cluster # 9222

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Schistosoma mansoni
cluster # 9222 cluster # 9222 Sequences # 9 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_9222#0 length = 389 sequences # 9

consensusID : consensus_9222#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 389
fasta sequence

                              [GTGTTGCAAAGGGGCCGTGACCTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCAGCCCACTGGCTTTGCAACA]

[+] EMBL CD091772             [GTGTTGCAAAGGGGCCGTGACCTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTCCCTGATAGATCAGCCCACTGGCTTTGCAACA]
[-] EMBL CD122201             [                     CTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATCGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCA                   ]
[-] EMBL CD122205             [                     CTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGATATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCA                   ]
[-] EMBL CD122234             [                     CTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAACTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCA                   ]
[-] EMBL CD122167             [                     CTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCA                   ]
[-] EMBL CD122212             [                     CTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCA                   ]
[-] EMBL CD122224             [                     CTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCA                   ]
[-] EMBL CD122240             [                     CTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCA                   ]
[-] EMBL CD122193             [                     CTGAATTATGGAGCCTGA   CGCCGCACTTACACCACTGAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGAAGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACTTTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATTGCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTATTGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCCTGATAGATCA                   ]




>consensus_9222#0
GTGTTGCAAAGGGGCCGTGACCTGAATTATGGAGCCTGACGCCGCCGCACTTACACCACT
GAGCGAAAGTGCATTAATCGCTGATGCCAATCCAGTGGCTATTGTTTGATTGGTGTCCGA
AGTCGTAATCGAATAATTCGCATTGTTGGAGCCATTAATAGTTATTGTTAGCGTGTTACT
TTGGAACGGAGGAGCATCGCTTATTGCAATTTGTGTCACGGTAGAAAAATTGATCGAATT
GCTAGGTAACGACATGAATTGTGATGTGCCATCAAAGCTCAGTGCCGGATAGCTATTTAT
TGACGAATTGAGAAACAATGGTCGTTTTGGAAAAGTAGCCGTCAGGTTATTGGAATTTCC
TGATAGATCAGCCCACTGGCTTTGCAACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case