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Schistosoma mansoni
cluster # 9244 cluster # 9244       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9244#0 length = 1353 sequences # 9  

consensusID : consensus_9244#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1353
fasta sequence
                              [AGAACTCCACGGTAGGAACTCTCCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCACCGGCAGATGCTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATTGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGTCCATCATGTCCAGGTTGTCCAAATCCATCAGATTCCAATTCCAACAAAGGATATCTTAATCCAGTTGAATCAAATGAAGAAGTTCGTGTTAACGTTTTTTCGAATTCTTATCGTGAAAAACTTCGCTCTTATTGTTCAAGTTATCATCTTGTTCAAACTATTTTGCATTTGATACATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGTCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTTCTATTCGCACGAAATCGAGCTCTGCTAGTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT-GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTTGTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCTGTTATACTGTTTTGATGATTATGGTAATCAGTCATCTGAACTATGAGTTACTATTCGTAATTCATTGGTTAAGGATATCTTGTCAGTTTTGTTCTTTCACGTTTCTGTTTTGTGAAGATTTGTAAAACAGAGGTTTATTTTACGTTCTTTATGATTTCAAAAGTTATGCCTTTTCTTTTTTGCAATATGTCAATGAAATTCAATATGATTTAAAATAAACCG]

[-] EMBL CD110991             [AGAACTCCACGGTAGGAACTCTCCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCGCCGGCAGATGCTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATTGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD111366             [AGAACTCCACGGTAGGAACTCTCCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCACCGGCAGATGTTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATCGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI975564             [                    acgCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTCACCGGCAGATGCTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAATACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGCGATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATTACGACATAAATTGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGTCCATCATGTCCAGGTTGTCCAAATCCATCAGATTCCAATTCCAACAAAGGATATCTTAATCCAGTTGAATCAAATGAAGAAGTTCGTGTTAACGTTTTTTCGAATTCTTATCGTGAAAAACTTCGCTCTTATTGTTCAAGTTATCATCTTGTTCAAACTATTTTGCATTTGATACATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGGCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTTCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD126211             [                                                                                                                                                                                                                                        GAAACATTACGACAT AATTGCTTTTACGGGCAGCATGTTACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTCCTACGGTGGTCCATCATGTCCAGGTTGTCCAAATCCATCAGATTCCAATTCCAACAAAGGATATCTTAATCCAGTTGAATCAAATGAAGAAGTTCGTGTTAACGTTTTTTCGAATTCTTATCGTGAAAAACTTCGCTCTTATTGTTCAAGTTATCATCTTGTTCAAACTATTTTGCATTTGATGCATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGTCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTCCTATTCGCACGAAATCGAGCTCTGCTAGTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD078870             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTTTGCATTTGATACATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTTGTTATTGGCTGTCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTTCTATTCGCACGAAATCGAGCTCTGCTAGTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTTGTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCT                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD169953             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTGTTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTT AAATCAAGTAGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD090113             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGTTGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCAT GTTTGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGTTTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACAATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD167507             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTTCAGATACA TTTGGACCTCTTTGCATTCTCCATGGTTGGTGTTACTATTGTTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAGCCACCTTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD073330             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACCTCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATATTATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTTTGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCATTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTTGTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCTGTTATACTGTTTTGATGATTATGGTAATCAGTCATCTGAACTATGAGTTACTATTCGTAATTCATTGGTTAAGGATATCTTGTCAGTTTTGTTCTTTCACGTTTCTGTTTTGTGAAGATTTGTAAAACAGAGGTTTATTTTACGTTCTTTATGATTTCAAAAGTTATGCCTTTTCTTTTTTGCAATATGTCAATGAAATTCAATATGATTTAAAATAAACCG]


>consensus_9244#0 AGAACTCCACGGTAGGAACTCTCCCAAAAGAATGGATCATGCCCACGGTTCTCATCCTTC ACCGGCAGATGCTAGTATGCAGTCGAGTGATCATTCCATGGATATGAAAATGTATTTCAA TACTGATATGCATTATACATTGCTTTTTTCATCCTGGATTATTGATACAGTTGGAAAAGC GATTGTAGCATGTCTTGGCTCTTTCATACTCGCTATCATATATGAGGCCCTAGAAACATT ACGACATAAATTGCTTTTACGGGCAGCATGTAACAATCAGTGTGAACGTGCTGGAAATTC CTACGGTGGTCCATCATGTCCAGGTTGTCCAAATCCATCAGATTCCAATTCCAACAAAGG ATATCTTAATCCAGTTGAATCAAATGAAGAAGTTCGTGTTAACGTTTTTTCGAATTCTTA TCGTGAAAAACTTCGCTCTTATTGTTCAAGTTATCATCTTGTTCAAACTATTTTGCATTT GATACATGCATTTATGGGCTATATTCTTATGTTGATTGTGATGACATACAATGTCTATTT GTTATTGGCTGTCCTATTCGGTTTCACCCTTGGTTACTTTCTATTCGCACGAAATCGAGC TCTGCTAGTCCGATCGCATAACTGCTGTCATTAGACAATGAGCGCATAATTATGTGTGTG TTGGTCAGTGAATTAGTTCAAGCTCTTCGGATTCGTTTGAAGATAATCAAATTACTTTGT TGCACACTGTTCAGATACATTTTGGACCTCTTTGCATTCTCCATGTTTGTGTTACTATTG TTGTTCCTGTGTTATTTATTCTCATTTTTTCAACATTGTTCTCCACCTTCATTCTTTACC TCCATTTTTTTAACCACCTTATCTAGATTTTGTGAATTCCCAATATGCATCAATATATAT TATTTTGTAAAAATCTTTCTTAAAATCAAGTAGTGTGTGTGTGGTTTTGATTGTTTTGTT TGTAATTTCTGTTTTACCTTTCCTAAATCATTTCTACCACGCTTCATGTACACTAGACCA TTTTACTTAGGGTTTGTTGATTCTCCCCGATCTCTATTATCAATAAAATATTTGTGATTT GTGCTCAAGACGTATTTCAATAATACCTTTTGGCTATTATGATGTTACCCTGTTATACTG TTTTGATGATTATGGTAATCAGTCATCTGAACTATGAGTTACTATTCGTAATTCATTGGT TAAGGATATCTTGTCAGTTTTGTTCTTTCACGTTTCTGTTTTGTGAAGATTTGTAAAACA GAGGTTTATTTTACGTTCTTTATGATTTCAAAAGTTATGCCTTTTCTTTTTTGCAATATG TCAATGAAATTCAATATGATTTAAAATAAACCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)