAATACTTTTGTTTGGTTATATATAACACGACTTCACTACCGCGCTTCTTAAAATATAAACGT]




>consensus_922#0
GCAATTGACAGGTTAAAACCCGCTTTCATAGAGTCTGAAACACATAACAGTCGAAAGCCT
TCTAAAGACAACAACTGCACAACACAGCTTCCTGCGTTTCCAGCTAATTCTTCACCTACT
TCTGTGAAATCGCCAACTCAAACAATGTGTGATGCTAATGTTACGCCTCCTACAAACTTA
GTTCCTAATTCCACTACCTTACCTTTTTTTAAAAACTACTCGTACAGGAAGACAGGTACA
TATTCCTAAACGTTATGTTGAACTCATTACTTAATCTTCATTTGGTCATATTCTGTAATG
TGAGTAAATACCTATATGCTAAGAGTTACTCATGATGCTCATTATTAACTGTAACGATAT
CCAACTTAGTTGTATTTGTTCATTTTATAATTGATCGTTTACATTGATATATACAGATAT
TAAAAGTTTTTCCGGTAATATATCAATTTAATTAACGTTATTATTAATACCACTATTATT
TTTATTATACGTTCAATTATCTTTGCTAAATTTTTTTTTTTACATACATTAAAGATAATA
AACACAAAATTTTTTTTTTTCTAACCACACAAAGCATTTTGTTTCATAAGTATATATACT
TATTAAATTNTTTTTTTGATAACCTCTATTTATTCTTTCCTTTGTTGTGTAATAATTTTT
TTTCCCCTCCAAAGCACTTAGAATTTACGTCGGGCATACCTCCACCGACGCATGCCCTAG
GGAGGGAGTTATATAGTGACATTTATGTCTAGTGATTTTTTGTAACAACAAATTGAAGGT
CACATATTTTCCCTAGTTGTCACACTTTTTATGTAATCACACTCATATTTGATATCTATT
GTTTTTCTGTATCAATCGTAAAGAAACGAATACTTTTGTTTGGTTATATATAACACGACT
TCACTACCGCGCTTCTTAAAATATAAACGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case